Gravar um job do MapReduce com o conector do BigQuery

O conector do BigQuery para Hadoop é instalado por padrão em todos os nós do cluster do Dataproc 1.0-1.2 em /usr/lib/hadoop/lib/. Ele está disponível nos ambientes Spark e PySpark.

Versões de imagem do Dataproc 1.5+: o conector do BigQuery não é instalado por padrão nas versões de imagem 1.5 e posteriores do Dataproc. Para usá-lo com estas versões:

  1. Instale o conector do BigQuery usando a ação de inicialização.

  2. Especifique o conector do BigQuery no parâmetro jars ao enviar um job:

    --jars=gs://hadoop-lib/bigquery/bigquery-connector-hadoop3-latest.jar
    

  3. Inclua as classes do conector do BigQuery nas dependências do aplicativo com jar.

Para evitar conflitos: se o aplicativo usar uma versão de conector diferente da versão do conector implantado no cluster do Dataproc, será necessário:

  1. Criar um novo cluster com uma ação de inicialização que instale a versão do conector usada pelo seu aplicativo ou

  2. incluir e realocar as classes do conector e as dependências do conector da versão que você está usando no jar do aplicativo para evitar conflitos entre a versão do conector e a versão do conector implantada no cluster do Dataproc (veja este exemplo de realocação de dependências no Maven).

Classe GsonBigQueryInputFormat

GsonBigQueryInputFormat fornece ao Hadoop os objetos do BigQuery em um formato JsonObject por meio das seguintes operações principais:

  • Como usar uma consulta especificada pelo usuário para selecionar objetos do BigQuery
  • Dividir os resultados da consulta igualmente entre os nós do Hadoop.
  • Analisar as divisões em objetos Java para transferir ao mapeador. A classe Mapper do Hadoop recebe uma representação JsonObject de cada objeto do BigQuery selecionado.

A classe BigQueryInputFormat fornece acesso aos registros do BigQuery por meio de uma extensão da classe InputFormat do Hadoop. Para usar a classe BigQueryInputFormat:

  1. As linhas precisam ser adicionadas ao job principal do Hadoop para definir parâmetros na configuração do Hadoop.

  2. A classe InputFormat precisa ser definida como GsonBigQueryInputFormat.

As seções abaixo mostram como atender a esses requisitos.

Parâmetros de entrada

QualifiedInputTableId
A tabela do BigQuery para leitura, no formato: optional-projectId:datasetId.tableId
Exemplo: publicdata:samples.shakespeare
projectId
O projectId do BigQuery em que todas as operações de entrada ocorrem.
Exemplo: my-first-cloud-project
// Set the job-level projectId.
conf.set(BigQueryConfiguration.PROJECT_ID_KEY, projectId);

// Configure input parameters.
BigQueryConfiguration.configureBigQueryInput(conf, inputQualifiedTableId);

// Set InputFormat.
job.setInputFormatClass(GsonBigQueryInputFormat.class);

Observações:

  • job refere-se ao org.apache.hadoop.mapreduce.Job, o job do Hadoop a ser executado.
  • conf refere-se a org.apache.hadoop.Configuration para o job do Hadoop.

Mapeador

A classe GsonBigQueryInputFormat lê no BigQuery e transmite um objeto por vez como entrada para a função Mapper do Hadoop. As entradas assumem a forma de um par composto pelo seguinte:

  • LongWritable, o número de registro
  • JsonObject, o registro do BigQuery formatado em Json

O Mapper aceita LongWritable e JsonObject pair como entrada.

Veja um snippet de Mapper para um job de exemplo de scikit (em inglês).

  // private static final LongWritable ONE = new LongWritable(1);
  // The configuration key used to specify the BigQuery field name
  // ("column name").
  public static final String WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY =
      "mapred.bq.samples.wordcount.word.key";

  // Default value for the configuration entry specified by
  // WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY. Examples: 'word' in
  // publicdata:samples.shakespeare or 'repository_name'
  // in publicdata:samples.github_timeline.
  public static final String WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_VALUE_DEFAULT = "word";

  /**
   * The mapper function for WordCount.
   */
  public static class Map
      extends Mapper <LongWritable, JsonObject, Text, LongWritable> {
    private static final LongWritable ONE = new LongWritable(1);
    private Text word = new Text();
    private String wordKey;

    @Override
    public void setup(Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      // Find the runtime-configured key for the field name we're looking for
      // in the map task.
      Configuration conf = context.getConfiguration();
      wordKey = conf.get(WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY,
          WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_VALUE_DEFAULT);
    }

    @Override
    public void map(LongWritable key, JsonObject value, Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      JsonElement countElement = value.get(wordKey);
      if (countElement != null) {
        String wordInRecord = countElement.getAsString();
        word.set(wordInRecord);
        // Write out the key, value pair (write out a value of 1, which will be
        // added to the total count for this word in the Reducer).
        context.write(word, ONE);
      }
    }
  }

Classe IndirectBigQueryOutputFormat

IndirectBigQueryOutputFormat permite que o Hadoop grave valores JsonObject diretamente em uma tabela do BigQuery. Essa classe fornece acesso a registros do BigQuery por meio de uma extensão da classe OutputFormat do Hadoop. Para usá-la corretamente, diversos parâmetros precisam ser ajustados na configuração do Hadoop, e a classe OutputFormat precisa ser configurada como IndirectBigQueryOutputFormat. Veja abaixo um exemplo dos parâmetros a serem definidos e as linhas de código necessárias para usar IndirectBigQueryOutputFormat corretamente.

Parâmetros de saída

projectId
O projectId do BigQuery no qual todas as operações de saída ocorrem.
Exemplo: "my-first-cloud-project"
QualifiedOutputTableId
O conjunto de dados do BigQuery para gravar os resultados do job final, no formato optional-projectId:datasetId.tableId. O datasetId já deve estar presente no seu projeto. O conjunto de dados outputDatasetId será criado no BigQuery para resultados temporários. Ele não pode entrar em conflito com um conjunto de dados existente.
Exemplos:
test_output_dataset.wordcount_output
my-first-cloud-project:test_output_dataset.wordcount_output
outputTableFieldSchema
Um esquema que define o esquema da tabela de saída do BigQuery
GcsOutputPath
O caminho de saída para armazenar dados temporários do Cloud Storage (gs://bucket/dir/)
    // Define the schema we will be using for the output BigQuery table.
    List<TableFieldSchema> outputTableFieldSchema = new ArrayList<TableFieldSchema>();
    outputTableFieldSchema.add(new TableFieldSchema().setName("Word").setType("STRING"));
    outputTableFieldSchema.add(new TableFieldSchema().setName("Count").setType("INTEGER"));
    TableSchema outputSchema = new TableSchema().setFields(outputTableFieldSchema);

    // Create the job and get its configuration.
    Job job = new Job(parser.getConfiguration(), "wordcount");
    Configuration conf = job.getConfiguration();

    // Set the job-level projectId.
    conf.set(BigQueryConfiguration.PROJECT_ID_KEY, projectId);

    // Configure input.
    BigQueryConfiguration.configureBigQueryInput(conf, inputQualifiedTableId);

    // Configure output.
    BigQueryOutputConfiguration.configure(
        conf,
        outputQualifiedTableId,
        outputSchema,
        outputGcsPath,
        BigQueryFileFormat.NEWLINE_DELIMITED_JSON,
        TextOutputFormat.class);

    // (Optional) Configure the KMS key used to encrypt the output table.
    BigQueryOutputConfiguration.setKmsKeyName(
        conf,
        "projects/myproject/locations/us-west1/keyRings/r1/cryptoKeys/k1");
);

Redutor

A classe IndirectBigQueryOutputFormat grava no BigQuery. Ela adiciona uma chave e um valor JsonObject como entrada e grava somente o valor JsonObject no BigQuery. A chave é ignorada. O JsonObject contém um registro do BigQuery formatado em Json. O Redutor deve gerar uma chave de qualquer tipo (NullWritable é usado no job de amostra do WordCount) e pares de valores JsonObject. O Redutor do job de WordCount de exemplo é exibido abaixo.

  /**
   * Reducer function for WordCount.
   */
  public static class Reduce
      extends Reducer<Text, LongWritable, JsonObject, NullWritable> {

    @Override
    public void reduce(Text key, Iterable<LongWritable> values, Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      // Add up the values to get a total number of occurrences of our word.
      long count = 0;
      for (LongWritable val : values) {
        count = count + val.get();
      }

      JsonObject jsonObject = new JsonObject();
      jsonObject.addProperty("Word", key.toString());
      jsonObject.addProperty("Count", count);
      // Key does not matter.
      context.write(jsonObject, NullWritable.get());
    }
  }

Limpar

Após a conclusão do job, limpe os caminhos de exportação do Cloud Storage.

job.waitForCompletion(true);
GsonBigQueryInputFormat.cleanupJob(job.getConfiguration(), job.getJobID());

É possível conferir a contagem de palavras na tabela de saída do BigQuery no Console do Google Cloud.

Código completo para um job de WordCount de exemplo

O código abaixo é um exemplo de um job simples de WordCount que agrega contagens de palavras de objetos no BigQuery.

package com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.samples;

import com.google.api.services.bigquery.model.TableFieldSchema;
import com.google.api.services.bigquery.model.TableSchema;
import com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.BigQueryConfiguration;
import com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.BigQueryFileFormat;
import com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.GsonBigQueryInputFormat;
import com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.output.BigQueryOutputConfiguration;
import com.google.cloud.hadoop.io.bigquery.output.IndirectBigQueryOutputFormat;
import com.google.gson.JsonElement;
import com.google.gson.JsonObject;

import org.apache.hadoop.conf.Configuration;
import org.apache.hadoop.io.LongWritable;
import org.apache.hadoop.io.NullWritable;
import org.apache.hadoop.io.Text;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.TextOutputFormat;
import org.apache.hadoop.util.GenericOptionsParser;

import java.io.IOException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.List;

/**
 * Sample program to run the Hadoop Wordcount example over tables in BigQuery.
 */
public class WordCount {

 // The configuration key used to specify the BigQuery field name
  // ("column name").
  public static final String WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY =
      "mapred.bq.samples.wordcount.word.key";

  // Default value for the configuration entry specified by
  // WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY. Examples: 'word' in
  // publicdata:samples.shakespeare or 'repository_name'
  // in publicdata:samples.github_timeline.
  public static final String WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_VALUE_DEFAULT = "word";

  // Guava might not be available, so define a null / empty helper:
  private static boolean isStringNullOrEmpty(String toTest) {
    return toTest == null || "".equals(toTest);
  }

  /**
   * The mapper function for WordCount. For input, it consumes a LongWritable
   * and JsonObject as the key and value. These correspond to a row identifier
   * and Json representation of the row's values/columns.
   * For output, it produces Text and a LongWritable as the key and value.
   * These correspond to the word and a count for the number of times it has
   * occurred.
   */

  public static class Map
      extends Mapper <LongWritable, JsonObject, Text, LongWritable> {
    private static final LongWritable ONE = new LongWritable(1);
    private Text word = new Text();
    private String wordKey;

    @Override
    public void setup(Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      // Find the runtime-configured key for the field name we're looking for in
      // the map task.
      Configuration conf = context.getConfiguration();
      wordKey = conf.get(WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY, WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_VALUE_DEFAULT);
    }

    @Override
    public void map(LongWritable key, JsonObject value, Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      JsonElement countElement = value.get(wordKey);
      if (countElement != null) {
        String wordInRecord = countElement.getAsString();
        word.set(wordInRecord);
        // Write out the key, value pair (write out a value of 1, which will be
        // added to the total count for this word in the Reducer).
        context.write(word, ONE);
      }
    }
  }

  /**
   * Reducer function for WordCount. For input, it consumes the Text and
   * LongWritable that the mapper produced. For output, it produces a JsonObject
   * and NullWritable. The JsonObject represents the data that will be
   * loaded into BigQuery.
   */
  public static class Reduce
      extends Reducer<Text, LongWritable, JsonObject, NullWritable> {

    @Override
    public void reduce(Text key, Iterable<LongWritable> values, Context context)
        throws IOException, InterruptedException {
      // Add up the values to get a total number of occurrences of our word.
      long count = 0;
      for (LongWritable val : values) {
        count = count + val.get();
      }

      JsonObject jsonObject = new JsonObject();
      jsonObject.addProperty("Word", key.toString());
      jsonObject.addProperty("Count", count);
      // Key does not matter.
      context.write(jsonObject, NullWritable.get());
    }
  }

  /**
   * Configures and runs the main Hadoop job. Takes a String[] of 5 parameters:
   * [ProjectId] [QualifiedInputTableId] [InputTableFieldName]
   * [QualifiedOutputTableId] [GcsOutputPath]
   *
   * ProjectId - Project under which to issue the BigQuery
   * operations. Also serves as the default project for table IDs that don't
   * specify a project for the table.
   *
   * QualifiedInputTableId - Input table ID of the form
   * (Optional ProjectId):[DatasetId].[TableId]
   *
   * InputTableFieldName - Name of the field to count in the
   * input table, e.g., 'word' in publicdata:samples.shakespeare or
   * 'repository_name' in publicdata:samples.github_timeline.
   *
   * QualifiedOutputTableId - Input table ID of the form
   * (Optional ProjectId):[DatasetId].[TableId]
   *
   * GcsOutputPath - The output path to store temporary
   * Cloud Storage data, e.g., gs://bucket/dir/
   *
   * @param args a String[] containing ProjectId, QualifiedInputTableId,
   *     InputTableFieldName, QualifiedOutputTableId, and GcsOutputPath.
   * @throws IOException on IO Error.
   * @throws InterruptedException on Interrupt.
   * @throws ClassNotFoundException if not all classes are present.
   */
  public static void main(String[] args)
      throws IOException, InterruptedException, ClassNotFoundException {

    // GenericOptionsParser is a utility to parse command line arguments
    // generic to the Hadoop framework. This example doesn't cover the specifics,
    // but recognizes several standard command line arguments, enabling
    // applications to easily specify a NameNode, a ResourceManager, additional
    // configuration resources, etc.
    GenericOptionsParser parser = new GenericOptionsParser(args);
    args = parser.getRemainingArgs();

    // Make sure we have the right parameters.
    if (args.length != 5) {
      System.out.println(
          "Usage: hadoop jar bigquery_wordcount.jar [ProjectId] [QualifiedInputTableId] "
              + "[InputTableFieldName] [QualifiedOutputTableId] [GcsOutputPath]\n"
              + "    ProjectId - Project under which to issue the BigQuery operations. Also serves "
              + "as the default project for table IDs that don't explicitly specify a project for "
              + "the table.\n"
              + "    QualifiedInputTableId - Input table ID of the form "
              + "(Optional ProjectId):[DatasetId].[TableId]\n"
              + "    InputTableFieldName - Name of the field to count in the input table, e.g., "
              + "'word' in publicdata:samples.shakespeare or 'repository_name' in "
              + "publicdata:samples.github_timeline.\n"
              + "    QualifiedOutputTableId - Input table ID of the form "
              + "(Optional ProjectId):[DatasetId].[TableId]\n"
              + "    GcsOutputPath - The output path to store temporary Cloud Storage data, e.g., "
              + "gs://bucket/dir/");
      System.exit(1);
    }

    // Get the individual parameters from the command line.
    String projectId = args[0];
    String inputQualifiedTableId = args[1];
    String inputTableFieldId = args[2];
    String outputQualifiedTableId = args[3];
    String outputGcsPath = args[4];

   // Define the schema we will be using for the output BigQuery table.
    List<TableFieldSchema> outputTableFieldSchema = new ArrayList<TableFieldSchema>();
    outputTableFieldSchema.add(new TableFieldSchema().setName("Word").setType("STRING"));
    outputTableFieldSchema.add(new TableFieldSchema().setName("Count").setType("INTEGER"));
    TableSchema outputSchema = new TableSchema().setFields(outputTableFieldSchema);

    // Create the job and get its configuration.
    Job job = new Job(parser.getConfiguration(), "wordcount");
    Configuration conf = job.getConfiguration();

    // Set the job-level projectId.
    conf.set(BigQueryConfiguration.PROJECT_ID_KEY, projectId);

    // Configure input.
    BigQueryConfiguration.configureBigQueryInput(conf, inputQualifiedTableId);

    // Configure output.
    BigQueryOutputConfiguration.configure(
        conf,
        outputQualifiedTableId,
        outputSchema,
        outputGcsPath,
        BigQueryFileFormat.NEWLINE_DELIMITED_JSON,
        TextOutputFormat.class);

    // (Optional) Configure the KMS key used to encrypt the output table.
    BigQueryOutputConfiguration.setKmsKeyName(
        conf,
        "projects/myproject/locations/us-west1/keyRings/r1/cryptoKeys/k1");

    conf.set(WORDCOUNT_WORD_FIELDNAME_KEY, inputTableFieldId);

    // This helps Hadoop identify the Jar which contains the mapper and reducer
    // by specifying a class in that Jar. This is required if the jar is being
    // passed on the command line to Hadoop.
    job.setJarByClass(WordCount.class);

    // Tell the job what data the mapper will output.
    job.setOutputKeyClass(Text.class);
    job.setOutputValueClass(LongWritable.class);
    job.setMapperClass(Map.class);
    job.setReducerClass(Reduce.class);
    job.setInputFormatClass(GsonBigQueryInputFormat.class);

    // Instead of using BigQueryOutputFormat, we use the newer
    // IndirectBigQueryOutputFormat, which works by first buffering all the data
    // into a Cloud Storage temporary file, and then on commitJob, copies all data from
    // Cloud Storage into BigQuery in one operation. Its use is recommended for large jobs
    // since it only requires one BigQuery "load" job per Hadoop/Spark job, as
    // compared to BigQueryOutputFormat, which performs one BigQuery job for each
    // Hadoop/Spark task.
    job.setOutputFormatClass(IndirectBigQueryOutputFormat.class);

    job.waitForCompletion(true);

    // After the job completes, clean up the Cloud Storage export paths.
    GsonBigQueryInputFormat.cleanupJob(job.getConfiguration(), job.getJobID());

    // You can view word counts in the BigQuery output table at
    // https://console.cloud.google.com/.
  }
}

Versão do Java

O conector do BigQuery exige o Java 8.

Informações de dependências do Apache Maven

<dependency>
    <groupId>com.google.cloud.bigdataoss</groupId>
    <artifactId>bigquery-connector</artifactId>
    <version>insert "hadoopX-X.X.X" connector version number here</version>
</dependency>

Para informações mais detalhadas, consulte as Notas de lançamento do conector do BigQuery e a referência do Javadoc.