Esta página foi traduzida pela API Cloud Translation.
Switch to English

Ferramenta Variant Transforms

Variant Transforms é uma ferramenta de código aberto usada com o Cloud Life Sciences. Ela é baseada no Apache Beam e usa o Dataflow.

Essa ferramenta permite transformar e carregar centenas de milhares de arquivos, milhões de amostras e bilhões de registros de maneira escalonável. A ferramenta também tem um pré-processador que pode ser usado para validar arquivos VCF e identificar inconsistências.

O fluxo de trabalho típico para usar a ferramenta consiste nas seguintes etapas:

  1. Armazenar arquivos VCF brutos no Cloud Storage.
  2. Usar a ferramenta Variant Transforms para carregar os arquivos VCF do Cloud Storage no BigQuery.

Você pode usar o BigQuery para analisar as variantes.

Conheça o esquema de variantes do BigQuery para saber como a ferramenta carrega arquivos VCF nas tabelas do BigQuery.