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Dataproc Python-Umgebung konfigurieren

PySpark-Jobs auf Dataproc werden von einem Python-Interpreter auf dem Cluster ausgeführt. Jobcode muss zur Laufzeit mit der Python-Interpreter-Version kompatibel sein und Abhängigkeiten.

Dolmetscherversion und Module prüfen

Das folgende Beispielprogramm check_python_env.py prüft den Linux-Nutzer, der den Job ausführt, den Python-Interpreter und die verfügbaren Module.

import getpass
import sys
import imp

print('This job is running as "{}".'.format(getpass.getuser()))
print(sys.executable, sys.version_info)
for package in sys.argv[1:]:
  print(imp.find_module(package))

Programm starten

REGION=region
gcloud dataproc jobs submit pyspark check_python_env.py \
    --cluster=my-cluster \
    --region=${REGION} \
    -- pandas scipy

Beispielausgabe

This job is running as "root".
('/usr/bin/python', sys.version_info(major=2, minor=7, micro=13, releaselevel='final', serial=0))
(None, '/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas', ('', '', 5))
(None, '/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/scipy', ('', '', 5))

Dataproc-Image-Python-Umgebungen

In den folgenden Abschnitten werden die Python-Umgebungen Dataproc-Image-Versionscluster

Dataproc-Image-Version 1.5

Miniconda3 ist auf Dataproc 1.5-Clustern installiert. Der Standard-Interpreter ist Python 3.7. Es befindet sich auf der VM-Instanz unter /opt/conda/miniconda3/bin/python3.7. Python 2.7 ist auch unter /usr/bin/python2.7 verfügbar.

Sie können die Pakete conda und pip in der Umgebung base installieren oder Richten Sie Ihre eigene conda-Umgebung im Cluster ein mit Conda-bezogene Clusterattribute.

Um Anaconda3 anstelle von Miniconda3 zu installieren, wählen Sie die Optionale Anaconda-Komponente und installieren Sie die Pakete conda und pip in der Umgebung base oder richten Sie conda-Umgebung im Cluster mithilfe von Conda-bezogene Clusterattribute

Beispiel

REGION=region
gcloud beta dataproc clusters create my-cluster \
    --image-version=1.5 \
    --region=${REGION} \
    --optional-components=ANACONDA \
    --properties=^#^dataproc:conda.packages='pytorch==1.0.1,visions==0.7.1'#dataproc:pip.packages='tokenizers==0.10.1,datasets==1.5.0'

Wenn Sie die optionale Komponente Anaconda3 installieren, wird Miniconda3 aus dem Cluster entfernt und /opt/conda/anaconda3/bin/python3.6 zum Standard-Python-Interpreter für PySpark-Jobs. Sie können die Python-Interpreter-Version der optionalen Komponente nicht ändern.

Wenn Sie Python 2.7 als Standard-Interpreter für Cluster 1.5 verwenden möchten, verwenden Sie nicht die Optionale Anaconda-Komponente beim Erstellen des Clusters. Verwenden Sie stattdessen die Methode Conda-Initialisierungsaktion um Miniconda2 zu installieren Conda-bezogene Clusterattribute um die Pakete conda und pip in der Umgebung base zu installieren oder Ihr eigene conda-Umgebung im Cluster.

Beispiel

REGION=region
gcloud dataproc clusters create my-cluster \
    --image-version=1.5 \
    --region=${REGION} \
    --metadata='MINICONDA_VARIANT=2' \
    --metadata='MINICONDA_VERSION=latest' \
    --initialization-actions=gs://goog-dataproc-initialization-actions-${REGION}/conda/bootstrap-conda.sh \
    --properties=^#^dataproc:conda.packages='pytorch==1.0.1,visions==0.7.1'#dataproc:pip.packages='tokenizers==0.10.1,datasets==1.5.0'

Dataproc-Image-Version 2.x

conda ist installiert auf Dataproc 2.x-Cluster Der standardmäßige Python3-Interpreter auf der VM-Instanz unter /opt/conda/default/bin. Auf den folgenden Seiten Die in Dataproc-Image-Versionen enthaltene Python-Version:

Der nicht standardmäßige Python-Interpreter aus dem Betriebssystem ist unter /usr/bin/ verfügbar.

Sie können die Pakete conda und pip in der Umgebung base installieren oder Ihr eigene conda-Umgebung im Cluster mithilfe von Conda-bezogene Clusterattribute.

Beispiel

REGION=region
gcloud dataproc clusters create my-cluster \
    --image-version=2.0 \
    --region=${REGION} \
    --properties=^#^dataproc:conda.packages='pytorch==1.7.1,coverage==5.5'#dataproc:pip.packages='tokenizers==0.10.1,datasets==1.5.0'

Hinweis: Anaconda ist für Dataproc 2.0-Cluster nicht verfügbar.

Python-Interpreter für einen Job auswählen

Wenn in Ihrem Cluster mehrere Python-Interpreter installiert sind, führt das System /etc/profile.d/effective-python.sh aus. Dabei wird die Umgebungsvariable PYSPARK_PYTHON exportiert, um den Standard-Python-Interpreter für Ihre PySpark-Jobs auszuwählen. Wenn Sie für einen PySpark-Job einen nicht standardmäßigen Python-Interpreter benötigen, legen Sie beim Senden des Jobs an den Cluster die Attribute spark.pyspark.python und spark.pyspark.driver.python auf die erforderliche Python-Versionsnummer fest (zum Beispiel "python2.7" oder "python3.6").

Beispiel

REGION=region
gcloud dataproc jobs submit pyspark check_python_env.py \
    --cluster=my-cluster \
    --region=${REGION} \
    --properties="spark.pyspark.python=python2.7,spark.pyspark.driver.python=python2.7"

Python mit Sudo

Wenn Sie eine SSH-Verbindung zu einem Clusterknoten herstellen, auf dem Miniconda oder Anaconda installiert ist, und sudo python --version ausführen, kann sich die angezeigte Python-Version von python --version unterscheiden. Dieser Versionsunterschied kann auftreten, weil sudo das Standardsystem Python /usr/bin/python verwendet und /etc/profile.d/effective-python.sh nicht ausführt, um die Python-Umgebung zu initialisieren. Wenn Sie sudo verwenden möchten, suchen Sie nach dem Python-Pfad, der in /etc/profile.d/effective-python.sh festgelegt ist. Führen Sie dann den Befehl env aus, um PATH auf diesen Python-Pfad festzulegen. Hier ein Beispiel für einen 1,5-Cluster:

sudo env PATH=/opt/conda/default/bin:${PATH} python --version

Conda-bezogene Clusterattribute verwenden

Sie können die conda-Umgebung während der Clustererstellung mit conda-bezogenen Einstellungen anpassen Clusterattribute.

Es gibt zwei sich gegenseitig ausschließende Möglichkeiten, die Conda-Umgebung anzupassen, erstellen Sie einen Dataproc-Cluster:

Verwenden Sie zum Erstellen und Aktivieren das Clusterattribut dataproc:conda.env.config.uri eine neue Conda-Umgebung im Cluster erstellt. oder
Die Cluster dataproc:conda.packages und dataproc:pip.packages verwenden Properties conda- bzw. pip-Pakete zu conda base hinzufügen. Umgebung im Cluster.

Conda-bezogene Clusterattribute

dataproc:conda.env.config.uri:Der absolute Pfad zu einem YAML-Konfigurationsdatei für die Conda-Umgebung in Cloud Storage. Diese Datei wird zum Erstellen und Aktivieren einer neuen conda-Umgebung im Cluster verwendet.

Hinweis: Das Clusterattribut dataproc:conda.env.config.uri kann nicht mit dataproc:conda.packages- oder dataproc:pip.packages- Clusterattributen verwendet werden.

Beispiel:
1. Rufen Sie eine Conda-environment.yaml-Konfigurationsdatei ab oder erstellen Sie eine. Sie können manuelle Erstellung Datei Sie verwenden eine vorhandene Datei oder Vorhandene Conda-Umgebung exportieren) in eine environment.yaml-Datei umwandeln, wie unten gezeigt.
```
conda env export --name=env-name > environment.yaml
```
  .
2. Kopieren Sie die Konfigurationsdatei in Ihren Cloud Storage-Bucket.
```
gcloud storage cp environment.yaml gs://bucket-name/environment.yaml
```
3. Erstellen Sie den Cluster und verweisen Sie auf die Konfigurationsdatei der Umgebung in Cloud Storage.
```
REGION=region
gcloud dataproc clusters create cluster-name \
    --region=${REGION} \
    --properties='dataproc:conda.env.config.uri=gs://bucket-name/environment.yaml' \
    ... other flags ...
```
dataproc:conda.packages:Eine Liste von condaPaketen mit bestimmten Versionen, die in der Basisumgebung installiert werden sollen, formatiert als pkg1==v1,pkg2==v2... Wenn conda nicht aufgelöst werden kann mit vorhandenen Paketen in der Basisumgebung in Konflikt steht, werden nicht installiert.

Hinweise:
- Die Clusterattribute dataproc:conda.packages und dataproc:pip.packages können nicht mit dem Clusterattribut dataproc:conda.env.config.uri verwendet werden.
- Wenn Sie mehrere Pakete angeben (durch ein Komma getrennt), müssen Sie ein alternatives Trennzeichen angeben (siehe Clusterattribut Formatierung). Im folgenden Beispiel wird "#" als Trennzeichen angegeben, um mehrere durch Kommas getrennte Paketnamen an das Attribut dataproc:conda.packages zu übergeben.
Beispiel:

REGION=region
gcloud dataproc clusters create cluster-name \
    --region=${REGION} \
    --properties='^#^dataproc:conda.packages=pytorch==1.7.1,coverage==5.5' \
    ... other flags ...

dataproc:pip.packages:Eine Liste von pip Paketen mit bestimmten Versionen, die in der Basisumgebung installiert werden sollen, formatiert als pkg1==v1,pkg2==v2... „pip“ aktualisiert vorhandene Abhängigkeiten nur, wenn erforderlich. Konflikte können dazu führen, dass die Umgebung inkonsistent ist.

Hinweise:
- Die Clusterattribute dataproc:pip.packages und dataproc:conda.packages können nicht mit dem Clusterattribut dataproc:conda.env.config.uri verwendet werden.
- Wenn Sie mehrere Pakete angeben (durch ein Komma getrennt), müssen Sie ein alternatives Trennzeichen angeben (siehe Clusterattribut Formatierung). Im folgenden Beispiel wird "#" als Trennzeichen angegeben, um mehrere durch Kommas getrennte Paketnamen an das Attribut dataproc:pip.packages zu übergeben.
Example:

REGION=region
gcloud dataproc clusters create cluster-name \
    --region=${REGION} \
    --properties='^#^dataproc:pip.packages=tokenizers==0.10.1,datasets==1.4.1' \
    ... other flags ...

Sie können beim Erstellen eines Clusters sowohl dataproc:conda.packages als auch dataproc:pip.packages verwenden.

Example:

REGION=region
gcloud dataproc clusters create cluster-name \
    --region=${REGION} \
    --image-version=1.5 \
    --metadata='MINICONDA_VARIANT=2' \
    --metadata='MINICONDA_VERSION=latest' \
    --properties=^#^dataproc:conda.packages='pytorch==1.7.1,coverage==5.5'#dataproc:pip.packages='tokenizers==0.10.1,datasets==1.4.1' \
    ... other flags ...