Auf dieser Seite wird erläutert, wie Sie mit der v1beta1-Konfiguration DicomTagConfig
in der Cloud Healthcare API sensible Daten in DICOM-Instanzen auf den folgenden Ebenen de-identifizieren:
- Auf Dataset-Ebene mit
datasets.deidentify
- Auf DICOM-Speicherebene mit
dicomStores.deidentify
Auf dieser Seite wird auch erläutert, wie Sie Filter anwenden, wenn Sie Daten auf DICOM-Speicherebene de-identifizieren.
Sie können DICOM-De-Identifikationsvorgänge entweder mit dem Legacy-v1-Objekt DicomConfig
oder dem v1beta1-Objekt DicomTagConfig
konfigurieren. Wir empfehlen dringend die Verwendung von DicomTagConfig
.
Wenn Sie bereits DicomConfig
für Ihre De-Identifikationsvorgänge verwenden, empfehlen wir Ihnen, zu DicomTagConfig
zu migrieren. Eine Zusammenfassung der neuen Funktionen finden Sie unter Neue Konfigurationsoptionen in DicomTagConfig
.
Eine Anleitung zur Migration finden Sie unter Anfragen und Antworten zur Verwendung von DicomTagConfig
migrieren.
Neue Konfigurationsoptionen in DicomTagConfig
Text mit kontextbezogener De-Identifikation de-identifizieren
Sie können das Objekt DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
so konfigurieren, dass die kontextbezogene De-Identifikation von unstrukturiertem Metadatentext aktiviert wird.
Diese Option basiert auf der Option „Clean Descriptors“.
Wenn Sie DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
angeben, wird bei der Prüfung ein zusätzlicher infoType verwendet, der sich auf die Abrechnungskosten auswirken kann.
Mit der Option DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
wird jeder unstrukturierte Metadatentext umgewandelt, der mit entfernten Tags übereinstimmt. Dadurch wird die Qualität der De-Identifikation verbessert. Angenommen, Sie de-identifizieren ein Röntgenbild und der Röntgenpatient hat einen Nachnamen, der auch ein Substantiv ist, z. B. Wall
. Wenn Metadaten in der Instanz, z. B. der Text in StudyDescription
, das Wort Wall
enthalten, wird der Text transformiert.
Mit der Option CleanDescriptorsOption
werden kontextbezogene Wortgruppen entfernt, die mit Tags übereinstimmen, die im DICOM-Basisprofil zum Entfernen markiert sind, sofern die Tags mit einem der folgenden Aktionscodes übereinstimmen:
D
Z
X
U
Übereinstimmende kontextbezogene Wortgruppen werden durch das Token [CTX]
ersetzt.
Sie können konfigurieren, welche Tags entfernt werden, indem Sie Folgendes angeben:
- Ein Enum im Objekt
ProfileType
. Es ist nicht erforderlich, eine Aufzählung anzugeben. - Mit dem Filter
CleanTextTag
können Sie nach bestimmten Tags filtern.
Die im DICOM-Basisprofil verwendeten Tags können jedoch nicht geändert werden.
Eingebrannten Text mit kontextabhängiger De-Identifikation entfernen
Sie können die Enum TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
angeben, um die kontextabhängige De-Identifikation von eingebrannten Text in einem Bild zu aktivieren.
Diese Option basiert auf der Option „Clean Descriptors“.
Wenn Sie die Aufzählung TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
angeben, wird während der Prüfung ein zusätzlicher infoType verwendet, der sich auf die Abrechnungskosten auswirken kann.
Sie können die Aufzählung TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
auf folgende Arten angeben:
In einem
Options.ImageConfig
-Objekt mitDicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
. Wenn Sie diese Option angeben, wird das TagPixelData (7FE0,0010)
automatisch der Liste der zu entfernenden Tags hinzugefügt.In einem
Action.CleanImageTag
-Objekt mitDicomTagConfig.Action.CleanImageTag.TextRedactionMode
. Wenn Sie diese Option angeben, müssen Sie dasPixelData
-Tag manuell demAction.queries[]
-Array hinzufügen. Bei Verwendung vonAction.CleanImageTag
wird nur das TagPixelData
unterstützt.
Mit der Option TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
wird der eingebrannte Text entfernt, der mit allen Tags übereinstimmt, die im DICOM-Basisprofil zum Entfernen markiert sind, sofern die Tags mit einem der folgenden Aktionscodes übereinstimmen:
D
Z
X
U
Für die kontextbezogene De-Identifikation von eingebranntem Text ist nur eine Aktivierung oder Deaktivierung mit einer Aufzählung im ProfileType
-Objekt erforderlich. Es ist nicht erforderlich, eine Aufzählung anzugeben.
Zusätzliche infoTypes bei der De-Identifikation von Bildern
Sie können mit Informationstypen (infoTypes) angeben, nach welchen Daten bei der De-Identifikation von Tags gesucht werden soll. Ein infoType ist ein Typ sensibler Daten wie Patientenname, E-Mail-Adresse, Telefonnummer, Sozialversicherungsnummer oder Kreditkartennummer.
Sie können die folgenden Felder im Objekt DicomTagConfig.Options.ImageConfig
konfigurieren, um zu bestimmen, welche infoTypes bei der De-Identifikation von DICOM-Bildern verwendet werden sollen:
Diese Felder sind nur wirksam, wenn DicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
auf einen der folgenden Werte festgelegt ist:
Anfragen und Antworten zur Verwendung von DicomTagConfig
migrieren
Sie können die DICOM-De-Identifikation mit DicomTagConfig
konfigurieren. Diese ist in der Cloud Healthcare API v1beta1 verfügbar und eine Alternative zur Verwendung des Legacy-DicomConfig
.
Beim Senden einer Anfrage können Sie nicht sowohl DicomConfig
als auch DicomTagConfig
angeben.
In den folgenden Abschnitten werden Konfigurationen in DicomConfig
und deren Migration zu DicomTagConfig
beschrieben.
TagFilterProfile
bis ProfileType
Ersetzen Sie das Objekt DicomConfig
TagFilterProfile
durch das Objekt DicomTagConfig
ProfileType
. Dieselben vier Profile in TagFilterProfileType
sind in ProfileType
verfügbar.
Das folgende Beispiel zeigt, wie Sie eine Anfrage von TagFilterProfile
zu ProfileType
migrieren:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
keepList
und removeList
Die Felder DicomConfig
keepList
und removeList
sind in DicomTagConfig
nicht mehr verfügbar. Wenn Sie anstelle eines Profils keepList
und removeList
verwendet haben, um Tags anzugeben, die beibehalten oder entfernt werden sollen, müssen Sie zum neuen Action
-Objekt migrieren, in dem Sie das Tag-Verhalten festlegen. Das Action
-Objekt bietet zusätzliche Optionen zum Transformieren von Tags.
Das folgende Beispiel zeigt, wie Sie eine Anfrage von keepList
zu Action.keepTag
migrieren. Die Anfrage gibt an, dass der Wert des Tags PatientID
während des De-Identifikationsvorgangs beibehalten wird.
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
Keep-Listen, Entfernungslisten und Profile kombinieren
Im Objekt DicomConfig
können Sie anhand von Keeplists, Entfernungslisten und Profilen festlegen, ob Daten beibehalten oder entfernt werden sollen. Diese Optionen schließen sich gegenseitig aus.
Wenn Sie das DicomTagConfig
-Objekt verwenden, können Sie diese Optionen kombinieren. Geben Sie dazu an, welche Tags in einem Action
-Objekt beibehalten und entfernt werden sollen, und geben Sie gleichzeitig ein Profil in ProfileType
an.
Optionen, die im Objekt Action
konfiguriert sind, überschreiben die im Profil ProfileType
konfigurierten Optionen. Die Optionen im Action
-Objekt werden in der Reihenfolge angewendet, in der sie in der Anfrage angegeben sind.
skipIdRedaction
bis Objects.primaryIds
Ersetzen Sie das Feld skipIdRedaction
im Objekt DicomConfig
durch das Feld primaryIds
im Objekt DicomTagConfig
. Das Feld primaryIds
im Objekt Options
enthält ein Objekt PrimaryIdsOption
, in dem Sie eine der folgenden Enums angeben:
PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
: Standardverhalten, wenn fürPrimaryIdsOption
kein Wert angegeben wird. Die Standardeinstellung ist die inProfileType
angegebene Option.KEEP
: Lassen Sie die primären IDs unverändert.REGEN
: Generieren Sie die primären IDs neu.
Das folgende Beispiel zeigt, wie Sie eine Anfrage von skipIdRedaction
zu Options.primaryIds
migrieren. Die Anfrage gibt an, dass die Werte der primären IDs während des De-Identifikationsvorgangs beibehalten werden:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
DeidentifyConfig.ImageConfig
bis DicomTagConfig.Options.ImageConfig
Ersetzen Sie das Objekt DeidentifyConfig.ImageConfig
durch das Objekt DicomTagConfig.Options.ImageConfig
.
Die Optionen im ImageConfig
-Objekt sind in beiden Versionen identisch.
Das folgende Beispiel zeigt, wie Sie eine Anfrage von der Verwendung eines ImageConfig
in DeidentifyConfig.image
zu einer ImageConfig
in DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage
migrieren.
Die Anfrage gibt an, dass der gesamte Text in einem Bild während des De-Identifikationsvorgangs entfernt werden soll:
DeidentifyConfig.image | DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage |
---|---|
|
|
Übersicht über die De-Identifikation
De-Identifikation auf Dataset-Ebene
Rufen Sie die Methode datasets.deidentify
auf, um DICOM-Daten auf Dataset-Ebene zu de-identifizieren. Die Methode datasets.deidentify
hat die folgenden Komponenten:
- Das Quell-Dataset: Ein Dataset, das DICOM-Speicher mit einer oder mehreren Instanzen enthält, die sensible Daten enthalten. Wenn Sie die Methode
datasets.deidentify
aufrufen, werden alle Instanzen in allen DICOM-Speichern im Dataset de-identifiziert. - Ziel-Dataset: Die De-Identifikation wirkt sich nicht auf das ursprüngliche Dataset oder seine Daten aus. Stattdessen werden de-identifizierte Kopien der ursprünglichen Daten in ein neues Dataset geschrieben, das als Ziel-Dataset bezeichnet wird.
- Zu de-identifizierende Elemente: Konfigurationsparameter, die angeben, wie die DICOM-Daten im Dataset verarbeitet werden sollen. Sie können die DICOM-De-Identifikation konfigurieren, um DICOM-Instanzmetadaten (mithilfe von Tag-Keywords) oder eingebrannten Text in DICOM-Bildern zu de-identifizieren. Dazu geben Sie diese Parameter in einem
DeidentifyConfig
-Objekt an.
Die meisten Beispiele in diesem Leitfaden zeigen, wie DICOM-Daten auf Dataset-Ebene de-identifiziert werden.
DICOM-De-Identifikation auf Speicherebene
Wenn Sie DICOM-Daten auf DICOM-Speicherebene de-identifizieren, können Sie besser steuern, welche Daten de-identifiziert werden. Wenn Sie beispielsweise ein Dataset mit mehreren DICOM-Speichern haben, können Sie die De-Identifikation jedes DICOM-Speichers entsprechend dem jeweiligen Datentyp aufheben.
Rufen Sie die Methode dicomStores.deidentify
auf, um DICOM-Daten in einem DICOM-Speicher zu de-identifizieren. Die Methode dicomStores.deidentify
hat die folgenden Komponenten:
- Der DICOM-Speicher für Quellen: Ein DICOM-Speicher mit einer oder mehreren Instanzen, die vertrauliche Daten enthalten. Wenn Sie den Vorgang
dicomStores.deidentify
aufrufen, werden alle Instanzen im DICOM-Speicher de-identifiziert. - Der Ziel-DICOM-Speicher: Die De-Identifikation wirkt sich nicht auf den ursprünglichen DICOM-Speicher oder seine Daten aus. Stattdessen werden de-identifizierte Kopien der Originaldaten in den DICOM-Zielspeicher geschrieben. Der DICOM-Zielspeicher muss bereits vorhanden sein.
- Zu de-identifizierende Elemente: Konfigurationsparameter, die angeben, wie der DICOM-Speicher verarbeitet werden soll. Sie können die DICOM-De-Identifikation konfigurieren, um DICOM-Instanzmetadaten (mithilfe von Tag-Keywords) oder eingebrannten Text in DICOM-Bildern zu de-identifizieren. Dazu geben Sie diese Parameter in einem
DeidentifyConfig
-Objekt an.
Ein Beispiel zum De-Identifizieren von DICOM-Daten auf DICOM-Speicherebene finden Sie unter Daten auf DICOM-Speicherebene de-identifizieren.
Filter
Wenn Sie DICOM-Daten auf DICOM-Speicherebene de-identifizieren, können Sie eine Teilmenge der Daten im DICOM-Speicher de-identifizieren, indem Sie eine Filterdatei konfigurieren und die Datei in der dicomStores.deidentify
-Anfrage angeben. Ein Beispiel finden Sie unter Teilmenge eines DICOM-Speichers de-identifizieren.
Beispiele – Übersicht
In den Beispielen in diesem Leitfaden wird eine einzelne DICOM-Instanz mit dem Namen dicom_deid_instance_sample.dcm
verwendet. Sie können jedoch auch mehrere Instanzen de-identifizieren. Wenn Sie die DICOM-Beispielinstanz in den Beispielen auf dieser Seite verwenden möchten, laden Sie die Datei auf Ihren lokalen Computer herunter und folgen Sie der Anleitung unter DICOM-Daten speichern, um sie in einem DICOM-Speicher zu speichern.
Die folgenden Abschnitte zeigen, wie das Bild in der DICOM-Instanz aussieht und die Metadaten in der Instanz.
Beispielbild
Einige Beispiele auf dieser Seite enthalten eine Ausgabe des de-identifizierten Bilds. In jedem Beispiel wird das folgende Originalbild als Eingabe verwendet. Sie können das Ausgabebild jedes De-Identifikationsvorgangs mit diesem Originalbild vergleichen, um die Auswirkungen des Vorgangs zu sehen:
Beispielmetadaten
Die meisten Beispiele auf dieser Seite enthalten eine Ausgabe der geänderten Metadaten in der DICOM-Instanz. In jedem Beispiel werden die folgenden ursprünglichen Metadaten als Eingabe verwendet. Sie können die Ausgabemetadaten jedes De-Identifikationsvorgangs mit diesen ursprünglichen Metadaten vergleichen, um die Auswirkungen der De-Identifikation zu sehen:
[
{
"00020002": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00020003": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00020010": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.1.2.4.50"
]
},
"00020012": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.0.3.6.1"
]
},
"00020013": {
"vr": "SH",
"Value": [
"OFFIS_DCMTK_361"
]
},
"00080005": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_IR 100"
]
},
"00080016": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00080018": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00080020": {
"vr": "DA",
"Value": [
"20110909"
]
},
"00080030": {
"vr": "TM",
"Value": [
"110032"
]
},
"00080050": {
"vr": "SH"
},
"00080064": {
"vr": "CS",
"Value": [
"WSD"
]
},
"00080070": {
"vr": "LO",
"Value": [
"Manufacturer"
]
},
"00080090": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "John Doe"
}
]
},
"00081090": {
"vr": "LO",
"Value": [
"ABC1"
]
},
"00100010": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "Ann Johnson"
}
]
},
"00100020": {
"vr": "LO",
"Value": [
"S1214223-1"
]
},
"00100030": {
"vr": "DA",
"Value": [
"19880812"
]
},
"00100040": {
"vr": "CS",
"Value": [
"F"
]
},
"0020000D": {
"vr": "UI",
"Value": [
"2.25.70541616638819138568043293671559322355"
]
},
"0020000E": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694"
]
},
"00200010": {
"vr": "SH"
},
"00200011": {
"vr": "IS"
},
"00200013": {
"vr": "IS"
},
"00200020": {
"vr": "CS"
},
"00280002": {
"vr": "US",
"Value": [
3
]
},
"00280004": {
"vr": "CS",
"Value": [
"YBR_FULL_422"
]
},
"00280006": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00280010": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280011": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280100": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280101": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280102": {
"vr": "US",
"Value": [
7
]
},
"00280103": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00282110": {
"vr": "CS",
"Value": [
"01"
]
},
"00282114": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_10918_1"
]
}
}
]
Eingebrannten Text aus Bildern entfernen
Sie können eingebrannten Text in DICOM-Bildern mit dem Objekt ImageConfig
in einem Action
-Objekt de-identifizieren. In ImageConfig
können Sie angeben, welche infoTypes ein- oder ausgeschlossen werden sollen und wie Text mithilfe des Objekts TextRedactionMode
entfernt werden soll.
Gesamten Text entfernen
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie eine DICOM-Instanz de-identifizieren, indem Sie TextRedactionMode
auf REDACT_ALL_TEXT
setzen.
Bei dieser Konfiguration wird der gesamte eingebrannte Text im Bild entfernt.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Nach der De-Identifikation des Images mit REDACT_ALL_TEXT
sieht das Image so aus. Sie sehen, dass der gesamte eingebrannte Text unten im Bild entfernt wurde.
Vertraulichen Text mit der Option „Deskriptoren bereinigen“ entfernen
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie eine DICOM-Instanz de-identifizieren, indem Sie TextRedactionMode
auf REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
setzen.
Weitere Informationen zur Option CleanDescriptorsOption
finden Sie unter Text mit kontextbezogener De-Identifikation de-identifizieren.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Nach der De-Identifikation des Images mit REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
sieht das Image so aus. Beachten Sie, dass nicht der gesamte eingebrannte Text am unteren Rand des Bildes entfernt wurde. Der Text Female
wird weiterhin angezeigt, da PatientSex (0010,0040)
keiner der Standard-DICOM-infoTypes ist.
DICOM-Tags de-identifizieren
Sie können DICOM-Instanzen anhand von Tag-Keywords in den DICOM-Metadaten de-identifizieren.
Die folgenden Tag-Filtermethoden sind im DicomTagConfig
-Objekt Action
verfügbar:
Sie geben jede Action
-Option als Liste von DICOM-Tag-IDs, -Namen oder -Wertdarstellungen an. Anschließend führt die Option eine Aktion für die Tags in der Liste aus. Sie können in einer Liste von Tags nicht mehr als eine Action
-Option angeben.
Jedes Action
-Objekt stellt eine queries[]
-Liste bereit, in der Sie eine Liste von Tags angeben. Folgende Tag-Formate werden unterstützt:
- Tag-IDs, z. B.
"00100010"
- Tag-Namen, z. B.
"PatientName"
- Wertdarstellungen (VRs), wie
"PN"
Die Anzahl der Tags, die in der queries[]
-Liste angegeben werden können, ist nicht begrenzt.
Für jedes Tag kann jedoch nur eine einzige Action
-Option ausgeführt werden.
Wenn Sie verschiedene Tags angeben möchten, für die unterschiedliche Action
-Optionen ausgeführt werden, müssen Sie mehrere Action
-Objekte angeben.
Tags beibehalten
Wenn Sie verhindern möchten, dass Tag-Werte entfernt werden, geben Sie die Tags in einem KeepTag
-Objekt im DicomTagConfig
-Objekt an.
Damit Sie bei Verwendung eines KeepTag
-Objekts ein gültiges DICOM-Objekt erstellen können, geben Sie im Objekt ProfileType
die Werte MINIMAL_KEEP_LIST_PROFILE
oder DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS
an.
Wenn Sie eines dieser Profile angeben, werden die folgenden Tags automatisch beibehalten. Dadurch wird sichergestellt, dass die de-identifizierte DICOM-Instanz ein gültiges DICOM-Element ist:
StudyInstanceUID
SeriesInstanceUID
SOPInstanceUID
TransferSyntaxUID
MediaStorageSOPInstanceUID
MediaStorageSOPClassUID
PixelData
Rows
Columns
SamplesPerPixel
BitsAllocated
BitsStored
Highbit
PhotometricInterpretation
PixelRepresentation
NumberOfFrames
PlanarConfiguration
PixelAspectRatio
SmallestImagePixelValue
LargestImagePixelValue
RedPaletteColorLookupTableDescriptor
GreenPaletteColorLookupTableDescriptor
BluePaletteColorLookupTableDescriptor
RedPaletteColorLookupTableData
GreenPaletteColorLookupTableData
BluePaletteColorLookupTableData
ICCProfile
ColorSpace
WindowCenter
WindowWidth
VOILUTFunction
Die Werte für einige der vorhergehenden Tags werden neu generiert. Dies bedeutet, dass die Werte durch eine deterministische Transformation durch einen anderen Wert ersetzt werden. Weitere Informationen finden Sie unter Option zum Beibehalten von UIDs im DICOM-Standard.
Die Werte von StudyInstanceUID
, SeriesInstanceUID
, SOPInstanceUID
und MediaStorageSOPInstanceUID
werden als "primäre IDs" bezeichnet. Geben Sie in PrimaryIdsOption
einen Wert an, um zu bestimmen, wie primäre IDs transformiert werden.
Die folgenden Beispiele zeigen, wie das Objekt KeepTag
verwendet wird, um die Werte bestimmter Tags während der De-Identifikation unverändert zu lassen.
Das Tag PatientName
wird der Liste queries[]
hinzugefügt, sodass der Wert PatientName
bei der De-Identifikation nicht entfernt wird.
Da PrimaryIdsOption
im Beispiel nicht angegeben ist, wird standardmäßig für das Feld primaryIds
der Wert PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
verwendet, also der Wert aus ProfileType
. Da ProfileType
ebenfalls nicht angegeben ist, wird für das Feld profileType
standardmäßig PROFILE_TYPE_UNSPECIFIED
verwendet. Dadurch werden Tags auf Grundlage des Basisprofils der Attributvertraulichkeit (DICOM-Standardversion 2018) entfernt.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Tags entfernen
Die folgenden Beispiele zeigen, wie das Objekt RemoveTag
verwendet wird, um die Werte bestimmter Tags während der De-Identifikation zu entfernen. Ein entferntes Tag wird durch einen leeren Wert ersetzt.
In den folgenden Beispielen wird das Tag PatientName
der Liste queries[]
hinzugefügt, sodass sein Wert während der De-Identifikation durch einen leeren Wert ersetzt wird.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Tags löschen
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie mit dem Objekt DeleteTag
während der De-Identifikation bestimmte Tags löschen.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Tags auf Platzhalterwert zurücksetzen
Die folgenden Beispiele zeigen, wie das Objekt ResetTag
verwendet wird, um den Wert von Tags während der De-Identifikation auf den String PLACEHOLDER
festzulegen.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Beachten Sie insbesondere, dass der Wert des Tags
PatientName
aufPLACEHOLDER
festgelegt ist:Original metadata
Metadaten nach der Ausführung von ResetTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "PLACEHOLDER" } ] }
Vertraulichen Text in Tags prüfen und umwandeln
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie mit dem CleanTextTag
-Objekt Tags prüfen und die Werte der Tags entsprechend der Konfiguration im Objekt TextConfig
transformieren.
In diesen Beispielen werden die folgenden Optionen im Actions
-Objekt festgelegt:
- Ein
CleanTextTag
-Objekt. - Eine
queries[]
-Liste, die das DICOM-TagPatientName
enthält.
Die folgenden Optionen werden im TextConfig
-Objekt festgelegt:
- Ein
InfoTypeTransformation
-Objekt, das Text umwandelt, der einem bestimmten infoType entspricht. - Ein
ReplaceWithInfoTypeConfig
-Objekt, das übereinstimmende Texte durch den Namen des infoType ersetzt. - Eine
infoTypes[]
-Liste, die den infoTypePERSON_NAME
enthält.
Wenn diese Konfigurationen konfiguriert sind, prüft der De-Identifikationsvorgang das Tag PatientName
, gleicht das Tag mit dem infoType PERSON_NAME
ab und ersetzt den Wert des Tags durch den infoType PERSON_NAME
.
Das Tag PatientName
hat die Wertdarstellung (VR) PN
, eine der unterstützten VRs im CleanTextTag
-Objekt.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Beachten Sie insbesondere, dass der Wert des Tags
PatientName
auf[PERSON_NAME]
festgelegt ist:Original metadata
Metadaten nach der Ausführung von CleanTextTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "[PERSON_NAME]" } ] }
UID durch eine generierte UID ersetzen
Die folgenden Beispiele zeigen, wie das Objekt RegenUidTag
verwendet wird, um eine UID durch eine neu generierte UID zu ersetzen. Die einzige VR, die vom RegenUidTag
-Objekt unterstützt wird, ist UI
.
Standardmäßig wird bei jedem Tag in den Beispielmetadaten mit einer VR von UI
während der De-Identifikation eine UID generiert. Im Beispiel werden die folgenden Optionen festgelegt, um zu zeigen, wie eine UID für ein bestimmtes Tag generiert wird:
ProfileType
ist aufKEEP_ALL
-Enum gesetzt, wodurch verhindert wird, dass DICOM-Metadaten de-identifiziert werden.PrimaryIdsOption
ist aufKEEP
festgelegt. Die primären IDs (StudyInstanceUID
,SeriesInstanceUID
,SOPInstanceUID
undMediaStorageSOPInstanceUID
) bleiben unverändert.
Wenn diese Optionen festgelegt sind, wird keine der primären ID-UIDs in den Beispieldaten durch neu generierte Werte ersetzt. Wenn Sie jedoch SOPInstanceUID
zum Action.queries[]
-Array hinzufügen, können Sie eine neue UID speziell für das SOPInstanceUID
-Tag generieren.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Instanz-UID, weil Sie das Tag
SOPInstanceUID
im ArrayAction.queries[]
angegeben haben. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die UID der Instanz geändert hat:
Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mit dem neuen Wert die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Beachten Sie, dass von den primären IDs nur
SOPInstanceUID
eine neu generierte UID hat.
Tags in einem verschachtelten Sequence
rekursiv de-identifizieren
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie mit dem RecurseTag
-Objekt verschachtelte DICOM-Tags in einem Sequence
rekursiv de-identifizieren.
Das Objekt RecurseTag
unterstützt nur die VR-Funktion SQ
, die der VR-Funktion für ein Sequence
entspricht.
Weitere Informationen zur SQ
-VR finden Sie unter 7.5 Verschachteln von Datensätzen.
Die für diese Seite bereitgestellte DICOM-Beispielinstanz enthält keine DICOM-Tags mit einer SQ
VR.
Sie können eine DICOM-Instanz mit fiktiven Daten, die die SQ
-VR enthalten, erstellen und speichern. Führen Sie dazu die folgenden Schritte aus, die auf der Anleitung unter DICOM-Instanzen aus JSON-Metadaten und JPEG-Dateien erstellen basieren.
Die DICOM-Instanz, die Sie in den folgenden Schritten erstellen, verwendet fiktive Daten und soll nur das Verhalten von RecurseTag
veranschaulichen.
Speichern Sie die folgenden DICOM-Metadaten in einer JSON-Datei mit dem Namen
instance.json
. Die Metadaten enthalten einPhysiciansReadingStudyIdentificationSequence
-Tag (00081062
). Das Tag weist eineSQ
-VR auf und enthält zwei verschachteltePersonIdentificationCodeSequence
-Tags (00401101
). Die verschachtelten Tags haben auch eineSQ
-VR und jedes Tag enthält die folgenden verschachtelten Tags:CodeValue
(00080100
)CodingSchemeDesignator
(00080102
)
[{ "00020010": { "vr": "UI", "Value": [ "1.2.840.10008.1.2.4.50" ] }, "00080005": { "vr": "CS", "Value": [ "ISO_IR 192" ] }, "00080016": { "vr": "UI", "Value": [ "1111111" ] }, "00080018": { "vr": "UI", "Value": [ "2222222" ] }, "0020000D": { "vr": "UI", "Value": [ "3333333" ] }, "0020000E": { "vr": "UI", "Value": [ "4444444" ] }, "00280002": { "vr": "US", "Value": [ 3 ] }, "00280004": { "vr": "CS", "Value": [ "YBR_FULL_422" ] }, "00280006": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "00280008": { "vr": "IS", "Value": [ 1 ] }, "00280010": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280011": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280100": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280101": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280102": { "vr": "US", "Value": [ 7 ] }, "00280103": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "7FE00010": { "vr": "OB", "BulkDataURI": "jpeg-image" }, "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue2" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator2" ] } } ] } } ] } }]
Laden Sie die Datei
google.jpg
auf Ihren lokalen Computer herunter. Die DICOMweb API der Cloud Healthcare API akzeptiert jedes JPEG-Bild, das mit JSON-Metadaten gekoppelt ist, solange die Metadaten gültig sind.Führen Sie die folgenden Befehle aus, um ein öffnendes Bild (für die JSON-Metadaten), ein mittleres Bild (für das JPEG-Bild) und ein schließendes Begrenzungsbild im Bild zu erstellen:
echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file
Umschließen Sie das
google.jpg
-Bild innerhalb der mittleren und schließenden Begrenzungen. Die Ausgabedatei, die Sie an die Cloud Healthcare API senden, heißtmultipart-request.file
:cat opening.file instance.json middle.file google.jpg closing.file > multipart-request.file
Speichern Sie die Datei
multipart-request.file
:REST
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
--data-binary @multipart-request.file \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-InFile multipart-request.file `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Führen Sie die folgenden Schritte aus, um die gespeicherte DICOM-Instanz zu de-identifizieren.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
JSON-Text anfordern:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:
Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)3333333
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314
Serien-UID ( 0020000E
)4444444
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347
Instanz-UID ( 00080018
)2222222
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Beachten Sie insbesondere, dass die Werte der verschachtelten Tags
CodeValue
undCodingSchemaDesignator
aufPLACEHOLDER
festgelegt sind:Original metadata
Metadaten nach der Ausführung von RecurseTag
{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [
"CodeValue2"
] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": ["CodingSchemeDesignator2"
] } } ] } } ] } }{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } } ] } }
Daten auf DICOM-Speicherebene de-identifizieren
Die vorherigen Beispiele zeigen, wie DICOM-Daten auf Dataset-Ebene de-identifiziert werden. In diesem Abschnitt wird beschrieben, wie Sie Daten auf der DICOM-Speicherebene de-identifizieren.
Nehmen Sie die folgenden Änderungen vor, um eine Dataset-De-Identifizierungsanfrage in eine DICOM-Store-De-Identifizierungsanfrage zu ändern:
- Ersetzen Sie
destinationDataset
im Anfragetext durchdestinationStore
. - Fügen Sie
dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID
am Ende des Werts indestinationStore
hinzu, wenn Sie das Ziel angeben. - Fügen Sie
dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID
hinzu, wenn Sie den Speicherort der Quelldaten angeben.
Die folgenden Beispiele zeigen eine De-Identifikationsanfrage auf Dataset-Ebene und wie die Anfrage für eine De-Identifikation auf DICOM-Speicherebene geändert wird:
De-Identifikation auf Dataset-Ebene
"destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"
DICOM-De-Identifikation auf Speicherebene
"destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie eine DICOM-Instanz in einem DICOM-Speicher de-identifizieren und die de-identifizierten Daten in einen neuen DICOM-Speicher schreiben. Bevor die Beispiele ausgeführt werden, muss die ID des DICOM-Zielspeichers bereits vorhanden sein.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden. Muss vor dem Ausführen des De-Identifikationsvorgangs bereits vorhanden sein.
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: der DICOM-Speicher im Ziel-Dataset. Muss vor dem Ausführen des De-Identifikationsvorgangs bereits vorhanden sein.
JSON-Text anfordern:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Sie benötigen diesen Wert im nächsten Schritt.Mit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Teilmenge eines DICOM-Speichers de-identifizieren
Um eine Teilmenge der Daten in einem DICOM-Speicher zu de-identifizieren geben Sie einen Filter an.
Der Filter hat die Form einer Filterdatei, die Sie als Wert für das Feld resourcePathsGcsUri
im Objekt DicomFilterConfig
angeben. Die Filterdatei muss in einem Cloud Storage-Bucket vorhanden sein. Sie können keine Filterdatei angeben, die auf Ihrem lokalen Computer oder einer anderen Quelle vorhanden ist. Der Speicherort der Datei muss das Format gs://BUCKET/PATH/TO/FILE
haben.
Filterdatei erstellen
Eine Filterdatei definiert, welche DICOM-Dateien de-identifiziert werden sollen. Sie können Dateien auf den folgenden Ebenen filtern:
- Auf der Studienebene
- Für die Reihe
- Auf Instanzebene
Die Filterdatei besteht aus einer Zeile pro Studie, Serie oder Instanz, die Sie de-identifizieren möchten. Jede Zeile hat das Format /studies/STUDY_UID[/series/SERIES_UID[/instances/INSTANCE_UID]]
.
Am Ende jeder Zeile befindet sich ein Zeilenvorschubzeichen: entweder \n
oder \r\n
.
Wenn eine Studie, Serie oder Instanz in der Filterdatei, die Sie beim Aufrufen des De-Identifikationsvorgangs übergeben haben, nicht angegeben ist, wird diese Studie, Serie oder Instanz nicht de-identifiziert und ist nicht im Ziel-DICOM-Speicher vorhanden.
Nur der Teil /studies/STUDY_UID
des Pfads ist erforderlich. Dies bedeutet, dass Sie eine Studie durch Angabe von /studies/STUDY_UID
de-identifizieren können, oder Sie können eine Reihe durch Angabe von /studies/STUDY_UID/series/SERIES_UID
de-identifizieren.
Betrachten Sie die folgende Filterdatei. Die Filterdatei führt dazu, dass eine Studie, zwei Serien und drei einzelne Instanzen de-identifiziert werden:
/studies/1.123.456.789
/studies/1.666.333.111/series/123.456\n
/studies/1.666.333.111/series/567.890\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/111\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/222\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/333\n
Filterdatei mit BigQuery erstellen
Normalerweise erstellen Sie eine Filterdatei, indem Sie zuerst die Metadaten aus einem DICOM-Speicher in BigQuery exportieren. Sie können BigQuery verwenden, um die Studien-, Series- und Instanz-UIDs der DICOM-Daten in Ihrem DICOM-Speicher anzuzeigen. Danach haben Sie folgende Möglichkeiten:
Fragen Sie die Studien-, Reihen- und Instanz-UIDs ab, an denen Sie interessiert sind. Nachdem Sie beispielsweise die Metadaten in BigQuery exportiert haben, können Sie die folgende Abfrage ausführen, um die Studien-, Serien- und Instanz-UIDs in einem Format zu verketten, das mit den Anforderungen der Filterdatei kompatibel ist:
SELECT CONCAT ('/studies/', StudyInstanceUID, '/series/', SeriesInstanceUID, '/instances/', SOPInstanceUID) FROM [PROJECT_ID:BIGQUERY_DATASET.BIGQUERY_TABLE]
Wenn die Abfrage eine große Ergebnismenge zurückgibt, können Sie eine neue Tabelle materialisieren, indem Sie die Abfrageergebnisse in einer Zieltabelle in BigQuery speichern.
Nachdem Sie die Abfrageergebnisse in der Zieltabelle gespeichert haben, können Sie den Inhalt der Zieltabelle in einer Datei speichern und in Cloud Storage exportieren. Die erforderlichen Schritte finden Sie unter Tabellendaten exportieren. Die exportierte Datei ist Ihre Filterdatei. Sie verwenden den Speicherort der Filterdatei in Cloud Storage, wenn Sie den Filter im Exportvorgang angeben.
Filterdatei manuell erstellen
Sie können eine Filterdatei mit benutzerdefinierten Inhalten erstellen und diese in einen Cloud Storage-Bucket hochladen.
Sie verwenden den Speicherort der Filterdatei in Cloud Storage, wenn Sie den Filter im De-Identifizierungsvorgang angeben. Im folgenden Beispiel wird gezeigt, wie Sie mit dem Befehl gsutil cp
eine Filterdatei in einen Cloud Storage-Bucket hochladen:
gsutil cp PATH/TO/FILTER_FILE gs://BUCKET/DIRECTORY
Beispiel:
gsutil cp /home/user/Desktop/filters.txt gs://my-bucket/my-directory
Filter nutzen
Nachdem Sie die Filterdatei konfiguriert haben, können Sie sie als Wert an das Feld resourcePathsGcsUri
im Objekt filterConfig
übergeben.
Das folgende Beispiel erweitert die De-Identifikation von Daten auf DICOM-Speicherebene. Es wird jedoch eine Filterdatei in Cloud Storage bereitgestellt, um zu bestimmen, welche DICOM-Ressourcen de-identifiziert werden.
REST
De-identifizieren Sie das Dataset.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- LOCATION ist der Standort des Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers, der die zu de-identifizierenden Daten enthält
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset
- BUCKET/PATH/TO/FILE ist der Speicherort der Filterdatei in einem Cloud Storage-Bucket
JSON-Text anfordern:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentMit der Methode
projects.locations.datasets.operations.get
können Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit abrufen.Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- SOURCE_DATASET_ID: die ID des Datasets, das die zu de-identifizierenden Daten enthält
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
"done": true
enthält, ist der Vorgang mit langer Ausführungszeit abgeschlossen.Nach erfolgreicher De-Identifikation können Sie die Metadaten für die de-identifizierte Instanz abrufen, um zu sehen, wie sie geändert wurde. Die de-identifizierte Instanz hat eine neue Studien-UID, Serien-UID und Instanz-UID. Sie müssen also zuerst im neuen Dataset nach der de-identifizierten Instanz suchen.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentSie sollten eine JSON-Antwort ähnlich wie diese erhalten:
Die folgende Tabelle zeigt, wie sich die Studien-UID, die Serien-UID und die Instanz-UID geändert haben:Metadaten der ursprünglichen Instanz De-identifizierte Instanzmetadaten Studien-UID ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
Serien-UID ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
Instanz-UID ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Rufen Sie mithilfe der neuen Werte die Metadaten für die Instanz ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- DESTINATION_DATASET_ID: die ID des Ziel-Datasets, in das de-identifizierte Daten geschrieben werden
- SOURCE_DATASET_LOCATION: der Speicherort des Quell-Datasets
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: die ID des DICOM-Speichers im Ziel-Dataset. Dies entspricht der ID des DICOM-Speichers im Quell-Dataset.
Senden Sie die Anfrage mithilfe einer der folgenden Optionen:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Öffnen Sie die Methodenreferenzseite. Der API Explorer wird rechts auf der Seite geöffnet. Sie können mit diesem Tool interagieren, um Anfragen zu senden. Füllen Sie die Pflichtfelder aus und klicken Sie auf Ausführen.
Fehler bei DICOM-De-Identifikationsvorgängen beheben
Wenn Fehler während einer DICOM-De-Identifikation auftreten, werden die Fehler in Cloud Logging protokolliert. Weitere Informationen finden Sie unter Fehlerlogs in Cloud Logging ansehen.
Wenn der gesamte Vorgang einen Fehler zurückgibt, finden Sie weitere Informationen unter Fehlerbehebung bei Vorgängen mit langer Ausführungszeit.