Auf dieser Seite wird erläutert, wie Sie DICOM-Instanzen nach Cloud Storage exportieren und DICOM-Objekte aus Cloud Storage importieren. Eine DICOM-Instanz ist normalerweise ein Bild, kann aber auch ein anderer nichtflüchtiger Datentyp sein, z. B. ein strukturierter Bericht. Ein DICOM-Objekt in Cloud Storage ist eine DICOM-Instanz, die sich in Cloud Storage befindet. Weitere Informationen finden Sie unter Cloud Storage.
Cloud Storage-Berechtigungen festlegen
Bevor Sie DICOM-Daten in Cloud Storage importieren bzw. daraus exportieren können, müssen Sie dem Dienstkonto Cloud Healthcare Service Agent zusätzliche Berechtigungen erteilen. Weitere Informationen finden Sie unter Cloud Storage-Berechtigungen für DICOM-Speicher.
DICOM-Objekte importieren
Sie können eine der folgenden Methoden verwenden, um mehrere DICOM-Instanzdateien in einen DICOM-Speicher zu importieren:
- Speichern Sie die Daten direkt in einem DICOM-Speicher von Ihrem lokalen Computer aus mithilfe des RESTful-Webdienstes Speichertransaktion, der in der Cloud Healthcare API implementiert ist, programmatisch.
- Laden Sie die DICOM-Daten in einen Cloud Storage-Bucket hoch und importieren Sie die Dateien dann mithilfe eines einzigen Importvorgangs in einen DICOM-Speicher, wie in diesem Abschnitt erläutert.
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie DICOM-Objekte aus einem Cloud Storage-Bucket importieren.
Console
So importieren Sie DICOM-Objekte aus einem Cloud Storage-Bucket:
- Rufen Sie in der Google Cloud Console die Seite Datasets auf.
Zu den Datasets - Klicken Sie auf das Dataset mit dem DICOM-Speicher, in den Sie DICOM-Objekte importieren.
- Wählen Sie aus der Liste der Datenspeicher Importieren aus der Liste Aktionen für den DICOM-Speicher aus.
Die Seite In DICOM-Speicher importieren wird angezeigt. - Wählen Sie in der Liste Projekt ein Cloud Storage-Projekt aus.
- Wählen Sie in der Liste Standort einen Cloud Storage-Bucket aus.
- So legen Sie einen bestimmten Speicherort für den Import von Dateien fest:
- Erweiterte Optionen einblenden.
- Wählen Sie Cloud Storage-Pfad überschreiben aus.
- Wenn Sie eine bestimmte Quelle für den Import von Dateien festlegen möchten, definieren Sie den Pfad mithilfe der folgenden Variablen im Textfeld Speicherort:
*
: entspricht Nicht-Trennzeichen.**
: entspricht Zeichen, einschließlich Trennzeichen. Dies kann mit einer Dateinamenerweiterung verwendet werden, um alle Dateien desselben Typs abzugleichen.?
: entspricht einem Zeichen.
- Klicken Sie auf Importieren, um DICOM-Objekte aus der definierten Quelle zu importieren.
- Klicken Sie auf den Tab Vorgänge, um den Status des Vorgangs zu verfolgen. Wenn der Vorgang abgeschlossen ist, werden folgende Hinweise angezeigt:
- Im Abschnitt Status: Lang andauernder Vorgang befindet sich unter der Überschrift OK ein grünes Häkchen.
- Der Abschnitt Übersicht hat ein grünes Häkchen und einen OK-Indikator in der Zeile, in der sich auch die Vorgangs-ID befindet.
gcloud
Verwenden Sie den Befehl gcloud healthcare dicom-stores import gcs
, um DICOM-Objekte aus einem Cloud Storage-Bucket zu importieren. Geben Sie den Namen des übergeordneten Datasets, den Namen des DICOM-Speichers und den Speicherort des Objekts in einem Cloud Storage-Bucket an.
- Der Speicherort der Dateien im Bucket ist beliebig und muss nicht genau dem im folgenden Beispiel angegebenen Format entsprechen.
- Wenn Sie den Speicherort der DICOM-Objekte in Cloud Storage angeben, können Sie Platzhalter verwenden, um mehrere Dateien aus einem oder mehreren Verzeichnissen zu importieren.
Die folgenden Platzhalter werden unterstützt:
- Verwenden Sie
*
, um null oder mehr Nicht-Trennzeichen abzugleichen. Zum Beispiel stimmtgs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.dcm
mit Example.dcm und Example22.dcm in DIRECTORY überein. - Verwenden Sie
**
, um 0 oder mehr Zeichen (einschließlich Trennzeichen) abzugleichen. Muss am Ende eines Pfads und ohne andere Platzhalter im Pfad verwendet werden. Kann auch mit einer Dateinamenerweiterung wie .dcm verwendet werden, die alle Dateien mit der Dateinamenerweiterung im angegebenen Verzeichnis und in seinen Unterverzeichnissen importiert. Beispiel:gs://BUCKET/DIRECTORY/**.dcm
importiert alle Dateien mit der Endung .dcm in DIRECTORY und seinen Unterverzeichnissen. - Verwenden Sie
?
als Platzhalter für genau 1 Zeichen. Beispiel:gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.dcm
stimmt mit Example1.dcm überein, aber nicht mit Example.dcm oder Example01.dcm.
- Verwenden Sie
Das folgende Beispiel zeigt, wie DICOM-Objekte aus einem Cloud Storage-Bucket importiert werden.
gcloud healthcare dicom-stores import gcs DICOM_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --gcs-uri=gs://BUCKET/DIRECTORY/DICOM_INSTANCE.dcm
In der Befehlszeile wird die Vorgangs-ID angezeigt:
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID
Führen Sie den gcloud healthcare operations describe
-Befehl aus und geben Sie OPERATION_ID aus der Antwort an, um den Status des Vorgangs anzuzeigen:
gcloud healthcare operations describe OPERATION_ID \ --location=LOCATION \ --dataset=DATASET_ID
Nach Abschluss des Befehls enthält die Antwort done: true
.
done: true metadata: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ImportDicomData counter: success: SUCCESSFUL_INSTANCES failure: FAILED_INSTANCES createTime: "CREATE_TIME" endTime: "END_TIME" name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID response: '@type': "..."
API
Verwenden Sie die Methode projects.locations.datasets.dicomStores.import
, um DICOM-Objekte aus einem Cloud Storage-Bucket zu importieren.
- Der Speicherort der Dateien im Bucket kann variieren und muss nicht dem in den folgenden Beispielen angegebenen Format entsprechen.
- Wenn Sie den Speicherort der DICOM-Objekte in Cloud Storage angeben, verwenden Sie Platzhalter, um mehrere Dateien aus einem oder mehreren Verzeichnissen zu importieren.
Die folgenden Platzhalter werden unterstützt:
- Verwenden Sie
*
, um null oder mehr Nicht-Trennzeichen abzugleichen. Zum Beispiel stimmtgs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.dcm
mit Example.dcm und Example22.dcm in DIRECTORY überein. - Verwenden Sie
**
, um 0 oder mehr Zeichen (einschließlich Trennzeichen) abzugleichen. Muss am Ende eines Pfads und ohne andere Platzhalter im Pfad verwendet werden. Kann auch mit einer Dateinamenerweiterung wie .dcm verwendet werden, die alle Dateien mit der Dateinamenerweiterung im angegebenen Verzeichnis und in seinen Unterverzeichnissen importiert. Beispiel:gs://BUCKET/DIRECTORY/**.dcm
importiert alle Dateien mit der Endung .dcm in DIRECTORY und seinen Unterverzeichnissen. - Verwenden Sie
?
als Platzhalter für genau 1 Zeichen. Beispiel:gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.dcm
stimmt mit Example1.dcm überein, aber nicht mit Example.dcm oder Example01.dcm.
- Verwenden Sie
REST
Importieren Sie das DICOM-Objekt.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
PROJECT_ID
ist die ID Ihres Google Cloud-ProjektsLOCATION
ist der Standort des DatasetsDATASET_ID
ist das übergeordnete Dataset des DICOM-SpeichersDICOM_STORE_ID
ist die ID des DICOM-SpeichersBUCKET/PATH/TO/FILE
: der Pfad zum DICOM-Objekt in Cloud Storage
JSON-Text anfordern:
{ "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import" | Select-Object -Expand ContentRufen Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- LOCATION ist der Standort des Datasets
- DATASET_ID: das übergeordnete Dataset des DICOM-Speichers
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content
Go
Java
Node.js
Python
Zum Abrufen einer einzelnen Instanz oder Studie aus einem DICOM-Speicher rufen Sie DICOM-Daten mit dem RESTful-Webdienst Abrufen von Transaktionen ab, der in der Cloud Healthcare API implementiert ist.
Speicherklasse zum Importieren von DICOM-Objekten angeben (Vorschau)
Standardmäßig importiert die Methode projects.locations.datasets.dicomStores.import
ein DICOM-Objekt in einen DICOM-Speicher mit einer Standardspeicherklasse. Sie können die Speicherklasse festlegen, wenn Sie DICOM-Objekte aus Cloud Storage importieren.
Weitere Informationen finden Sie unter DICOM-Speicherklasse ändern.
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie die Speicherklasse angeben, wenn Sie DICOM-Objekte aus Cloud Storage importieren.
REST
Verwenden Sie die Methode projects.locations.datasets.dicomStores.import
.
Importieren Sie das DICOM-Objekt.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
PROJECT_ID
ist die ID Ihres Google Cloud-ProjektsLOCATION
ist der Standort des DatasetsDATASET_ID
ist das übergeordnete Dataset des DICOM-SpeichersDICOM_STORE_ID
ist die ID des DICOM-SpeichersBUCKET/PATH/TO/FILE
: der Pfad zum DICOM-Objekt in Cloud StorageSTORAGE_CLASS
: die Speicherklasse für das DICOM-Objekt im DICOM-Speicher ausSTANDARD
,NEARLINE
,COLDLINE
undARCHIVE
JSON-Text anfordern:
{ "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" }, "blob_storage_settings": { "blob_storage_class": "STORAGE_CLASS" } }
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:cat > request.json << 'EOF' { "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" }, "blob_storage_settings": { "blob_storage_class": "STORAGE_CLASS" } } EOF
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import"PowerShell
Speichern Sie den Anfragetext in einer Datei mit dem Namen
request.json
. Führen Sie folgenden Befehl im Terminal aus, um diese Datei im aktuellen Verzeichnis zu erstellen oder zu überschreiben:@' { "gcsSource": { "uri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE.dcm" }, "blob_storage_settings": { "blob_storage_class": "STORAGE_CLASS" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Führen Sie dann folgenden Befehl aus, um Ihre REST-Anfrage zu senden:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import" | Select-Object -Expand ContentRufen Sie den Status des Vorgangs mit langer Ausführungszeit ab.
Bevor Sie die Anfragedaten verwenden, ersetzen Sie die folgenden Werte:
- PROJECT_ID ist die ID Ihres Google Cloud-Projekts
- LOCATION ist der Standort des Datasets
- DATASET_ID: das übergeordnete Dataset des DICOM-Speichers
- OPERATION_ID ist die ID, die vom lang andauernden Vorgang zurückgegeben wurde
Wenn Sie die Anfrage senden möchten, wählen Sie eine der folgenden Optionen aus:
curl
Führen Sie folgenden Befehl aus:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Führen Sie folgenden Befehl aus:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content
Fehlerbehebung bei DICOM-Importanfragen
Wenn während einer DICOM-Importanfrage Fehler auftreten, werden die Fehler in Cloud Logging protokolliert. Weitere Informationen finden Sie unter Fehlerlogs in Cloud Logging ansehen.
DICOM-Instanzen exportieren
In den folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie DICOM-Instanzen in einen Cloud Storage-Bucket exportieren. Wenn Sie DICOM-Instanzen aus einem DICOM-Speicher exportieren, werden alle Instanzen aus dem Speicher exportiert.
Console
So exportieren Sie DICOM-Instanzen nach Cloud Storage:
- Rufen Sie in der Google Cloud Console die Seite Datasets auf.
Zu den Datasets - Klicken Sie auf das Dataset, das den DICOM-Speicher enthält, aus dem Sie DICOM-Instanzen exportieren.
- Wählen Sie in der Liste der Datenspeicher aus der Liste Aktionen für den DICOM-Speicher Exportieren aus.
- Wählen Sie auf der Seite DICOM-Speicher exportieren die Option Google Cloud Storage-Bucket aus.
- Wählen Sie in der Liste Projekt ein Cloud Storage-Projekt aus.
- Wählen Sie in der Liste Standort einen Cloud Storage-Bucket aus.
- Wählen Sie in den DICOM-Exporteinstellungen den Dateityp aus, mit dem die DICOM-Instanzen exportiert werden sollen. Die folgenden Typen sind verfügbar:
- DICOM-Datei (
.dcm
) - octet-stream
- Bild (
.jpg
,.png
)
- DICOM-Datei (
- Um eine zusätzliche Übertragungssyntax zu definieren, wählen Sie diese aus der Liste Übertragungssyntax aus.
- Klicken Sie auf Exportieren, um DICOM-Instanzen an den definierten Speicherort in Cloud Storage zu exportieren.
- Klicken Sie auf den Tab Vorgänge, um den Status des Vorgangs zu verfolgen. Wenn der Vorgang abgeschlossen ist, werden folgende Hinweise angezeigt:
- Im Abschnitt Status: Lang andauernder Vorgang befindet sich unter der Überschrift OK ein grünes Häkchen.
- Der Abschnitt Übersicht hat ein grünes Häkchen und einen OK-Indikator in der Zeile, in der sich auch die Vorgangs-ID befindet.
gcloud
Verwenden Sie den Befehl gcloud healthcare dicom-stores export gcs
, um DICOM-Instanzen in einen Cloud Storage-Bucket zu exportieren.
- Geben Sie den Namen des übergeordneten Datasets, den Namen des DICOM-Speichers und den Cloud Storage-Ziel-Bucket an.
- Schreiben Sie in einen Cloud Storage-Bucket oder ein Cloud Storage-Verzeichnis und nicht in ein Objekt, da die Cloud Healthcare API für jedes Objekt eine
.dcm
-Datei erstellt. - Wenn der Befehl ein nicht vorhandenes Verzeichnis angibt, wird das Verzeichnis erstellt.
Das folgende Beispiel zeigt den Befehl gcloud healthcare dicom-stores export gcs
.
gcloud healthcare dicom-stores export gcs DICOM_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --gcs-uri-prefix=gs://BUCKET/DIRECTORY
In der Befehlszeile wird die Vorgangs-ID angezeigt:
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID
Führen Sie den gcloud healthcare operations describe
-Befehl aus und geben Sie OPERATION_ID aus der Antwort an, um den Status des Vorgangs anzuzeigen:
gcloud healthcare operations describe OPERATION_ID \ --location=LOCATION \ --dataset=DATASET_ID
Nach Abschluss des Befehls enthält die Antwort done: true
.
done: true metadata: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ExportDicomData counter: success: SUCCESSFUL_INSTANCES failure: FAILED_INSTANCES createTime: "CREATE_TIME" endTime: "END_TIME" name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID response: '@type': "..."
API
Verwenden Sie die Methode projects.locations.datasets.dicomStores.export
, um DICOM-Instanzen in einen Cloud Storage-Bucket zu exportieren.
- Schreiben Sie in einen Cloud Storage-Bucket oder ein Cloud Storage-Verzeichnis und nicht in ein Objekt, da die Cloud Healthcare API für jedes Objekt eine
.dcm
-Datei erstellt. - Wenn der Befehl ein nicht vorhandenes Verzeichnis angibt, wird das Verzeichnis erstellt.
curl
Zum Exportieren von DICOM-Instanzen senden Sie eine POST
-Anfrage und geben die folgenden Informationen an:
- Name und Speicherort des übergeordneten Datasets
- Der Name des DICOM-Speichers
- Der Cloud Storage-Ziel-Bucket
Das folgende Beispiel zeigt eine POST
-Anfrage mit curl
.
curl -X POST \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \ --data "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' } }" "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export"
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die Antwort im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
Die Antwort enthält einen Vorgangsnamen. Mit der Vorgangsmethode get
können Sie den Status des Vorgangs verfolgen:
curl -X GET \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server eine Antwort mit dem Status des Vorgangs im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ExportDicomData", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter":{ "success": SUCCESSFUL_INSTANCES "failure": FAILED_INSTANCES } }, "done": true, "response": { "@type": "..." } }
PowerShell
Zum Exportieren von DICOM-Instanzen senden Sie eine POST
-Anfrage und geben die folgenden Informationen an:
- Name und Speicherort des übergeordneten Datasets
- Der Name des DICOM-Speichers
- Der Cloud Storage-Ziel-Bucket
Das folgende Beispiel zeigt eine POST
-Anfrage mit Windows PowerShell.
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Post ` -Headers $headers ` -ContentType: "application/json; charset=utf-8" ` -Body "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' } }" ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export" | Select-Object -Expand Content
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die Antwort im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
Die Antwort enthält einen Vorgangsnamen. Mit der Vorgangsmethode get
können Sie den Status des Vorgangs verfolgen:
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Get ` -Headers $headers ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server eine Antwort mit dem Status des Vorgangs im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ExportDicomData", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter":{ "success": SUCCESSFUL_INSTANCES "failure": FAILED_INSTANCES }, }, "done": true, "response": { "@type": "..." } }
Go
Java
Node.js
Python
DICOM-Instanzen mithilfe von Filtern exportieren
Wenn Sie DICOM-Dateien in Cloud Storage exportieren, werden standardmäßig alle DICOM-Dateien im DICOM-Speicher exportiert. Ebenso werden beim Exportieren von DICOM-Metadaten nach BigQuery die Metadaten für alle DICOM-Daten im DICOM-Speicher exportiert.
Sie können eine Teilmenge der DICOM-Daten oder -Metadaten mithilfe einer Filterdatei exportieren.
Filterdatei konfigurieren
Mit einer Filterdatei können Sie die Liste der DICOM-Dateien definieren, die nach Cloud Storage oder BigQuery exportiert werden sollen.
Jede Zeile in der Filterdatei definiert die Studie, Serie oder Instanz und verwendet das Format /studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID
.
Sie können eine Zeile abschneiden, um festzulegen, auf welcher Ebene der Filter funktioniert.
Sie können beispielsweise eine gesamte Studie exportieren, indem Sie /studies/STUDY_INSTANCE_UID
angeben, oder eine ganze Reihe exportieren, indem Sie /studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID
angeben.
Betrachten Sie die folgende Filterdatei:
/studies/1.123.456.789 /studies/1.666.333.111/series/123.456 /studies/1.666.333.111/series/567.890 /studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/111 /studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/222 /studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/333
Mit dieser Filterdatei wird Folgendes gefiltert:
- Die gesamte Studie mit der UID der Studieninstanz als
1.123.456.789
- Zwei separate Reihen mit Serieninstanz-UIDs wie
123.456
und567.890
in der Studie1.666.333.111
- Drei einzelne Instanzen mit Instanz-IDs als
111
,222
und333
in der Studie1.888.999.222
und der Serie123.456
Filterdatei mit BigQuery erstellen
Zum Erstellen einer Filterdatei mit BigQuery müssen Sie die Metadaten Ihres DICOM-Speichers nach BigQuery exportieren. Die exportierten Metadaten zeigen die Studien-, Reihen- und Instanz-UIDs der DICOM-Daten in Ihrem DICOM-Speicher.
Führen Sie nach dem Export die folgenden Schritte aus:
Fragen Sie die erforderlichen Studien-, Reihen- und Instanz-UIDs ab.
Führen Sie nach dem Exportieren von DICOM-Metadaten nach BigQuery beispielsweise die folgende Abfrage aus, um die Studien-, Reihen- und Instanz-UIDs zu verketten, damit sie den Anforderungen an das Filterdateiformat entsprechen:
SELECT CONCAT ('/studies/', StudyInstanceUID, '/series/', SeriesInstanceUID, '/instances/', SOPInstanceUID) FROM [PROJECT_ID:BIGQUERY_DATASET.BIGQUERY_TABLE]
Optional: Wenn die Abfrage eine große Ergebnismenge zurückgibt, die die maximale Antwortgröße überschreitet, speichern Sie die Abfrageergebnisse in einer neuen Zieltabelle in BigQuery.
Speichern Sie die Abfrageergebnisse in einer Datei und exportieren Sie sie in Cloud Storage. Wenn Sie die Abfrageergebnisse in Schritt 2 in einer neuen Zieltabelle gespeichert haben, erfahren Sie unter Tabellendaten exportieren, wie Sie die Inhalte der Tabelle nach Cloud Storage exportieren.
Bearbeiten Sie die exportierte Datei nach Bedarf und verwenden Sie sie als Filterdatei. Der Speicherort der Filterdatei in Cloud Storage ist im Exportvorgang erforderlich.
Filterdatei manuell erstellen
So erstellen Sie eine Filterdatei mit benutzerdefiniertem Inhalt und laden sie in einen Cloud Storage-Bucket hoch:
Erstellen Sie eine Filterdatei mit einer Liste von Instanzen, deren Speicherklasse auf dem lokalen Computer geändert werden muss. Verwenden Sie das im Abschnitt Filterdatei konfigurieren beschriebene Format.
Laden Sie die Filtertextdatei an einen Cloud Storage-Speicherort hoch.
gsutil cp PATH_TO_FILTER_FILE/FILTER_FILE_NAME.txt gs://BUCKET/DIRECTORY
Ersetzen Sie Folgendes:
PATH_TO_FILTER_FILE
: der Pfad zur Filterdatei auf Ihrem lokalen ComputerFILTER_FILE_NAME
: der Name der FilterdateiBUCKET/DIRECTORY
: der Pfad zum Cloud Storage-Speicherort
Beispiel:
gsutil cp my-local-folder/archive-filters.txt gs://my-bucket/my-directory
Filterdatei übergeben
Nachdem Sie eine Filterdatei erstellt haben, können Sie den DICOM-Exportvorgang aufrufen und die Filterdatei mit der REST API übergeben. In folgenden Beispielen wird gezeigt, wie Sie DICOM-Daten mit einem Filter exportieren.
gcloud
Verwenden Sie den Befehl gcloud beta healthcare dicom-stores export gcs
, um DICOM-Metadaten mithilfe eines Filters nach Cloud Storage zu exportieren:
gcloud beta healthcare dicom-stores export gcs DICOM_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --gcs-uri-prefix=gs://DESTINATION_BUCKET/DIRECTORY \ --filter-config-gcs-uri=gs://BUCKET/DIRECTORY/FILTER_FILE
Ersetzen Sie Folgendes:
- DICOM_STORE_ID ist die Kennung für den DICOM-Speicher
- DATASET_ID ist der Name des übergeordneten Datasets des DICOM-Speichers
- LOCATION ist der Speicherort des übergeordneten Datasets des DICOM-Speichers
- DESTINATION_BUCKET/DIRECTORY ist der Ziel-Bucket von Cloud Storage
- BUCKET/DIRECTORY/FILTER_FILE ist der Speicherort der Filterdatei in einem Cloud Storage-Bucket
Die Ausgabe sieht so aus:
Request issued for: [DICOM_STORE_ID] Waiting for operation [projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID] to complete...done. name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID
Führen Sie den gcloud healthcare operations describe
-Befehl aus und geben Sie OPERATION_ID aus der Antwort an, um den Status des Vorgangs anzuzeigen:
gcloud healthcare operations describe OPERATION_ID \ --location=LOCATION \ --dataset=DATASET_ID
Ersetzen Sie Folgendes:
- OPERATION_ID ist die ID-Nummer, die von der vorherigen Antwort zurückgegeben wurde
- DATASET_ID ist der Name des übergeordneten Datasets des DICOM-Speichers
- LOCATION ist der Speicherort des übergeordneten Datasets des DICOM-Speichers
Die Ausgabe sieht so aus:
done: true metadata: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1beta1.OperationMetadata apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1beta1.dicom.DicomService.ExportDicomData counter: success: SUCCESSFUL_INSTANCES failure: FAILED_INSTANCES createTime: 'CREATE_TIME' endTime: 'END_TIME' logsUrl: 'https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL' name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID response: '@type': '...'
API
Verwenden Sie die Methode projects.locations.datasets.dicomStores.export
, um DICOM-Daten mithilfe eines Filters zu exportieren.
curl
Wenn Sie DICOM-Daten mithilfe einer Filterdatei exportieren möchten, senden Sie eine POST
-Anfrage und geben Sie die folgenden Informationen an:
- Name und Speicherort des übergeordneten Datasets
- Der Name des DICOM-Speichers
- Der Cloud Storage-Ziel-Bucket
- Der Speicherort der Filterdatei in einem Cloud Storage-Bucket
Das folgende Beispiel zeigt eine POST
-Anfrage mit curl
.
curl -X POST \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \ --data "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' }, 'filterConfig': { 'resourcePathsGcsUri': 'gs://BUCKET/DIRECTORY/FILTER_FILE' } }" "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export"
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die folgende Antwort im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
Die Antwort enthält einen Vorgangsnamen. Verwenden Sie die Vorgangsmethode get
, um den Status des Vorgangs zu verfolgen:
curl -X GET \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_NAME"
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die folgende Antwort im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1beta1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1beta1.dicom.DicomService.ExportDicomData", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME" }, "done": true, "response": { "@type": "..." } }
PowerShell
Wenn Sie DICOM-Daten mithilfe einer Filterdatei exportieren möchten, senden Sie eine POST
-Anfrage und geben Sie die folgenden Informationen an:
- Name und Speicherort des übergeordneten Datasets
- Der Name des DICOM-Speichers
- Der Cloud Storage-Ziel-Bucket
- Der Speicherort der Filterdatei in einem Cloud Storage-Bucket
Das folgende Beispiel zeigt eine POST
-Anfrage mit Windows PowerShell.
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Post ` -Headers $headers ` -ContentType: "application/json; charset=utf-8" ` -Body "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' }, 'filterConfig': { 'resourcePathsGcsUri': 'gs://BUCKET/DIRECTORY/FILTER_FILE' }" ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export" | Select-Object -Expand Content
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die folgende Antwort im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
Die Antwort enthält einen Vorgangsnamen. Verwenden Sie die Vorgangsmethode get
, um den Status des Vorgangs zu verfolgen:
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Get ` -Headers $headers ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_NAME" | Select-Object -Expand Content
Wenn die Anfrage erfolgreich ist, gibt der Server die folgende Antwort mit dem Status des Vorgangs im JSON-Format zurück:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/REGION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1beta1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1beta1.dicom.DicomService.ExportDicomData", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME" }, "done": true, "response": { "@type": "..." } }
Fehlerbehebung bei DICOM-Exportanfragen
Wenn während einer DICOM-Exportanfrage Fehler auftreten, werden die Fehler in Cloud Logging protokolliert. Weitere Informationen finden Sie unter Fehlerlogs in Cloud Logging ansehen.
Wenn der gesamte Vorgang einen Fehler zurückgibt, finden Sie weitere Informationen unter Fehlerbehebung bei Vorgängen mit langer Ausführungszeit.