Strumento di trasformazione delle varianti
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Variant Transforms è uno strumento open source utilizzato con Cloud Life Sciences. Si basa su
Apache Beam e utilizza Dataflow.
Puoi utilizzare Variant Transforms per trasformare e caricare in modo scalabile quanto segue:
- Centinaia di migliaia di file
- Milioni di campioni
- Miliardi di record
Puoi utilizzare il pre-processore Variant Transforms per convalidare i file VCF e identificare le incoerenze.
Il flusso di lavoro tipico quando si utilizza lo strumento è costituito dai seguenti passaggi:
- Archiviazione di file VCF non elaborati in Cloud Storage.
- Utilizza lo strumento Variant Transforms per caricare i file VCF da Cloud Storage in BigQuery.
Puoi quindi utilizzare BigQuery per analizzare le varianti.
Ti consigliamo di acquisire familiarità con lo schema delle varianti BigQuery per informazioni su come lo strumento carica i file VCF nelle tabelle BigQuery.
Salvo quando diversamente specificato, i contenuti di questa pagina sono concessi in base alla licenza Creative Commons Attribution 4.0, mentre gli esempi di codice sono concessi in base alla licenza Apache 2.0. Per ulteriori dettagli, consulta le norme del sito di Google Developers. Java è un marchio registrato di Oracle e/o delle sue consociate.
Ultimo aggiornamento 2025-07-29 UTC.
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