Cancer Imaging Archive(TCIA)データセット

Cancer Imaging Archive(TCIA)は、主に DICOM 形式の匿名化された医療画像のコレクションをホストしています。コレクションは、病気(例:がん)、画像モダリティ(MRI、CT)、および研究に焦点を当てて構成されています。

Cloud Healthcare API は、Google Cloud データアクセスでの説明のように、Google Cloud(GCP)を介してこれらのデータセットにアクセスします。

ライセンスと帰属表示

TCIA 公開アクセス データセットは、クリエイティブ・コモンズ表示 3.0 非移植ライセンスに基づいて提供されています。ほとんどのコレクションは「商業目的、科学目的、教育目的で自由に閲覧、ダウンロードおよび使用できます」。詳しくは、TCIA のデータ使用ポリシーと制限事項をご覧ください。

引用

使用するコレクションごとに、TCIA 全般とコレクションの特定のソースの両方を引用します。

一般的な引用

次の一般的な TCIA の出版物を引用します。

Clark K, Vendt B, Smith K, Freymann J, Kirby J, Koppel P, Moore S, Phillips S, Maffitt D, Pringle M, Tarbox L, Prior F. Cancer Imaging Archive(TCIA): Maintaining and Operating a Public Information Repository。Journal of Digital Imaging、26 巻 6 号、2013 年 12 月、1045~1057 ページ。(論文

コレクションの引用

それぞれの TCIA コレクションには特定の引用要件があります。データの引用、出版物の引用、またはその両方の場合があります。一部のコレクションでは、追加のデータソースの帰属表示も必要です。

詳細については、TCIA アトリビューションのセクションをご覧ください。また、TCIA サイトでは、各コレクションの概要ページで引用とデータの利用ポリシーを参照できます。

TCIA データセットへのアクセス

Cloud Storage や BigQuery から、または Cloud Healthcare API を使用して TCIA データセットを取得できます。

クラウド ストレージ

各 TCIA データセットは、chc-tcia という名前の Google Cloud プロジェクト内の Cloud Storage バケットで使用できます。

Cloud Storage の TCIA データセットに移動

データセット バケット名の形式は次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-DATASET_ID

DATASET_ID を見つけるには、TCIA アトリビューションのセクションをご覧ください。アトリビューション ページの URL の最後の部分(.html の直前)がデータセット ID に対応します。たとえば、TCGA-BRCA の引用ページの URL は次のとおりです。

https://cloud.google.com/healthcare/docs/resources/public-datasets/tcia-attribution/tcga-brca.html

データセット ID は tcga-brca です。対応する Cloud Storage バケットは次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-tcga-brca

各バケット内のデータは、次のように構成されています。

gs://gcs-public-data--healthcare-DATASET/dicom/STUDY_UID/SERIES_UID/INSTANCE_UID.dcm

各 Cloud Storage バケットでは、「リクエスト元による支払い」モデルを使用して課金されます。Google Cloud プロジェクトには、TCIA データへのアクセスに関連する料金が請求されます。詳細については、リクエスト元による支払いをご覧ください。

BigQuery

各 TCIA データセットは、chc-tcia Google Cloud プロジェクト内の BigQuery で使用できます。

BigQuery の TCIA データセットに移動

BigQuery で一般公開データにアクセスする方法については、BigQuery の一般公開データセットをご覧ください。

Cloud Healthcare API

各 TCIA データセットは、chc-tcia プロジェクトの Cloud Healthcare API で使用できます。

TCIA データセットへのアクセスをリクエストするには、このフォームに記入します。

Cloud Healthcare API の TCIA データセットに移動

データの構造については、DICOM の概要DICOMweb 規格の使用をご覧ください。

外部データビューア

Cloud Healthcare API と統合されたビューアも使用できます。

eUnity: https://demo.eunity.app

IMS CloudVue: https://cloudvue.imstsvc.com