Cancer Imaging Archive(TCIA)データセット

Cancer Imaging Archive(TCIA)は、主に DICOM 形式の匿名化された医療画像のコレクションをホストしています。コレクションは、病気(例:がん)、画像モダリティ(MRI、CT)、および研究に焦点を当てて構成されています。

Cloud Healthcare API は、Google Cloud データアクセスでの説明のように、Google Cloud(GCP)を介してこれらのデータセットにアクセスします。

ライセンスと帰属表示

TCIA 公開アクセス データセットは、クリエイティブ・コモンズ表示 3.0 非移植ライセンスに基づいて提供されます。ほとんどのコレクションは「商業、科学、教育の目的で閲覧、ダウンロード、および使用が可能です」。詳しくは、TCIA のデータ使用ポリシーと制限事項をご覧ください。

引用

使用するコレクションごとに、TCIA 全般とコレクションの特定のソースの両方を引用します。

一般的な引用

以下の一般的な TCIA の出版物を引用します。

Clark K, Vendt B, Smith K, Freymann J, Kirby J, Koppel P, Moore S, Phillips S, Maffitt D, Pringle M, Tarbox L, Prior F. Cancer Imaging Archive(TCIA): Maintaining and Operating a Public Information Repository。Journal of Digital Imaging、26 巻 6 号、2013 年 12 月、1045~1057 ページ。(論文

コレクションの引用

それぞれの TCIA コレクションには特定の引用要件があります。データの引用、出版物の引用、またはその両方です。一部のコレクションでは、追加のデータソースについてのアトリビューションも必要です。

詳細については、TCIA アトリビューションのセクションをご覧ください。また、TCIA サイトの各コレクションの概要ページで、引用およびデータ使用ポリシーを参照することもできます。

Google Cloud のデータアクセス

Cloud Storage、BigQuery から、または Cloud Healthcare API を使用して、TCIA データセットを取得できます。

クラウド ストレージ

各 TCIA データセットは、chc-tcia という名前の Google Cloud プロジェクト内の Cloud Storage バケットで使用できます。

Cloud Storage の TCIA データセットに移動

データセット バケット名の形式は次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-DATASET_ID

DATASET_ID については、TCIA アトリビューションのセクションをご覧ください。アトリビューションページ URL の最後の部分(.html の直前)がデータセット ID に対応します。たとえば、TCGA-B カードの引用ページの URL は次のとおりです。

https://cloud.google.com/healthcare/docs/resources/public-datasets/tcia-attribution/tcga-brca.html

データセット ID は tcga-brca です。対応する Cloud Storage バケットは次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-tcga-brca

各バケット内のデータは次のように編成されます。

gs://gcs-public-data--healthcare-DATASET/dicom/STUDY_UID/SERIES_UID/INSTANCE_UID.dcm

各 Cloud Storage バケットは「リクエスト元による支払い」モデルを使用して課金されます。Google Cloud プロジェクトには、TCIA データへのアクセスに関連する料金が請求されます。詳しくは、リクエスト元による支払いをご覧ください。

BigQuery

各 TCIA データセットは、chc-tcia Google Cloud プロジェクトの BigQuery で使用できます。

BigQuery の TCIA データセットに移動

BigQuery で一般公開データにアクセスする方法については、BigQuery 一般公開データセットをご覧ください。

Cloud Healthcare API

各 TCIA データセットは、chc-tcia プロジェクトの Cloud Healthcare API で使用できます。

TCIA データセットへのアクセスをリクエストするには、このフォームに記入します。

Cloud Healthcare API の TCIA データセットに移動

データの構造については、DICOM の概要DICOMweb 規格の使用をご覧ください。

データビューア

Cloud Healthcare API に統合されているビューアも使用できます。

eUnity: https://demo.eunity.app

IMS CloudVue: https://cloudvue.imstsvc.com