Cancer Imaging Archive(TCIA)データセット

Cancer Imaging Archive(TCIA)は、主に DICOM 形式の匿名化された医療画像のコレクションをホストしています。コレクションは、病気(例:がん)、画像モダリティ(MRI、CT)、および研究に焦点を当てて構成されています。

Cloud Healthcare API は、Google Cloud データアクセスでの説明のように、Google Cloud(GCP)を介してこれらのデータセットにアクセスします。

ライセンスと帰属

TCIA 公開アクセス データセットは、クリエイティブ・コモンズ表示 3.0 非移植ライセンスに基づいて提供されています。ほとんどのコレクションは「商業目的、科学目的、教育目的で自由に閲覧、ダウンロードおよび使用できます」。詳しくは、TCIA のデータ使用ポリシーと制限事項をご覧ください。

引用

使用するコレクションごとに、TCIA 全般とコレクションの特定のソースの両方を引用します。

一般的な引用

次の一般的な TCIA の出版物を引用します。

Clark K、Vendt B、Smith K、Freymann J、Kirby J、Koppel P、Moore S、Phillips S、Maffitt D、Pringle M、Tarbox L、Prior F.。Cancer Imaging Archive(TCIA): Maintaining and Operating a Public Information Repository。Journal of Digital Imaging、26 巻 6 号、2013 年 12 月、1045~1057 ページ。(論文

コレクションの引用

各 TCIA コレクションには、引用に関する特定の要件があります。これらは、データの引用またはパブリケーションの引用、もしくはその両方です。コレクションによっては、追加のデータソースの帰属も必要になります。

詳細については、TCIA への帰属セクションをご覧ください。また、TCIA サイトの各コレクションの概要ページで、引用とデータの利用ポリシーもご覧ください。

TCIA データセットへのアクセス

Cloud Storage や BigQuery から、または Cloud Healthcare API を使用して TCIA データセットを取得できます。

クラウド ストレージ

各 TCIA データセットは、chc-tcia という名前の Google Cloud プロジェクト内の Cloud Storage バケットで使用できます。

Cloud Storage の TCIA データセットに移動

データセット バケット名の形式は次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-DATASET_ID

DATASET_ID を見つけるには、TCIA アトリビューションのセクションをご覧ください。アトリビューション ページの URL の最後の部分(.html の直前)がデータセット ID に対応します。たとえば、TCGA-BRCA の引用ページの URL は次のとおりです。

https://cloud.google.com/healthcare/docs/resources/public-datasets/tcia-attribution/tcga-brca.html

データセット ID は tcga-brca です。対応する Cloud Storage バケットは次のとおりです。

gs://gcs-public-data--healthcare-tcia-tcga-brca

各バケット内のデータは、次のように構成されています。

gs://gcs-public-data--healthcare-DATASET/dicom/STUDY_UID/SERIES_UID/INSTANCE_UID.dcm

各 Cloud Storage バケットは、リクエストに「リクエスト元による支払い」モデルを使用します。TCIA データへのアクセスに関連する料金が Google Cloud プロジェクトに課金されます。詳しくは、リクエスト元による支払いをご覧ください。

BigQuery

各 TCIA データセットは、chc-tcia Google Cloud プロジェクト内の BigQuery で使用できます。

BigQuery の TCIA データセットに移動

BigQuery で一般公開データにアクセスする方法については、BigQuery の一般公開データセットをご覧ください。

Cloud Healthcare API

各 TCIA データセットは、chc-tcia プロジェクトの Cloud Healthcare API で使用できます。

TCIA データセットへのアクセスをリクエストするには、このフォームに記入します。

Cloud Healthcare API の TCIA データセットに移動

データの構造については、DICOM の概要DICOMweb 規格の使用をご覧ください。

外部データビューア

Cloud Healthcare API と統合されたビューアも使用できます。

eUnity: https://demo.eunity.app

IMS CloudVue: https://cloudvue.imstsvc.com