Cette page a été traduite par l'API Cloud Translation.

Créer et gérer des magasins FHIR

Cette page explique comment créer, modifier, afficher, répertorier et supprimer des magasins FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources). Les magasins FHIR contiennent des ressources FHIR, telles que des ressources "Claim", des ressources "Patient", des ressources "Medication", etc.

L'API Cloud Healthcare est compatible avec les versions suivantes de FHIR :

Créer un magasin FHIR

Pour pouvoir créer un datastore FHIR, vous devez d'abord créer un ensemble de données.

Les exemples suivants montrent comment créer un magasin FHIR à l'aide de la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.create.

Console

Pour créer un store FHIR, procédez comme suit :

Dans la console Google Cloud, accédez à la page Ensembles de données.
Accéder à la page "Ensembles de données"
Ouvrez l'ensemble de données dans lequel vous souhaitez créer un magasin FHIR.
Cliquez sur Créer un datastore.
Sélectionnez FHIR comme type de datastore.
Saisissez un nom unique dans votre ensemble de données. Si le nom n'est pas unique, la création du magasin FHIR échoue.
Cliquez sur Suivant.
Pour configurer votre store FHIR, procédez comme suit:
1. Choisissez la version FHIR du magasin FHIR (DSTU2, STU3 ou R4).
2. Sélectionnez les paramètres avancés applicables parmi les suivants :
  - Allow update create (Autoriser la création de mises à jour) : cochez cette option pour autoriser la création d'une ressource à l'aide d'une opération de mise à jour avec un ID spécifié par l'utilisateur.
  - Vérifications de l'intégrité du référentiel: sélectionnez cette option pour activer l'intégrité référentielle dans ce magasin. Vous ne pourrez plus le modifier une fois le store créé.
  - Gestion des versions des ressources: sélectionnez cette option pour enregistrer automatiquement les versions historiques des ressources. Une fois le magasin créé, vous ne pourrez plus modifier ce paramètre.
3. Sélectionnez les paramètres de validation du profil applicables dans les champs suivants. Pour plus d'informations, voir ValidationConfig:
  - Activer la validation de profil : sélectionnez cette option pour activer la validation de profil. Pour appliquer un guide d'implémentation activé dans votre store FHIR, vous devez activer le profil la validation.
  - Activer la validation des champs obligatoires : sélectionnez cette option pour activer la validation des champs de ressources par rapport aux définitions de structure de votre profil FHIR.
  - Activer la validation des types de référence : sélectionnez cette option pour activer la validation des types de référence.
  - Activer la validation FHIRPath : cochez cette case pour activer la vérification de la compatibilité FHIRPath.
4. Cliquez sur Suivant.
Facultatif: Pour activer les guides d'implémentation dans votre store FHIR, procédez comme suit:
1. Cliquez sur Activer les guides d'implémentation.
2. Cliquez sur la liste Guides d'implémentation et développez-la.
3. Sélectionnez les guides d'implémentation applicables dans la liste.
  Chaque guide d'implémentation est compatible avec une version spécifique de FHIR. La liste n'affiche que les guides d'implémentation compatibles avec la version du store FHIR sélectionnée.
4. Cliquez sur Importer un guide d'implémentation personnalisé à partir de Cloud Storage pour importer un bundle de validation de fiche personnalisé à partir d'un emplacement Cloud Storage.
5. Dans le panneau Sélectionner un objet, sélectionnez une ressource de bundle de validation de profil à partir d'un emplacement Cloud Storage. Pour en savoir plus, consultez Utiliser la console Google Cloud pour activer les guides d'implémentation
6. Cliquez sur Sélectionner.
  - Les guides d'implémentation sélectionnés sont listés dans un tableau avec leur version, leur URL et leur état.
  - Si vous avez activé les guides d'implémentation, mais que vous n'avez pas activé la validation du profil, le guide d'implémentation n'entre pas en vigueur.
  - Cliquez sur Suivant.
Facultatif: Pour exporter les modifications de ressources vers BigQuery chaque fois que les ressources FHIR de votre magasin sont créées, mises à jour, corrigées ou supprimées, procédez comme suit:
1. Cliquez sur Diffuser les modifications des ressources vers BigQuery.
2. Cliquez sur Ajouter une configuration de streaming. Pour en savoir plus sur BigQuery, en flux continu, consultez la section Diffuser les modifications des ressources FHIR dans BigQuery.
3. Sélectionnez le niveau de profondeur dans le curseur Profondeur de la structure récursive pour définir la profondeur de toutes les structures récursives dans le schéma de sortie. Par défaut, la valeur de profondeur récursive est 2.
4. Cliquez sur OK pour enregistrer la configuration de streaming.
5. Cliquez sur Suivant.
Facultatif : Pour configurer un sujet Pub/Sub pour le magasin FHIR, procédez comme suit :
1. Cliquez sur Recevoir des notifications Cloud Pub/Sub.
2. Cliquez sur Ajouter un sujet Cloud Pub/Sub et sélectionnez le nom du sujet.
  Lorsque vous spécifiez un thème Pub/Sub, saisissez l'URI qualifié du thème, comme indiqué dans l'exemple suivant :
```
projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC
```
3. Cliquez sur Suivant.
Facultatif : Pour ajouter des libellés à la boutique, procédez comme suit :
1. Cliquez sur Ajouter des étiquettes pour organiser vos datastores.
2. Saisissez la clé et la valeur du libellé. Pour en savoir plus sur les libellés de ressources, consultez la section Utiliser des libellés de ressources.
3. Cliquez sur Créer.

Le nouveau magasin FHIR apparaît dans la liste.

gcloud

Pour créer un data store FHIR dans l'ensemble de données, exécutez la commande gcloud healthcare fhir-stores create.

Avant d'utiliser les données de la commande ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : identifiant du magasin FHIR. L'ID du store FHIR doit comporter les éléments suivants :
- Un ID unique dans son ensemble de données
- Une chaîne Unicode de 1 à 256 caractères composée des éléments suivants :
FHIR_STORE_VERSION : version FHIR du store FHIR. Les options disponibles sont DSTU2, STU3 ou R4.

Exécutez la commande suivante :

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION `
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION ^
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Vous devriez obtenir un résultat semblable à celui-ci :

Réponse

Created fhirStore [FHIR_STORE_ID].

REST

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : identifiant du magasin FHIR. L'ID du store FHIR doit comporter les éléments suivants :
- Un ID unique dans son ensemble de données
- Une chaîne Unicode de 1 à 256 caractères composée des éléments suivants :
FHIR_STORE_VERSION : version FHIR du store FHIR. Les options disponibles sont DSTU2, STU3 ou R4.

Corps JSON de la requête :

{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login, ou en utilisant Cloud Shell, qui vous connecte automatiquement à la CLI gcloud. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

cat > request.json << 'EOF'
{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}
EOF

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

curl -X POST \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

@'
{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method POST `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Copiez le corps de la requête et ouvrez la page de référence de la méthode. Le panneau APIs Explorer s'ouvre dans la partie droite de la page. Vous pouvez interagir avec cet outil pour envoyer des requêtes. Collez le corps de la requête dans cet outil, renseignez tous les champs obligatoires, puis cliquez sur Execute (Exécuter).

Vous devriez recevoir une réponse JSON de ce type :

Réponse

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createFHIRStore creates an FHIR store.
func createFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)
	version := "R4"

	resp, err := storesService.Create(parent, &healthcare.FhirStore{Version: version}).FhirStoreId(fhirStoreID).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created FHIR store: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

public class FhirStoreCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreCreate(String datasetName, String fhirStoreId) throws IOException {
    // String datasetName =
    //     String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");
    // String fhirStoreId = "your-fhir-id"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the FhirStore to be created.
    Map<String, String> labels = new HashMap<>();
    labels.put("key1", "value1");
    labels.put("key2", "value2");
    String version = "STU3";
    FhirStore content = new FhirStore().setLabels(labels).setVersion(version);

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Create request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .fhirStores()
            .create(datasetName, content)
            .setFhirStoreId(fhirStoreId);

    // Execute the request and process the results.
    FhirStore response = request.execute();
    System.out.println("FHIR store created: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const version = 'STU3';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {
    parent,
    fhirStoreId,
    resource: {
      version,
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.create(request);
  console.log(`Created FHIR store: ${fhirStoreId}`);
};

createFhirStore();

Python

def create_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id, version):
    """Creates a new FHIR store within the parent dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    # version = 'R4'  # replace with the FHIR store version
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    body = {"version": version}

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .create(parent=fhir_store_parent, body=body, fhirStoreId=fhir_store_id)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Created FHIR store: {fhir_store_id}")

    return response

Modifier un magasin FHIR

Les exemples suivants montrent comment modifier un data store FHIR. Vous pouvez modifier un store FHIR pour modifier les propriétés telles que les suivantes :

Le sujet Pub/Sub auquel l'API Cloud Healthcare envoie des notifications en cas de modification du store FHIR.
Étiquettes du store FHIR. Les libellés sont des paires clé/valeur qui vous aident à organiser vos ressources Google Cloud.

Lorsque vous spécifiez un sujet Pub/Sub, saisissez l'URI qualifié du sujet, comme indiqué dans l'exemple suivant :

projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC

Pour que les notifications fonctionnent, vous devez accorder des autorisations supplémentaires au compte de service Agent de service Cloud Healthcare. Pour en savoir plus, consultez Autorisations Pub/Sub pour les magasins DICOM, FHIR et HL7v2.

Console

Pour modifier un magasin FHIR, procédez comme suit :

Dans la console Google Cloud, accédez à la page Ensembles de données.
Accéder à la page "Ensembles de données"
Sélectionnez l'ensemble de données contenant le magasin FHIR que vous souhaitez modifier.
Dans la liste Datastores, sélectionnez le magasin FHIR que vous souhaitez modifier.
Pour modifier la configuration du store, cliquez sur Configuration du magasin FHIR

Pour en savoir plus sur les options de configuration du store FHIR, consultez la section Créer un store FHIR.
Pour modifier les guides d'implémentation du store, cliquez sur Guides d'implémentation, puis sélectionnez les guides d'implémentation applicables ou importez un guide d'implémentation personnalisé à partir de Cloud Storage. Pour plus pour en savoir plus, consultez Utiliser la console Google Cloud pour activer les guides d'implémentation

Pour modifier les guides de mise en œuvre ou appliquer les guides de mise en œuvre activés, vous devez activer la validation des profils dans la section Configuration du store FHIR.
Pour exporter les modifications de ressources vers BigQuery chaque fois que les ressources FHIR de votre store sont créées, mises à jour, corrigées ou supprimées, cliquez sur Ajouter une configuration de streaming dans le champ Ensemble de données.
Sélectionnez un ensemble de données BigQuery dans lequel les modifications de ressources seront diffusées en continu. Pour en savoir plus sur le streaming BigQuery, consultez la section Diffuser les modifications de ressources FHIR dans BigQuery.
Pour définir la profondeur de toutes les structures récursives dans le schéma de sortie, cliquez sur la profondeur appropriée dans le curseur Profondeur de la structure récursive. Par défaut, la profondeur récursive est 2.
Pour n'exporter des modifications de ressources que pour des types de ressources spécifiques, sélectionnez les types de ressources dans la liste Sélectionner les types de ressources FHIR.
Pour configurer un sujet Pub/Sub pour le data store, sélectionnez un nom de sujet dans la section Notifications Cloud Pub/Sub. Lorsque vous spécifiez un thème Pub/Sub, saisissez l'URI qualifié du thème, comme indiqué dans l'exemple suivant :
```
projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC
```
Pour ajouter une ou plusieurs étiquettes au store, cliquez sur Étiquettes et Ajouter une étiquette, puis saisissez l'étiquette de clé-valeur. Pour en savoir plus sur les étiquettes des ressources, consultez la page Utiliser des étiquettes de ressources.
Cliquez sur Enregistrer.

gcloud

Pour modifier un store FHIR, exécutez la commande gcloud healthcare fhir-stores update.

Avant d'utiliser les données de la commande ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.
PUBSUB_TOPIC_ID: sujet Pub/Sub dans lequel les messages sont publiés lorsqu'un événement se produit dans un data store

Exécutez la commande suivante :

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION `
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION ^
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Vous devriez obtenir un résultat semblable à celui-ci :

Réponse

Updated fhirStore [FHIR_STORE_ID].
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
notificationConfig:
 pubsubTopic: projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID
version: FHIR_STORE_VERSION

REST

Pour modifier un store FHIR, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.patch.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.
PUBSUB_TOPIC_ID: sujet Pub/Sub dans lequel les messages sont publiés lorsqu'un événement se produit dans un data store. Pour déterminer quelles données inclure dans les notifications Pub/Sub, consultez Notifications Pub/Sub FHIR
KEY1 : clé de la première étiquette
VALUE1 : valeur de la première étiquette
KEY2 : clé de la deuxième étiquette
VALUE2 : valeur de la deuxième étiquette

Corps JSON de la requête :

{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

cat > request.json << 'EOF'
{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}
EOF

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

curl -X PATCH \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=notificationConfig,labels"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

@'
{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method PATCH `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=notificationConfig,labels" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Vous devriez recevoir une réponse JSON de ce type :

Réponse

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID%",
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  },
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// patchFHIRStore updates (patches) a FHIR store by updating its Pub/sub topic name.
func patchFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID, topicName string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	// topicName format is "projects/*/locations/*/topics/*"
	notificationConfig := &healthcare.FhirNotificationConfig{
		PubsubTopic: topicName,
	}

	fhirStore := &healthcare.FhirStore{
		NotificationConfigs: []*healthcare.FhirNotificationConfig{notificationConfig},
	}

	patchRequest := storesService.Patch(name, fhirStore).UpdateMask("notificationConfigs")

	if _, err := patchRequest.Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Patch: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Patched FHIR store %s with Pub/sub topic %s\n", datasetID, topicName)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirNotificationConfig;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStorePatch {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStorePatch(String fhirStoreName, String pubsubTopic) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    // String.format(
    // FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id",
    // "your-fhir-id");
    // String pubsubTopic = "projects/your-project-id/topics/your-pubsub-topic";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Fetch the initial state of the FHIR store.
    FhirStores.Get getRequest = client
        .projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .get(fhirStoreName);
    FhirStore store = getRequest.execute();

    // Update the FhirStore fields as needed as needed. For a full list of FhirStore
    // fields, see:
    // https://cloud.google.com/healthcare/docs/reference/rest/v1/projects.locations.datasets.fhirStores#FhirStore
    FhirNotificationConfig notificationConfig = new FhirNotificationConfig()
        .setPubsubTopic(pubsubTopic);
    store.setNotificationConfigs(Collections.singletonList(notificationConfig));

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Patch request = client
        .projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .patch(fhirStoreName, store)
        .setUpdateMask("notificationConfigs");

    // Execute the request and process the results.
    store = request.execute();
    System.out.println("FHIR store patched: \n" + store.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see
    // https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential = GoogleCredentials.getApplicationDefault()
        .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration
    // to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer = request -> {
      new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
      request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
      request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
    };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const patchFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const pubsubTopic = 'my-topic'
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {
    name,
    updateMask: 'notificationConfigs',
    resource: {
      notificationConfigs: [
        {
          pubsubTopic: `projects/${projectId}/topics/${pubsubTopic}`,
        },
      ],
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.patch(request);
  console.log(
    `Patched FHIR store ${fhirStoreId} with Cloud Pub/Sub topic ${pubsubTopic}`
  );
};

patchFhirStore();

Python

def patch_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Updates the FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with your dataset ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    # TODO(developer): Replace with the full URI of an existing Pub/Sub topic
    patch = {"notificationConfig": None}

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .patch(name=fhir_store_name, updateMask="notificationConfig", body=patch)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Patched FHIR store {fhir_store_id} with Cloud Pub/Sub topic: None")

    return response

Obtenir des détails sur un datastore FHIR

Les exemples suivants montrent comment obtenir des détails sur un datastore FHIR.

Console

Pour afficher les détails d'un magasin FHIR :

Dans la console Google Cloud, accédez à la page "Ensembles de données".
Accéder à la page "Ensembles de données"
Sélectionnez l'ensemble de données contenant le store FHIR.
Cliquez sur le nom du magasin FHIR.

gcloud

Pour obtenir les détails d'un store FHIR, exécutez la commande gcloud healthcare fhir-stores describe.

Avant d'utiliser les données de la commande ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.

Exécutez la commande suivante :

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID \
 --dataset=DATASET_ID \
 --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID `
 --dataset=DATASET_ID `
 --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID ^
 --dataset=DATASET_ID ^
 --location=LOCATION

Vous devriez obtenir un résultat semblable au suivant.

Si vous avez configuré des champs dans la ressource FhirStore, ils apparaissent également dans la réponse.

Réponse

...
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
...
version: FHIR_STORE_VERSION

REST

Pour obtenir des détails sur un store FHIR, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.get.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Exécutez la commande suivante :

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Exécutez la commande suivante :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Ouvrez la page de référence de la méthode. Le panneau APIs Explorer s'ouvre dans la partie droite de la page. Vous pouvez interagir avec cet outil pour envoyer des requêtes. Renseignez tous les champs obligatoires, puis cliquez sur Execute (Exécuter).

Vous devriez obtenir un résultat semblable au suivant.

Si vous avez configuré des champs dans la ressource FhirStore, ils apparaissent également dans la réponse.

Réponse

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  ...
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// getFHIRStore gets an FHIR store.
func getFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	store, err := storesService.Get(name).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Get: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Got FHIR store: %q\n", store.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreGet {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreGet(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-fhir-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Get request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().get(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    FhirStore store = request.execute();
    System.out.println("FHIR store retrieved: \n" + store.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const getFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {name};

  const fhirStore =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.get(request);
  console.log(fhirStore.data);
};

getFhirStore();

Python

def get_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Gets the specified FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    # Imports Python's built-in "json" module
    import json

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    fhir_stores = client.projects().locations().datasets().fhirStores()
    fhir_store = fhir_stores.get(name=fhir_store_name).execute()

    print(json.dumps(fhir_store, indent=2))
    return fhir_store

Répertorier les magasins FHIR dans un ensemble de données

Les exemples suivants montrent comment répertorier les datastores FHIR d'un ensemble de données.

Console

Pour afficher les datastores d'un ensemble de données, procédez comme suit :

Dans la console Google Cloud, accédez à la page Ensembles de données.
Accéder à la page "Ensembles de données"
Sélectionnez l'ensemble de données contenant le data store que vous souhaitez afficher.

gcloud

Pour afficher les détails d'un store FHIR, exécutez la commande gcloud healthcare fhir-stores list.

Avant d'utiliser les données de la commande ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données

Exécutez la commande suivante :

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Vous devriez obtenir un résultat semblable au suivant.

Si vous avez configuré des champs dans la ressource FhirStore, ils apparaissent également dans la réponse.

ID             LOCATION     REF_INT  RES_VER  UPDATE_CREATE  TOPIC
FHIR_STORE_ID  LOCATION                                       PUBSUB_TOPIC
...

REST

Pour répertorier les magasins FHIR dans un ensemble de données, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.list.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Exécutez la commande suivante :

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Exécutez la commande suivante :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Vous devriez obtenir un résultat semblable au suivant.

Si vous avez configuré des champs dans la ressource FhirStore, ils apparaissent également dans la réponse.

Réponse

{
  "fhirStores": [
    {
      "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
      "version": "FHIR_STORE_VERSION"
    },
    {
      ...
    }
  ]
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// listFHIRStores prints a list of FHIR stores to w.
func listFHIRStores(w io.Writer, projectID, location, datasetID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)

	resp, err := storesService.List(parent).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("List: %w", err)
	}

	fmt.Fprintln(w, "FHIR stores:")
	for _, s := range resp.FhirStores {
		fmt.Fprintln(w, s.Name)
	}
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.ListFhirStoresResponse;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.List;

public class FhirStoreList {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreList(String datasetName) throws IOException {
    // String datasetName =
    //    String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Results are paginated, so multiple queries may be required.
    String pageToken = null;
    List<FhirStore> stores = new ArrayList<>();
    do {
      // Create request and configure any parameters.
      FhirStores.List request =
          client
              .projects()
              .locations()
              .datasets()
              .fhirStores()
              .list(datasetName)
              .setPageSize(100) // Specify pageSize up to 1000
              .setPageToken(pageToken);

      // Execute response and collect results.
      ListFhirStoresResponse response = request.execute();
      stores.addAll(response.getFhirStores());

      // Update the page token for the next request.
      pageToken = response.getNextPageToken();
    } while (pageToken != null);

    // Print results.
    System.out.printf("Retrieved %s Fhir stores: \n", stores.size());
    for (FhirStore data : stores) {
      System.out.println("\t" + data.toPrettyString());
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const listFhirStores = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {parent};

  const fhirStores =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.list(request);
  console.log(JSON.stringify(fhirStores.data));
};

listFhirStores();

Python

def list_fhir_stores(project_id, location, dataset_id):
    """Lists the FHIR stores in the given dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    fhir_stores = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .list(parent=fhir_store_parent)
        .execute()
        .get("fhirStores", [])
    )

    for fhir_store in fhir_stores:
        print(fhir_store)

    return fhir_stores

Obtenir la déclaration de capacités ou de conformité d'un magasin FHIR

Les exemples suivants montrent comment obtenir (STU3 ou R4). ou conformité (DSTU2) pour un store FHIR.

Les informations contenues dans la déclaration de capacités ou de conformité reflètent les paramètres du magasin FHIR. Par exemple, si FhirStore.enableUpdateCreate est défini sur true, cela se reflète dans le champ CapabilityStatement.rest.resource.updateCreate de la déclaration de capacités.

Le tableau suivant montre la méthode de l'API Cloud Healthcare pour obtenir la déclaration de capacités ou de conformité d'un magasin FHIR et son interaction de spécification FHIR équivalente :

Méthode de l'API Cloud Healthcare	Interaction de spécification FHIR
`projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.capabilities`	capacités (STU3, R4) ou `conformance` (DSTU2)

Console

La console Google Cloud et gcloud CLI ne permettent pas d'effectuer cette opération. Utilisez plutôt curl, PowerShell ou le langage de votre choix.

gcloud

La console Google Cloud et gcloud CLI ne permettent pas d'effectuer cette opération. Utilisez plutôt curl, PowerShell ou le langage de votre choix.

REST

Pour obtenir la déclaration de capacités ou de conformité d'un store FHIR, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.capabilities.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Exécutez la commande suivante :

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/metadata"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Exécutez la commande suivante :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/metadata" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Vous devriez recevoir une réponse JSON de ce type :

Réponse

{
  "acceptUnknown": "both",
  "date": "YYYY-MM-DD",
  "description": "FHIR capability statement for the FHIR store specified by the request.",
  "experimental": true,
  "fhirVersion": "FHIR_STORE_VERSION",
  "format": [
    "json"
  ],
  "id": "FHIR_STORE_ID",
  "kind": "instance",
  "patchFormat": [
    "application/json-patch+json"
  ],
  "publisher": "Google",
  "resourceType": "CapabilityStatement",
  ...
  "status": "draft",
  "url": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  "version": "YYYYMMDD"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// getFHIRMetadata gets FHIR store metadata.
func getFHIRMetadata(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	fhirService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores.Fhir

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	resp, err := fhirService.Capabilities(name).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Capabilities: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("Capabilities: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores.Fhir.Capabilities;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.HttpBody;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreGetMetadata {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreGetMetadata(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "store-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Capabilities request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().fhir().capabilities(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    HttpBody response = request.execute();
    System.out.println("FHIR store metadata retrieved: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const getFhirStoreCapabilities = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/metadata`;
  const request = {name};

  const fhirStore =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.get(request);
  console.log(JSON.stringify(fhirStore.data, null, 2));
};

getFhirStoreCapabilities();

Python

def get_fhir_store_metadata(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Gets the FHIR capability statement (STU3, R4), or the conformance statement
    in the DSTU2 case for the store, which contains a description of functionality
    supported by the server.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    # Imports Python's built-in "json" module
    import json

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    fhir_stores = client.projects().locations().datasets().fhirStores()
    response = fhir_stores.fhir().capabilities(name=fhir_store_name).execute()

    print(json.dumps(response, indent=2))
    return response

Définir le niveau de validation des ressources de base

Par défaut, la validation des ressources de base est appliquée à toutes les ressources de votre magasin FHIR. Cette validation garantit que les conditions suivantes sont remplies lors de la création de la ressource :

Tous les champs obligatoires sont définis.
Tous les types de ressources référencés sont valides.
La ressource répond à toutes les contraintes FHIRPath.

Vous pouvez rendre votre validation de ressource de base moins stricte en désactivant un ou plusieurs de ces types de validation des ressources de base pour votre magasin FHIR.

Console

La console Google Cloud et gcloud CLI ne permettent pas d'effectuer cette opération. Utilisez plutôt curl, PowerShell ou le langage de votre choix.

gcloud

La console Google Cloud et gcloud CLI ne permettent pas d'effectuer cette opération. Utilisez plutôt curl, PowerShell ou le langage de votre choix.

REST

Pour désactiver la validation des ressources de base dans un store FHIR existant, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.patch.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE : type de validation des ressources de base que vous souhaitez désactiver. Pour désactiver la validation, définissez l'un des champs suivants sur true :
- disableRequiredFieldValidation
- disableReferenceTypeValidation
- disableFhirpathValidation

Corps JSON de la requête :

{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

cat > request.json << 'EOF'
{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}
EOF

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

curl -X PATCH \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=validationConfig"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Enregistrez le corps de la requête dans un fichier nommé request.json. Exécutez la commande suivante dans le terminal pour créer ou écraser ce fichier dans le répertoire actuel :

@'
{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Exécutez ensuite la commande suivante pour envoyer votre requête REST :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method PATCH `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=validationConfig" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Vous devriez obtenir un résultat semblable au suivant.

Si vous avez configuré des champs dans la ressource FhirStore, ils apparaissent également dans la réponse.

Réponse

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  ...
  "version": "FHIR_STORE_VERSION",
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}

Supprimer un datastore FHIR

Les exemples suivants montrent comment supprimer un datastore FHIR.

Console

Pour supprimer un datastore, procédez comme suit :

Dans la console Google Cloud, accédez à la page Ensembles de données.
Accéder à la page "Ensembles de données"
Sélectionnez l'ensemble de données contenant le datastore que vous souhaitez supprimer.
Choisissez Supprimer dans la liste déroulante Actions du datastore que vous souhaitez supprimer.
Pour confirmer, saisissez le nom du datastore, puis cliquez sur Supprimer.

gcloud

Pour supprimer un store FHIR, exécutez la commande gcloud healthcare fhir-stores delete.

Avant d'utiliser les données de la commande ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.

Exécutez la commande suivante :

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION

Vous devriez obtenir un résultat semblable à celui-ci :

Deleted fhirStore [FHIR_STORE_ID].

REST

Pour supprimer un magasin FHIR, utilisez la méthode projects.locations.datasets.fhirStores.delete.

Avant d'utiliser les données de requête ci-dessous, effectuez les remplacements suivants :

PROJECT_ID : ID de votre projet Google Cloud
LOCATION : emplacement de l'ensemble de données
DATASET_ID : ensemble de données parent du magasin FHIR.
FHIR_STORE_ID : ID du magasin FHIR.

Pour envoyer votre requête, choisissez l'une des options suivantes :

curl

Exécutez la commande suivante :

curl -X DELETE \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Remarque : La commande suivante suppose que vous vous êtes connecté à la CLI gcloud avec votre compte utilisateur en exécutant la commande gcloud init ou gcloud auth login. Vous pouvez exécuter la commande gcloud auth list pour vérifier quel est le compte actuellement actif.

Exécutez la commande suivante :

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method DELETE `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

API Explorer

Vous devriez recevoir une réponse JSON de ce type :

Réponse

{}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// deleteFHIRStore deletes an FHIR store.
func deleteFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	if _, err := storesService.Delete(name).Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Delete: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Deleted FHIR store: %q\n", fhirStoreID)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreDelete {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreDelete(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-fhir-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Delete request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().delete(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    request.execute();
    System.out.println("FHIR store deleted.");
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const deleteFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {name};

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.delete(request);
  console.log(`Deleted FHIR store: ${fhirStoreId}`);
};

deleteFhirStore();

Python

def delete_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Deletes the specified FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .delete(name=fhir_store_name)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Deleted FHIR store: {fhir_store_id}")

    return response

Étape suivante

Découvrez comment créer et utiliser des ressources FHIR.