Utilizzo dello standard DICOMweb

Questa pagina spiega come utilizzare l'implementazione dell'API Cloud Healthcare di DICOMweb per archiviare e gestire i dati delle immagini DICOM.

Per ulteriori informazioni su come l'API Cloud Healthcare implementa i vari servizi REST DICOMweb, consulta la dichiarazione di conformità DICOM.

L'implementazione DICOMweb nell'API Cloud Healthcare supporta solo REST, non RPC.

Installa l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare

Molti degli esempi in questa pagina utilizzano l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare, uno strumento open source che semplifica l'interazione con i server DICOMweb. Lo strumento fornisce funzionalità per l'archiviazione, il recupero, l'eliminazione e la ricerca di file DICOM. La pagina GitHub dello strumento contiene ulteriori informazioni, ad esempio i requisiti di installazione dettagliati e i modi per personalizzare lo strumento.

Lo strumento viene eseguito tramite Python. Per informazioni su come configurare Python su Google Cloud, consulta Configurazione di un ambiente di sviluppo Python.

Dopo aver configurato Python, puoi installare lo strumento utilizzando Pip:

pip install https://github.com/GoogleCloudPlatform/healthcare-api-dicomweb-cli/archive/v1.0.zip

Per utilizzare lo strumento, devi eseguire l'autenticazione sui server Google Cloud. Puoi farlo utilizzando uno dei seguenti metodi:

• Impostazione della variabile di ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS
• Autenticazione tramite Google Cloud CLI con gcloud auth application-default login

Dopo aver configurato una di queste opzioni, lo strumento rileva automaticamente le tue credenziali.

Archivia dati DICOM

Prima di poter archiviare i dati DICOM, devi creare un archivio DICOM.

L'API Cloud Healthcare implementa il servizio web RESTful per la transazione di archiviazione durante l'archiviazione dei dati DICOM. Per ulteriori informazioni, consulta Transazione di archiviazione nella dichiarazione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Puoi archiviare i dati DICOM utilizzando i seguenti metodi. In entrambi i casi, devi passare un'intestazione application/dicom Accept nella richiesta.

• Archivia un'istanza DICOM (in genere un file .dcm).

• Archivia i metadati JSON DICOM con file JPEG.

  Tutte le richieste per archiviare i metadati JSON DICOM con file JPEG sono messaggi multipart, che vengono indicati dalla parte multipart/related del Content-Type. La porzione multipart/related di Content-Type indica che la richiesta è composta da più parti di dati che vengono combinate dopo il completamento. Ciascuno di questi set di dati deve essere separato utilizzando un confine, come indicato dalla parte boundary del Content-Type.

Gli esempi riportati di seguito mostrano come archiviare un'istanza in un archivio DICOM. Per saperne di più, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

Archivia un'istanza DICOM

Gli esempi riportati di seguito mostrano come archiviare un'istanza DICOM. Per maggiori informazioni, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

REST

Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: il percorso di un file di istanza DICOM sulla tua macchina locale che termina con il suffisso .dcm

Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

arricciatura

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

curl -X POST \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    --data-binary @DICOM_INSTANCE_FILE \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"

PowerShell

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method POST `
    -Headers $headers `
    -InFile DICOM_INSTANCE_FILE `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand Content

L'output è la seguente risposta XML:

Risposta

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Go

import (
	"bytes"
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebStoreInstance stores the given dicomFile with the dicomWebPath.
func dicomWebStoreInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath, dicomFile string) error {
	ctx := context.Background()

	dicomData, err := ioutil.ReadFile(dicomFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ReadFile: %w", err)
	}

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.StoreInstances(parent, dicomWebPath, bytes.NewReader(dicomData))
	call.Header().Set("Content-Type", "application/dicom")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("StoreInstances: %w", err)
	}
	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("StoreInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.nio.file.Files;
import java.nio.file.Paths;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.ByteArrayEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class DicomWebStoreInstance {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebStoreInstance(String dicomStoreName, String filePath)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String filePath = "path/to/file.dcm";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%sv1/%s/dicomWeb/studies", client.getRootUrl(), dicomStoreName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // Load the data from file representing the study.
    File f = new File(filePath);
    byte[] dicomBytes = Files.readAllBytes(Paths.get(filePath));
    ByteArrayEntity requestEntity = new ByteArrayEntity(dicomBytes);

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.post(uriBuilder.build())
            .setEntity(requestEntity)
            .addHeader("Content-Type", "application/dicom")
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception storing DICOM instance: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("DICOM instance stored: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');

const dicomWebStoreInstance = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const dcmFile = 'file.dcm';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'studies';
  // Use a stream because other types of reads overwrite the client's HTTP
  // headers and cause storeInstances to fail.
  const binaryData = fs.createReadStream(dcmFile);
  const request = {
    parent,
    dicomWebPath,
    requestBody: binaryData,
  };

  const instance =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances(
      request,
      {
        headers: {
          'Content-Type': 'application/dicom',
          Accept: 'application/dicom+json',
        },
      }
    );
  console.log('Stored DICOM instance:\n', JSON.stringify(instance.data));
};

dicomWebStoreInstance();

Python

def dicomweb_store_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, dcm_file):
    """Handles the POST requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # dcm_file = 'dicom000_0001.dcm'  # replace with a DICOM file
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    with open(dcm_file, "rb") as dcm:
        dcm_content = dcm.read()

    # Sets required "application/dicom" header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom"}

    response = session.post(dicomweb_path, data=dcm_content, headers=headers)
    response.raise_for_status()
    print("Stored DICOM instance:")
    print(response.text)
    return response

Specifica la classe di archiviazione per archiviare le istanze DICOM (anteprima)

Anteprima

In questa sezione vengono descritte le funzionalità in anteprima che sono soggette a modifica e che potrebbero avere supporto limitato. Le modifiche ai prodotti e alle funzionalità pre-GA potrebbero non essere compatibili con altre versioni pre-GA. Per maggiori informazioni, consulta i Termini dell'offerta pre-GA per l'API Cloud Healthcare e le descrizioni della fase di lancio.

Per impostazione predefinita, il metodo projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances archivia un'istanza DICOM in un archivio DICOM con una classe di archiviazione standard. Puoi impostare la classe di archiviazione quando archivi gli oggetti DICOM dalla tua macchina locale. Per ulteriori informazioni, consulta Modificare la classe di archiviazione DICOM.

I seguenti esempi mostrano come specificare la classe di archiviazione quando si archiviano oggetti DICOM dalla macchina locale.

curl

Utilizza il metodo projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances. Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: il percorso di un file di istanza DICOM sulla tua macchina locale che termina con il suffisso .dcm
• STORAGE_CLASS: la classe di archiviazione per l'istanza DICOM nell'archivio DICOM da STANDARD, NEARLINE, COLDLINE e ARCHIVE

curl -X POST \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Storage-Class: STORAGE_CLASS"
    --data-binary @DICOM_INSTANCE_FILE \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

PowerShell

Utilizza il metodo projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: il percorso di un file di istanza DICOM sulla tua macchina locale che termina con il suffisso .dcm
• STORAGE_CLASS: la classe di archiviazione per l'istanza DICOM nell'archivio DICOM da STANDARD, NEARLINE, COLDLINE e ARCHIVE

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred"; "Storage-Class" = "STORAGE_CLASS" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/dicom" `
  -InFile DCM_FILE.dcm `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand Content

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

crea istanze DICOM da metadati JSON e immagini JPEG

L'API Cloud Healthcare può creare istanze DICOM utilizzando un file di metadati JSON e un file JPEG. Crea istanze DICOM da metadati JSON e file JPEG se preferisci non eseguire personalmente l'analisi e la serializzazione DICOM, poiché l'API Cloud Healthcare può svolgere queste attività per conto tuo.

La richiesta HTTP in cui vengono archiviati questi dati deve includere quanto segue in Content-Type della richiesta:

• Il tipo di media multipart/related
• Il tipo MIME application/dicom+json
• Un separatore boundary

Gli esempi riportati di seguito mostrano come archiviare un file di metadati JSON con un file JPEG.

curl

Nel seguente esempio si presuppone che tu disponga di un'immagine JPEG.

L'archiviazione di un file di metadati JSON con un'immagine JPEG prevede tre passaggi:

1. Creare un file che include una rappresentazione JSON di un'istanza DICOM contenente un'immagine JPEG. Di seguito viene fornito un file modello.

2. Creare tre file di separazione:

   • opening.file: contiene il separatore di apertura per il file di metadati JSON
   • middle.file: contiene il limite centrale per l'immagine JPEG
   • closing.file: contiene il confine di chiusura per tutte le parti del messaggio

3. Crea un file denominato multipart-request.file racchiudendo il file di metadati JSON e l'immagine JPEG all'interno dei file di confine.

Tieni presente che i valori riportati di seguito sono forniti per impostazione predefinita nel file modello di metadati JSON:

• L'UID della sintassi di trasferimento (1.2.840.10008.1.2.4.50) indica la sintassi di trasferimento come base JPEG. La maggior parte delle immagini JPEG è nel formato JPEG di base. Il valore di interpretazione fotometrica (YBR_FULL_422) indica che l'immagine è a colori e non in scala di grigi.
• BulkDataUri è un descrittore arbitrario per l'immagine e nel modello è impostato su jpeg-image. Questo valore viene utilizzato al momento della creazione del separatore dell'immagine.

I valori per SOP_CLASS_UID, SOP_INSTANCE_UID, STUDY_INSTANCE_UID e SERIES_INSTANCE_UID possono essere qualsiasi valore numerico separato da punti. DICOM utilizza una gerarchia di identificatori per istanze, pazienti, studi e serie, quindi scegli un set logico di identificatori per queste variabili.

Sostituisci SOP Class UID con un valore della tabella delle classi SOP standard che indica il tipo di immagine da archiviare.

Nota: a seconda della classe SOP utilizzata, potrebbe essere necessario aggiungere altri tag al file di metadati JSON. Ad esempio, se utilizzi un'immagine a risonanza magnetica (immagine RM), consulta la Tabella A.4-1. MR Image IOD Modules per determinare i tag richiesti.

Sostituisci Rows con l'altezza verticale dell'immagine JPEG in pixel. Sostituisci Columns con la larghezza orizzontale dell'immagine JPEG in pixel.

Procedi con i seguenti passaggi:

1. Salva il testo seguente in un file denominato instance.json, sostituendo le variabili dove specificato.

   [{
    "00020010":{"vr":"UI","Value":["1.2.840.10008.1.2.4.50"]},
    "00080005":{"vr":"CS","Value":["ISO_IR 192"]},
    "00080016":{"vr":"UI","Value":["SOP_CLASS_UID"]},
    "00080018":{"vr":"UI","Value":["SOP_INSTANCE_UID"]},
    "0020000D":{"vr":"UI","Value":["STUDY_INSTANCE_UID"]},
    "0020000E":{"vr":"UI","Value":["SERIES_INSTANCE_UID"]},
    "00280002":{"vr":"US","Value":[3]},
    "00280004":{"vr":"CS","Value":["YBR_FULL_422"]},
    "00280006":{"vr":"US","Value":[0]},
    "00280008":{"vr":"IS","Value":[1]},
    "00280010":{"vr":"US","Value":[Rows]},
    "00280011":{"vr":"US","Value":[Columns]},
    "00280100":{"vr":"US","Value":[8]},
    "00280101":{"vr":"US","Value":[8]},
    "00280102":{"vr":"US","Value":[7]},
    "00280103":{"vr":"US","Value":[0]},
    "7FE00010":{"vr":"OB","BulkDataURI":"jpeg-image"}
   }]
   

2. Per creare il separatore di apertura (per i metadati JSON), quello centrale (per l'immagine JPEG) e quello di chiusura, esegui questi comandi:

   echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file
   echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file
   echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file
   

3. Inserisci l'immagine JPEG tra il separatore centrale e quello di chiusura. Il file di output, che invii all'API Cloud Healthcare, è denominato multipart-request.file:

   cat opening.file instance.json middle.file image.jpg closing.file > multipart-request.file
   

4. Effettua una richiesta POST e specifica le seguenti informazioni:

   • Il nome del set di dati padre
   • Il nome dell'archivio DICOM
   • Il file multipart-request.file
   • Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta POST che utilizza curl.

curl -X POST \
    -H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies \
    --data-binary @multipart-request.file

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato XML:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

utilizza l'interfaccia a riga di comando DICOMweb

I seguenti esempi mostrano come utilizzare l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare per archiviare una o più istanze DICOM. Sono disponibili altri esempi nel repository GitHub di DICOMweb CLI.

Archiviare una singola istanza DICOM:

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  store DCM_FILE

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta simile alla seguente:

TIMESTAMP -- DCM_FILE.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Archiviazione di più file in parallelo utilizzando caratteri jolly:

Il seguente esempio mostra come archiviare in modo ricorsivo più file DICOM in parallelo dalla directory di lavoro corrente. Per archiviare i file in parallelo, aggiungi il flag -m.

dcmweb -m \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  store "./**.dcm"

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta simile alla seguente:

TIMESTAMP -- DCM_FILE_1.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- DCM_FILE_2.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- DCM_FILE_3.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
...
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Cerca dati DICOM

Puoi cercare studi, serie, istanze e frame. Gli esempi riportati di seguito mostrano un'implementazione della transazione di ricerca per cercare istanze in un archivio DICOM. Per maggiori informazioni, consulta Transazione di ricerca nella dichiarazione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Gli esempi riportati di seguito mostrano come cercare istanze in un archivio DICOM. Per maggiori informazioni, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.searchForInstances.

REST

Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM

Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

arricciatura

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"

PowerShell

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand Content

Explorer API

Apri la pagina di riferimento del metodo. Il riquadro Explorer API si apre sul lato destro della pagina. Puoi interagire con questo strumento per inviare richieste. Compila tutti i campi obbligatori e fai clic su Esegui.

Dovresti ricevere una risposta JSON simile alla seguente:

Risposta

[
   {
      "00080005":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "00080016":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080018":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080020":{
         "vr":"DA",
         "Value":[
            "DATE_TIME"
         ]
      },
      "00080030":{
         "vr":"TM",
         "Value":[
            "TIME"
         ]
      },
      "00080060":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "0008103E":{
         "vr":"LO",
         "Value":[
            "LONG_STRING"
         ]
      },
      "00100010":{
         "vr":"PN",
         "Value":[
            {
               "Alphabetic":"Anonymized"
            }
         ]
      },
   },
...
]

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebSearchInstances searches instances.
func dicomWebSearchInstances(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	resp, err := storesService.SearchForInstances(parent, "instances").Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ioutil.ReadAll: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}

	respString := string(respBytes)
	fmt.Fprintf(w, "Found instances: %s\n", respString)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebSearchForInstances {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebSearchForInstances(String dicomStoreName) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.SearchForInstances request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .searchForInstances(dicomStoreName, "instances");

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();
    System.out.println("Dicom store instances found: \n" + response.toString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebSearchForInstances = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'instances';
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const instances =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.searchForInstances(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'application/dicom+json,multipart/related'},
      }
    );
  console.log(`Found ${instances.data.length} instances:`);
  console.log(JSON.stringify(instances.data));
};

dicomWebSearchForInstances();

Python

def dicomweb_search_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Handles the GET requests specified in DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/instances".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    # Sets required application/dicom+json; charset=utf-8 header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom+json; charset=utf-8"}

    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    instances = response.json()

    print("Instances:")
    print(json.dumps(instances, indent=2))

    return instances

Cerca utilizzando i tag DICOM

Puoi perfezionare le ricerche aggiungendo tag DICOM alle tue richieste sotto forma di parametri di ricerca. Ad esempio, potresti voler cercare studi contenenti il nome di un paziente.

Come gli esempi precedenti, quelli riportati di seguito mostrano un'implementazione della transazione di ricerca per cercare studi in un archivio DICOM. Tuttavia, questi esempi mostrano come cercare studi in cui il nome della paziente è "Sally Zhang".

Il seguente esempio mostra una parte dei metadati di un'istanza DICOM in cui è elencato il nome del paziente:

...
{
  "vr": "PN",
  "Value": [
    {
      "Alphabetic": "Sally Zhang"
    }
  ]
}
...

Per cercare studi in un archivio DICOM che riguardano il paziente, aggiungi un parametro di query alla richiesta in cui esegui la ricerca tramite il tag DICOM PatientName. Per un elenco dei parametri di ricerca supportati nell'API Cloud Healthcare, consulta la documentazione sulla transazione di ricerca.

REST

Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM

Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

arricciatura

Nota: assicurati di aver impostato la variabile di ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS sul percorso del file della chiave privata dell'account di servizio.

Nota: puoi aggiungere la corrispondenza parziale quando esegui una ricerca in base a PatientName impostando il parametro di query di seguito su ?PatientName=Sally%20Zhang&fuzzymatching=true. La corrispondenza parziale esegue la tokenizzazione e la normalizzazione sia sul valore di PatientName nella query sia sul valore archiviato. Corrisponde se qualsiasi token di ricerca è un prefisso di qualsiasi token archiviato. Ad esempio, se PatientName è Sally%20Zhang, allora sa, Zh e Sally^Zhang corrispondono. Tuttavia, ally non corrisponde.

Esegui questo comando:

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies?PatientName=Sally%20Zhang"

PowerShell

Nota: assicurati di aver impostato la variabile di ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS sul percorso del file della chiave privata dell'account di servizio.

Nota: puoi aggiungere la corrispondenza parziale quando esegui una ricerca in base a PatientName impostando il parametro di query di seguito su ?PatientName=Sally%20Zhang&fuzzymatching=true. La corrispondenza parziale esegue la tokenizzazione e la normalizzazione sia sul valore di PatientName nella query sia sul valore archiviato. Corrisponde se qualsiasi token di ricerca è un prefisso di qualsiasi token archiviato. Ad esempio, se PatientName è Sally%20Zhang, allora sa, Zh e Sally^Zhang corrispondono. Tuttavia, ally non corrisponde.

Esegui questo comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies?PatientName=Sally%20Zhang" | Select-Object -Expand Content

Explorer API

Apri la pagina di riferimento del metodo. Il riquadro Explorer API si apre sul lato destro della pagina. Puoi interagire con questo strumento per inviare richieste. Compila tutti i campi obbligatori e fai clic su Esegui.

Dovresti ricevere una risposta JSON simile alla seguente:

Risposta

[
  {
    "00080005": {
      "vr": "CS",
      "Value": [
        "CODE_STRING"
      ]
    },
    "00080020": {
      "vr": "DA",
      "Value": [
        "DATE_TIME"
      ]
    },
    "00080030": {
      "vr": "TM",
      "Value": [
        "TIME"
      ]
    },
    "00080050": {
      "vr": "SH"
    },
    "00080090": {
      "vr": "PN",
      "Value": [
        {
          "Alphabetic": "VALUE"
        }
      ]
    },
    "00100010": {
      "vr": "PN",
      "Value": [
        {
          "Alphabetic": "Sally Zhang"
        }
      ]
    },
    "00100020": {
      "vr": "LO",
      "Value": [
        "VALUE"
      ]
    },
    "00100030": {
      "vr": "DA"
    },
    "00100040": {
      "vr": "CS",
      "Value": [
        "F"
      ]
    },
    "0020000D": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "STUDY_INSTANCE_UID"
      ]
    },
    "00200010": {
      "vr": "SH"
    }
  }
]

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// queryParamOpt is a googleapi.Option (https://godoc.org/google.golang.org/api/googleapi#CallOption)
// that adds query parameters to an API call.
type queryParamOpt struct {
	key, value string
}

func (qp queryParamOpt) Get() (string, string) { return qp.key, qp.value }

// dicomWebSearchStudies refines a DICOMweb studies search by appending DICOM tags to the request.
func dicomWebSearchStudies(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.SearchForStudies(name, dicomWebPath)
	// Refine your search by appending DICOM tags to the
	// request in the form of query parameters. This sample
	// searches for studies containing a patient's name.
	patientName := queryParamOpt{key: "PatientName", value: "Sally Zhang"}
	resp, err := call.Do(patientName)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Get: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ioutil.ReadAll: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("SearchForStudies: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	respString := string(respBytes)
	if len(respString) > 0 {
		fmt.Fprintf(w, "Found studies: %s\n", respString)
	} else {
		fmt.Println("No studies found.")
	}

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebSearchStudies {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebSearchStudies(String dicomStoreName) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    DicomStores.SearchForStudies request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .searchForStudies(dicomStoreName, "studies")
            // Refine your search by appending DICOM tags to the
            // request in the form of query parameters. This sample
            // searches for studies containing a patient's name.
            .set("PatientName", "Sally Zhang");

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();
    System.out.println("Studies found: \n" + response.toString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebSearchStudies = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'studies';
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const studies =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.searchForStudies(
      request,
      {
        // Refine your search by appending DICOM tags to the
        // request in the form of query parameters. This sample
        // searches for studies containing a patient's name.
        params: {PatientName: 'Sally Zhang'},
        headers: {Accept: 'application/dicom+json'},
      }
    );
  console.log(studies);

  console.log(`Found ${studies.data.length} studies:`);
  console.log(JSON.stringify(studies.data));
};

dicomWebSearchStudies();

Python

def dicomweb_search_studies(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    # Refine your search by appending DICOM tags to the
    # request in the form of query parameters. This sample
    # searches for studies containing a patient's name.
    params = {"PatientName": "Sally Zhang"}

    response = session.get(dicomweb_path, params=params)

    response.raise_for_status()

    print(f"Studies found: response is {response}")

    # Uncomment the following lines to process the response as JSON.
    # patients = response.json()
    # print('Patients found matching query:')
    # print(json.dumps(patients, indent=2))

    # return patients

utilizza l'interfaccia a riga di comando DICOMweb

Il seguente esempio mostra come utilizzare l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare per cercare istanze in un archivio DICOM. Sono disponibili altri esempi, incluso come filtrare la ricerca, nel repository GitHub dell'interfaccia a riga di comando DICOM.

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  search instances

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:

[
   {
      "00080005":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "00080016":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080018":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080020":{
         "vr":"DA",
         "Value":[
            "DATE_TIME"
         ]
      },
      "00080030":{
         "vr":"TM",
         "Value":[
            "TIME"
         ]
      },
      "00080060":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "0008103E":{
         "vr":"LO",
         "Value":[
            "LONG_STRING"
         ]
      },
      "00100010":{
         "vr":"PN",
         "Value":[
            {
               "Alphabetic":"Anonymized"
            }
         ]
      },
   },

...

]

Recupero di dati DICOM

L'API Cloud Healthcare implementa la transazione di recupero per recuperare studi, serie, istanze e frame in un archivio DICOM.

Per maggiori informazioni, consulta Recuperare la transazione nella dichiarazione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Recupera uno studio

Gli esempi riportati di seguito mostrano come recuperare uno studio. Per ulteriori informazioni, consulta Studio/serie/istanze DICOM nella dichiarazione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Quando specifichi il file di output, utilizza un'estensione come .multipart. Poi analizza il file multiparte per ottenere le singole serie e istanze nello studio.

Per maggiori informazioni, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.studies.retrieveStudy.

curl

Per recuperare uno studio, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• Un file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta GET che utilizza curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" \
     --output FILENAME.multipart

Se la richiesta ha esito positivo, il file DICOM viene scritto sulla tua macchina.

PowerShell

Per recuperare uno studio, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• Un file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta GET mediante Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" | Select-Object -Expand Content
  -OutFile FILENAME.multipart `

Se la richiesta ha esito positivo, il file DICOM viene scritto sulla tua macchina.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveStudy retrieves all instances in the given dicomWebPath
// study.
func dicomWebRetrieveStudy(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.111396399857604"
	// outputFile := "study.multipart"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	resp, err := storesService.RetrieveStudy(parent, dicomWebPath).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveStudy: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveStudy: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	// When specifying the output file, use an extension like ".multipart".
	// Then, parse the downloaded multipart file to get each individual DICOM
	// file.
	fmt.Fprintf(w, "Study retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveStudy {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveStudy(String dicomStoreName, String studyId)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String studyId = "your-study-id";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Studies.RetrieveStudy request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .retrieveStudy(dicomStoreName, "studies/" + studyId);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    // When specifying the output file, use an extension like ".multipart".
    // Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
    // DICOM file.
    String outputPath = "study.multipart";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM study written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format("Exception retrieving DICOM study: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    // The response's default transfer syntax is Little Endian Explicit.
    // As a result, if the file was uploaded using a compressed transfer syntax,
    // the returned object will be decompressed. This can negatively impact performance and lead
    // to errors for transfer syntaxes that the Cloud Healthcare API doesn't support.
    // To avoid these issues, and if the returned object's transfer syntax doesn't matter to
    // your application, use the
    // multipart/related; type="application/dicom"; transfer-syntax=* Accept Header.
    headers.setAccept("multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
// When specifying the output file, use an extension like ".multipart."
// Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
// DICOM file.
const fileName = 'study_file.multipart';

const dicomWebRetrieveStudy = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const study =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.retrieveStudy(
      request,
      {
        headers: {
          Accept:
            'multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*',
        },
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );

  const fileBytes = Buffer.from(study.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved study and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveStudy();

Python

def dicomweb_retrieve_study(
    project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.227'  # replace with the study UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
    )

    # When specifying the output file, use an extension like ".multipart."
    # Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
    # DICOM file.
    file_name = "study.multipart"

    response = session.get(dicomweb_path)

    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(f"Retrieved study and saved to {file_name} in current directory")

    return response

Recupera un'istanza

Gli esempi riportati di seguito mostrano come recuperare un'istanza. Per ulteriori informazioni, consulta il documento relativo alle istanze DICOM nell'istruzione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Se stai recuperando un'istanza, puoi evitare di analizzare i confini multiparte utilizzando l'intestazione HTTP Accept: application/dicom. L'aggiunta di transfer-syntax=* evita la transcodifica restituendo il file nel formato in cui è stato originariamente archiviato.

Per ulteriori informazioni, vedi projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveInstance.

curl

Per recuperare un'istanza, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie, l'UID dell'istanza
• Un nome file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta GET che utilizza curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: application/dicom; transfer-syntax=*" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID" \
     --output FILENAME.dcm

Se la richiesta ha esito positivo, il file DICOM viene scritto sulla tua macchina.

PowerShell

Per recuperare un'istanza, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie
• L'UID dell'istanza
• Un nome file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta GET mediante Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "application/dicom; transfer-syntax=*" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID"
  -OutFile FILENAME.dcm `

Se la richiesta ha esito positivo, il file DICOM viene scritto sulla tua macchina.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveInstance retrieves a specific instance.
func dicomWebRetrieveInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1113639985/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1953511724/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.9562821369"
	// outputFile := "instance.dcm"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.RetrieveInstance(parent, dicomWebPath)
	call.Header().Set("Accept", "application/dicom; transfer-syntax=*")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveInstance: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveInstance: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "DICOM instance retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveInstance {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final String DICOMWEB_PATH = "studies/%s/series/%s/instances/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveInstance(String dicomStoreName, String dicomWebPath)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String dicomWebPath = String.format(DICOMWEB_PATH, "your-study-id", "your-series-id",
    // "your-instance-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Instances.RetrieveInstance request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .series()
            .instances()
            .retrieveInstance(dicomStoreName, dicomWebPath);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    String outputPath = "instance.dcm";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM instance written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format("Exception retrieving DICOM instance: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    headers.set("X-GFE-SSL", "yes");
    // Avoid parsing multipart boundaries by setting 'application/dicom' HTTP header.
    // Add 'transfer-syntax=*' to avoid transcoding by returning the file in the format it
    // was originally stored in.
    headers.setAccept("application/dicom; transfer-syntax=*");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
const fileName = 'instance_file.dcm';

const dicomWebRetrieveInstance = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  // const seriesUid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633';
  // const instanceUid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}/series/${seriesUid}/instances/${instanceUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const instance =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveInstance(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'application/dicom; transfer-syntax=*'},
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );
  const fileBytes = Buffer.from(instance.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved DICOM instance and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveInstance();

Python

def dicomweb_retrieve_instance(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    dicom_store_id,
    study_uid,
    series_uid,
    instance_uid,
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    # series_uid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633'  # replace with the series UID
    # instance_uid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148'  # replace with the instance UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicom_store_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    dicomweb_path = "{}/dicomWeb/studies/{}/series/{}/instances/{}".format(
        dicom_store_path, study_uid, series_uid, instance_uid
    )

    file_name = "instance.dcm"

    # Set the required Accept header on the request
    headers = {"Accept": "application/dicom; transfer-syntax=*"}
    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(
            "Retrieved DICOM instance and saved to {} in current directory".format(
                file_name
            )
        )

    return response

Recupero dei formati delle immagini dei consumatori

Gli esempi riportati di seguito mostrano come recuperare un formato di immagine per consumatori come JPEG o PNG utilizzando l'implementazione dell'API Cloud Healthcare delle risorse sottoposte a rendering. Per ulteriori informazioni, consulta Risorse sottoposte a rendering nell'istruzione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Per maggiori informazioni, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveRendered.

Nota: se vuoi eseguire il rendering di un'immagine multi-frame, usa il metodo frames.retrieveFrames anziché il metodo frames.retrieveRendered perché frames.retrieveRendered non supporta immagini multi-frame.

curl

Per recuperare un'immagine, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie
• L'UID dell'istanza
• Un nome file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra come recuperare un'immagine PNG con una richiesta GET utilizzando curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: image/png" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/rendered" \
     --output FILENAME.png

Se la richiesta ha esito positivo, il file PNG viene scritto sul tuo computer.

PowerShell

Per recuperare un'immagine, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie
• L'UID dell'istanza
• Un nome file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra come recuperare un'immagine PNG con una richiesta GET utilizzando Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "image/png" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/rendered"
  -OutFile FILENAME.png `

Se la richiesta ha esito positivo, il file PNG viene scritto sul tuo computer.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveRendered retrieves a consumer imaging format like JPEG or PNG.
func dicomWebRetrieveRendered(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1113639985/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1953511724/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.9562821369/rendered"
	// outputFile := "rendered_image.png"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.RetrieveRendered(parent, dicomWebPath)
	call.Header().Set("Accept", "image/png")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveRendered: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveRendered: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Rendered PNG image retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveRendered {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final String DICOMWEB_PATH = "studies/%s/series/%s/instances/%s/rendered";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveRendered(String dicomStoreName, String dicomWebPath)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String dicomWebPath = String.format(DICOMWEB_PATH, "your-study-id", "your-series-id",
    // "your-instance-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Instances.RetrieveRendered request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .series()
            .instances()
            .retrieveRendered(dicomStoreName, dicomWebPath);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    String outputPath = "image.png";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM rendered PNG image written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception retrieving DICOM rendered image: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    headers.set("X-GFE-SSL", "yes");
    // Retrieve using the PNG consumer imaging format.
    headers.setAccept("image/png");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
const fileName = 'rendered_image.png';

const dicomWebRetrieveRendered = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  // const seriesUid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633';
  // const instanceUid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}/series/${seriesUid}/instances/${instanceUid}/rendered`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const rendered =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveRendered(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'image/png'},
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );
  const fileBytes = Buffer.from(rendered.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved rendered image and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveRendered();

Python

def dicomweb_retrieve_rendered(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    dicom_store_id,
    study_uid,
    series_uid,
    instance_uid,
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    # series_uid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633'  # replace with the series UID
    # instance_uid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148'  # replace with the instance UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicom_store_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    dicomweb_path = "{}/dicomWeb/studies/{}/series/{}/instances/{}/rendered".format(
        dicom_store_path, study_uid, series_uid, instance_uid
    )

    file_name = "rendered_image.png"

    # Sets the required Accept header on the request for a PNG image
    headers = {"Accept": "image/png"}
    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(
            "Retrieved rendered image and saved to {} in current directory".format(
                file_name
            )
        )

    return response

Recupero dei metadati

Puoi recuperare i metadati per tutte le istanze in uno studio o in una serie. Il seguente esempio mostra come recuperare i metadati per un'istanza. Per ulteriori informazioni, consulta Risorse dei metadati nella dichiarazione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Per ulteriori informazioni, vedi projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveMetadata.

Quando chiami retrieveMetadata, il metodo restituisce lo stesso insieme di campi restituito quando cerchi un'istanza con il parametro di query includefield=all. Se la tua applicazione è sensibile alla latenza e vuoi recuperare i metadati per un insieme specifico di campi (anziché tutti i campi), non chiamare retrieveMetadata. Richiama invece uno dei metodi searchForInstances e specifica i campi. La risposta sarà un insieme più ridotto di campi e un insieme più ridotto è utile per le applicazioni sensibili alla latenza.

Per impostazione predefinita, retrieveMetadata restituisce una risposta JSON. Per restituire una risposta XML, trasmetti un'intestazione HTTP Accept: multipart/related; type="application/dicom+xml" nella richiesta.

REST

Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

• PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
• LOCATION: la posizione del set di dati
• DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
• DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM
• STUDY_INSTANCE_UID: l'identificatore univoco dell'istanza dello studio
• SERIES_INSTANCE_UID: l'identificatore univoco dell'istanza della serie
• INSTANCE_UID: l'identificatore univoco dell'istanza

Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

arricciatura

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/metadata"

PowerShell

Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

Esegui questo comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/metadata" | Select-Object -Expand Content

Explorer API

Apri la pagina di riferimento del metodo. Il riquadro Explorer API si apre sul lato destro della pagina. Puoi interagire con questo strumento per inviare richieste. Compila tutti i campi obbligatori e fai clic su Esegui.

Dovresti ricevere una risposta JSON simile alla seguente:

Risposta

[
  {
    "00020002": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020003": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020010": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020012": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020013": {
      "vr": "SH",
      "Value": [
        "OFFIS_DCMTK_"
      ]
    },
    "00080016": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    ...
  }
]

Recupera dati collettivi

Anteprima

In questa sezione vengono descritte le funzionalità in anteprima che sono soggette a modifica e che potrebbero avere supporto limitato. Le modifiche ai prodotti e alle funzionalità pre-GA potrebbero non essere compatibili con altre versioni pre-GA. Per maggiori informazioni, consulta i Termini dell'offerta pre-GA per l'API Cloud Healthcare e le descrizioni della fase di lancio.

Puoi recuperare i byte non elaborati per un tag bulksheet specifico in un'istanza archiviata. Quando recuperi i metadati da un'istanza utilizzando i metodi di anteprima, verranno generati BulkDataURI per i tag bulksheet supportati (consulta la definizione di Bulkdata).

Per ulteriori informazioni, vedi projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.bulkdata.retrieveBulkdata.

L'esempio seguente creerà l'URL della richiesta direttamente in base al percorso noto di un tag bulksheet (senza utilizzare retrieveMetadata per ottenere il BulkDataURI).

curl

Per recuperare i dati collettivi, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie
• L'UID dell'istanza
• Il percorso del tag dati collettivi di destinazione.
  • Per un tag (XXXX,XXXX) all'interno di una sequenza (AAAA,AAAA) nell'indice i, il percorso sarà "AAAAAAAA/i/XXXXXXXX"
• Un nome file di output
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra come recuperare un file DAT con una richiesta GET utilizzando curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/bulkdata/BULKDATA_PATH" \
     --output FILENAME.dat

Se la richiesta ha esito positivo, il file DAT che contiene i byte non elaborati dell'istanza viene scritto sulla tua macchina.

PowerShell

Per recuperare i dati collettivi, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati padre
• Il nome dell'archivio DICOM
• L'identificatore univoco (UID) dello studio
• L'UID della serie
• L'UID dell'istanza
• Il percorso del tag dati collettivi di destinazione.
  • Per un tag (XXXX,XXXX) all'interno di una sequenza (AAAA,AAAA) nell'indice i, il percorso sarà "AAAAAAAA/i/XXXXXXXX"
• Un nome file di output
• Un token di accesso

L'esempio seguente mostra come recuperare un file DAT con una richiesta GET utilizzando Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "application/octet-stream; transfer-syntax=*" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/bulkdata/BULKDATA_PATH"
  -OutFile FILENAME.DAT `

Se la richiesta ha esito positivo, il file DAT che contiene i byte non elaborati dell'istanza viene scritto sulla tua macchina.

utilizza l'interfaccia a riga di comando DICOMweb

Il seguente esempio mostra come utilizzare l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare per recuperare tutte le istanze in un archivio DICOM e salvarle sulla tua macchina nella directory di lavoro attuale. Sono disponibili altri esempi nel repository GitHub di DICOMweb CLI.

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  retrieve

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta simile alla seguente e i file DICOM vengono scritti sulla tua macchina:

TIMESTAMP -- Saving files into ./
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Eliminare uno studio, una serie o un'istanza

L'API Cloud Healthcare implementa un servizio web di proprietà per l'eliminazione di studi, serie e istanze DICOM. Questo servizio non fa parte dei servizi dello standard DICOMweb. Per ulteriori informazioni, consulta la sezione Elimina nell'istruzione di conformità DICOM dell'API Cloud Healthcare.

Le richieste di eliminazione per studi e serie restituiscono un'operazione a lunga esecuzione. Al termine dell'operazione, tutte le istanze nello studio o nella serie vengono eliminate.

Le richieste di eliminazione per le istanze non restituiscono un'operazione a lunga esecuzione, ma un corpo di risposta vuoto come il seguente:

{}

Gli esempi riportati di seguito mostrano come eliminare uno studio DICOM. Per saperne di più, consulta projects.locations.datasets.dicomStores.studies.delete.

REST

1. Elimina lo studio.

   Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

   • PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
   • LOCATION: la posizione del set di dati
   • DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
   • DICOM_STORE_ID: l'ID archivio DICOM
   • STUDY_INSTANCE_UID: l'identificatore univoco dell'istanza dello studio

   Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

   arricciatura

   Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

   Esegui questo comando:

   curl -X DELETE \
       -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
       "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID"

   PowerShell

   Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

   Esegui questo comando:

   $cred = gcloud auth print-access-token
   $headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
   
   Invoke-WebRequest `
       -Method DELETE `
       -Headers $headers `
       -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" | Select-Object -Expand Content

   Explorer API

   Apri la pagina di riferimento del metodo. Il riquadro Explorer API si apre sul lato destro della pagina. Puoi interagire con questo strumento per inviare richieste. Compila tutti i campi obbligatori e fai clic su Esegui.

   Dovresti ricevere una risposta JSON simile alla seguente:

   Risposta

   {
     "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
   }
   

2. Visualizza lo stato dell'operazione a lunga esecuzione.

   Prima di utilizzare i dati della richiesta, effettua le seguenti sostituzioni:

   • PROJECT_ID: l'ID del tuo progetto Google Cloud
   • LOCATION: la posizione del set di dati
   • DATASET_ID: il set di dati padre dell'archivio DICOM
   • OPERATION_ID: l'ID restituito dall'operazione a lunga esecuzione

   Per inviare la richiesta, scegli una delle seguenti opzioni:

   arricciatura

   Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

   Esegui questo comando:

   curl -X GET \
       -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
       "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"

   PowerShell

   Nota: il comando seguente presuppone che tu abbia eseguito l'accesso all'interfaccia a riga di comando gcloud con il tuo account utente eseguendo gcloud init o gcloud auth login oppure utilizzando Cloud Shell, che ti consente di accedere automaticamente all'interfaccia a riga di comando gcloud. Puoi controllare l'account attualmente attivo eseguendo gcloud auth list.

   Esegui questo comando:

   $cred = gcloud auth print-access-token
   $headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
   
   Invoke-WebRequest `
       -Method GET `
       -Headers $headers `
       -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content

   Explorer API

   Apri la pagina di riferimento del metodo. Il riquadro Explorer API si apre sul lato destro della pagina. Puoi interagire con questo strumento per inviare richieste. Compila tutti i campi obbligatori e fai clic su Esegui.

   Dovresti ricevere una risposta JSON simile alla seguente:

   Risposta

   {
     "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
     "metadata": {
       "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
       "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicomweb.DicomWebService.DeleteStudy",
       "createTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ",
       "endTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ",
       "logsUrl": "CLOUD_LOGGING_URL",
     },
     "done": true,
     "response": {
       "@type": "type.googleapis.com/google.protobuf.Empty",
     }
   }
   

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebDeleteStudy deletes all instances in the given dicomWebPath study.
func dicomWebDeleteStudy(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	if _, err := storesService.Delete(parent, dicomWebPath).Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Delete: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Deleted %q\n", dicomWebPath)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebDeleteStudy {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebDeleteStudy(String dicomStoreName, String studyId) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String studyId = "your-study-id";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Studies.Delete request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .delete(dicomStoreName, "studies/" + studyId);

    // Execute the request and process the results.
    request.execute();
    System.out.println("DICOM study deleted.");
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebDeleteStudy = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.delete(
    request
  );
  console.log('Deleted DICOM study');
};

dicomWebDeleteStudy();

Python

def dicomweb_delete_study(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, study_uid):
    """Handles DELETE requests equivalent to the GET requests specified in
    the WADO-RS standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
    )

    # Sets the required application/dicom+json; charset=utf-8 header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom+json; charset=utf-8"}

    response = session.delete(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    print("Deleted study.")

    return response

utilizza l'interfaccia a riga di comando DICOMweb

Il seguente esempio mostra come utilizzare l'interfaccia a riga di comando DICOMweb dell'API Cloud Healthcare per eliminare uno studio:

dcmweb \
    https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
   delete studies/STUDY_INSTANCE_UID

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce un'operazione che lo strumento di interfaccia a riga di comando esegue il polling fino al completamento dell'operazione di eliminazione.