Modèle BigQuery vers TFRecord Cloud Storage

Le modèle BigQuery vers TFRecords Cloud Storage est un pipeline qui lit les données à partir d'une requête BigQuery et les écrit dans un bucket Cloud Storage au format TFRecord. Vous pouvez spécifier les pourcentages de répartition pour l'entraînement, les tests et la validation. Par défaut, la répartition est de 1 ou 100 % pour l'ensemble d'entraînement, et de 0 ou 0 % pour les ensembles de test et de validation. Lorsque vous définissez la répartition des ensembles de données, la somme des valeurs assignées à l'entraînement, aux tests et à la validation doit être égale à 1 ou 100 % (par exemple : 0,6 + 0,2 + 0,2). Dataflow détermine automatiquement le nombre optimal de segments pour chaque ensemble de données de sortie.

Conditions requises pour ce pipeline

• L'ensemble de données et la table BigQuery doivent exister.
• Le bucket Cloud Storage de sortie doit exister avant l'exécution du pipeline. Les sous-répertoires d'entraînement, de test et de validation n'ont pas besoin d'exister au préalable, ils sont générés automatiquement.

Paramètres de modèle

Paramètres obligatoires

• readQuery: requête SQL BigQuery qui extrait les données de la source. Exemple :select * from dataset1.sample_table
• outputDirectory: préfixe du chemin d'accès de niveau supérieur dans Cloud Storage à utiliser lors de l'écriture des fichiers TFRecord d'entraînement, de test et de validation. Les sous-répertoires dédiés aux fichiers TFRecord d'entraînement, de test et de validation résultants sont générés à partir de outputDirectory. Par exemple, gs://mybucket/output.

Paramètres facultatifs

• readIdColumn: nom de la colonne BigQuery stockant l'identifiant unique de la ligne.
• invalidOutputPath: chemin d'accès Cloud Storage où écrire les lignes BigQuery qui ne peuvent pas être converties en entités cibles. Exemple :gs://your-bucket/your-path
• outputSuffix: suffixe des fichiers TFRecord d'entraînement, de test et de validation écrits. La valeur par défaut est .tfrecord.
• trainingPercentage: pourcentage des données de requête alloué aux fichiers TFRecord d'entraînement. La valeur par défaut est 1 ou 100%.
• testingPercentage: pourcentage des données de requête alloué aux fichiers TFRecord de test. La valeur par défaut est 0 ou 0%.
• validationPercentage: pourcentage des données de requête alloué aux fichiers TFRecord de validation. La valeur par défaut est 0 ou 0%.

Exécuter le modèle

Console

1. Accédez à la page Dataflow Créer un job à partir d'un modèle.
Accéder à la page Créer un job à partir d'un modèle
2. Dans le champ Nom du job, saisissez un nom de job unique.
3. Facultatif : pour Point de terminaison régional, sélectionnez une valeur dans le menu déroulant. La région par défaut est us-central1.

   Pour obtenir la liste des régions dans lesquelles vous pouvez exécuter un job Dataflow, consultez la page Emplacements Dataflow.

4. Dans le menu déroulant Modèle Dataflow, sélectionnez the BigQuery to TFRecords template.
5. Dans les champs fournis, saisissez vos valeurs de paramètres.
6. Cliquez sur Run Job (Exécuter la tâche).

gcloud

Remarque : Pour utiliser Google Cloud CLI afin d'exécuter les modèles classic, vous devez avoir Google Cloud CLI version 138.0.0 ou ultérieure.

Dans le shell ou le terminal, exécutez le modèle :

gcloud dataflow jobs run JOB_NAME \
    --gcs-location gs://dataflow-templates-REGION_NAME/VERSION/Cloud_BigQuery_to_GCS_TensorFlow_Records \
    --region REGION_NAME \
    --parameters \
readQuery=READ_QUERY,\
outputDirectory=OUTPUT_DIRECTORY,\
trainingPercentage=TRAINING_PERCENTAGE,\
testingPercentage=TESTING_PERCENTAGE,\
validationPercentage=VALIDATION_PERCENTAGE,\
outputSuffix=OUTPUT_FILENAME_SUFFIX

Remplacez les éléments suivants :

• JOB_NAME : nom de job unique de votre choix
• VERSION : version du modèle que vous souhaitez utiliser

  Vous pouvez utiliser les valeurs suivantes :

  • latest pour utiliser la dernière version du modèle, disponible dans le dossier parent non daté du bucket gs://dataflow-templates-REGION_NAME/latest/
  • Le nom de la version, par exemple 2023-09-12-00_RC00, pour utiliser une version spécifique du modèle, qui est imbriqué dans le dossier parent daté respectif dans le bucket : gs://dataflow-templates-REGION_NAME/
  Attention : La dernière version des modèles peut être mise à jour avec des modifications destructives. Vos environnements de production devraient utiliser des modèles conservés dans le dernier dossier parent daté afin d'empêcher que ces modifications n'affectent vos workflows.
• REGION_NAME : région dans laquelle vous souhaitez déployer votre job Dataflow, par exemple us-central1
• READ_QUERY : requête BigQuery à exécuter
• OUTPUT_DIRECTORY : préfixe du chemin d'accès Cloud Storage pour les ensembles de données de sortie
• TRAINING_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données d'entraînement
• TESTING_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données de test
• VALIDATION_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données de validation
• OUTPUT_FILENAME_SUFFIX : suffixe souhaité pour les fichiers TensorFlow Record de sortie

API

Pour exécuter le modèle à l'aide de l'API REST, envoyez une requête HTTP POST. Pour en savoir plus sur l'API, ses autorisations et leurs champs d'application, consultez la section projects.templates.launch.

POST https://dataflow.googleapis.com/v1b3/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/templates:launch?gcsPath=gs://dataflow-templates-LOCATION/VERSION/Cloud_BigQuery_to_GCS_TensorFlow_Records
{
   "jobName": "JOB_NAME",
   "parameters": {
       "readQuery":"READ_QUERY",
       "outputDirectory":"OUTPUT_DIRECTORY",
       "trainingPercentage":"TRAINING_PERCENTAGE",
       "testingPercentage":"TESTING_PERCENTAGE",
       "validationPercentage":"VALIDATION_PERCENTAGE",
       "outputSuffix":"OUTPUT_FILENAME_SUFFIX"
   },
   "environment": { "zone": "us-central1-f" }
}

Remplacez les éléments suivants :

• PROJECT_ID : ID du projet Google Cloud dans lequel vous souhaitez exécuter le job Dataflow
• JOB_NAME : nom de job unique de votre choix
• VERSION : version du modèle que vous souhaitez utiliser

  Vous pouvez utiliser les valeurs suivantes :

  • latest pour utiliser la dernière version du modèle, disponible dans le dossier parent non daté du bucket gs://dataflow-templates-REGION_NAME/latest/
  • Le nom de la version, par exemple 2023-09-12-00_RC00, pour utiliser une version spécifique du modèle, qui est imbriqué dans le dossier parent daté respectif dans le bucket : gs://dataflow-templates-REGION_NAME/
  Attention : La dernière version des modèles peut être mise à jour avec des modifications destructives. Vos environnements de production devraient utiliser des modèles conservés dans le dernier dossier parent daté afin d'empêcher que ces modifications n'affectent vos workflows.
• LOCATION : région dans laquelle vous souhaitez déployer votre job Dataflow, par exemple us-central1
• READ_QUERY : requête BigQuery à exécuter
• OUTPUT_DIRECTORY : préfixe du chemin d'accès Cloud Storage pour les ensembles de données de sortie
• TRAINING_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données d'entraînement
• TESTING_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données de test
• VALIDATION_PERCENTAGE : valeur décimale du pourcentage représentant la fraction de l'ensemble de données de validation
• OUTPUT_FILENAME_SUFFIX : suffixe souhaité pour les fichiers TensorFlow Record de sortie

Code source du modèle

Java

/*
 * Copyright (C) 2019 Google LLC
 *
 * Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License"); you may not
 * use this file except in compliance with the License. You may obtain a copy of
 * the License at
 *
 *   http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 *
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS, WITHOUT
 * WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied. See the
 * License for the specific language governing permissions and limitations under
 * the License.
 */
package com.google.cloud.teleport.templates;

import com.google.api.services.bigquery.model.TableFieldSchema;
import com.google.cloud.teleport.metadata.Template;
import com.google.cloud.teleport.metadata.TemplateCategory;
import com.google.cloud.teleport.metadata.TemplateParameter;
import com.google.cloud.teleport.templates.BigQueryToTFRecord.Options;
import com.google.cloud.teleport.templates.common.BigQueryConverters.BigQueryReadOptions;
import com.google.protobuf.ByteString;
import java.util.Iterator;
import java.util.Random;
import org.apache.avro.generic.GenericData;
import org.apache.avro.generic.GenericRecord;
import org.apache.avro.util.Utf8;
import org.apache.beam.sdk.Pipeline;
import org.apache.beam.sdk.PipelineResult;
import org.apache.beam.sdk.coders.ByteArrayCoder;
import org.apache.beam.sdk.io.FileIO;
import org.apache.beam.sdk.io.TFRecordIO;
import org.apache.beam.sdk.io.gcp.bigquery.BigQueryIO;
import org.apache.beam.sdk.io.gcp.bigquery.SchemaAndRecord;
import org.apache.beam.sdk.options.Default;
import org.apache.beam.sdk.options.PipelineOptionsFactory;
import org.apache.beam.sdk.options.ValueProvider;
import org.apache.beam.sdk.transforms.Partition;
import org.apache.beam.sdk.transforms.Reshuffle;
import org.apache.beam.sdk.values.PCollection;
import org.apache.beam.sdk.values.PCollectionList;
import org.apache.beam.vendor.guava.v32_1_2_jre.com.google.common.annotations.VisibleForTesting;
import org.tensorflow.example.Example;
import org.tensorflow.example.Feature;
import org.tensorflow.example.Features;

/**
 * Dataflow template which reads BigQuery data and writes it to GCS as a set of TFRecords. The
 * source is a SQL query.
 *
 * <p>Check out <a
 * href="https://github.com/GoogleCloudPlatform/DataflowTemplates/blob/main/v1/README_Cloud_BigQuery_to_GCS_TensorFlow_Records.md">README</a>
 * for instructions on how to use or modify this template.
 */
@Template(
    name = "Cloud_BigQuery_to_GCS_TensorFlow_Records",
    category = TemplateCategory.BATCH,
    displayName = "BigQuery to TensorFlow Records",
    description =
        "The BigQuery to Cloud Storage TFRecords template is a pipeline that reads data from a BigQuery query and writes it to a Cloud Storage bucket in TFRecord format. "
            + "You can specify the training, testing, and validation percentage splits. "
            + "By default, the split is 1 or 100% for the training set and 0 or 0% for testing and validation sets. "
            + "When setting the dataset split, the sum of training, testing, and validation needs to add up to 1 or 100% (for example, 0.6+0.2+0.2). "
            + "Dataflow automatically determines the optimal number of shards for each output dataset.",
    optionsClass = Options.class,
    optionsOrder = {BigQueryReadOptions.class, Options.class},
    documentation =
        "https://cloud.google.com/dataflow/docs/guides/templates/provided/bigquery-to-tfrecords",
    contactInformation = "https://cloud.google.com/support",
    requirements = {
      "The BigQuery dataset and table must exist.",
      "The output Cloud Storage bucket must exist before pipeline execution. Training, testing, and validation subdirectories don't need to preexist and are autogenerated."
    })
public class BigQueryToTFRecord {

  /**
   * The {@link BigQueryToTFRecord#buildFeatureFromIterator(Class, Object, Feature.Builder)} method
   * handles {@link GenericData.Array} that are passed into the {@link
   * BigQueryToTFRecord#buildFeature} method creating a TensorFlow feature from the record.
   */
  private static final String TRAIN = "train/";

  private static final String TEST = "test/";
  private static final String VAL = "val/";

  private static void buildFeatureFromIterator(
      Class<?> fieldType, Object field, Feature.Builder feature) {
    ByteString byteString;
    GenericData.Array f = (GenericData.Array) field;
    if (fieldType == Long.class) {
      Iterator<Long> longIterator = f.iterator();
      while (longIterator.hasNext()) {
        Long longValue = longIterator.next();
        feature.getInt64ListBuilder().addValue(longValue);
      }
    } else if (fieldType == double.class) {
      Iterator<Double> doubleIterator = f.iterator();
      while (doubleIterator.hasNext()) {
        double doubleValue = doubleIterator.next();
        feature.getFloatListBuilder().addValue((float) doubleValue);
      }
    } else if (fieldType == String.class) {
      Iterator<Utf8> stringIterator = f.iterator();
      while (stringIterator.hasNext()) {
        String stringValue = stringIterator.next().toString();
        byteString = ByteString.copyFromUtf8(stringValue);
        feature.getBytesListBuilder().addValue(byteString);
      }
    } else if (fieldType == boolean.class) {
      Iterator<Boolean> booleanIterator = f.iterator();
      while (booleanIterator.hasNext()) {
        Boolean boolValue = booleanIterator.next();
        int boolAsInt = boolValue ? 1 : 0;
        feature.getInt64ListBuilder().addValue(boolAsInt);
      }
    }
  }

  /**
   * The {@link BigQueryToTFRecord#buildFeature} method takes in an individual field and type
   * corresponding to a column value from a SchemaAndRecord Object returned from a BigQueryIO.read()
   * step. The method builds a TensorFlow Feature based on the type of the object- ie: STRING, TIME,
   * INTEGER etc..
   */
  private static Feature buildFeature(Object field, String type) {
    Feature.Builder feature = Feature.newBuilder();
    ByteString byteString;

    switch (type) {
      case "STRING":
      case "TIME":
      case "DATE":
        if (field instanceof GenericData.Array) {
          buildFeatureFromIterator(String.class, field, feature);
        } else {
          byteString = ByteString.copyFromUtf8(field.toString());
          feature.getBytesListBuilder().addValue(byteString);
        }
        break;
      case "BYTES":
        byteString = ByteString.copyFrom((byte[]) field);
        feature.getBytesListBuilder().addValue(byteString);
        break;
      case "INTEGER":
      case "INT64":
      case "TIMESTAMP":
        if (field instanceof GenericData.Array) {
          buildFeatureFromIterator(Long.class, field, feature);
        } else {
          feature.getInt64ListBuilder().addValue((long) field);
        }
        break;
      case "FLOAT":
      case "FLOAT64":
        if (field instanceof GenericData.Array) {
          buildFeatureFromIterator(double.class, field, feature);
        } else {
          feature.getFloatListBuilder().addValue((float) (double) field);
        }
        break;
      case "BOOLEAN":
      case "BOOL":
        if (field instanceof GenericData.Array) {
          buildFeatureFromIterator(boolean.class, field, feature);
        } else {
          int boolAsInt = (boolean) field ? 1 : 0;
          feature.getInt64ListBuilder().addValue(boolAsInt);
        }
        break;
      default:
        throw new RuntimeException("Unsupported type: " + type);
    }
    return feature.build();
  }

  /**
   * The {@link BigQueryToTFRecord#record2Example(SchemaAndRecord)} method uses takes in a
   * SchemaAndRecord Object returned from a BigQueryIO.read() step and builds a TensorFlow Example
   * from the record.
   */
  @VisibleForTesting
  protected static byte[] record2Example(SchemaAndRecord schemaAndRecord) {
    Example.Builder example = Example.newBuilder();
    Features.Builder features = example.getFeaturesBuilder();
    GenericRecord record = schemaAndRecord.getRecord();
    for (TableFieldSchema field : schemaAndRecord.getTableSchema().getFields()) {
      Object fieldValue = record.get(field.getName());
      if (fieldValue != null) {
        Feature feature = buildFeature(fieldValue, field.getType());
        features.putFeature(field.getName(), feature);
      }
    }
    return example.build().toByteArray();
  }

  /**
   * The {@link BigQueryToTFRecord#concatURI} method uses takes in a Cloud Storage URI and a
   * subdirectory name and safely concatenates them. The resulting String is used as a sink for
   * TFRecords.
   */
  private static String concatURI(String dir, String folder) {
    if (dir.endsWith("/")) {
      return dir + folder;
    } else {
      return dir + "/" + folder;
    }
  }

  /**
   * The {@link BigQueryToTFRecord#applyTrainTestValSplit} method transforms the PCollection by
   * randomly partitioning it into PCollections for each dataset.
   */
  static PCollectionList<byte[]> applyTrainTestValSplit(
      PCollection<byte[]> input,
      ValueProvider<Float> trainingPercentage,
      ValueProvider<Float> testingPercentage,
      ValueProvider<Float> validationPercentage,
      Random rand) {
    return input.apply(
        Partition.of(
            3,
            (Partition.PartitionFn<byte[]>)
                (number, numPartitions) -> {
                  Float train = trainingPercentage.get();
                  Float test = testingPercentage.get();
                  Float validation = validationPercentage.get();
                  Double d = rand.nextDouble();
                  if (train + test + validation != 1) {
                    throw new RuntimeException(
                        String.format(
                            "Train %.2f, Test %.2f, Validation"
                                + " %.2f percentages must add up to 100 percent",
                            train, test, validation));
                  }
                  if (d < train) {
                    return 0;
                  } else if (d >= train && d < train + test) {
                    return 1;
                  } else {
                    return 2;
                  }
                }));
  }

  /** Run the pipeline. */
  public static void main(String[] args) {
    Options options = PipelineOptionsFactory.fromArgs(args).withValidation().as(Options.class);
    run(options);
  }

  /**
   * Runs the pipeline to completion with the specified options. This method does not wait until the
   * pipeline is finished before returning. Invoke {@code result.waitUntilFinish()} on the result
   * object to block until the pipeline is finished running if blocking programmatic execution is
   * required.
   *
   * @param options The execution options.
   * @return The pipeline result.
   */
  public static PipelineResult run(Options options) {
    Random rand = new Random(100); // set random seed
    Pipeline pipeline = Pipeline.create(options);

    PCollection<byte[]> bigQueryToExamples =
        pipeline
            .apply(
                "RecordToExample",
                BigQueryIO.read(BigQueryToTFRecord::record2Example)
                    .fromQuery(options.getReadQuery())
                    .withCoder(ByteArrayCoder.of())
                    .withTemplateCompatibility()
                    .withoutValidation()
                    .usingStandardSql()
                    .withMethod(BigQueryIO.TypedRead.Method.DIRECT_READ)
                // Enable BigQuery Storage API
                )
            .apply("ReshuffleResults", Reshuffle.viaRandomKey());

    PCollectionList<byte[]> partitionedExamples =
        applyTrainTestValSplit(
            bigQueryToExamples,
            options.getTrainingPercentage(),
            options.getTestingPercentage(),
            options.getValidationPercentage(),
            rand);

    partitionedExamples
        .get(0)
        .apply(
            "WriteTFTrainingRecord",
            FileIO.<byte[]>write()
                .via(TFRecordIO.sink())
                .to(
                    ValueProvider.NestedValueProvider.of(
                        options.getOutputDirectory(), dir -> concatURI(dir, TRAIN)))
                .withNumShards(0)
                .withSuffix(options.getOutputSuffix()));

    partitionedExamples
        .get(1)
        .apply(
            "WriteTFTestingRecord",
            FileIO.<byte[]>write()
                .via(TFRecordIO.sink())
                .to(
                    ValueProvider.NestedValueProvider.of(
                        options.getOutputDirectory(), dir -> concatURI(dir, TEST)))
                .withNumShards(0)
                .withSuffix(options.getOutputSuffix()));

    partitionedExamples
        .get(2)
        .apply(
            "WriteTFValidationRecord",
            FileIO.<byte[]>write()
                .via(TFRecordIO.sink())
                .to(
                    ValueProvider.NestedValueProvider.of(
                        options.getOutputDirectory(), dir -> concatURI(dir, VAL)))
                .withNumShards(0)
                .withSuffix(options.getOutputSuffix()));

    return pipeline.run();
  }

  /** Define command line arguments. */
  public interface Options extends BigQueryReadOptions {

    @TemplateParameter.GcsWriteFolder(
        order = 1,
        groupName = "Target",
        description = "Output Cloud Storage directory.",
        helpText =
            "The top-level Cloud Storage path prefix to use when writing the training, testing, and validation TFRecord files. Subdirectories for resulting training, testing, and validation TFRecord files are automatically generated from `outputDirectory`.",
        example = "gs://mybucket/output")
    ValueProvider<String> getOutputDirectory();

    void setOutputDirectory(ValueProvider<String> outputDirectory);

    @TemplateParameter.Text(
        order = 2,
        groupName = "Target",
        optional = true,
        regexes = {"^[A-Za-z_0-9.]*"},
        description = "The output suffix for TFRecord files",
        helpText =
            "The file suffix for the training, testing, and validation TFRecord files that are written. The default value is `.tfrecord`.")
    @Default.String(".tfrecord")
    ValueProvider<String> getOutputSuffix();

    void setOutputSuffix(ValueProvider<String> outputSuffix);

    @TemplateParameter.Float(
        order = 3,
        optional = true,
        description = "Percentage of data to be in the training set ",
        helpText =
            "The percentage of query data allocated to training TFRecord files. The default value is `1`, or `100%`.")
    @Default.Float(1)
    ValueProvider<Float> getTrainingPercentage();

    void setTrainingPercentage(ValueProvider<Float> trainingPercentage);

    @TemplateParameter.Float(
        order = 4,
        optional = true,
        description = "Percentage of data to be in the testing set ",
        helpText =
            "The percentage of query data allocated to testing TFRecord files. The default value is `0`, or `0%`.")
    @Default.Float(0)
    ValueProvider<Float> getTestingPercentage();

    void setTestingPercentage(ValueProvider<Float> testingPercentage);

    @TemplateParameter.Float(
        order = 5,
        optional = true,
        description = "Percentage of data to be in the validation set ",
        helpText =
            "The percentage of query data allocated to validation TFRecord files. The default value is `0`, or `0%`.")
    @Default.Float(0)
    ValueProvider<Float> getValidationPercentage();

    void setValidationPercentage(ValueProvider<Float> validationPercentage);
  }
}

Étape suivante

• Apprenez-en plus sur les modèles Dataflow.
• Consultez la liste des modèles fournis par Google.