Armazene dados de saúde com bibliotecas de cliente

Nesta página, mostramos como usar a API Cloud Healthcare e as bibliotecas de cliente das APIs do Google para concluir as seguintes tarefas:

  1. Criar um conjunto de dados da API Cloud Healthcare;
  2. Criar um dos seguintes armazenamentos de dados no conjunto de dados:
    • Armazenamento de imagens e comunicações digitais em medicina (DICOM, na sigla em inglês)
    • Armazenamento de recursos de interoperabilidade rápida de saúde (FHIR, na sigla em inglês)
    • Armazenamento do Health Level Seven International Version 2 (HL7v2)
  3. Armazenar e inspecionar um tipo específico de dados médicos no armazenamento DICOM, FHIR ou HL7v2.

Se você só tiver interesse em trabalhar com um tipo de repositório de dados, pule diretamente para essa seção do guia de início rápido depois de concluir as etapas em Antes de começar e Criar um conjunto de dados.

Antes de começar

  1. Faça login na sua conta do Google Cloud. Se você começou a usar o Google Cloud agora, crie uma conta para avaliar o desempenho de nossos produtos em situações reais. Clientes novos também recebem US$ 300 em créditos para executar, testar e implantar cargas de trabalho.
  2. Instale a CLI do Google Cloud.
  3. Para inicializar a CLI gcloud, execute o seguinte comando:

    gcloud init
  4. Crie ou selecione um projeto do Google Cloud.

    • Crie um projeto do Google Cloud:

      gcloud projects create PROJECT_ID

      Substitua PROJECT_ID por um nome para o projeto do Google Cloud que você está criando.

    • Selecione o projeto do Google Cloud que você criou:

      gcloud config set project PROJECT_ID

      Substitua PROJECT_ID pelo nome do projeto do Google Cloud.

  5. Verifique se a cobrança está ativada para o seu projeto do Google Cloud.

  6. Ative Cloud Healthcare API:

    gcloud services enable healthcare.googleapis.com
  7. Crie as credenciais de autenticação para sua Conta do Google:

    gcloud auth application-default login
  8. Atribua os papéis à sua Conta do Google. Execute uma vez o seguinte comando para cada um dos seguintes papéis do IAM: roles/healthcare.datasetAdmin, roles/healthcare.fhirStoreAdmin, roles/healthcare.dicomStoreAdmin, roles/healthcare.hl7V2StoreAdmin

    gcloud projects add-iam-policy-binding PROJECT_ID --member="user:EMAIL_ADDRESS" --role=ROLE
    • Substitua PROJECT_ID pela ID do seu projeto.
    • Substitua EMAIL_ADDRESS pelo seu endereço de e-mail.
    • Substitua ROLE por cada papel individual.
  9. Instale a CLI do Google Cloud.
  10. Para inicializar a CLI gcloud, execute o seguinte comando:

    gcloud init
  11. Crie ou selecione um projeto do Google Cloud.

    • Crie um projeto do Google Cloud:

      gcloud projects create PROJECT_ID

      Substitua PROJECT_ID por um nome para o projeto do Google Cloud que você está criando.

    • Selecione o projeto do Google Cloud que você criou:

      gcloud config set project PROJECT_ID

      Substitua PROJECT_ID pelo nome do projeto do Google Cloud.

  12. Verifique se a cobrança está ativada para o seu projeto do Google Cloud.

  13. Ative Cloud Healthcare API:

    gcloud services enable healthcare.googleapis.com
  14. Crie as credenciais de autenticação para sua Conta do Google:

    gcloud auth application-default login
  15. Atribua os papéis à sua Conta do Google. Execute uma vez o seguinte comando para cada um dos seguintes papéis do IAM: roles/healthcare.datasetAdmin, roles/healthcare.fhirStoreAdmin, roles/healthcare.dicomStoreAdmin, roles/healthcare.hl7V2StoreAdmin

    gcloud projects add-iam-policy-binding PROJECT_ID --member="user:EMAIL_ADDRESS" --role=ROLE
    • Substitua PROJECT_ID pela ID do seu projeto.
    • Substitua EMAIL_ADDRESS pelo seu endereço de e-mail.
    • Substitua ROLE por cada papel individual.

Instalar as bibliotecas de cliente

Os exemplos a seguir mostram como instalar as bibliotecas de cliente da API do Google:

Go

Para informações sobre a configuração de um ambiente de desenvolvimento Go, consulte Como configurar um ambiente de desenvolvimento Go.

go get google.golang.org/api/healthcare/v1

Java

Para informações sobre a configuração de um ambiente de desenvolvimento em Java, consulte Como configurar um ambiente de desenvolvimento em Java.

Se você estiver usando o Maven, adicione o seguinte ao seu arquivo pom.xml usando uma versão na Lista de materiais (BoM) das bibliotecas do Google Cloud. Para mais informações sobre BoMs, consulte Como usar bibliotecas de cliente do Cloud.

<dependencyManagement>
  <dependencies>
    <dependency>
      <groupId>com.google.cloud</groupId>
      <artifactId>libraries-bom</artifactId>
      <version>26.18.0</version>
      <type>pom</type>
      <scope>import</scope>
    </dependency>
  </dependencies>
</dependencyManagement>

<dependencies>
  <dependency>
    <groupId>com.google.apis</groupId>
    <artifactId>google-api-services-healthcare</artifactId>
  </dependency>

</dependencies>

Node.js

Para informações sobre como configurar um ambiente de desenvolvimento em Node.js, consulte Como configurar um ambiente de desenvolvimento em Node.js.

npm install @googleapis/healthcare

Python

Para informações sobre como configurar um ambiente de desenvolvimento em Python, consulte Como configurar um ambiente de desenvolvimento em Python.

# Use a virtual environment as shown in the Python development environment guide.
pip install --upgrade google-api-python-client

criar um conjunto de dados

Conjuntos de dados contêm armazenamentos de dados com dados de saúde. Para usar a API Cloud Healthcare, você precisa criar pelo menos um conjunto de dados.

Execute a amostra a seguir para criar um conjunto de dados. Você vai usar esse conjunto de dados ao longo deste guia de início rápido.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"time"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createDataset creates a dataset.
func createDataset(w io.Writer, projectID, location, datasetID string) error {
	// Set a deadline for the dataset to become initialized.
	ctx, cancel := context.WithTimeout(context.Background(), 2*time.Minute)
	defer cancel()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	datasetsService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s", projectID, location)

	resp, err := datasetsService.Create(parent, &healthcare.Dataset{}).DatasetId(datasetID).Context(ctx).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	// The dataset is not always ready to use immediately, instead a long-running operation is returned.
	// This is how you might poll the operation to ensure the dataset is fully initialized before proceeding.
	// Initialization usually takes less than a minute.
	for !resp.Done {
		time.Sleep(15 * time.Second)
		resp, err = datasetsService.Operations.Get(resp.Name).Context(ctx).Do()
		if err != nil {
			return fmt.Errorf("Operations.Get(%s): %w", resp.Name, err)
		}
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created dataset: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Dataset;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Operation;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DatasetCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void datasetCreate(String projectId, String regionId, String datasetId)
      throws IOException {
    // String projectId = "your-project-id";
    // String regionId = "us-central1";
    // String datasetId = "your-dataset-id";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the dataset to be created.
    Dataset dataset = new Dataset();
    dataset.setTimeZone("America/Chicago");

    // Create request and configure any parameters.
    String parentName = String.format("projects/%s/locations/%s", projectId, regionId);
    Datasets.Create request = client.projects().locations().datasets().create(parentName, dataset);
    request.setDatasetId(datasetId);

    // Execute the request, wait for the operation to complete, and process the results.
    try {
      Operation operation = request.execute();
      System.out.println(operation.toPrettyString());
      while (operation.getDone() == null || !operation.getDone()) {
        // Update the status of the operation with another request.
        Thread.sleep(500); // Pause for 500ms between requests.
        operation =
            client
                .projects()
                .locations()
                .datasets()
                .operations()
                .get(operation.getName())
                .execute();
      }
      System.out.println("Dataset created. Response content: " + operation.getResponse());
    } catch (Exception ex) {
      System.out.printf("Error during request execution: %s\n", ex.toString());
      ex.printStackTrace(System.out);
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createDataset = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}`;
  const request = {parent, datasetId};

  await healthcare.projects.locations.datasets.create(request);
  console.log(`Created dataset: ${datasetId}`);
};

createDataset();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

# Imports the Dict type for runtime type hints.
from typing import Dict

def create_dataset(project_id: str, location: str, dataset_id: str) -> Dict[str, str]:
    """Creates a Cloud Healthcare API dataset.

    See
    https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/datasets
    before running the sample.
    See
    https://googleapis.github.io/google-api-python-client/docs/dyn/healthcare_v1.projects.locations.datasets.html#create
    for the Python API reference.

    Args:
      project_id: The project ID or project number of the Google Cloud project you want
          to use.
      location: The name of the dataset's location.
      dataset_id: The ID of the dataset to create.

    Returns:
      A dictionary representing a long-running operation that results from
      calling the 'CreateDataset' method. Dataset creation is typically fast.
    """
    # Imports the Python built-in time module.
    import time

    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    # Imports HttpError from the Google Python API client errors module.
    from googleapiclient.errors import HttpError

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'
    # location = 'us-central1'
    # dataset_id = 'my-dataset'
    dataset_parent = f"projects/{project_id}/locations/{location}"

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .create(parent=dataset_parent, body={}, datasetId=dataset_id)
    )

    # Wait for operation to complete.
    start_time = time.time()
    max_time = 600  # 10 minutes, but dataset creation is typically only a few seconds.

    try:
        operation = request.execute()
        while not operation.get("done", False):
            # Poll until the operation finishes.
            print("Waiting for operation to finish...")
            if time.time() - start_time > max_time:
                raise TimeoutError("Timed out waiting for operation to finish.")
            operation = (
                client.projects()
                .locations()
                .datasets()
                .operations()
                .get(name=operation["name"])
                .execute()
            )
            # Wait 5 seconds between each poll to the operation.
            time.sleep(5)

        if "error" in operation:
            raise RuntimeError(f"Create dataset operation failed: {operation['error']}")
        else:
            dataset_name = operation["response"]["name"]
            print(f"Created dataset: {dataset_name}")
            return operation

    except HttpError as err:
        # A common error is when the dataset already exists.
        if err.resp.status == 409:
            print(f"Dataset with ID {dataset_id} already exists.")
            return
        else:
            raise err

Para concluir este guia de início rápido, escolha uma das seguintes seções:

Armazenar e visualizar uma instância DICOM

Neste documento, mostramos como concluir as seguintes tarefas:

  1. Crie um armazenamento DICOM.
  2. Armazenar uma instância DICOM no armazenamento DICOM.
  3. Visualizar os metadados da instância DICOM.

A API Cloud Healthcare implementa o padrão DICOMweb para armazenar e acessar dados de diagnóstico médico por imagem.

Criar um armazenamento DICOM

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

Os armazenamentos DICOM existem nos conjuntos de dados e armazenam instâncias DICOM. Execute os exemplos a seguir para criar um armazenamento DICOM.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-dicom-store para o ID do repositório DICOM

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createDICOMStore creates a DICOM store.
func createDICOMStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	store := &healthcare.DicomStore{}
	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)

	resp, err := storesService.Create(parent, store).DicomStoreId(dicomStoreID).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created DICOM store: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.DicomStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

public class DicomStoreCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomStoreCreate(String datasetName, String dicomStoreId) throws IOException {
    // String datasetName =
    //     String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the dicomStore to be created.
    Map<String, String> labels = new HashMap<>();
    labels.put("key1", "value1");
    labels.put("key2", "value2");
    DicomStore content = new DicomStore().setLabels(labels);

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.Create request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .create(datasetName, content)
            .setDicomStoreId(dicomStoreId);

    // Execute the request and process the results.
    DicomStore response = request.execute();
    System.out.println("DICOM store created: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createDicomStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {parent, dicomStoreId};

  await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.create(request);
  console.log(`Created DICOM store: ${dicomStoreId}`);
};

createDicomStore();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def create_dicom_store(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Creates a new DICOM store within the parent dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the DICOM store's parent dataset ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store'  # replace with the DICOM store's ID
    dicom_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .dicomStores()
        .create(parent=dicom_store_parent, body={}, dicomStoreId=dicom_store_id)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Created DICOM store: {dicom_store_id}")
    return response

Armazenar uma instância DICOM

  1. Faça o download do arquivo de instância do DICOM de amostra na sua máquina. O arquivo contém um raio X do paciente desidentificado.

    curl

    curl -O https://cloud.google.com/healthcare-api/docs/resources/dicom_00000001_000.dcm
    

    PowerShell

    Invoke-WebRequest -Uri "https://cloud.google.com/healthcare-api/docs/resources/dicom_00000001_000.dcm" -OutFile $pwd/dicom_00000001_000.dcm
    
  2. Execute as amostras a seguir para armazenar a instância DICOM. Os exemplos pressupõem que você está executando o código do mesmo diretório em que fez o download da instância DICOM.

    Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

    • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
    • my-dataset como ID do conjunto de dados;
    • us-central1 para o local do conjunto de dados
    • my-dicom-store para o ID do repositório DICOM
    • dicom_00000001_000.dcm para o nome do arquivo DICOM

    Go

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    import (
    	"bytes"
    	"context"
    	"fmt"
    	"io"
    	"io/ioutil"
    
    	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
    )
    
    // dicomWebStoreInstance stores the given dicomFile with the dicomWebPath.
    func dicomWebStoreInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath, dicomFile string) error {
    	ctx := context.Background()
    
    	dicomData, err := ioutil.ReadFile(dicomFile)
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("ReadFile: %w", err)
    	}
    
    	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
    	}
    
    	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores
    
    	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)
    
    	call := storesService.StoreInstances(parent, dicomWebPath, bytes.NewReader(dicomData))
    	call.Header().Set("Content-Type", "application/dicom")
    	resp, err := call.Do()
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("StoreInstances: %w", err)
    	}
    	defer resp.Body.Close()
    
    	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
    	}
    
    	if resp.StatusCode > 299 {
    		return fmt.Errorf("StoreInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
    	}
    	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)
    	return nil
    }
    

    Java

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
    import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
    import com.google.api.client.json.JsonFactory;
    import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
    import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
    import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
    import java.io.File;
    import java.io.IOException;
    import java.net.URISyntaxException;
    import java.nio.file.Files;
    import java.nio.file.Paths;
    import java.util.Collections;
    import org.apache.http.HttpEntity;
    import org.apache.http.HttpResponse;
    import org.apache.http.HttpStatus;
    import org.apache.http.client.HttpClient;
    import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
    import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
    import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
    import org.apache.http.entity.ByteArrayEntity;
    import org.apache.http.impl.client.HttpClients;
    
    public class DicomWebStoreInstance {
      private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
      private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
      private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();
    
      public static void dicomWebStoreInstance(String dicomStoreName, String filePath)
          throws IOException, URISyntaxException {
        // String dicomStoreName =
        //    String.format(
        //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
        // String filePath = "path/to/file.dcm";
    
        // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
        CloudHealthcare client = createClient();
    
        HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
        String uri = String.format("%sv1/%s/dicomWeb/studies", client.getRootUrl(), dicomStoreName);
        URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
        // Load the data from file representing the study.
        File f = new File(filePath);
        byte[] dicomBytes = Files.readAllBytes(Paths.get(filePath));
        ByteArrayEntity requestEntity = new ByteArrayEntity(dicomBytes);
    
        HttpUriRequest request =
            RequestBuilder.post(uriBuilder.build())
                .setEntity(requestEntity)
                .addHeader("Content-Type", "application/dicom")
                .build();
    
        // Execute the request and process the results.
        HttpResponse response = httpClient.execute(request);
        HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
        if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
          System.err.print(
              String.format(
                  "Exception storing DICOM instance: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
          responseEntity.writeTo(System.err);
          throw new RuntimeException();
        }
        System.out.println("DICOM instance stored: ");
        responseEntity.writeTo(System.out);
      }
    
      private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
        // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
        // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
        GoogleCredentials credential =
            GoogleCredentials.getApplicationDefault()
                .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    
        // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
        HttpRequestInitializer requestInitializer =
            request -> {
              new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
              request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
              request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
            };
    
        // Build the client for interacting with the service.
        return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
            .setApplicationName("your-application-name")
            .build();
      }
    
      private static String getAccessToken() throws IOException {
        GoogleCredentials credential =
            GoogleCredentials.getApplicationDefault()
                .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    
        return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
      }
    }

    Node.js

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    const google = require('@googleapis/healthcare');
    const healthcare = google.healthcare({
      version: 'v1',
      auth: new google.auth.GoogleAuth({
        scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
      }),
    });
    const fs = require('fs');
    
    const dicomWebStoreInstance = async () => {
      // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
      // const cloudRegion = 'us-central1';
      // const projectId = 'adjective-noun-123';
      // const datasetId = 'my-dataset';
      // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
      // const dcmFile = 'file.dcm';
      const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
      const dicomWebPath = 'studies';
      // Use a stream because other types of reads overwrite the client's HTTP
      // headers and cause storeInstances to fail.
      const binaryData = fs.createReadStream(dcmFile);
      const request = {
        parent,
        dicomWebPath,
        requestBody: binaryData,
      };
    
      const instance =
        await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances(
          request,
          {
            headers: {
              'Content-Type': 'application/dicom',
              Accept: 'application/dicom+json',
            },
          }
        );
      console.log('Stored DICOM instance:\n', JSON.stringify(instance.data));
    };
    
    dicomWebStoreInstance();

    Python

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    def dicomweb_store_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, dcm_file):
        """Handles the POST requests specified in the DICOMweb standard.
    
        See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
        before running the sample."""
        # Imports Python's built-in "os" module
        import os
    
        # Imports the google.auth.transport.requests transport
        from google.auth.transport import requests
    
        # Imports a module to allow authentication using a service account
        from google.oauth2 import service_account
    
        # Gets credentials from the environment.
        credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
            os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
        )
        scoped_credentials = credentials.with_scopes(
            ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
        )
        # Creates a requests Session object with the credentials.
        session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)
    
        # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
        base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"
    
        # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
        # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
        # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
        # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
        # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
        # dcm_file = 'dicom000_0001.dcm'  # replace with a DICOM file
        url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"
    
        dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies".format(
            url, dataset_id, dicom_store_id
        )
    
        with open(dcm_file, "rb") as dcm:
            dcm_content = dcm.read()
    
        # Sets required "application/dicom" header on the request
        headers = {"Content-Type": "application/dicom"}
    
        response = session.post(dicomweb_path, data=dcm_content, headers=headers)
        response.raise_for_status()
        print("Stored DICOM instance:")
        print(response.text)
        return response
    
    

Ver metadados da instância DICOM

Execute as amostras a seguir para visualizar os metadados da instância.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-dicom-store para o ID do repositório DICOM

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebSearchInstances searches instances.
func dicomWebSearchInstances(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	resp, err := storesService.SearchForInstances(parent, "instances").Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ioutil.ReadAll: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}

	respString := string(respBytes)
	fmt.Fprintf(w, "Found instances: %s\n", respString)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebSearchForInstances {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebSearchForInstances(String dicomStoreName) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.SearchForInstances request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .searchForInstances(dicomStoreName, "instances");

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();
    System.out.println("Dicom store instances found: \n" + response.toString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebSearchForInstances = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'instances';
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const instances =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.searchForInstances(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'application/dicom+json,multipart/related'},
      }
    );
  console.log(`Found ${instances.data.length} instances:`);
  console.log(JSON.stringify(instances.data));
};

dicomWebSearchForInstances();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def dicomweb_search_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Handles the GET requests specified in DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/instances".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    # Sets required application/dicom+json; charset=utf-8 header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom+json; charset=utf-8"}

    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    instances = response.json()

    print("Instances:")
    print(json.dumps(instances, indent=2))

    return instances

Depois de armazenar e visualizar uma instância DICOM na API Cloud Healthcare, continue em Limpar para evitar cobranças na sua conta do Google Cloud pelos recursos usados nesta página.

Para saber mais informações sobre como trabalhar com dados DICOM, consulte A seguir.

Armazenar e visualizar recursos FHIR

Neste documento, mostramos como concluir as seguintes tarefas:

  1. Crie um armazenamento de FHIR.
  2. Armazene um recurso FHIR no armazenamento FHIR.
  3. Visualize os dados do recurso FHIR.

A API Cloud Healthcare implementa o padrão da especificação FHIR para armazenar e acessar dados FHIR.

Criar um armazenamento FHIR

Os armazenamentos de FHIR existem nos conjuntos de dados e armazenam dados FHIR. Execute as amostras a seguir para criar um armazenamento FHIR.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-fhir-store para o ID do repositório FHIR

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createFHIRStore creates an FHIR store.
func createFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)
	version := "R4"

	resp, err := storesService.Create(parent, &healthcare.FhirStore{Version: version}).FhirStoreId(fhirStoreID).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created FHIR store: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

public class FhirStoreCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreCreate(String datasetName, String fhirStoreId) throws IOException {
    // String datasetName =
    //     String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");
    // String fhirStoreId = "your-fhir-id"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the FhirStore to be created.
    Map<String, String> labels = new HashMap<>();
    labels.put("key1", "value1");
    labels.put("key2", "value2");
    String version = "STU3";
    FhirStore content = new FhirStore().setLabels(labels).setVersion(version);

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Create request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .fhirStores()
            .create(datasetName, content)
            .setFhirStoreId(fhirStoreId);

    // Execute the request and process the results.
    FhirStore response = request.execute();
    System.out.println("FHIR store created: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const version = 'STU3';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {
    parent,
    fhirStoreId,
    resource: {
      version,
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.create(request);
  console.log(`Created FHIR store: ${fhirStoreId}`);
};

createFhirStore();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def create_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id, version):
    """Creates a new FHIR store within the parent dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    # version = 'R4'  # replace with the FHIR store version
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    body = {"version": version}

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .create(parent=fhir_store_parent, body=body, fhirStoreId=fhir_store_id)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Created FHIR store: {fhir_store_id}")

    return response

Armazenar um recurso FHIR

Execute os exemplos a seguir para armazenar um recurso de paciente.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-fhir-store para o ID do repositório FHIR

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"bytes"
	"context"
	"encoding/json"
	"fmt"
	"io"
	"io/ioutil"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createFHIRResource creates an FHIR resource.
func createFHIRResource(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID, resourceType string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	fhirService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores.Fhir

	payload := map[string]interface{}{
		"resourceType": resourceType,
		"language":     "FR",
	}
	jsonPayload, err := json.Marshal(payload)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("json.Encode: %w", err)
	}

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	call := fhirService.Create(parent, resourceType, bytes.NewReader(jsonPayload))
	call.Header().Set("Content-Type", "application/fhir+json;charset=utf-8")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}
	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := ioutil.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("Create: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)

	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceCreate {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceCreate(String fhirStoreName, String resourceType)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-fhir-id");
    // String resourceType = "Patient";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%sv1/%s/fhir/%s", client.getRootUrl(), fhirStoreName, resourceType);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    StringEntity requestEntity =
        new StringEntity("{\"resourceType\": \"" + resourceType + "\", \"language\": \"en\"}");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.post()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .setEntity(requestEntity)
            .addHeader("Content-Type", "application/fhir+json")
            .addHeader("Accept-Charset", "utf-8")
            .addHeader("Accept", "application/fhir+json; charset=utf-8")
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_CREATED) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception creating FHIR resource: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.print("FHIR resource created: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
  headers: {'Content-Type': 'application/fhir+json'},
});

async function createFhirResource() {
  // Replace the following body with the data for the resource you want to
  // create.
  const body = {
    name: [{use: 'official', family: 'Smith', given: ['Darcy']}],
    gender: 'female',
    birthDate: '1970-01-01',
    resourceType: 'Patient',
  };

  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;

  const request = {parent, type: resourceType, requestBody: body};
  const resource =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.create(
      request
    );
  console.log(`Created FHIR resource with ID ${resource.data.id}`);
  console.log(resource.data);
}

createFhirResource();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

# Imports the types Dict and Any for runtime type hints.
from typing import Any, Dict  # noqa: E402

def create_patient(
    project_id: str,
    location: str,
    dataset_id: str,
    fhir_store_id: str,
) -> Dict[str, Any]:
    """Creates a new Patient resource in a FHIR store.

    See
    https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample.
    See
    https://googleapis.github.io/google-api-python-client/docs/dyn/healthcare_v1.projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.html#create
    for the Python API reference.

    Args:
      project_id: The project ID or project number of the Cloud project you want
        to use.
      location: The name of the parent dataset's location.
      dataset_id: The name of the parent dataset.
      fhir_store_id: The name of the FHIR store that holds the Patient resource.

    Returns:
      A dict representing the created Patient resource.
    """
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"

    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'
    # location = 'us-central1'
    # dataset_id = 'my-dataset'
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'
    fhir_store_parent = (
        f"projects/{project_id}/locations/{location}/datasets/{dataset_id}"
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    patient_body = {
        "name": [{"use": "official", "family": "Smith", "given": ["Darcy"]}],
        "gender": "female",
        "birthDate": "1970-01-01",
        "resourceType": "Patient",
    }

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .fhir()
        .create(parent=fhir_store_name, type="Patient", body=patient_body)
    )
    # Sets required application/fhir+json header on the googleapiclient.http.HttpRequest.
    request.headers["content-type"] = "application/fhir+json;charset=utf-8"
    response = request.execute()

    print(f"Created Patient resource with ID {response['id']}")
    return response

Visualizar o conteúdo do recurso de FHIR

Execute as amostras a seguir para ver informações sobre o recurso "Paciente".

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-fhir-store para o ID do repositório FHIR
  • Patient para o tipo de recurso FHIR

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceSearchGet {
  private static final String FHIR_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s/fhir/%s";
  // The endpoint URL for the Healthcare API. Required for HttpClient.
  private static final String API_ENDPOINT = "https://healthcare.googleapis.com";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceSearchGet(String resourceName)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String resourceName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "fhir-store-id");
    // String resourceType = "Patient";

    // Instantiate the client, which will be used to interact with the service.
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%s/v1/%s", API_ENDPOINT, resourceName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // To set additional parameters for search filtering, add them to the URIBuilder. For
    // example, to search for a Patient with the family name "Smith", specify the following:
    // uriBuilder.setParameter("family:exact", "Smith");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.get()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception searching GET FHIR resources: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("FHIR resource GET search results: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };
    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

// Import google-auth-library for authentication.
const {GoogleAuth} = require('google-auth-library');

const searchFhirResourcesGet = async () => {
  const auth = new GoogleAuth({
    scopes: 'https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform',
  });
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const url = `https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/${resourceType}`;

  const params = {};
  // Specify search filters in a params object. For example, to filter on a
  // Patient with the last name "Smith", set resourceType to "Patient" and
  // specify the following params:
  // params = {'family:exact' : 'Smith'};
  const client = await auth.getClient();
  const response = await client.request({url, method: 'GET', params});
  const resources = response.data.entry;
  console.log(`Resources found: ${resources.length}`);
  console.log(JSON.stringify(resources, null, 2));
};

searchFhirResourcesGet();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def search_resources_get(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    fhir_store_id,
    resource_type,
):
    """
    Uses the searchResources GET method to search for resources in the given FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    # resource_type = 'Patient'  # replace with the FHIR resource type
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    resource_path = "{}/datasets/{}/fhirStores/{}/fhir/{}".format(
        url, dataset_id, fhir_store_id, resource_type
    )

    response = session.get(resource_path)
    response.raise_for_status()

    resources = response.json()

    print(
        "Using GET request, found a total of {} {} resources:".format(
            resources["total"], resource_type
        )
    )
    print(json.dumps(resources, indent=2))

    return resources

Depois de armazenar e visualizar um recurso FHIR na API Cloud Healthcare, continue até Limpar para evitar cobranças na sua conta do Google Cloud pelos recursos usados nesta página.

Para mais informações sobre como trabalhar com dados FHIR, consulte A seguir.

Armazenar e visualizar uma mensagem HL7v2

Neste documento, mostramos como concluir as seguintes tarefas:

  1. Criar uma loja HL7v2.
  2. Armazenar uma mensagem HL7v2 no armazenamento HL7v2.
  3. Visualizar os dados da mensagem HL7v2.

A implementação do HL7v2 na API Cloud Healthcare está alinhada com o padrão HL7v2.

Criar um armazenamento HL7v2

Os armazenamentos de HL7v2 existem nos conjuntos de dados e armazenam mensagens de HL7v2. Execute os exemplos a seguir para criar um armazenamento HL7v2.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-hl7v2-store para o ID do repositório HL7v2.

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createHL7V2Store creates an HL7V2 store.
func createHL7V2Store(w io.Writer, projectID, location, datasetID, hl7V2StoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores

	// Set the HL7v2 store parser version to V3.
	store := &healthcare.Hl7V2Store{ParserConfig: &healthcare.ParserConfig{Version: "V3"}}
	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)

	resp, err := storesService.Create(parent, store).Hl7V2StoreId(hl7V2StoreID).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created HL7V2 store: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Hl7V2Store;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.ParserConfig;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

public class Hl7v2StoreCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void hl7v2StoreCreate(String datasetName, String hl7v2StoreId) throws IOException {
    // String datasetName =
    // String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id",
    // "your-dataset-id");
    // String hl7v2StoreId = "your-hl7v25-id"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the store to be created.
    Map<String, String> labels = new HashMap<>();
    labels.put("key1", "value1");
    labels.put("key2", "value2");
    Hl7V2Store content =
        new Hl7V2Store().setLabels(labels).setParserConfig(new ParserConfig().setVersion("V3"));

    // Create request and configure any parameters.
    Hl7V2Stores.Create request = client
        .projects()
        .locations()
        .datasets()
        .hl7V2Stores()
        .create(datasetName, content)
        .setHl7V2StoreId(hl7v2StoreId);

    // Execute the request and process the results.
    Hl7V2Store response = request.execute();
    System.out.println("Hl7V2Store store created: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see
    // https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential = GoogleCredentials.getApplicationDefault()
        .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration
    // to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer = request -> {
      new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
      request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
      request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
    };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createHl7v2Store = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const hl7v2StoreId = 'my-hl7v2-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {
    parent,
    hl7V2StoreId: hl7v2StoreId,
    resource: {
      parserConfig: {
        version: 'V3',
      },
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.hl7V2Stores.create(request);
  console.log(`Created HL7v2 store: ${hl7v2StoreId}`);
};

createHl7v2Store();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def create_hl7v2_store(project_id, location, dataset_id, hl7v2_store_id):
    """Creates a new HL7v2 store within the parent dataset.
    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/hl7v2
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the HL7v2 store's parent dataset ID
    # hl7v2_store_id = 'my-hl7v2-store'  # replace with the HL7v2 store's ID
    hl7v2_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    # Use the V3 parser. Immutable after HL7v2 store creation.
    body = {"parserConfig": {"version": "V3"}}

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .hl7V2Stores()
        .create(parent=hl7v2_store_parent, body=body, hl7V2StoreId=hl7v2_store_id)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Created HL7v2 store: {hl7v2_store_id}")
    return response

Criar uma mensagem HL7v2

  1. Faça o download do arquivo de mensagens HL7v2 de amostra na sua máquina:

    curl

    curl -O https://cloud.google.com/healthcare-api/docs/resources/hl7v2-sample.json
    

    PowerShell

    Invoke-WebRequest -Uri "https://cloud.google.com/healthcare-api/docs/resources/hl7v2-sample.json" -OutFile $pwd/hl7v2-sample.json
    

    A mensagem HL7v2 contém as seguintes informações básicas, em que está codificada em base-64 no campo data do arquivo de amostra:

    MSH|^~\&|A|SEND_FACILITY|A|A|20180101000000||TYPE^A|20180101000000|T|0.0|||AA||00|ASCII
    EVN|A00|20180101040000
    PID||14^111^^^^MRN|11111111^^^^MRN~1111111111^^^^ORGNMBR
    
  2. Execute os exemplos a seguir para armazenar a mensagem de HL7v2. Os exemplos pressupõem que você está executando o código no mesmo diretório em que fez o download da mensagem HL7v2.

    Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

    • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
    • my-dataset como ID do conjunto de dados;
    • us-central1 para o local do conjunto de dados
    • my-hl7v2-store para o ID do repositório HL7v2.
    • hl7v2-sample.json para o nome do arquivo de mensagens HL7v2;

    Go

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    import (
    	"context"
    	"encoding/base64"
    	"fmt"
    	"io"
    	"io/ioutil"
    
    	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
    )
    
    // ingestHL7V2Message ingests an HL7V2 message.
    func ingestHL7V2Message(w io.Writer, projectID, location, datasetID, hl7V2StoreID, messageFile string) error {
    	ctx := context.Background()
    
    	hl7v2message, err := ioutil.ReadFile(messageFile)
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("ReadFile: %w", err)
    	}
    
    	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
    	}
    
    	messagesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores.Messages
    
    	req := &healthcare.IngestMessageRequest{
    		Message: &healthcare.Message{
    			Data: base64.StdEncoding.EncodeToString(hl7v2message),
    		},
    	}
    	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/hl7V2Stores/%s", projectID, location, datasetID, hl7V2StoreID)
    
    	resp, err := messagesService.Ingest(parent, req).Do()
    	if err != nil {
    		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
    	}
    
    	fmt.Fprintf(w, "Ingested HL7V2 message: %q\n", resp.Message.Name)
    	return nil
    }
    

    Java

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
    import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
    import com.google.api.client.json.JsonFactory;
    import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores.Messages;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.model.IngestMessageRequest;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.model.IngestMessageResponse;
    import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Message;
    import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
    import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
    import java.io.IOException;
    import java.nio.charset.Charset;
    import java.nio.file.Files;
    import java.nio.file.Paths;
    import java.util.Collections;
    import java.util.List;
    
    @SuppressWarnings("checkstyle:AbbreviationAsWordInName")
    public class HL7v2MessageIngest {
      private static final String HL7v2_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/hl7V2Stores/%s";
      private static final String MESSAGE_NAME =
          "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/hl7V2Stores/%s/messages/%s";
      private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
      private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();
    
      public static void hl7v2MessageIngest(String hl7v2StoreName, String filePath) throws IOException {
        // String hl7v2StoreName =
        //    String.format(
        //        HL7v2_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-hl7v2-id");
    
        // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
        CloudHealthcare client = createClient();
    
        // Load the data from file and format it into an ingest request.
        List<String> lines = Files.readAllLines(Paths.get(filePath), Charset.defaultCharset());
        String data = String.join("\n", lines);
        Message message = new Message().setData(data);
        IngestMessageRequest ingestRequest = new IngestMessageRequest().setMessage(message);
    
        // Create request and configure any parameters.
        Messages.Ingest request =
            client
                .projects()
                .locations()
                .datasets()
                .hl7V2Stores()
                .messages()
                .ingest(hl7v2StoreName, ingestRequest);
    
        // Execute the request and process the results.
        IngestMessageResponse response = request.execute();
        System.out.println("HL7v2 message ingested: " + response.toPrettyString());
      }
    
      private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
        // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
        // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
        GoogleCredentials credential =
            GoogleCredentials.getApplicationDefault()
                .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    
        // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
        HttpRequestInitializer requestInitializer =
            request -> {
              new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
              request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
              request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
            };
    
        // Build the client for interacting with the service.
        return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
            .setApplicationName("your-application-name")
            .build();
      }
    }

    Node.js

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    const google = require('@googleapis/healthcare');
    const healthcare = google.healthcare({
      version: 'v1',
      auth: new google.auth.GoogleAuth({
        scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
      }),
    });
    const fs = require('fs');
    const util = require('util');
    const readFile = util.promisify(fs.readFile);
    
    const ingestHl7v2Message = async () => {
      // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
      // const cloudRegion = 'us-central1';
      // const projectId = 'adjective-noun-123';
      // const datasetId = 'my-dataset';
      // const hl7v2StoreId = 'my-hl7v2-store';
      // const hl7v2MessageFile = 'hl7v2-message.json';
      const hl7v2Message = JSON.parse(await readFile(hl7v2MessageFile));
    
      const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/hl7V2Stores/${hl7v2StoreId}`;
      const request = {parent, resource: hl7v2Message};
    
      const response =
        await healthcare.projects.locations.datasets.hl7V2Stores.messages.ingest(
          request
        );
      const data = response.data.hl7Ack;
      const buff = new Buffer.from(data, 'base64');
      const hl7Ack = buff.toString('ascii');
      console.log('Ingested HL7v2 message with ACK:\n', hl7Ack);
    };
    
    ingestHl7v2Message();

    Python

    Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

    Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

    def ingest_hl7v2_message(
        project_id, location, dataset_id, hl7v2_store_id, hl7v2_message_file
    ):
        """Ingests a new HL7v2 message from the hospital and sends a notification
        to the Cloud Pub/Sub topic. Return is an HL7v2 ACK message if the message
        was successfully stored.
    
        See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/hl7v2
        before running the sample."""
        # Imports the Google API Discovery Service.
        from googleapiclient import discovery
    
        # Imports Python's built-in "json" module
        import json
    
        api_version = "v1"
        service_name = "healthcare"
        # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
        # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
        client = discovery.build(service_name, api_version)
    
        # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
        # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
        # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
        # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the HL7v2 store's parent dataset ID
        # hl7v2_store_id = 'my-hl7v2-store'  # replace with the HL7v2 store's ID
        # hl7v2_message_file = 'hl7v2-message.json'  # replace with the path to the HL7v2 file
        hl7v2_parent = f"projects/{project_id}/locations/{location}"
        hl7v2_store_name = "{}/datasets/{}/hl7V2Stores/{}".format(
            hl7v2_parent, dataset_id, hl7v2_store_id
        )
    
        with open(hl7v2_message_file) as hl7v2_message:
            hl7v2_message_content = json.load(hl7v2_message)
    
        request = (
            client.projects()
            .locations()
            .datasets()
            .hl7V2Stores()
            .messages()
            .ingest(parent=hl7v2_store_name, body=hl7v2_message_content)
        )
    
        response = request.execute()
        print(f"Ingested HL7v2 message from file: {hl7v2_message_file}")
        return response
    
    

    A saída contém um ID de mensagem HL7v2. Você vai precisar desse ID na próxima seção.

Ver o conteúdo da mensagem HL7v2

Execute as amostras a seguir para visualizar o conteúdo das mensagens de HL7v2.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados
  • my-hl7v2-store para o ID do repositório HL7v2.
  • o ID na resposta quando você armazenou a mensagem do ID da mensagem HL7v2

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"encoding/base64"
	"encoding/json"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// getHL7V2Message gets an HL7V2 message.
func getHL7V2Message(w io.Writer, projectID, location, datasetID, hl7V2StoreID, hl7V2MessageID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	messagesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores.Messages

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/hl7V2Stores/%s/messages/%s", projectID, location, datasetID, hl7V2StoreID, hl7V2MessageID)
	message, err := messagesService.Get(name).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Get: %w", err)
	}

	rawData, err := base64.StdEncoding.DecodeString(message.Data)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("base64.DecodeString: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Got HL7V2 message.\n")
	fmt.Fprintf(w, "Raw length: %d.\n", len(rawData))
	fmt.Fprintf(w, "Parsed data:\n")
	parsedJSON, _ := json.MarshalIndent(message.ParsedData, "", "  ")
	fmt.Fprintf(w, "%s", parsedJSON)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.Hl7V2Stores.Messages;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Message;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

@SuppressWarnings("checkstyle:AbbreviationAsWordInName")
public class HL7v2MessageGet {
  private static final String MESSAGE_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/hl7V2Stores/%s/messages/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void hl7v2MessageGet(String hl7v2MessageName) throws IOException {
    // String hl7v2MessageName =
    //    String.format(
    //        MESSAGE_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "hl7v2-id", "message-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Messages.Get request =
        client.projects().locations().datasets().hl7V2Stores().messages().get(hl7v2MessageName);

    // Execute the request and process the results.
    Message store = request.execute();
    System.out.println("HL7v2 message retrieved: \n" + store.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const getHl7v2Message = async () => {
  // TODO(developer): uncomment the lines beginning with 'const' before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const hl7v2StoreId = 'my-hl7v2-store';
  // The value for hl7v2MessageId is the server-generated ID returned when you
  // created or ingested the HL7v2 message in an HL7v2 store.
  // const hl7v2MessageId = 'qCnewKno44gTt3oBn4dQ0u8ZA23ibDdV9GpifD2E=';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/hl7V2Stores/${hl7v2StoreId}/messages/${hl7v2MessageId}`;
  // Use the 'FULL' enum to include all of the message fields in the response.
  const view = 'FULL';
  const request = {name, view};

  const hl7v2Message =
    await healthcare.projects.locations.datasets.hl7V2Stores.messages.get(
      request
    );
  console.log('Got HL7v2 message:\n', hl7v2Message.data);
};

getHl7v2Message();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def get_hl7v2_message(
    project_id, location, dataset_id, hl7v2_store_id, hl7v2_message_id
):
    """Gets an HL7v2 message.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/hl7v2
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the HL7v2 store's parent dataset ID
    # hl7v2_store_id = 'my-hl7v2-store'  # replace with the HL7v2 store's ID
    # hl7v2_message_id = '2yqbdhYHlk_ucSmWkcKOVm_N0p0OpBXgIlVG18rB-cw='  # replace with the HL7v2 message ID that was returned by the server
    hl7v2_parent = f"projects/{project_id}/locations/{location}"
    hl7v2_message_name = "{}/datasets/{}/hl7V2Stores/{}/messages/{}".format(
        hl7v2_parent, dataset_id, hl7v2_store_id, hl7v2_message_id
    )

    msgs = client.projects().locations().datasets().hl7V2Stores().messages()
    message = msgs.get(name=hl7v2_message_name).execute()

    print("Name: {}".format(message.get("name")))
    print("Data: {}".format(message.get("data")))
    print("Creation time: {}".format(message.get("createTime")))
    print("Sending facility: {}".format(message.get("sendFacility")))
    print("Time sent: {}".format(message.get("sendTime")))
    print("Message type: {}".format(message.get("messageType")))
    print("Patient IDs:")
    patient_ids = message.get("patientIds")
    for patient_id in patient_ids:
        print("\tPatient value: {}".format(patient_id.get("value")))
        print("\tPatient type: {}".format(patient_id.get("type")))
    print("Labels: {}".format(message.get("labels")))

    print(message)
    return message

Depois de armazenar e visualizar uma mensagem HL7v2 na API Cloud Healthcare, continue para Limpar para evitar cobranças na sua conta do Google Cloud pelos recursos usados nesta página.

Para mais informações sobre como trabalhar com dados HL7v2, consulte A seguir.

Limpar

Para evitar cobranças na sua conta do Google Cloud pelos recursos usados nesta página, exclua o projeto do Google Cloud com esses recursos.

Se você criou um novo projeto para este guia de início rápido, siga as etapas em Excluir o projeto. Caso contrário, siga as etapas em Excluir o conjunto de dados.

  1. Opcional: revogue as credenciais de autenticação que você criou e exclua o arquivo de credenciais local:

    gcloud auth application-default revoke
  2. Opcional: revogar credenciais da CLI gcloud.

    gcloud auth revoke

Exclua o projeto

    Exclua um projeto do Google Cloud:

    gcloud projects delete PROJECT_ID

Excluir o conjunto de dados

Se você não precisar mais do conjunto de dados criado neste guia de início rápido, poderá excluí-lo. Excluir um conjunto de dados exclui permanentemente o conjunto de dados e todos os armazenamentos FHIR, HL7v2 ou DICOM que ele contém.

Antes de executar as amostras, remova a marca de comentário e forneça os seguintes valores, se necessário:

  • pelo ID do projeto do Google Cloud que você criou ou selecionou em Antes de começar.
  • my-dataset como ID do conjunto de dados;
  • us-central1 para o local do conjunto de dados

Go

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Go no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Go.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// deleteDataset deletes the given dataset.
func deleteDataset(w io.Writer, projectID, location, datasetID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	datasetsService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)
	if _, err := datasetsService.Delete(name).Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Delete: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Deleted dataset: %q\n", name)
	return nil
}

Java

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Java no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Java.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DatasetDelete {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void datasetDelete(String datasetName) throws IOException {
    // String datasetName =
    //     String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Datasets.Delete request = client.projects().locations().datasets().delete(datasetName);

    // Execute the request and process the results.
    request.execute();
    System.out.println("Dataset deleted.");
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Node.js no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Node.js.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const deleteDataset = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {name: parent};

  await healthcare.projects.locations.datasets.delete(request);
  console.log(`Deleted dataset: ${datasetId}`);
};

deleteDataset();

Python

Antes de testar esta amostra, siga as instruções de configuração de Python no Guia de início rápido da API Cloud Healthcare usando bibliotecas de cliente. Para mais informações, consulte a documentação de referência da API Cloud Healthcare Python.

Para autenticar a API Cloud Healthcare, configure o Application Default Credentials. Para mais informações, consulte Configurar a autenticação para um ambiente de desenvolvimento local.

def delete_dataset(project_id: str, location: str, dataset_id: str) -> None:
    """Deletes a dataset.

    See
    https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/datasets
    before running the sample.
    See https://googleapis.github.io/google-api-python-client/docs/dyn/healthcare_v1.projects.locations.datasets.html#delete
    for the Python API reference.

    Args:
      project_id: The project ID or project number of the Google Cloud project you want
          to use.
      location: The name of the dataset's location.
      dataset_id: The name of the dataset to delete.

    Returns:
      An empty response body.
    """
    # Imports HttpError from the Google Python API client errors module.
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery
    from googleapiclient.errors import HttpError

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'
    # location = 'us-central1'
    # dataset_id = 'my-dataset'
    dataset_name = f"projects/{project_id}/locations/{location}/datasets/{dataset_id}"

    request = client.projects().locations().datasets().delete(name=dataset_name)

    try:
        request.execute()
        print(f"Deleted dataset: {dataset_id}")
    except HttpError as err:
        raise err

Como foi?

A seguir

Consulte as seções a seguir para informações gerais sobre a API Cloud Healthcare e como executar as tarefas neste guia de início rápido usando outra interface:

DICOM

Consulte a instrução de conformidade DICOM para ver informações sobre como a API Cloud Healthcare implementa o padrão DICOMweb.

FHIR

Consulte a Declaração de conformidade FHIR para ver informações sobre como a API Cloud Healthcare implementa o padrão FHIR.

HL7v2