Ricerca delle risorse FHIR

Questa pagina spiega le istruzioni di base per cercare risorse FHIR in un datastore FHIR. La ricerca di risorse FHIR è il modo principale per eseguire query e ottenere insight dai dati FHIR.

Puoi cercare le risorse FHIR nell'API Cloud Healthcare nei seguenti modi:

• Utilizzo del visualizzatore FHIR nella console Google Cloud.
• Utilizzando il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search. Il metodo offre i seguenti modi per cercare risorse FHIR:
  • Richieste GET
  • Richieste POST

Questa pagina riassume molte delle funzionalità di ricerca di uso comune, ma non è un elenco esaustivo delle parti della specifica di ricerca FHIR supportata dall'API Cloud Healthcare.

Utilizzo del visualizzatore FHIR

Il visualizzatore FHIR è una pagina della console Google Cloud che ti consente di cercare e visualizzare i contenuti delle risorse FHIR.

Per cercare risorse in un datastore FHIR, completa i seguenti passaggi:

1. Nella console Google Cloud, vai alla pagina Visualizzatore FHIR.

   Vai al visualizzatore FHIR

2. Nell'elenco a discesa Archivio FHIR, seleziona un set di dati, quindi seleziona un datastore FHIR nel set di dati.

3. Per filtrare l'elenco dei tipi di risorse, cerca quelli che vuoi visualizzare:

   1. Fai clic sul campo Tipo di risorsa.

   2. Nell'elenco a discesa Proprietà che viene visualizzato, seleziona Tipo di risorsa.

   3. Inserisci un tipo di risorsa.

   4. Per cercare un altro tipo di risorsa, seleziona O dall'elenco a discesa Operatori visualizzato, quindi inserisci un altro tipo di risorsa.

4. Nell'elenco dei tipi di risorsa, seleziona quello in cui vuoi eseguire la ricerca.

5. Nella casella di ricerca per la tabella delle risorse che viene visualizzata, inserisci il valore che vuoi cercare.

Il visualizzatore FHIR mostra i risultati di ricerca in una tabella. Dopo aver selezionato una risorsa, il visualizzatore FHIR visualizza i contenuti della risorsa.

Quando visualizzi i contenuti di una risorsa, puoi cercare i dati all'interno della risorsa.

Per cercare dati all'interno di una risorsa:

1. Seleziona una risorsa.

2. Nel riquadro Visualizzatore FHIR, fai clic sulla scheda Elementi.

3. Nella casella di ricerca, inserisci il valore da cercare.

download di dati binari all'interno delle risorse FHIR

Per scaricare i dati binari disponibili associati a una risorsa nel visualizzatore FHIR, segui questi passaggi:

1. Seleziona una risorsa.

2. Nel riquadro Visualizzatore FHIR, fai clic sulla scheda Elementi.

3. Se necessario, espandi gli elementi per accedere all'elemento di risorsa richiesto.

4. Fai clic su Scarica file per scaricare i dati disponibili.

Creazione ed esecuzione di query di ricerca avanzate

Puoi utilizzare le query di ricerca avanzata per cercare risorse FHIR specifiche utilizzando la specifica di ricerca FHIR.

Per creare una query di ricerca avanzata, procedi nel seguente modo:

1. Nella pagina del visualizzatore FHIR, fai clic sulla scheda Ricerca.

2. Per creare una query di ricerca, fai clic su Apri Query Builder.

   Viene visualizzato il riquadro Selezione query.

3. Dall'elenco Seleziona un tipo di risorsa FHIR, scegli il tipo di risorsa FHIR che vuoi cercare.

4. Fai clic su Continua.

5. Dall'elenco Parametro, seleziona il parametro che vuoi utilizzare per cercare le risorse.

6. Dall'elenco Modificatore, seleziona il modificatore da applicare alla query. L'elenco include solo i modificatori compatibili con il tipo di dati del parametro selezionato.

   Questa è una selezione facoltativa. Se non è selezionato alcun modificatore, viene eseguito un controllo di uguaglianza.

7. Nel campo Valore, inserisci il valore del parametro di ricerca.

8. Per aggiungere più di un valore parametro, fai clic su O. In questo modo puoi includere più valori del parametro della risorsa nella query di ricerca.

   Durante la creazione della query di ricerca, questa viene visualizzata nel riquadro Anteprima query. Per visualizzare l'URL completo della query di ricerca, fai clic su Mostra percorso completo.

9. Per aggiungere più di un parametro, fai clic su E.

10. Fai clic su Continua.

11. Per includere le risorse a cui fanno riferimento quelle restituite nella query di ricerca, scegli il parametro risorsa dall'elenco a discesa Parametri inclusi.

12. Per includere le risorse che fanno riferimento alle risorse restituite nella query di ricerca, scegli il parametro risorsa dall'elenco a discesa Inverti parametri inclusi.

13. Fai clic su Fine per salvare la query di ricerca.

    La query di ricerca salvata viene visualizzata nel campo Operazione di ricerca FHIR.

14. Per cercare risorse con la query, fai clic su Esegui ricerca.

    I risultati di ricerca vengono visualizzati nell'elenco Risultati di ricerca. Per visualizzare i dettagli di una risorsa restituita dalla ricerca, fai clic su una risorsa nell'elenco.

15. Per salvare la query come modello, fai clic su Salva modello e scegli Salva modello o Salva modello con nome. Ti vengono richiesti un nome e una descrizione per la query. I parametri di ricerca vengono salvati in un modello, ma gli eventuali valori definiti vengono rimossi.

Esempio di query di ricerca

L'esempio seguente mostra una query di ricerca che cerca risorse delle dichiarazioni di un fornitore di servizi sanitari specifico, Practitioner/12345, per il mese di agosto 2021:

• Parametro: care-team
  • Valore: Practitioner/12345
• Operatore: AND
• Parametro: created
  • Prefisso: lt (lesser than)
  • Valore: 8/1/21, 12:00 AM
• Operatore: AND
• Parametro: created
  • Prefisso: gt (greater than)
  • Valore: 8/31/21, 11:59 PM

Questo viene configurato come segue nel riquadro Selezione query e la query viene visualizzata in anteprima nel riquadro Anteprima query. La query verrà visualizzata nel campo Operazione di ricerca FHIR.

Nota: la risorsa CareTeam include un riferimento a una risorsa Professionista definito includendo il tipo di risorsa, Professionista, prima dell'ID univoco della risorsa, 12345.

Modifica delle query di ricerca

Per modificare una query di ricerca, procedi in uno dei seguenti modi:

• Per modificare la query in Query Builder, fai clic su Apri Query Builder.
• Per modificare manualmente la query, modifica i valori parametro nella casella di testo.

Esecuzione dei modelli di query

Per eseguire una query da un modello salvato, segui questi passaggi:

1. Fai clic su Modelli salvati.

   Viene visualizzata la scheda Modelli di ricerca del riquadro Selezione query, che mostra tutti i modelli di query salvati.

2. Seleziona il modello di query che vuoi eseguire e fai clic su Fine.

   La query di ricerca del modello viene visualizzata nel campo Operazione di ricerca FHIR senza alcun valore.

3. Per definire i valori della query di ricerca, modifica i valori dei parametri nel campo.

4. Fai clic su Esegui ricerca per cercare le risorse con la query.

Utilizzo del metodo search

Per cercare risorse FHIR con l'API REST, utilizza il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search. Puoi chiamare il metodo utilizzando le richieste GET o POST.

Utilizzo del metodo search con GET

Gli esempi riportati di seguito mostrano come cercare risorse in un determinato datastore FHIR utilizzando il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search con GET.

curl

Per cercare risorse in un datastore FHIR, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati
• Il nome del datastore FHIR
• Il tipo di risorsa da cercare
• Una stringa di query contenente le informazioni che stai cercando, come descritto nella sezione Creazione di una query di ricerca
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta GET che utilizza curl per cercare tutti i pazienti con il cognome "Smith".

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient?family:exact=Smith"

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta come Bundle FHIR in formato JSON. Bundle.type è searchset e i risultati di ricerca sono voci nell'array Bundle.entry. In questo esempio, la richiesta restituisce una singola risorsa Paziente che include i dati al suo interno:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

PowerShell

Per cercare risorse in un datastore FHIR, effettua una richiesta GET e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati
• Il nome del datastore FHIR
• Il tipo di risorsa da cercare
• Una stringa di query contenente le informazioni che stai cercando, come descritto nella sezione Creazione di una query di ricerca
• Un token di accesso

L'esempio seguente mostra una richiesta GET mediante Windows PowerShell per cercare tutti i pazienti con il cognome "Smith".

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/RESOURCE_TYPE?family:exact=Smith" | ConvertTo-Json

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta come Bundle FHIR in formato JSON. Bundle.type è searchset e i risultati di ricerca sono voci nell'array Bundle.entry. In questo esempio, la richiesta restituisce una singola risorsa Paziente che include i dati al suo interno:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceSearchGet {
  private static final String FHIR_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s/fhir/%s";
  // The endpoint URL for the Healthcare API. Required for HttpClient.
  private static final String API_ENDPOINT = "https://healthcare.googleapis.com";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceSearchGet(String resourceName)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String resourceName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "fhir-store-id");
    // String resourceType = "Patient";

    // Instantiate the client, which will be used to interact with the service.
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%s/v1/%s", API_ENDPOINT, resourceName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // To set additional parameters for search filtering, add them to the URIBuilder. For
    // example, to search for a Patient with the family name "Smith", specify the following:
    // uriBuilder.setParameter("family:exact", "Smith");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.get()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception searching GET FHIR resources: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("FHIR resource GET search results: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };
    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

// Import google-auth-library for authentication.
const {GoogleAuth} = require('google-auth-library');

const searchFhirResourcesGet = async () => {
  const auth = new GoogleAuth({
    scopes: 'https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform',
  });
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const url = `https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/${resourceType}`;

  const params = {};
  // Specify search filters in a params object. For example, to filter on a
  // Patient with the last name "Smith", set resourceType to "Patient" and
  // specify the following params:
  // params = {'family:exact' : 'Smith'};
  const client = await auth.getClient();
  const response = await client.request({url, method: 'GET', params});
  const resources = response.data.entry;
  console.log(`Resources found: ${resources.length}`);
  console.log(JSON.stringify(resources, null, 2));
};

searchFhirResourcesGet();

Python

def search_resources_get(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    fhir_store_id,
    resource_type,
):
    """
    Uses the searchResources GET method to search for resources in the given FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    # resource_type = 'Patient'  # replace with the FHIR resource type
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    resource_path = "{}/datasets/{}/fhirStores/{}/fhir/{}".format(
        url, dataset_id, fhir_store_id, resource_type
    )

    response = session.get(resource_path)
    response.raise_for_status()

    resources = response.json()

    print(
        "Using GET request, found a total of {} {} resources:".format(
            resources["total"], resource_type
        )
    )
    print(json.dumps(resources, indent=2))

    return resources

Utilizzo del metodo search con POST

Gli esempi riportati di seguito mostrano come cercare risorse in un determinato datastore FHIR utilizzando il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search con POST.

curl

Per cercare risorse in un datastore FHIR, effettua una richiesta POST e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati
• Il nome del datastore FHIR
• Il tipo di risorsa da cercare
• Una stringa di query contenente le informazioni che stai cercando, come descritto nella sezione Creazione di una query di ricerca
• Un token di accesso

Il seguente esempio mostra una richiesta POST che utilizza curl per cercare tutti i pazienti con il cognome "Smith".

curl -X POST \
    --data "" \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/fhir+json; charset=utf-8" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/_search?family:exact=Smith"

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta come Bundle FHIR in formato JSON. Bundle.type è searchset e i risultati di ricerca sono voci nell'array Bundle.entry. In questo esempio, la richiesta restituisce una singola risorsa Paziente che include i dati al suo interno:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

PowerShell

Per cercare risorse in un datastore FHIR, effettua una richiesta POST e specifica le seguenti informazioni:

• Il nome del set di dati
• Il nome del datastore FHIR
• Il tipo di risorsa da cercare
• Una stringa di query contenente le informazioni che stai cercando, come descritto nella sezione Creazione di una query di ricerca
• Un token di accesso

L'esempio seguente mostra una richiesta POST mediante Windows PowerShell per cercare tutti i pazienti con il cognome "Smith".

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/fhir+json; charset=utf-8" `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/_search?family:exact=Smith" | ConvertTo-Json

Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta come Bundle FHIR in formato JSON. Bundle.type è searchset e i risultati di ricerca sono voci nell'array Bundle.entry. In questo esempio, la richiesta restituisce una singola risorsa Paziente che include i dati al suo interno:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceSearchPost {
  private static final String FHIR_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s/fhir/%s";
  // The endpoint URL for the Healthcare API. Required for HttpClient.
  private static final String API_ENDPOINT = "https://healthcare.googleapis.com";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceSearchPost(String resourceName)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String resourceName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "store-id", "resource-type");

    // Instantiate the client, which will be used to interact with the service.
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%s/v1/%s/_search", API_ENDPOINT, resourceName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // To set additional parameters for search filtering, add them to the URIBuilder. For
    // example, to search for a Patient with the family name "Smith", specify the following:
    // uriBuilder.setParameter("family:exact", "Smith");

    // Set a body otherwise HttpClient complains there is no Content-Length set.
    StringEntity requestEntity = new StringEntity("");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.post()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .setEntity(requestEntity)
            .addHeader("Content-Type", "application/fhir+json")
            .addHeader("Accept-Charset", "utf-8")
            .addHeader("Accept", "application/fhir+json; charset=utf-8")
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception searching POST FHIR resources: %s\n",
              response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("FHIR resource POST search results: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

// Import google-auth-library for authentication.
const {GoogleAuth} = require('google-auth-library');

const searchFhirResourcesPost = async () => {
  const auth = new GoogleAuth({
    scopes: 'https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform',
    // Set application/fhir+json header because this is a POST request.
    headers: {'Content-Type': 'application/fhir+json'},
  });
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const url = `https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/${resourceType}/_search`;

  const params = {};
  // Specify search filters in a params object. For example, to filter on a
  // Patient with the last name "Smith", set resourceType to "Patient" and
  // specify the following params:
  // params = {'family:exact' : 'Smith'};
  const client = await auth.getClient();
  const response = await client.request({url, method: 'POST', params});
  const resources = response.data.entry;
  console.log(`Resources found: ${resources.length}`);
  console.log(JSON.stringify(resources, null, 2));
};

searchFhirResourcesPost();

Python

def search_resources_post(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """
    Searches for resources in the given FHIR store. Uses the
    _search POST method and a query string containing the
    information to search for. In this sample, the search criteria is
    'family:exact=Smith' on a Patient resource.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    fhir_store_path = "{}/datasets/{}/fhirStores/{}/fhir".format(
        url, dataset_id, fhir_store_id
    )

    resource_path = f"{fhir_store_path}/Patient/_search?family:exact=Smith"

    # Sets required application/fhir+json header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/fhir+json;charset=utf-8"}

    response = session.post(resource_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    resources = response.json()
    print(
        "Using POST request, found a total of {} Patient resources:".format(
            resources["total"]
        )
    )

    print(json.dumps(resources, indent=2))

    return resources

Costruzione di una query di ricerca

La stringa di query è una serie di coppie name=value codificate in forma di URL. Una ricerca combina tutte le coppie con un valore logico AND. Ogni valore può essere un elenco di valori separati da virgole, che vengono trattati come un OR logico di questi valori. Ad esempio, Patient?key1=value1&key2=value2,value3 è una ricerca delle risorse pazienti che utilizza i seguenti criteri:

(key1 = value1) AND (key2 = value2 OR key2 = value3)

Non esiste una sintassi per eseguire un'operazione di tipo OR su due coppie name=value.

Ogni tipo di risorsa FHIR definisce i propri parametri di ricerca in ogni versione di FHIR. I parametri disponibili sono documentati nella specifica FHIR per ogni risorsa. Per un esempio, consulta Paziente FHIR R4. Puoi recuperare i parametri in modo programmatico attraverso l'istruzione di capacità. L'API Cloud Healthcare supporta la maggior parte dei parametri di ricerca; puoi trovare le esclusioni tramite l'istruzione di funzionalità o la dichiarazione di conformità FHIR.

Impaginazione e ordinamento

Il numero di risorse restituite su ogni pagina dei risultati di ricerca FHIR dipende dai seguenti fattori:

• Il parametro _count. Controlla il numero massimo di risorse restituite dal metodo di ricerca. Ad esempio, _count=10 restituisce al massimo 10 risorse corrispondenti alla query. Il valore predefinito è 100 e il valore massimo consentito è 1000.
• La dimensione dei dati della risposta. Una pagina di risultati di ricerca potrebbe restituire meno risorse rispetto al valore specificato nel parametro _count se le dimensioni della risposta sono grandi.

Se una ricerca restituisce un numero di risorse superiore a quello consentito in una singola pagina, la risposta include un URL di impaginazione nel campo Bundle.link. Potrebbero essere restituiti più valori in questo campo; il valore con Bundle.link.relation = next indica che puoi utilizzare il valore Bundle.link.url corrispondente per recuperare la pagina successiva.

Il valore di Bundle.total indica il numero totale di risorse corrispondenti. Questo valore è esatto se i risultati rientrano completamente in una pagina, ma diventa una stima approssimativa poiché il numero di risultati supera una pagina. Puoi ottenere un totale esatto per una ricerca che corrisponde a molti risultati seguendo ripetutamente i link di impaginazione fino a esaurimento dei risultati.

Per saperne di più sui totali di impaginazione e ricerca, consulta Implementazione dei totali di impaginazione e ricerca con la ricerca FHIR.

Puoi ordinare i risultati utilizzando il parametro _sort, che accetta un elenco separato da virgole di nomi dei parametri di ricerca in ordine di priorità. Puoi utilizzare un prefisso - per indicare l'ordine decrescente. Ad esempio, la seguente query è ordinata in base allo stato in ordine crescente, in base alla data in ordine decrescente e in base alla categoria in ordine crescente.

_sort=status,-date,category

Nota: un datastore FHIR configurato per l'utilizzo della versione DSTU2 utilizza una sintassi _sort diversa presente in quella versione della specifica. Ogni istanza di _sort richiede un parametro di ricerca e un modificatore facoltativo di :asc o :desc. Ad esempio, in DSTU2, per eseguire lo stesso ordinamento dell'esempio precedente, utilizza _sort=status&_sort:desc=date&_sort=category.

Ritardo di indicizzazione

Le risorse FHIR sono indicizzate in modo asincrono, quindi potrebbe verificarsi un leggero ritardo tra il momento in cui una risorsa viene creata o modificata e il momento in cui la modifica si riflette nei risultati di ricerca. L'unica eccezione sono i dati degli identificatori di risorsa, che sono indicizzati in modo sincrono come indice speciale. Di conseguenza, la ricerca con l'identificatore di risorsa non è soggetta a ritardo di indicizzazione. Per utilizzare l'indice sincrono speciale, il termine di ricerca per l'identificatore deve essere nel pattern identifier=[system]|[value] o identifier=[value] ed è possibile utilizzare uno dei seguenti parametri dei risultati di ricerca:

• _count
• _include
• _revinclude
• _summary
• _elements

Se la query contiene altri parametri di ricerca, verrà utilizzato l'indice asincrono standard. Tieni presente che la ricerca rispetto all'indice speciale è ottimizzata per risolvere un numero ridotto di corrispondenze. La ricerca non è ottimizzata se i criteri di ricerca degli identificatori corrispondono a un numero elevato (ovvero più di 2000) di risorse. Per una query di ricerca che corrisponde a un numero elevato di risorse, puoi evitare di utilizzare lo speciale indice sincrono includendo un parametro _sort aggiuntivo nella query. Utilizza _sort=-_lastUpdated per mantenere l'ordinamento predefinito.

Nota: l'indice speciale di identificatori sincrono è attualmente disabilitato per le ricerche DocumentReference e DocumentManifest.

Ricerca in tutti i tipi di risorse

Alcuni parametri di ricerca, mostrati da un trattino basso iniziale come _id, si applicano a tutti i tipi di risorsa. Questi parametri per tutte le risorse sono elencati nella specifica FHIR per il Tipo di risorsa.

Quando utilizzi questi parametri di ricerca, puoi eseguire una ricerca su più tipi di risorse omettendo il tipo di risorsa dal percorso della richiesta. Ad esempio, l'uso di GET .../fhir?_id=1234 anziché GET .../fhir/Patient?_id=1234 di ricerche in tutte le risorse FHIR anziché solo in una risorsa Patient. Puoi utilizzare il parametro speciale _type con questo tipo di richiesta per limitare i risultati a un elenco separato da virgole di tipi di risorse. Ad esempio, la seguente query restituisce solo risultati corrispondenti per le risorse Observation e Condition:

GET .../fhir?_tag=active&_type=Observation,Condition

Tipi di dati

Ogni parametro di ricerca definito da FHIR ha un tipo di dati, che include tipi primitivi come il seguente:

• Stringa
• Numero
• Data

I tipi di dati includono anche i seguenti tipi complessi:

• Token
• Riferimento
• Quantità

Ogni tipo di dati ha la propria sintassi per specificare i valori. Ogni tipo di dati supporta modificatori che alterano il modo in cui viene eseguita la ricerca.

Le sezioni seguenti mostrano come utilizzare i tipi di dati. Per ulteriori dettagli su altri tipi di dati, sintassi dei valori e modificatori, consulta Funzionalità di ricerca FHIR avanzate.

Numero

Cerca valori interi o in virgola mobile. Per cambiare il criterio di confronto, aggiungi il prefisso al valore con uno dei seguenti modificatori:

• ne
• lt
• le
• gt
• ge

Ad esempio, utilizza [parameter]=100 per l'uguaglianza o [parameter]=ge100 per un valore maggiore o uguale a 100.

Data

Esegue ricerche in qualsiasi tipo di data, ora o periodo. Il formato del parametro della data è il seguente:

yyyy-mm-ddThh:mm:ss[Z|(+|-)hh:mm]

Si applicano gli stessi modificatori di prefisso utilizzati per numero.

Stringa

Il valore predefinito è una ricerca con prefisso che non è sensibile alle maiuscole, agli accenti o ad altri segni diacritici.

Nota: i caratteri di punteggiatura dividono una ricerca in più parole e gli stessi caratteri di punteggiatura vengono ignorati.

Token

Cerca una corrispondenza stringa esatta di un "codice". Puoi limitare la ricerca all'URI di un "system" che indica il set di valori da cui proviene il codice utilizzando il seguente formato:

[parameter]=[system]|[code]

Ad esempio, la seguente ricerca corrisponde al codice 10738-3, ma solo se qualificato come valore da un sistema di codifica con l'URI specificato:

code=http://hl7.org/fhir/ValueSet/observation-codes|10738-3

Quantità

Cerca un valore numerico utilizzando gli stessi modificatori di prefisso di numero. Puoi qualificare la ricerca con un sistema e un codice specifici che indicano le unità del valore nel seguente formato:

[parameter]=[prefix][number]|[system]|[code]

Ad esempio, la seguente query cerca valori della quantità inferiori a 9,1 con il sistema e il codice unità specificati:

value-quantity=lt9.1|http://unitsofmeasure.org|mg

Riferimento

Cerca i riferimenti tra le risorse. Puoi utilizzare le seguenti query per i riferimenti alle risorse all'interno di un datastore FHIR:

• [parameter]=[id]
• [parameter]=[type]/[id]

Puoi utilizzare [parameter]=[url] per specificare tramite URL i riferimenti che potrebbero essere esterni al datastore FHIR.

Gestione dei parametri di ricerca

Per impostazione predefinita, il metodo di ricerca applica una gestione "permissiva", che ignora i parametri non riconosciuti dalla ricerca. Il metodo di ricerca esegue la ricerca utilizzando tutti i parametri rimanenti nella richiesta, il che potrebbe restituire più risorse del previsto.

La risposta include quanto segue:

• Un valore in Bundle.link con un valore di Bundle.link.relation = self
• Il valore Bundle.link.url di un URL contenente solo i parametri applicati correttamente alla ricerca. Puoi controllare questo valore per determinare se alcuni parametri sono stati ignorati.

Puoi impostare l'intestazione HTTP della richiesta su Prefer: handling=strict su una richiesta di ricerca. L'impostazione dell'intestazione fa sì che il datastore FHIR restituisca un errore su qualsiasi parametro non riconosciuto.

Nota: se imposti l'opzione del datastore FHIR defaultSearchHandlingStrict, il valore predefinito verrà modificato in strict per tutte le richieste di ricerca, a meno che una singola richiesta non utilizzi l'intestazione HTTP Prefer: handling=lenient per scegliere la modalità rilassata.