Buscar recursos de FHIR

En esta página, se explican las instrucciones básicas para buscar recursos de FHIR en un almacén de FHIR. Buscando Los recursos de FHIR son la forma principal de consultar y obtener estadísticas de los datos de FHIR.

Puedes buscar recursos de FHIR en la API de Cloud Healthcare de las siguientes maneras:

En esta página, se resumen muchas de las funciones de búsqueda de uso común, pero no se enumeran de forma exhaustiva las partes de la especificación de búsqueda de FHIR compatibles con la API de Cloud Healthcare.

Usa el visor de FHIR

El visualizador de FHIR es una página en la consola de Google Cloud que te permite buscar y ver el contenido de los recursos de FHIR.

Para buscar recursos en un almacén de FHIR, completa los siguientes pasos:

  1. En la consola de Google Cloud, ve a la página Visor de FHIR.

    Ir al Visor de FHIR

  2. En la lista desplegable Almacén de FHIR, selecciona un conjunto de datos y, luego, un almacén de FHIR en el conjunto de datos.

  3. Para filtrar la lista de tipos de recursos, busca los tipos de recursos que deseas mostrar:

    1. Haz clic en el campo Tipo de recurso.

    2. En la lista desplegable Propiedades que aparece, selecciona Tipo de recurso.

    3. Ingresa un tipo de recurso.

    4. Para buscar otro tipo de recurso, selecciona O en la lista desplegable Operadores que aparece y, luego, ingresa otro tipo de recurso.

  4. En la lista de tipos de recursos, selecciona el tipo de recurso en el que deseas realizar la búsqueda.

  5. En el cuadro de búsqueda de la tabla de recursos que aparece, ingresa el valor que deseas buscar.

El visor de FHIR muestra los resultados de la búsqueda en una tabla. Después de seleccionar un recurso, el visor de FHIR muestra el contenido del recurso.

Cuando ves el contenido de un recurso, puedes buscar datos dentro del recurso.

Para buscar datos dentro de un recurso, sigue estos pasos:

  1. Selecciona un recurso

  2. En el panel Visor de FHIR, haz clic en la pestaña Elementos.

  3. En el cuadro de búsqueda, ingresa el valor que quieras buscar.

Descarga de datos binarios en recursos de FHIR

Para descargar los datos binarios disponibles asociados con un recurso en el visor de FHIR, sigue estos pasos:

  1. Selecciona un recurso.

  2. En el panel Visor de FHIR, haz clic en la pestaña Elementos.

  3. Si es necesario, expande los elementos para acceder al elemento de recurso requerido.

  4. Haz clic en Descargar archivo para descargar los datos disponibles.

Crear y ejecutar consultas de búsqueda avanzada

Puedes usar consultas de búsquedas avanzadas para buscar recursos de FHIR específicos mediante la especificación de búsqueda de FHIR.

Para crear una búsqueda avanzada, sigue estos pasos:

  1. En la página Visor de FHIR, haz clic en la pestaña Buscar.

  2. Para crear una búsqueda, haz clic en Abrir el compilador de consultas.

    Se mostrará el panel Selección de consultas.

  3. En la lista Selecciona un tipo de recurso de FHIR, elige el tipo de recurso de FHIR que deseas buscar.

  4. Haga clic en Continuar.

  5. En la lista Parámetro, selecciona el parámetro que deseas usar para buscar recursos.

  6. Desde la lista Modifier, selecciona el modificador que se aplicará al para cada búsqueda. La lista solo incluye modificadores compatibles con el tipo de datos del parámetro seleccionado.

    Esta selección es opcional. Si no se selecciona ningún modificador, se realiza una verificación de igualdad.

  7. En el campo Valor, ingresa el valor del parámetro de consulta.

  8. Para agregar más de un valor de parámetro, haz clic en O. Esto te permite incluir varios valores de tu parámetro de recursos en tu búsqueda.

    A medida que creas tu consulta de búsqueda, esta se muestra en el cuadro Panel Preview. Para ver la URL completa de la búsqueda, haz clic en Mostrar de la ruta de acceso.

  9. Para agregar más de un parámetro, haz clic en Y.

  10. Haz clic en Continuar.

  11. Para incluir recursos a los que hacen referencia los recursos que se muestran en tu consulta de búsqueda, elige el parámetro de recurso en la lista desplegable Parámetros incluidos.

  12. Para incluir recursos que hagan referencia a los recursos que se muestran en tu consulta de búsqueda, elige el parámetro de recurso de la lista desplegable Invertir parámetros incluidos.

  13. Haz clic en Listo para guardar la búsqueda.

    La búsqueda guardada se muestra en el campo Operación de búsqueda de FHIR.

  14. Para buscar recursos con la consulta, haz clic en Run Search.

    Los resultados de la búsqueda se muestran en la lista de resultados de la búsqueda. Para ver los detalles de un recurso que muestra la búsqueda, haz clic en él en la lista.

  15. Para guardar la consulta como una plantilla, haz clic en Guardar plantilla y elige Guardar plantilla o Guardar plantilla como. Se te solicitará un nombre y una descripción para la consulta. Los parámetros de consulta se guardan en una plantilla, pero se quitan los valores definidos.

Ejemplo de búsqueda

En el siguiente ejemplo, se muestra una búsqueda que busca recursos de reclamos de un proveedor de atención médica específico, Practitioner/12345, para el mes de agosto de 2021:

  • Parámetro: care-team
    • Value: Practitioner/12345
  • Operador: Y
  • Parámetro: created
    • Prefijo: lt (lesser than)
    • Value: 8/1/21, 12:00 AM
  • Operador: Y
  • Parámetro: created
    • Prefijo: gt (greater than)
    • Value: 8/31/21, 11:59 PM

Esto se configura de la siguiente manera en el panel Selección de consulta y la consulta se se ve en el panel Vista previa de la consulta. La consulta se mostrará en el Campo Operación de búsqueda de FHIR.

Búsqueda avanzada de FHIR

Cómo editar búsquedas

Para editar una búsqueda, realiza una de las siguientes acciones:

  • Para editar la consulta en el compilador de consultas, haz clic en Abrir el compilador de consultas.
  • Para editar la consulta de forma manual, edita los valores de los parámetros en el cuadro de texto.

Ejecuta plantillas de consulta

Para ejecutar una consulta desde una plantilla guardada, completa los siguientes pasos:

  1. Haz clic en Plantillas guardadas.

    Aparecerá la pestaña Plantillas de búsqueda del panel Selección de consultas, en la que se mostrarán todas las plantillas de consulta guardadas.

  2. Selecciona la plantilla de consulta que deseas ejecutar y haz clic en Listo.

    La búsqueda de la plantilla se muestra en la operación de búsqueda FHIR sin valores.

  3. Para definir los valores de tu búsqueda, edita los valores de los parámetros en el campo.

  4. Haz clic en Ejecutar búsqueda para buscar recursos con la consulta.

Usa el método search

Para buscar recursos de FHIR con la API de REST, usa el projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search . Puedes llamar al método con solicitudes GET o POST.

Usa el método search con GET

En los siguientes ejemplos, se muestra cómo buscar recursos en una tienda de FHIR determinada mediante el método projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search con GET.

curl

Para buscar recursos en una tienda de FHIR, realiza una solicitud GET y especifica la siguiente información:

  • El nombre del conjunto de datos
  • El nombre de la tienda de FHIR
  • El tipo de recurso que deseas buscar
  • Una string de consulta que contiene la información que buscas, como se describe en la sección Cómo construir una búsqueda
  • Un token de acceso

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud GET mediante curl para buscar todos los pacientes con el apellido "Smith".

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient?family:exact=Smith"

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará la respuesta como un Bundle de FHIR en formato JSON. Bundle.type es searchset y los resultados de la búsqueda son entradas en el arreglo Bundle.entry. En este ejemplo, la solicitud muestra un solo recurso Patient que incluye los datos dentro de ese recurso:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

PowerShell

Para buscar recursos en una tienda de FHIR, realiza una solicitud GET y especifica la siguiente información:

  • El nombre del conjunto de datos
  • El nombre de la tienda de FHIR
  • El tipo de recurso que deseas buscar
  • Una string de consulta que contiene la información que buscas, como se describe en la sección Cómo construir una búsqueda
  • Un token de acceso

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud GET mediante Windows PowerShell para buscar todos los pacientes con el apellido "Smith".

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/RESOURCE_TYPE?family:exact=Smith" | ConvertTo-Json

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará la respuesta como un Bundle de FHIR en formato JSON. Bundle.type es searchset y los resultados de la búsqueda son entradas en el arreglo Bundle.entry. En este ejemplo, la solicitud muestra un solo recurso Patient que incluye los datos dentro de ese recurso:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceSearchGet {
  private static final String FHIR_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s/fhir/%s";
  // The endpoint URL for the Healthcare API. Required for HttpClient.
  private static final String API_ENDPOINT = "https://healthcare.googleapis.com";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceSearchGet(String resourceName)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String resourceName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "fhir-store-id");
    // String resourceType = "Patient";

    // Instantiate the client, which will be used to interact with the service.
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%s/v1/%s", API_ENDPOINT, resourceName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // To set additional parameters for search filtering, add them to the URIBuilder. For
    // example, to search for a Patient with the family name "Smith", specify the following:
    // uriBuilder.setParameter("family:exact", "Smith");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.get()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception searching GET FHIR resources: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("FHIR resource GET search results: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };
    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

// Import google-auth-library for authentication.
const {GoogleAuth} = require('google-auth-library');

const searchFhirResourcesGet = async () => {
  const auth = new GoogleAuth({
    scopes: 'https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform',
  });
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const url = `https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/${resourceType}`;

  const params = {};
  // Specify search filters in a params object. For example, to filter on a
  // Patient with the last name "Smith", set resourceType to "Patient" and
  // specify the following params:
  // params = {'family:exact' : 'Smith'};
  const client = await auth.getClient();
  const response = await client.request({url, method: 'GET', params});
  const resources = response.data.entry;
  console.log(`Resources found: ${resources.length}`);
  console.log(JSON.stringify(resources, null, 2));
};

searchFhirResourcesGet();

Python

def search_resources_get(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    fhir_store_id,
    resource_type,
):
    """
    Uses the searchResources GET method to search for resources in the given FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    # resource_type = 'Patient'  # replace with the FHIR resource type
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    resource_path = "{}/datasets/{}/fhirStores/{}/fhir/{}".format(
        url, dataset_id, fhir_store_id, resource_type
    )

    response = session.get(resource_path)
    response.raise_for_status()

    resources = response.json()

    print(
        "Using GET request, found a total of {} {} resources:".format(
            resources["total"], resource_type
        )
    )
    print(json.dumps(resources, indent=2))

    return resources

Usa el método search con POST

En los siguientes ejemplos, se muestra cómo buscar recursos en una tienda de FHIR determinada mediante el método projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.search con POST.

curl

Para buscar recursos en una tienda de FHIR, realiza una solicitud POST y especifica la siguiente información:

  • El nombre del conjunto de datos
  • El nombre de la tienda de FHIR
  • El tipo de recurso que deseas buscar
  • Una string de consulta que contiene la información que buscas, como se describe en la sección Cómo construir una búsqueda
  • Un token de acceso

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante curl para buscar todos los pacientes con el apellido "Smith".

curl -X POST \
    --data "" \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/fhir+json; charset=utf-8" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/_search?family:exact=Smith"

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará la respuesta como un Bundle de FHIR en formato JSON. Bundle.type es searchset y los resultados de la búsqueda son entradas en el arreglo Bundle.entry. En este ejemplo, la solicitud muestra un solo recurso Patient que incluye los datos dentro de ese recurso:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

PowerShell

Para buscar recursos en una tienda de FHIR, realiza una solicitud POST y especifica la siguiente información:

  • El nombre del conjunto de datos
  • El nombre de la tienda de FHIR
  • El tipo de recurso que deseas buscar
  • Una string de consulta que contiene la información que buscas, como se describe en la sección Cómo construir una búsqueda
  • Un token de acceso

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante Windows PowerShell para buscar todos los pacientes con el apellido "Smith".

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/fhir+json; charset=utf-8" `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/_search?family:exact=Smith" | ConvertTo-Json

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará la respuesta como un Bundle de FHIR en formato JSON. Bundle.type es searchset y los resultados de la búsqueda son entradas en el arreglo Bundle.entry. En este ejemplo, la solicitud muestra un solo recurso Patient que incluye los datos dentro de ese recurso:

{
  "entry": [
    {
      "fullUrl": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/PATIENT_ID",
      "resource": {
        "birthDate": "1970-01-01",
        "gender": "female",
        "id": "PATIENT_ID",
        "meta": {
          "lastUpdated": "LAST_UPDATED",
          "versionId": "VERSION_ID"
        },
        "name": [
          {
            "family": "Smith",
            "given": [
              "Darcy"
            ],
            "use": "official"
          }
        ],
        "resourceType": "Patient"
      },
      "search": {
        "mode": "match"
      }
    }
  ],
  "link": [
    {
      "url": "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient/?family%3Aexact=Smith"
    }
  ],
  "resourceType": "Bundle",
  "total": 1,
  "type": "searchset"
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.StringEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class FhirResourceSearchPost {
  private static final String FHIR_NAME =
      "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s/fhir/%s";
  // The endpoint URL for the Healthcare API. Required for HttpClient.
  private static final String API_ENDPOINT = "https://healthcare.googleapis.com";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirResourceSearchPost(String resourceName)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String resourceName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "store-id", "resource-type");

    // Instantiate the client, which will be used to interact with the service.
    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%s/v1/%s/_search", API_ENDPOINT, resourceName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // To set additional parameters for search filtering, add them to the URIBuilder. For
    // example, to search for a Patient with the family name "Smith", specify the following:
    // uriBuilder.setParameter("family:exact", "Smith");

    // Set a body otherwise HttpClient complains there is no Content-Length set.
    StringEntity requestEntity = new StringEntity("");

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.post()
            .setUri(uriBuilder.build())
            .setEntity(requestEntity)
            .addHeader("Content-Type", "application/fhir+json")
            .addHeader("Accept-Charset", "utf-8")
            .addHeader("Accept", "application/fhir+json; charset=utf-8")
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception searching POST FHIR resources: %s\n",
              response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("FHIR resource POST search results: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

// Import google-auth-library for authentication.
const {GoogleAuth} = require('google-auth-library');

const searchFhirResourcesPost = async () => {
  const auth = new GoogleAuth({
    scopes: 'https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform',
    // Set application/fhir+json header because this is a POST request.
    headers: {'Content-Type': 'application/fhir+json'},
  });
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const resourceType = 'Patient';
  const url = `https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/${resourceType}/_search`;

  const params = {};
  // Specify search filters in a params object. For example, to filter on a
  // Patient with the last name "Smith", set resourceType to "Patient" and
  // specify the following params:
  // params = {'family:exact' : 'Smith'};
  const client = await auth.getClient();
  const response = await client.request({url, method: 'POST', params});
  const resources = response.data.entry;
  console.log(`Resources found: ${resources.length}`);
  console.log(JSON.stringify(resources, null, 2));
};

searchFhirResourcesPost();

Python

def search_resources_post(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """
    Searches for resources in the given FHIR store. Uses the
    _search POST method and a query string containing the
    information to search for. In this sample, the search criteria is
    'family:exact=Smith' on a Patient resource.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports Python's built-in "os" module
    import os

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using a service account
    from google.oauth2 import service_account

    # Gets credentials from the environment.
    credentials = service_account.Credentials.from_service_account_file(
        os.environ["GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS"]
    )
    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    fhir_store_path = "{}/datasets/{}/fhirStores/{}/fhir".format(
        url, dataset_id, fhir_store_id
    )

    resource_path = f"{fhir_store_path}/Patient/_search?family:exact=Smith"

    # Sets required application/fhir+json header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/fhir+json;charset=utf-8"}

    response = session.post(resource_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    resources = response.json()
    print(
        "Using POST request, found a total of {} Patient resources:".format(
            resources["total"]
        )
    )

    print(json.dumps(resources, indent=2))

    return resources

Cómo crear una búsqueda

La cadena de consulta es una serie de pares name=value codificados con el formato de una URL. Una búsqueda combina todos los pares con un AND lógico. Cada valor puede ser una lista de valores separados por comas, que se tratan como un OR lógico de esos valores. Por ejemplo, Patient?key1=value1&key2=value2,value3 es una búsqueda en Recursos para pacientes con los siguientes criterios:

(key1 = value1) AND (key2 = value2 OR key2 = value3)

No hay sintaxis para realizar una OR de dos pares name=value.

Cada tipo de recurso de FHIR define sus propios parámetros de búsqueda en cada versión de FHIR. Los parámetros disponibles se documentan en la especificación de FHIR de cada recurso. Para ver un ejemplo, consulta Paciente con FHIR R4. Puedes recuperar los parámetros de forma programática a través de la declaración de capabilities. La API de Cloud Healthcare admite la mayoría de los parámetros de búsqueda. puedes encontrar exclusiones mediante la declaración de capacidades o la declaración de conformidad de FHIR.

Paginación y ordenamiento

La cantidad de recursos que se muestran en cada página de los resultados de la búsqueda de FHIR depende en los siguientes factores:

  • El parámetro _count Controla la cantidad máxima de recursos que devuelve el método de búsqueda. Por ejemplo, _count=10 muestra como máximo 10 recursos que coinciden con la consulta. El valor predeterminado es 100 se permite es de 1,000.
  • Es el tamaño de los datos de la respuesta. Una página de resultados de búsqueda puede mostrar menos resultados recursos que el valor especificado en el parámetro _count si el tamaño la respuesta es grande.

Si una búsqueda muestra más recursos que la cantidad que cabe en una página, la respuesta incluye una URL de paginación en el campo Bundle.link. Hay puede ser varios valores mostrados en este campo; el valor con Bundle.link.relation = next indica que puedes usar el elemento Bundle.link.url para recuperar la página siguiente.

El valor de Bundle.total indica la cantidad total de recursos coincidentes. Este valor es exacto si los resultados caben todos en una página, pero se convierte en una estimación aproximada a medida que la cantidad de resultados supera una página. Puedes obtener un total exacto para una búsqueda que coincida con muchos resultados siguiendo enlaces de paginación repetidamente hasta que los resultados sean agotarse.

Para obtener más información sobre la paginación y los totales de búsqueda, consulta Implementa la paginación y los totales de búsqueda con la búsqueda de FHIR.

Puedes ordenar los resultados con el parámetro _sort, que acepta una lista separada por comas de nombres de parámetros de búsqueda en orden de prioridad. Puedes usar un prefijo - para indicar el orden decreciente. Por ejemplo, la siguiente consulta ordena por estado de forma ascendente, divide los vínculos por fecha de forma descendente y divide cualquier vínculo restante por categoría de forma ascendente:

_sort=status,-date,category

Demora en la indexación

Los recursos de FHIR se indexan de forma asíncrona, por lo que puede haber una pequeña demora entre el momento en que se crea o se cambia un recurso y el momento en que el cambio se refleja en los resultados de la búsqueda. La única excepción son los datos del identificador de recursos, que se indexa de forma síncrona como un índice especial. Como resultado, la búsqueda con el identificador de recursos no está sujeta a demoras de indexación. Para usar el índice síncrono especial, el término de búsqueda del identificador debe estar en el patrón identifier=[system]|[value] o identifier=[value], y se puede usar cualquiera de los siguientes parámetros de resultados de la búsqueda:

  • _count
  • _include
  • _revinclude
  • _summary
  • _elements

Si tu consulta contiene otros parámetros de búsqueda, la red asíncrona estándar en su lugar. Ten en cuenta que la búsqueda en el índice especial está optimizada para resolver una pequeña cantidad de coincidencias. La búsqueda no se optimiza si sus criterios de búsqueda del identificador coincidan con una gran cantidad (es decir, más de 2,000) de de Google Cloud. Para una búsqueda que coincida con una gran cantidad de recursos, puedes evitar usar el índice síncrono especial si incluyes un parámetro _sort adicional en la búsqueda. Usa _sort=-_lastUpdated si deseas mantener el orden de clasificación predeterminado.

Busca en todos los tipos de recursos

Ciertos parámetros de búsqueda, que se distinguen porque comienzan con un guión bajo como _id, se aplican a todos los tipos de recursos. Estos parámetros para todos los recursos se enumeran en la especificación de FHIR destinada al tipo de recurso.

Cuando usas estos parámetros de búsqueda, puedes realizar una búsqueda en varios tipos de recursos si omites el tipo de recurso en la ruta de la solicitud. Por ejemplo: con GET .../fhir?_id=1234 en lugar de búsquedas de GET .../fhir/Patient?_id=1234 en todos los recursos de FHIR, en lugar de en un recurso Paciente. Puedes usar el parámetro especial _type con este tipo de solicitud para limitar los resultados a una lista separada por comas lista de tipos de recursos. Por ejemplo, la siguiente consulta solo muestra los resultados coincidentes para los recursos Observation y Condition:

GET .../fhir?_tag=active&_type=Observation,Condition

Tipos de datos

Cada parámetro de búsqueda definido por FHIR tiene un tipo de datos, que incluye tipos primitivos, como los siguientes:

  • String
  • Número
  • Fecha

Los tipos de datos también incluyen los siguientes tipos complejos:

  • Token
  • Referencia
  • Cantidad

Cada tipo de datos tiene su propia sintaxis para especificar valores. Cada tipo de datos admite modificadores que alteran la forma en que se realiza la búsqueda.

En las siguientes secciones, se muestra cómo usar los tipos de datos. Para obtener más detalles sobre los tipos de datos adicionales, las sintaxis de valores y los modificadores, consulta Funciones de búsqueda avanzada de FHIR.

Número

Busca en valores de números enteros o de punto flotante. Para cambiar el comparador, antepone al valor uno de los siguientes modificadores:

  • ne
  • lt
  • le
  • gt
  • ge

Por ejemplo, usa [parameter]=100 para la igualdad o [parameter]=ge100 para mayor o igual que 100.

Fecha

Busca en cualquier tipo de fecha, hora o período. El parámetro date formato es el siguiente:

yyyy-mm-ddThh:mm:ss[Z|(+|-)hh:mm]

Se aplican los mismos modificadores de prefijo que se usan para número.

String

El valor predeterminado es una búsqueda de prefijo que no distingue mayúsculas de minúsculas. acentos u otros signos diacríticos.

Token

Busca una coincidencia de cadena exacta de un "código". Puedes determinar el alcance de la búsqueda al URI de un “sistema” que indica el conjunto de valores del que se obtiene el código el siguiente formato:

[parameter]=[system]|[code]

Por ejemplo, la siguiente búsqueda coincide con un código de 10738-3, pero solo cuando se califica como un valor de un sistema de codificación que contiene el URI especificado:

code=http://hl7.org/fhir/ValueSet/observation-codes|10738-3

Cantidad

Busca un valor numérico mediante los mismos modificadores de prefijo que número. Puedes calificar la búsqueda con un sistema y un código específicos que indiquen las unidades del valor en el siguiente formato:

[parameter]=[prefix][number]|[system]|[code]

Por ejemplo, la siguiente consulta busca valores de cantidad inferiores a 9.1 que tengan el código y el sistema de unidades especificados:

value-quantity=lt9.1|http://unitsofmeasure.org|mg

Referencia

Busca referencias entre recursos. Puedes usar las siguientes consultas para obtener referencias a recursos dentro de un almacén de FHIR:

  • [parameter]=[id]
  • [parameter]=[type]/[id]

Puedes usar [parameter]=[url] para especificar referencias por URL. que puede estar fuera del almacén de FHIR.

Busca en la organización de parámetros

De forma predeterminada, el método de búsqueda aplica "tolerante" que ignora parámetros que la búsqueda no reconoce. El método de búsqueda realiza la búsqueda con cualquier parámetro restante en la solicitud, lo que podría mostrar más recursos de los esperados.

La respuesta incluye lo siguiente:

  • Un valor en Bundle.link con un valor de Bundle.link.relation = self
  • Un Bundle.link.url de una URL que contiene solo los parámetros que se aplicaron correctamente a la búsqueda. Puedes inspeccionar este valor para determinar si se ignoró algún parámetro.

Puedes establecer el encabezado HTTP de la solicitud en Prefer: handling=strict en una búsqueda. para cada solicitud. Configurar el encabezado hace que el almacén de FHIR muestre un error en cualquier archivo no reconocido parámetro.