Halaman ini menjelaskan cara menggunakan konfigurasi DicomTagConfig
v1beta1 di Cloud Healthcare API untuk melakukan de-identifikasi data sensitif dalam instance DICOM pada tingkat berikut:
- Pada tingkat set data yang menggunakan
datasets.deidentify
- Di tingkat toko DICOM menggunakan
dicomStores.deidentify
Halaman ini juga menjelaskan cara menerapkan filter saat melakukan de-identifikasi data di tingkat penyimpanan DICOM.
Anda dapat mengonfigurasi operasi de-identifikasi DICOM menggunakan objek DicomConfig
v1 lama atau objek DicomTagConfig
v1beta1. Sebaiknya Anda menggunakan DicomTagConfig
.
Jika Anda sudah menggunakan DicomConfig
untuk operasi de-identifikasi, sebaiknya
Anda bermigrasi untuk menggunakan DicomTagConfig
. Untuk ringkasan fitur baru, lihat Opsi konfigurasi baru di DicomTagConfig
.
Untuk petunjuk tentang cara melakukan migrasi, lihat Memigrasikan permintaan dan respons untuk menggunakan DicomTagConfig
.
Opsi konfigurasi baru di DicomTagConfig
Melakukan de-identifikasi teks dengan de-identifikasi kontekstual
Anda dapat mengonfigurasi objek DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
untuk memungkinkan de-identifikasi kontekstual teks metadata yang tidak terstruktur.
Opsi ini didasarkan pada
Opsi Clean Descriptors.
Saat Anda menentukan DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
, infoType tambahan
akan digunakan selama pemeriksaan yang dapat memengaruhi biaya penagihan.
Penggunaan opsi DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
akan mengubah
teks metadata tidak terstruktur yang cocok dengan tag yang dihapus, sehingga meningkatkan
kualitas de-identifikasi. Misalnya, Anda melakukan de-identifikasi terhadap sinar-X, dan pasien sinar-X memiliki nama belakang yang juga merupakan
kata benda, seperti Wall
. Jika ada metadata dalam instance, seperti teks dalam StudyDescription
, berisi kata Wall
, teks akan diubah.
Opsi CleanDescriptorsOption
menyamarkan frasa kontekstual yang cocok dengan tag
yang ditandai untuk dihapus di Profil Dasar DICOM
selama tag tersebut cocok dengan salah satu kode tindakan berikut:
D
Z
X
U
Frasa kontekstual yang cocok akan diganti dengan token [CTX]
.
Anda dapat mengonfigurasi tag yang akan disamarkan dengan menentukan hal berikut:
- Enum dalam objek
ProfileType
. Menentukan enum tidak diperlukan. - Filter
CleanTextTag
ke tag tertentu.
Namun, tag yang digunakan dalam Profil Dasar DICOM tidak dapat diubah.
Menyamarkan teks sisipan dengan de-identifikasi kontekstual
Anda dapat menentukan enum TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
untuk mengaktifkan de-identifikasi kontekstual teks sisipan dalam gambar.
Opsi ini didasarkan pada
Opsi Clean Descriptors.
Saat Anda menentukan enum TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, infoType tambahan akan digunakan selama pemeriksaan yang dapat memengaruhi biaya penagihan.
Anda dapat menentukan enum TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
dengan cara berikut:
Dalam objek
Options.ImageConfig
denganDicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
. Saat Anda menentukan opsi ini, tagPixelData (7FE0,0010)
akan otomatis ditambahkan ke daftar tag yang akan disamarkan.Dalam objek
Action.CleanImageTag
denganDicomTagConfig.Action.CleanImageTag.TextRedactionMode
. Saat menentukan opsi ini, Anda harus menambahkan tagPixelData
secara manual ke arrayAction.queries[]
. TagPixelData
adalah satu-satunya tag yang didukung saat menggunakanAction.CleanImageTag
.
Opsi TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
menyamarkan
teks burn-in yang cocok dengan tag
yang ditandai untuk dihapus di Profil Dasar DICOM
selama tag tersebut cocok dengan salah satu kode tindakan berikut:
D
Z
X
U
Tidak ada konfigurasi tambahan untuk de-identifikasi kontekstual
teks burn-in selain mengaktifkan atau menonaktifkannya menggunakan enum dalam objek
ProfileType
. Menentukan enum tidak diperlukan.
InfoType tambahan dalam de-identifikasi gambar
Anda dapat menggunakan jenis informasi (infoTypes) untuk menentukan data yang akan dipindai saat melakukan de-identifikasi pada tag. infoType adalah jenis data sensitif, seperti nama pasien, alamat email, nomor telepon, nomor identifikasi, atau nomor kartu kredit.
Anda dapat mengonfigurasi kolom berikut dalam objek DicomTagConfig.Options.ImageConfig
untuk menentukan infoTypes yang akan digunakan selama de-identifikasi gambar DICOM:
Kolom ini hanya berlaku jika DicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
disetel ke salah satu nilai berikut:
Migrasikan permintaan dan respons untuk menggunakan DicomTagConfig
Anda dapat mengonfigurasi de-identifikasi DICOM menggunakan DicomTagConfig
, yang tersedia di Cloud Healthcare API v1beta1 dan merupakan alternatif penggunaan
DicomConfig
lama.
Saat mengirim permintaan, Anda tidak dapat menyertakan DicomConfig
dan DicomTagConfig
sekaligus.
Bagian berikut menjelaskan konfigurasi di DicomConfig
dan cara memigrasikannya ke DicomTagConfig
.
TagFilterProfile
ke ProfileType
Ganti objek TagFilterProfile
DicomConfig
dengan objek DicomTagConfig
ProfileType
. Empat profil yang sama di TagFilterProfileType
tersedia di
ProfileType
.
Contoh berikut menunjukkan cara memigrasikan permintaan dari menggunakan TagFilterProfile
ke menggunakan ProfileType
:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
keepList
dan removeList
Kolom DicomConfig
keepList
dan removeList
tidak lagi tersedia di DicomTagConfig
. Jika menggunakan keepList
dan removeList
untuk menentukan tag yang akan disimpan atau dihapus, bukan menggunakan profil,
Anda harus bermigrasi ke objek Action
baru tempat Anda menentukan perilaku tag. Objek Action
menyediakan opsi tambahan untuk mengubah tag.
Contoh berikut menunjukkan cara memigrasikan permintaan dari menggunakan
keepList
ke Action.keepTag
. Permintaan tersebut menentukan bahwa nilai tag PatientID
disimpan selama operasi de-identifikasi.
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
Menggabungkan daftar keeplist, removelist, dan profil
Pada objek DicomConfig
, Anda dapat menentukan apakah akan menyimpan atau menghapus data
berdasarkan keeplist, removelist, dan profil. Opsi ini sama-sama bersifat eksklusif.
Saat menggunakan objek DicomTagConfig
, Anda dapat menggabungkan opsi ini dengan menentukan
tag yang akan dipertahankan dan dihapus dalam objek Action
sekaligus menentukan profil di ProfileType
.
Opsi yang dikonfigurasi dalam objek Action
akan menggantikan opsi yang dikonfigurasi dalam
profil ProfileType
. Opsi dalam objek Action
berlaku sesuai urutan
penyewaannya dalam permintaan.
skipIdRedaction
ke Objects.primaryIds
Ganti kolom skipIdRedaction
di objek DicomConfig
dengan kolom primaryIds
di objek DicomTagConfig
. Kolom primaryIds
yang
ada di objek Options
,
berisi objek PrimaryIdsOption
tempat Anda menentukan salah satu enum berikut:
PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
: Perilaku default jika tidak ada nilai yang diberikan kePrimaryIdsOption
. Setelan default-nya adalah opsi yang ditentukan diProfileType
.KEEP
: Membiarkan ID utama tidak berubah.REGEN
: Membuat ulang ID utama.
Contoh berikut menunjukkan cara memigrasikan permintaan dari menggunakan
skipIdRedaction
ke Options.primaryIds
. Permintaan tersebut menentukan bahwa
nilai ID utama disimpan selama operasi de-identifikasi:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
DeidentifyConfig.ImageConfig
ke DicomTagConfig.Options.ImageConfig
Ganti objek DeidentifyConfig.ImageConfig
dengan objek
DicomTagConfig.Options.ImageConfig
.
Opsi dalam objek ImageConfig
sama di kedua versi.
Contoh berikut menunjukkan cara memigrasikan permintaan dari menggunakan ImageConfig
di DeidentifyConfig.image
ke ImageConfig
di DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage
.
Permintaan tersebut menentukan bahwa semua teks dalam gambar akan disamarkan selama
operasi de-identifikasi:
DeidentifyConfig.image | DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage |
---|---|
|
|
Ringkasan de-identifikasi
De-identifikasi tingkat set data
Untuk melakukan de-identifikasi data DICOM pada tingkat set data, panggil
metode
datasets.deidentify
. Metode datasets.deidentify
memiliki komponen berikut:
- Set data sumber: Set data yang berisi DICOM yang disimpan dengan satu atau beberapa instance yang memiliki data sensitif. Saat Anda memanggil metode
datasets.deidentify
, semua instance di semua penyimpanan DICOM dalam set data akan dide-identifikasi. - Set data tujuan: De-identifikasi tidak memengaruhi set data asli atau datanya. Sebagai gantinya, salinan data asli yang telah dide-identifikasi akan ditulis ke set data baru, yang disebut set data tujuan.
- Yang harus dide-identifikasi: Parameter konfigurasi yang menentukan cara memproses
data DICOM dalam set data. Anda dapat mengonfigurasi de-identifikasi DICOM untuk melakukan de-identifikasi metadata instance DICOM (menggunakan kata kunci tag) atau teks sisipan dalam gambar DICOM dengan menentukan parameter ini dalam objek
DeidentifyConfig
.
Sebagian besar contoh dalam panduan ini menunjukkan cara melakukan de-identifikasi data DICOM pada tingkat set data.
De-identifikasi tingkat toko DICOM
Dengan melakukan de-identifikasi data DICOM pada tingkat penyimpanan DICOM, Anda dapat memiliki kontrol lebih atas data yang dide-identifikasi. Misalnya, jika Anda memiliki set data dengan beberapa penyimpanan DICOM, Anda dapat melakukan de-identifikasi setiap penyimpanan DICOM berdasarkan jenis data yang ada di penyimpanan.
Untuk melakukan de-identifikasi data DICOM di penyimpanan DICOM, panggil
metode
dicomStores.deidentify
. Metode dicomStores.deidentify
memiliki komponen berikut:
- Penyimpanan DICOM sumber: Penyimpanan DICOM yang berisi satu atau beberapa
instance yang memiliki data sensitif. Saat Anda memanggil operasi
dicomStores.deidentify
, semua instance di penyimpanan DICOM akan dide-identifikasi. - Penyimpanan DICOM tujuan: De-identifikasi tidak memengaruhi penyimpanan DICOM asli atau datanya. Sebagai gantinya, salinan data asli yang telah dide-identifikasi akan ditulis ke penyimpanan DICOM tujuan. Penyimpanan DICOM tujuan harus sudah ada.
- Yang harus dide-identifikasi: Parameter konfigurasi yang menentukan cara memproses
penyimpanan DICOM. Anda dapat mengonfigurasi de-identifikasi DICOM untuk melakukan de-identifikasi metadata instance DICOM (menggunakan kata kunci tag) atau teks sisipan dalam gambar DICOM dengan menentukan parameter ini dalam objek
DeidentifyConfig
.
Untuk contoh cara melakukan de-identifikasi data DICOM di tingkat penyimpanan DICOM, lihat Melakukan de-identifikasi data di tingkat penyimpanan DICOM.
Filter
Saat melakukan de-identifikasi data DICOM di tingkat penyimpanan DICOM, Anda dapat melakukan de-identifikasi
sebagian data di penyimpanan DICOM dengan mengonfigurasi file
filter dan menentukan file dalam permintaan dicomStores.deidentify
. Sebagai
contoh, lihat
Melakukan de-identifikasi subset penyimpanan DICOM.
Ringkasan contoh
Contoh dalam panduan ini menggunakan instance DICOM tunggal bernama dicom_deid_instance_sample.dcm
, tetapi Anda juga dapat melakukan de-identifikasi beberapa instance. Untuk menggunakan contoh instance DICOM
dalam contoh di halaman ini, download file ke mesin lokal Anda
dan ikuti petunjuk di Menyimpan data DICOM
untuk menyimpannya di penyimpanan DICOM.
Bagian berikut menunjukkan tampilan gambar dalam instance DICOM dan metadata dalam instance.
Gambar contoh
Beberapa contoh di halaman ini berisi output gambar yang telah dide-identifikasi. Setiap contoh menggunakan gambar asli berikut sebagai inputnya. Anda dapat membandingkan gambar output dari setiap operasi de-identifikasi dengan gambar asli ini untuk melihat efek operasi tersebut:
Contoh metadata
Sebagian besar contoh di halaman ini berisi output metadata yang diubah dalam instance DICOM. Setiap contoh menggunakan metadata asli berikut sebagai inputnya. Anda dapat membandingkan metadata output dari setiap operasi de-identifikasi dengan metadata asli ini untuk melihat efek de-identifikasi:
[
{
"00020002": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00020003": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00020010": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.1.2.4.50"
]
},
"00020012": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.0.3.6.1"
]
},
"00020013": {
"vr": "SH",
"Value": [
"OFFIS_DCMTK_361"
]
},
"00080005": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_IR 100"
]
},
"00080016": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00080018": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00080020": {
"vr": "DA",
"Value": [
"20110909"
]
},
"00080030": {
"vr": "TM",
"Value": [
"110032"
]
},
"00080050": {
"vr": "SH"
},
"00080064": {
"vr": "CS",
"Value": [
"WSD"
]
},
"00080070": {
"vr": "LO",
"Value": [
"Manufacturer"
]
},
"00080090": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "John Doe"
}
]
},
"00081090": {
"vr": "LO",
"Value": [
"ABC1"
]
},
"00100010": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "Ann Johnson"
}
]
},
"00100020": {
"vr": "LO",
"Value": [
"S1214223-1"
]
},
"00100030": {
"vr": "DA",
"Value": [
"19880812"
]
},
"00100040": {
"vr": "CS",
"Value": [
"F"
]
},
"0020000D": {
"vr": "UI",
"Value": [
"2.25.70541616638819138568043293671559322355"
]
},
"0020000E": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694"
]
},
"00200010": {
"vr": "SH"
},
"00200011": {
"vr": "IS"
},
"00200013": {
"vr": "IS"
},
"00200020": {
"vr": "CS"
},
"00280002": {
"vr": "US",
"Value": [
3
]
},
"00280004": {
"vr": "CS",
"Value": [
"YBR_FULL_422"
]
},
"00280006": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00280010": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280011": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280100": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280101": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280102": {
"vr": "US",
"Value": [
7
]
},
"00280103": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00282110": {
"vr": "CS",
"Value": [
"01"
]
},
"00282114": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_10918_1"
]
}
}
]
Menyamarkan teks sisipan dari gambar
Anda dapat melakukan de-identifikasi teks sisipan dalam gambar DICOM menggunakan objek
ImageConfig
di dalam objek
Action
. Di dalam ImageConfig
, Anda dapat menentukan infoTypes yang akan disertakan atau dikecualikan, dan cara menyamarkan teks menggunakan objek TextRedactionMode
.
Samarkan semua teks
Contoh berikut menunjukkan cara melakukan de-identifikasi instance DICOM dengan menetapkan
TextRedactionMode
ke REDACT_ALL_TEXT
.
Konfigurasi ini akan menyamarkan semua teks sisipan pada gambar.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Setelah melakukan de-identifikasi gambar menggunakan REDACT_ALL_TEXT
, gambar
akan terlihat seperti ini. Perhatikan bahwa semua teks sisipan di bagian bawah
gambar telah disamarkan.
Menyamarkan teks sensitif dengan Opsi Clean Descriptors
Contoh berikut menunjukkan cara melakukan de-identifikasi instance DICOM dengan menetapkan
TextRedactionMode
ke REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
.
Untuk mengetahui
informasi selengkapnya tentang opsi CleanDescriptorsOption
, lihat
Melakukan de-identifikasi teks dengan de-identifikasi kontekstual.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Setelah melakukan de-identifikasi gambar menggunakan REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, gambar
akan terlihat seperti ini. Perhatikan bahwa tidak semua teks sisipan di bagian bawah
gambar telah disamarkan. Teks Female
tetap ditampilkan karena
PatientSex (0010,0040)
bukan salah satu infoTypes DICOM default.
Melakukan de-identifikasi tag DICOM
Anda dapat melakukan de-identifikasi instance DICOM berdasarkan kata kunci tag dalam metadata DICOM.
Metode pemfilteran tag berikut tersedia di objek
Action
DicomTagConfig
:
Anda menentukan setiap opsi Action
sebagai daftar ID tag, nama, atau
Representasi Nilai (VR) DICOM, lalu opsi tersebut akan melakukan tindakan pada
tag dalam daftar. Anda tidak dapat menentukan lebih dari satu opsi Action
pada daftar tag.
Setiap objek Action
menyediakan daftar queries[]
tempat Anda menentukan daftar tag. Format tag berikut didukung:
- ID tag, seperti
"00100010"
- Nama tag, seperti
"PatientName"
- Pernyataan Nilai (VR), seperti
"PN"
Tidak ada batasan jumlah tag yang dapat diberikan dalam daftar queries[]
.
Namun, setiap tag hanya dapat memiliki satu opsi Action
yang dijalankan pada tag tersebut.
Untuk menentukan berbagai tag yang memiliki opsi Action
berbeda yang dijalankan pada tag tersebut, Anda harus menentukan beberapa objek Action
.
Simpan tag
Anda dapat mencegah nilai tag agar tidak disamarkan dengan menentukan tag dalam objek KeepTag
di objek DicomTagConfig
.
Untuk menghasilkan objek DICOM yang valid saat menggunakan objek KeepTag
, tentukan nilai MINIMAL_KEEP_LIST_PROFILE
atau DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS
di objek ProfileType
.
Dengan menentukan salah satu profil ini, tag berikut akan otomatis disimpan, sehingga memastikan bahwa instance DICOM yang dide-identifikasi adalah DICOM yang valid:
StudyInstanceUID
SeriesInstanceUID
SOPInstanceUID
TransferSyntaxUID
MediaStorageSOPInstanceUID
MediaStorageSOPClassUID
PixelData
Rows
Columns
SamplesPerPixel
BitsAllocated
BitsStored
Highbit
PhotometricInterpretation
PixelRepresentation
NumberOfFrames
PlanarConfiguration
PixelAspectRatio
SmallestImagePixelValue
LargestImagePixelValue
RedPaletteColorLookupTableDescriptor
GreenPaletteColorLookupTableDescriptor
BluePaletteColorLookupTableDescriptor
RedPaletteColorLookupTableData
GreenPaletteColorLookupTableData
BluePaletteColorLookupTableData
ICCProfile
ColorSpace
WindowCenter
WindowWidth
VOILUTFunction
Nilai untuk beberapa tag sebelumnya dibuat ulang, yang berarti nilai tersebut diganti dengan nilai yang berbeda melalui transformasi deterministik. Untuk mengetahui informasi selengkapnya, lihat Mempertahankan Opsi UID dalam standar DICOM.
Nilai StudyInstanceUID
, SeriesInstanceUID
, SOPInstanceUID
,
dan MediaStorageSOPInstanceUID
disebut "ID utama". Untuk menentukan
cara ID utama diubah, tentukan nilai di
PrimaryIdsOption
.
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek KeepTag
untuk mempertahankan nilai tag tertentu selama de-identifikasi.
Tag PatientName
ditambahkan dalam daftar queries[]
, sehingga nilai PatientName
tidak disamarkan selama de-identifikasi.
Karena PrimaryIdsOption
tidak ditentukan dalam contoh, kolom primaryIds
ditetapkan secara default ke PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
, yang secara default disetel ke nilai dalam ProfileType
. Karena ProfileType
juga tidak ditentukan, kolom profileType
ditetapkan secara default ke PROFILE_TYPE_UNSPECIFIED
, yang menghapus tag berdasarkan Profil Dasar Kerahasiaan Atribut (DICOM Standard Edition 2018e).
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Menghapus tag
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek RemoveTag
untuk menghapus nilai tag tertentu selama de-identifikasi. Tag yang dihapus diganti dengan nilai kosong.
Pada contoh berikut, tag PatientName
ditambahkan dalam
daftar queries[]
, sehingga nilainya diganti dengan nilai kosong
selama de-identifikasi.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Menghapus tag
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek DeleteTag
untuk menghapus tag tertentu selama de-identifikasi.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Mereset tag ke nilai placeholder
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek ResetTag
untuk menetapkan
nilai tag ke string PLACEHOLDER
selama de-identifikasi.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Secara khusus, perhatikan bahwa nilai tag
PatientName
ditetapkan kePLACEHOLDER
:Original metadata
Metadata setelah menjalankan ResetTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "PLACEHOLDER" } ] }
Memeriksa dan mengubah teks sensitif dalam tag
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek CleanTextTag
untuk memeriksa tag dan mengubah nilai tag sesuai dengan konfigurasi dalam objek TextConfig
.
Dalam contoh ini, opsi berikut ditetapkan dalam objek Actions
:
- Objek
CleanTextTag
. - Daftar
queries[]
yang berisi tag DICOMPatientName
.
Opsi berikut ditetapkan dalam objek TextConfig
:
- Objek
InfoTypeTransformation
yang mengubah teks yang cocok dengan infoType tertentu. - Objek
ReplaceWithInfoTypeConfig
yang menggantikan teks yang cocok dengan nama infoType. - Daftar
infoTypes[]
yang berisi infoTypePERSON_NAME
.
Setelah konfigurasi ini ditetapkan, operasi de-identifikasi akan memeriksa tag PatientName
, mencocokkan tag dengan infoType PERSON_NAME
, dan mengganti nilai tag dengan infoType PERSON_NAME
.
Tag PatientName
memiliki Representasi Nilai (VR) dari PN
, yang merupakan salah satu
VR yang didukung dalam objek
CleanTextTag
.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Secara khusus, perhatikan bahwa nilai tag
PatientName
ditetapkan ke[PERSON_NAME]
:Original metadata
Metadata setelah menjalankan CleanTextTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "[PERSON_NAME]" } ] }
Mengganti UID dengan UID yang dihasilkan
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek RegenUidTag
untuk mengganti
UID dengan UID yang baru dihasilkan. Satu-satunya VR yang didukung objek RegenUidTag
adalah UI
.
Secara default, setiap tag dalam metadata contoh dengan VR
UI
memiliki UID yang dihasilkan selama de-identifikasi. Untuk menunjukkan cara membuat UID untuk tag tertentu, opsi berikut ditetapkan dalam contoh:
ProfileType
disetel ke enumKEEP_ALL
, yang mencegah de-identifikasi metadata DICOM.PrimaryIdsOption
disetel ke enumKEEP
, yang membiarkan ID utama (StudyInstanceUID
,SeriesInstanceUID
,SOPInstanceUID
, danMediaStorageSOPInstanceUID
) tidak berubah.
Jika opsi ini ditetapkan, tidak ada UID ID utama dalam data sampel yang diganti
dengan nilai yang baru dihasilkan. Namun, dengan menambahkan SOPInstanceUID
ke array Action.queries[]
, Anda dapat membuat UID baru khusus untuk tag SOPInstanceUID
.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID instance baru karena Anda menentukan tag
SOPInstanceUID
dalam arrayAction.queries[]
, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang telah dide-identifikasi.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan perubahan UID instance:
Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Perhatikan bahwa, dari ID utama, hanya
SOPInstanceUID
yang memiliki UID yang baru dihasilkan.
Melakukan de-identifikasi tag secara rekursif di Sequence
bertingkat
Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan objek RecurseTag
untuk melakukan de-identifikasi
tag DICOM bertingkat secara rekursif di Sequence
.
Objek RecurseTag
hanya mendukung VR SQ
, yang merupakan VR untuk
Sequence
.
Untuk informasi tentang VR SQ
, lihat 7.5 Penyusunan Set Data.
Instance contoh DICOM
yang disediakan untuk halaman ini tidak berisi tag DICOM yang memiliki VR SQ
.
Anda dapat membuat dan menyimpan instance DICOM dengan data palsu yang berisi VR SQ
dengan menyelesaikan langkah-langkah berikut, yang didasarkan pada petunjuk di
Membuat instance DICOM dari metadata JSON dan file JPEG.
Instance DICOM yang Anda buat pada langkah-langkah berikut menggunakan data palsu,
dan hanya dimaksudkan untuk menggambarkan perilaku RecurseTag
.
Simpan metadata DICOM berikut ke file JSON yang bernama
instance.json
. Metadata berisi tagPhysiciansReadingStudyIdentificationSequence
(00081062
). Tag memiliki VRSQ
, dan berisi dua tagPersonIdentificationCodeSequence
(00401101
) bertingkat. Tag bertingkat juga memiliki VRSQ
, dan masing-masing berisi tag bertingkat berikut:CodeValue
(00080100
)CodingSchemeDesignator
(00080102
)
[{ "00020010": { "vr": "UI", "Value": [ "1.2.840.10008.1.2.4.50" ] }, "00080005": { "vr": "CS", "Value": [ "ISO_IR 192" ] }, "00080016": { "vr": "UI", "Value": [ "1111111" ] }, "00080018": { "vr": "UI", "Value": [ "2222222" ] }, "0020000D": { "vr": "UI", "Value": [ "3333333" ] }, "0020000E": { "vr": "UI", "Value": [ "4444444" ] }, "00280002": { "vr": "US", "Value": [ 3 ] }, "00280004": { "vr": "CS", "Value": [ "YBR_FULL_422" ] }, "00280006": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "00280008": { "vr": "IS", "Value": [ 1 ] }, "00280010": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280011": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280100": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280101": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280102": { "vr": "US", "Value": [ 7 ] }, "00280103": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "7FE00010": { "vr": "OB", "BulkDataURI": "jpeg-image" }, "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue2" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator2" ] } } ] } } ] } }]
Download file
google.jpg
ke komputer lokal Anda. Cloud Healthcare API DICOMweb API menerima gambar JPEG apa pun yang disambungkan dengan metadata JSON selama metadata tersebut valid.Jalankan perintah berikut untuk membuat batas pembuka (untuk metadata JSON), gambar tengah (untuk JPEG), dan batas penutup dalam gambar:
echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file
Gabungkan gambar
google.jpg
dalam batas tengah dan penutup. File output, yang Anda kirim ke Cloud Healthcare API, disebutmultipart-request.file
:cat opening.file instance.json middle.file google.jpg closing.file > multipart-request.file
Simpan file
multipart-request.file
:REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di dalam set data sumber
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
--data-binary @multipart-request.file \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-InFile multipart-request.file `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Selesaikan langkah-langkah berikut untuk melakukan de-identifikasi instance DICOM yang Anda simpan.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
Meminta isi JSON:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:
Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)3333333
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314
UID serial ( 0020000E
)4444444
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347
UID instance ( 00080018
)2222222
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Secara khusus, perhatikan bahwa nilai tag
CodeValue
danCodingSchemaDesignator
bertingkat ditetapkan kePLACEHOLDER
:Original metadata
Metadata setelah menjalankan RecurseTag
{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [
"CodeValue2"
] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": ["CodingSchemeDesignator2"
] } } ] } } ] } }{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } } ] } }
Melakukan de-identifikasi data pada tingkat penyimpanan DICOM
Contoh sebelumnya menunjukkan cara melakukan de-identifikasi data DICOM pada tingkat set data. Bagian ini menjelaskan cara melakukan de-identifikasi data di tingkat penyimpanan DICOM.
Untuk mengubah permintaan de-identifikasi set data menjadi permintaan de-identifikasi penyimpanan DICOM, lakukan perubahan berikut:
- Ganti
destinationDataset
dalam isi permintaan dengandestinationStore
- Tambahkan
dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID
di akhir nilai dalamdestinationStore
saat menentukan tujuan - Menambahkan
dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID
saat menentukan lokasi data sumber
Contoh berikut menunjukkan permintaan de-identifikasi tingkat set data dan cara mengubah permintaan untuk de-identifikasi tingkat toko DICOM:
De-identifikasi tingkat set data:
"destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"
De-identifikasi tingkat toko DICOM:
"destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"
Contoh berikut menunjukkan cara melakukan de-identifikasi instance DICOM di penyimpanan DICOM dan menulis data yang dide-identifikasi ke penyimpanan DICOM baru. Sebelum menjalankan contoh, ID penyimpanan DICOM tujuan harus sudah ada.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi. Harus sudah ada sebelum menjalankan operasi de-identifikasi.
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: penyimpanan DICOM di set data tujuan. Harus sudah ada sebelum menjalankan operasi de-identifikasi.
Meminta isi JSON:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Anda memerlukan nilai ini di langkah berikutnya.Gunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Melakukan de-identifikasi subset penyimpanan DICOM
Anda dapat melakukan de-identifikasi subset data di penyimpanan DICOM dengan menentukan filter.
Filter berbentuk file filter yang Anda tentukan sebagai nilai untuk
kolom resourcePathsGcsUri
di objek
DicomFilterConfig
. File filter harus ada di bucket Cloud Storage; Anda tidak dapat menentukan file filter yang ada di mesin lokal Anda atau sumber lainnya. Lokasi file harus dalam format gs://BUCKET/PATH/TO/FILE
.
Membuat file filter
File filter menentukan file DICOM mana yang akan dide-identifikasi. Anda dapat memfilter file pada tingkat berikut:
- Di tingkat studi
- Di level serial
- Di tingkat instance
File filter terdiri dari satu baris per studi, rangkaian, atau instance yang ingin Anda de-identifikasi. Setiap baris menggunakan format /studies/STUDY_UID[/series/SERIES_UID[/instances/INSTANCE_UID]]
.
Di akhir setiap baris adalah karakter baris baru: \n
atau \r\n
.
Jika studi, rangkaian, atau instance tidak ditentukan dalam file filter yang Anda teruskan saat memanggil operasi de-identifikasi, studi, rangkaian, atau instance tersebut tidak akan dide-identifikasi dan tidak akan ada di penyimpanan DICOM tujuan.
Hanya bagian /studies/STUDY_UID
dari jalur yang
diperlukan. Ini berarti Anda dapat melakukan de-identifikasi studi dengan menentukan
/studies/STUDY_UID
, atau Anda dapat melakukan de-identifikasi
seri dengan menentukan /studies/STUDY_UID/series/SERIES_UID
.
Pertimbangkan file filter berikut. File filter menyebabkan satu studi, dua seri, dan tiga instance individual dide-identifikasi:
/studies/1.123.456.789
/studies/1.666.333.111/series/123.456\n
/studies/1.666.333.111/series/567.890\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/111\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/222\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/333\n
Membuat file filter menggunakan BigQuery
Anda biasanya membuat file filter dengan mengekspor metadata dari penyimpanan DICOM ke BigQuery terlebih dahulu. Hal ini memungkinkan Anda menggunakan BigQuery untuk melihat UID studi, deret, dan instance dari data DICOM di penyimpanan DICOM Anda. Kemudian, Anda dapat melakukan hal berikut:
Buat kueri untuk UID studi, rangkaian, dan instance yang Anda minati. Misalnya, setelah mengekspor metadata ke BigQuery, Anda dapat menjalankan kueri berikut untuk menggabungkan UID studi, rangkaian, dan instance ke format yang kompatibel dengan persyaratan file filter:
SELECT CONCAT ('/studies/', StudyInstanceUID, '/series/', SeriesInstanceUID, '/instances/', SOPInstanceUID) FROM [PROJECT_ID:BIGQUERY_DATASET.BIGQUERY_TABLE]
Jika kueri tersebut menampilkan kumpulan hasil besar, Anda dapat mewujud tabel baru dengan menyimpan hasil kueri ke tabel tujuan di BigQuery.
Setelah menyimpan hasil kueri ke tabel tujuan, Anda dapat menyimpan isi tabel tujuan ke file dan mengekspornya ke Cloud Storage. Untuk langkah-langkah cara melakukannya, lihat Mengekspor data tabel. {i>File<i} yang diekspor adalah {i>file filter<i} Anda. Anda akan menggunakan lokasi file filter di Cloud Storage saat menentukan filter dalam operasi ekspor.
Membuat file filter secara manual
Anda dapat membuat file filter dengan konten kustom dan menguploadnya ke bucket Cloud Storage.
Anda akan menggunakan lokasi file filter di Cloud Storage saat menentukan filter dalam operasi de-identifikasi. Contoh berikut menunjukkan cara mengupload file filter ke bucket Cloud Storage menggunakan perintah gsutil cp
:
gsutil cp PATH/TO/FILTER_FILE gs://BUCKET/DIRECTORY
Contoh:
gsutil cp /home/user/Desktop/filters.txt gs://my-bucket/my-directory
Menggunakan filter
Setelah mengonfigurasi file filter, Anda dapat meneruskannya sebagai nilai ke
kolom resourcePathsGcsUri
di objek filterConfig
.
Contoh berikut menjelaskan Melakukan de-identifikasi data di tingkat penyimpanan DICOM, tetapi file filter di Cloud Storage disediakan untuk menentukan resource DICOM mana yang dide-identifikasi.
REST
Melakukan de-identifikasi set data.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- LOCATION: lokasi set data
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan
- BUCKET/PATH/TO/FILE: lokasi file filter di bucket Cloud Storage
Meminta isi JSON:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentGunakan metode
projects.locations.datasets.operations.get
untuk mendapatkan status operasi yang berjalan lama.Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- SOURCE_DATASET_ID: ID set data yang berisi data yang akan dide-identifikasi
- OPERATION_ID: ID yang ditampilkan dari operasi yang berjalan lama
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
"done": true
, berarti operasi yang berjalan lama telah selesai.Setelah de-identifikasi berhasil, Anda dapat mengambil metadata untuk instance yang dide-identifikasi guna melihat perubahannya. Instance yang dide-identifikasi memiliki UID studi baru, UID seri, dan UID instance, sehingga Anda harus terlebih dahulu menelusuri set data baru untuk instance yang dide-identifikasi.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Tabel berikut menunjukkan bagaimana UID studi, UID seri, dan UID instance berubah:Metadata instance asli Metadata instance yang dide-identifikasi UID Studi ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID serial ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID instance ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Dengan menggunakan nilai baru, ambil metadata untuk instance tersebut.
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID project Google Cloud Anda
- DESTINATION_DATASET_ID: ID set data tujuan tempat penulisan data yang dide-identifikasi
- SOURCE_DATASET_LOCATION: lokasi set data sumber
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: ID penyimpanan DICOM di set data tujuan. ID ini sama dengan ID penyimpanan DICOM dalam set data sumber.
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Buka halaman referensi metode. Panel APIs Explorer akan terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Lengkapi kolom yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Memecahkan masalah operasi de-identifikasi DICOM
Jika terjadi error selama operasi de-identifikasi DICOM, error tersebut akan dicatat ke dalam log ke Cloud Logging. Untuk mengetahui informasi lebih lanjut, baca bagian Melihat log error di Cloud Logging.
Jika seluruh operasi menampilkan error, lihat Memecahkan masalah operasi yang berjalan lama.