Nesta página, explicamos como usar a configuração DicomTagConfig
da v1beta1 na API Cloud Healthcare para desidentificar dados sensíveis
em instâncias DICOM nos seguintes níveis:
- No nível do conjunto de dados usando
datasets.deidentify
. - No nível de armazenamento DICOM usando
dicomStores.deidentify
.
Esta página também explica como aplicar filtros ao desidentificar dados no nível do armazenamento DICOM.
É possível configurar operações de desidentificação DICOM usando o
objeto DicomConfig
legado v1
ou o objeto DicomTagConfig
v1beta1. Recomendamos que você use DicomTagConfig
.
Se você já usa DicomConfig
para suas operações de desidentificação, recomendamos
migrar para o uso de DicomTagConfig
. Para um resumo dos novos recursos, consulte Novas opções de configuração no DicomTagConfig
.
Para instruções sobre como migrar, consulte Migrar solicitações e respostas para usar DicomTagConfig
.
Novas opções de configuração no DicomTagConfig
Desidentificar texto com desidentificação contextual
É possível configurar o objeto DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
para ativar a desidentificação contextual de texto de metadados não estruturados.
Essa opção é baseada na
Opção de descritores limpos.
Quando você especifica DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
, um infoType
extra é usado durante a inspeção, o que pode afetar os custos de faturamento.
O uso da opção DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
transforma
qualquer texto de metadados não estruturados que corresponda às tags removidas e, ao fazer isso, melhora
a qualidade da desidentificação. Por exemplo, suponha que você
esteja desidentificando uma radiografia e que o paciente da radiografia tenha um sobrenome que também
seja um substantivo, como Wall
. Se algum metadado na instância, como o texto em
StudyDescription
, contiver a palavra Wall
, o texto será transformado.
A opção CleanDescriptorsOption
oculta frases contextuais que correspondem a qualquer tag
marcada para remoção no perfil básico DICOM,
desde que as tags correspondam a um dos seguintes códigos de ação:
D
Z
X
U
As frases contextuais correspondentes são substituídas pelo token [CTX]
.
É possível configurar quais tags são excluídas especificando o seguinte:
- Um tipo enumerado no objeto
ProfileType
. Não é necessário especificar um tipo enumerado. - O filtro
CleanTextTag
para tags específicas.
No entanto, as tags usadas no perfil básico DICOM não podem ser alteradas.
Editar texto gravado com desidentificação contextual
É possível especificar o tipo enumerado TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
para ativar a desidentificação contextual de texto gravado em uma imagem.
Essa opção é baseada na
Opção de descritores limpos.
Quando você especifica o tipo enumerado TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, um infoType extra é usado durante a inspeção, o que pode afetar os custos de faturamento.
É possível especificar o tipo enumerado TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
das seguintes maneiras:
Em um objeto
Options.ImageConfig
comDicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
. Quando você especifica essa opção, a tagPixelData (7FE0,0010)
é adicionada automaticamente à lista de tags a serem excluídas.Em um objeto
Action.CleanImageTag
comDicomTagConfig.Action.CleanImageTag.TextRedactionMode
. Ao especificar essa opção, adicione a tagPixelData
manualmente à matrizAction.queries[]
. A tagPixelData
é a única compatível comAction.CleanImageTag
.
A opção TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
oculta
texto gravado que corresponde a qualquer tag
marcada para remoção no perfil básico DICOM,
desde que as tags correspondam a um dos seguintes códigos de ação:
D
Z
X
U
Não há configuração adicional para desidentificação contextual de
texto gravado, exceto ativar ou desativar usando um tipo enumerado no objeto
ProfileType
. Não é necessário especificar um tipo enumerado.
Outros infoTypes na desidentificação de imagens
É possível usar tipos de informações (infoTypes) para especificar quais dados serão verificados ao realizar a desidentificação em tags. Um infoType é um tipo de dados confidenciais, como nome do paciente, endereço de e-mail, número de telefone, número de identificação ou número de cartão de crédito.
É possível configurar os campos a seguir no objeto DicomTagConfig.Options.ImageConfig
para determinar quais infoTypes usar durante a desidentificação da imagem DICOM:
Esses campos só vão entrar em vigor se DicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
for definido como um dos seguintes valores:
Migrar solicitações e respostas para usar DicomTagConfig
É possível configurar a desidentificação DICOM usando DicomTagConfig
, que está disponível na API Cloud Healthcare v1beta1 e é uma alternativa ao uso do
DicomConfig
legado.
Ao enviar uma solicitação, não é possível incluir DicomConfig
e DicomTagConfig
.
As seções a seguir descrevem as configurações no DicomConfig
e como
migrá-las para o DicomTagConfig
.
TagFilterProfile
a ProfileType
Substitua o objeto DicomConfig
TagFilterProfile
pelo objeto DicomTagConfig
ProfileType
. Os mesmos quatro perfis em TagFilterProfileType
estão disponíveis em
ProfileType
.
O exemplo a seguir mostra como migrar uma solicitação de TagFilterProfile
para ProfileType
:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
keepList
e removeList
Os campos DicomConfig
keepList
e removeList
não estão mais disponíveis no DicomTagConfig
. Se você usou keepList
e removeList
para especificar tags a serem mantidas ou removidas em vez de usar um perfil,
é necessário migrar para o novo objeto Action
em que você especifica o comportamento da tag. O objeto Action
oferece outras opções para transformar tags.
O exemplo a seguir mostra como migrar uma solicitação de
keepList
para Action.keepTag
. A solicitação especifica que o valor da tag PatientID
é mantido durante a operação de desidentificação.
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
Combinar listas de desejos, listas de remoção e perfis
No objeto DicomConfig
, é possível determinar se os dados serão mantidos ou removidos
com base em listas de retenção, listas de remoção e perfis. Essas opções são mutuamente exclusivas.
Ao usar o objeto DicomTagConfig
, é possível combinar essas opções especificando
quais tags manter e remover em um objeto Action
e também especificando um perfil em ProfileType
.
As opções configuradas no objeto Action
substituem as configuradas no
perfil ProfileType
. As opções no objeto Action
são aplicadas na ordem
em que são fornecidas na solicitação.
skipIdRedaction
a Objects.primaryIds
Substitua o campo skipIdRedaction
no objeto DicomConfig
pelo campo primaryIds
no objeto DicomTagConfig
. O campo primaryIds
, que
está no objeto Options
, contém um objeto PrimaryIdsOption
em que você especifica um dos seguintes tipos enumerados:
PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
: comportamento padrão quando nenhum valor é fornecido paraPrimaryIdsOption
. O padrão é a opção especificada emProfileType
.KEEP
: deixe os IDs principais como estão.REGEN
: gere novamente os IDs principais.
O exemplo a seguir mostra como migrar uma solicitação de skipIdRedaction
para Options.primaryIds
. A solicitação especifica que
os valores dos IDs principais são mantidos durante a operação de desidentificação:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
DeidentifyConfig.ImageConfig
a DicomTagConfig.Options.ImageConfig
Substitua o objeto DeidentifyConfig.ImageConfig
pelo
objeto DicomTagConfig.Options.ImageConfig
.
As opções no objeto ImageConfig
são as mesmas nas duas versões.
O exemplo a seguir mostra como migrar uma solicitação de um ImageConfig
em DeidentifyConfig.image
para um ImageConfig
em DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage
.
A solicitação especifica que todo o texto em uma imagem precisa ser editado durante
a operação de desidentificação:
DeidentifyConfig.image | DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage |
---|---|
|
|
Visão geral da desidentificação
Desidentificação no nível do conjunto de dados
Para desidentificar dados DICOM no nível do conjunto de dados, chame o
método
datasets.deidentify
. O método datasets.deidentify
tem os seguintes componentes:
- O conjunto de dados de origem: um conjunto de dados que contém DICOM armazena com uma ou mais instâncias que têm dados confidenciais. Quando você chama o método
datasets.deidentify
, todas as instâncias em todos os armazenamentos DICOM no conjunto de dados são desidentificadas. - O conjunto de dados de destino: a desidentificação não afeta o conjunto de dados original nem os dados dele. Em vez disso, as cópias desidentificadas dos dados originais são gravadas em um novo conjunto de dados, chamado de conjunto de dados de destino.
- O que desidentificar: parâmetros de configuração que especificam como processar
os dados DICOM no conjunto de dados. É possível configurar a desidentificação DICOM para desidentificar metadados de instância
DICOM (usando palavras-chave de tag) ou texto gravado em imagens DICOM
especificando esses parâmetros em um objeto
DeidentifyConfig
.
A maioria dos exemplos neste guia mostra como desidentificar dados DICOM no nível do conjunto de dados.
Desidentificação no nível de armazenamento DICOM
A desidentificação de dados DICOM no nível do armazenamento DICOM permite que você tenha mais controle sobre quais dados são desidentificados. Por exemplo, se você tiver um conjunto de dados com vários armazenamentos DICOM, poderá desidentificar cada um deles de acordo com o tipo de dados existente no armazenamento.
Para desidentificar dados DICOM em um armazenamento de mesmo tipo, chame o método dicomStores.deidentify
. O método dicomStores.deidentify
tem os seguintes componentes:
- O armazenamento DICOM de origem: um armazenamento DICOM contendo uma ou mais instâncias que têm dados confidenciais. Quando você chama a operação
dicomStores.deidentify
, todas as instâncias no armazenamento DICOM são desidentificadas. - O armazenamento DICOM de destino: a desidentificação não afeta o armazenamento DICOM original nem os dados dele. Em vez disso, as cópias desidentificadas dos dados originais são gravadas no armazenamento DICOM de destino. O armazenamento DICOM de destino já deve existir.
- O que desidentificar: parâmetros de configuração que especificam como processar
a loja DICOM. É possível configurar a desidentificação DICOM para desidentificar
metadados de instância DICOM (usando palavras-chave de tag) ou texto gravado em imagens DICOM
especificando esses parâmetros em um objeto
DeidentifyConfig
.
Para um exemplo de como desidentificar dados DICOM no nível do armazenamento DICOM, consulte Como desidentificar dados no nível do armazenamento DICOM.
Filtros
Ao desidentificar dados DICOM no nível do armazenamento DICOM, é possível desidentificar
um subconjunto dos dados no armazenamento DICOM configurando um arquivo de filtro
e especificando o arquivo na solicitação dicomStores.deidentify
. Para um
exemplo, consulte
Como desidentificar um subconjunto de um armazenamento DICOM.
Visão geral das amostras
As amostras neste guia usam uma única instância DICOM chamada
dicom_deid_instance_sample.dcm
,
mas também é possível desidentificar várias instâncias. Para usar a instância DICOM de amostra
nos exemplos desta página, faça o download do arquivo para sua máquina local
e siga as instruções em Armazenar dados DICOM
para armazená-lo em um armazenamento DICOM.
As seções a seguir mostram como é a imagem na instância DICOM e os metadados nela.
Imagem de amostra
Algumas amostras nesta página contêm uma saída da imagem desidentificada. Cada amostra usa a seguinte imagem original como entrada. É possível comparar a imagem de saída de cada operação de desidentificação com esta imagem original para conferir os efeitos da operação:
Exemplo de metadados
A maioria dos exemplos nesta página contém uma saída dos metadados alterados na instância DICOM. Cada amostra usa os seguintes metadados originais como entrada. É possível comparar os metadados de saída de cada operação de desidentificação com esses metadados originais para conferir os efeitos da desidentificação:
[
{
"00020002": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00020003": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00020010": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.1.2.4.50"
]
},
"00020012": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.0.3.6.1"
]
},
"00020013": {
"vr": "SH",
"Value": [
"OFFIS_DCMTK_361"
]
},
"00080005": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_IR 100"
]
},
"00080016": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00080018": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00080020": {
"vr": "DA",
"Value": [
"20110909"
]
},
"00080030": {
"vr": "TM",
"Value": [
"110032"
]
},
"00080050": {
"vr": "SH"
},
"00080064": {
"vr": "CS",
"Value": [
"WSD"
]
},
"00080070": {
"vr": "LO",
"Value": [
"Manufacturer"
]
},
"00080090": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "John Doe"
}
]
},
"00081090": {
"vr": "LO",
"Value": [
"ABC1"
]
},
"00100010": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "Ann Johnson"
}
]
},
"00100020": {
"vr": "LO",
"Value": [
"S1214223-1"
]
},
"00100030": {
"vr": "DA",
"Value": [
"19880812"
]
},
"00100040": {
"vr": "CS",
"Value": [
"F"
]
},
"0020000D": {
"vr": "UI",
"Value": [
"2.25.70541616638819138568043293671559322355"
]
},
"0020000E": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694"
]
},
"00200010": {
"vr": "SH"
},
"00200011": {
"vr": "IS"
},
"00200013": {
"vr": "IS"
},
"00200020": {
"vr": "CS"
},
"00280002": {
"vr": "US",
"Value": [
3
]
},
"00280004": {
"vr": "CS",
"Value": [
"YBR_FULL_422"
]
},
"00280006": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00280010": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280011": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280100": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280101": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280102": {
"vr": "US",
"Value": [
7
]
},
"00280103": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00282110": {
"vr": "CS",
"Value": [
"01"
]
},
"00282114": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_10918_1"
]
}
}
]
Editar texto gravado em imagens
É possível desidentificar o texto gravado em imagens DICOM usando o
objeto ImageConfig
dentro de um objeto
Action
. Em ImageConfig
, é possível especificar quais infoTypes incluir ou
excluir e como editar o texto usando o objeto
TextRedactionMode
.
Editar todo o texto
Os exemplos a seguir mostram como desidentificar uma instância DICOM definindo
TextRedactionMode
para REDACT_ALL_TEXT
.
Essa configuração edita todo o texto gravado na imagem.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Depois de desidentificar a imagem usando REDACT_ALL_TEXT
, ela
fica assim. Observe que todo o texto gravado na parte de baixo da
imagem foi editado.
Editar texto confidencial com a opção "Descritores limpos"
Os exemplos a seguir mostram como desidentificar uma instância DICOM definindo
TextRedactionMode
para REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
.
Para mais
informações sobre a opção CleanDescriptorsOption
, consulte
Como desidentificar texto com desidentificação contextual.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Depois de desidentificar a imagem usando REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, ela
fica assim. Observe que nem todo o texto gravado na parte de baixo da
imagem foi editado. O texto Female
ainda é mostrado porque
PatientSex (0010,0040)
não é um dos infoTypes DICOM padrão.
Desidentificar tags DICOM
É possível desidentificar instâncias DICOM com base em palavras-chave de tag nos metadados DICOM.
Os seguintes métodos de filtragem de tags estão disponíveis no objeto
DicomTagConfig
Action
:
Você especifica cada opção Action
como uma lista de IDs, nomes ou
representações de valor (RVs) de tags DICOM. Em seguida, a opção realiza uma ação nas
tags da lista. Não é possível especificar mais de uma opção Action
em uma lista de tags.
Cada objeto Action
fornece uma lista queries[]
em que você especifica uma lista
de tags. Os seguintes formatos de tag são compatíveis:
- IDs de tag, como
"00100010"
- Nomes de tags, como
"PatientName"
- Representações de valor (VRs, na sigla em inglês), como
"PN"
Não há limite para o número de tags que podem ser fornecidas na lista queries[]
.
No entanto, cada tag só pode ter uma única opção Action
.
Para especificar tags diferentes com opções Action
diferentes,
especifique vários objetos Action
.
Manter tags
É possível impedir que os valores das tags sejam editados especificando as
tags em um objeto KeepTag
no objeto
DicomTagConfig
.
Para produzir um objeto DICOM válido ao usar um objeto KeepTag
, especifique os valores MINIMAL_KEEP_LIST_PROFILE
ou DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS
no objeto ProfileType
.
Ao especificar um desses perfis, as seguintes tags são mantidas automaticamente, garantindo que a instância de DICOM desidentificada seja válida:
StudyInstanceUID
SeriesInstanceUID
SOPInstanceUID
TransferSyntaxUID
MediaStorageSOPInstanceUID
MediaStorageSOPClassUID
PixelData
Rows
Columns
SamplesPerPixel
BitsAllocated
BitsStored
Highbit
PhotometricInterpretation
PixelRepresentation
NumberOfFrames
PlanarConfiguration
PixelAspectRatio
SmallestImagePixelValue
LargestImagePixelValue
RedPaletteColorLookupTableDescriptor
GreenPaletteColorLookupTableDescriptor
BluePaletteColorLookupTableDescriptor
RedPaletteColorLookupTableData
GreenPaletteColorLookupTableData
BluePaletteColorLookupTableData
ICCProfile
ColorSpace
WindowCenter
WindowWidth
VOILUTFunction
Os valores de algumas das tags anteriores são gerados novamente, o que significa que eles são substituídos por um valor diferente por meio de uma transformação determinística. Para mais informações, consulte Opção de retenção de UIDs no padrão DICOM.
Os valores de StudyInstanceUID
, SeriesInstanceUID
, SOPInstanceUID
e MediaStorageSOPInstanceUID
são chamados de "IDs primários". Para determinar
como os IDs principais são transformados, especifique um valor em
PrimaryIdsOption
.
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto KeepTag
para manter os valores de
tags específicas inalterados durante a desidentificação.
A tag PatientName
é adicionada à lista queries[]
. Assim, o valor PatientName
não é ocultado durante a desidentificação.
Como PrimaryIdsOption
não foi especificado no exemplo,
o campo primaryIds
é definido como PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
, que é o valor padrão
em ProfileType
. Como ProfileType
também não foi especificado,
o campo profileType
é definido como PROFILE_TYPE_UNSPECIFIED
, o que remove
tags com base no Perfil básico de confidencialidade do atributo (DICOM Standard Edition 2018e).
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Remover tags
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto RemoveTag
para remover
os valores de tags específicas durante a desidentificação. Uma tag removida é
substituída por um valor vazio.
Nos exemplos a seguir, a tag PatientName
é adicionada à
lista queries[]
. Portanto, o valor dela é substituído por um valor
vazio durante a desidentificação.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Excluir tags
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto DeleteTag
para excluir
tags específicas durante a desidentificação.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Redefinir tags para um valor de marcador de posição
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto ResetTag
para definir
o valor das tags para a string PLACEHOLDER
durante a desidentificação.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Em particular, observe que o valor da tag
PatientName
está definido comoPLACEHOLDER
:Original metadata
Metadados após a execução de ResetTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "PLACEHOLDER" } ] }
Inspecionar e transformar texto sensível em tags
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto CleanTextTag
para inspecionar tags
e transformar os valores delas de acordo com a configuração no
objeto
TextConfig
.
Nesses exemplos, as seguintes opções são definidas no objeto Actions
:
- Um objeto
CleanTextTag
. - Uma lista
queries[]
que contém a tag DICOMPatientName
.
As seguintes opções são definidas no objeto TextConfig
:
- Um objeto
InfoTypeTransformation
que transforma o texto que corresponde a um infoType específico. - Um objeto
ReplaceWithInfoTypeConfig
que substitui qualquer texto correspondente pelo nome do infoType. - Uma lista
infoTypes[]
que contém o infoTypePERSON_NAME
.
Com essas configurações definidas, a operação de desidentificação inspeciona a tag PatientName
, a associa ao infoType PERSON_NAME
e substitui o valor da tag pelo infoType PERSON_NAME
.
A tag PatientName
tem uma representação de valor (RV, na sigla em inglês) de PN
, que é uma das
RVs aceitas no objeto
CleanTextTag
.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Em particular, observe que o valor da tag
PatientName
está definido como[PERSON_NAME]
:Original metadata
Metadados após a execução de CleanTextTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "[PERSON_NAME]" } ] }
Substituir um UID por um UID gerado
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto RegenUidTag
para substituir um
UID por um recém-gerado. A única VR com suporte do objeto RegenUidTag
é UI
.
Por padrão, todas as tags nos metadados da amostra com um VR
de UI
têm o UID gerado durante a desidentificação. Para mostrar como gerar
um UID para uma tag específica, as seguintes opções são definidas
no exemplo:
ProfileType
é definido como o tipo enumeradoKEEP_ALL
, que impede a desidentificação de metadados DICOM.PrimaryIdsOption
é definido como o tipo enumeradoKEEP
, que deixa os IDs principais (StudyInstanceUID
,SeriesInstanceUID
,SOPInstanceUID
eMediaStorageSOPInstanceUID
) inalterados.
Quando essas opções são definidas, nenhum dos UIDs de ID principal nos dados de amostra é substituído
por valores recém-gerados. No entanto, ao adicionar SOPInstanceUID
à matriz
Action.queries[]
, é possível gerar um novo UID especificamente para a tag SOPInstanceUID
.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de instâncias porque você especificou a tag
SOPInstanceUID
no arrayAction.queries[]
. Portanto, primeiro é necessário procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como o UID das instâncias mudou:
Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando o novo valor, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Observe que, dos IDs principais, apenas o
SOPInstanceUID
tem um UID recém-gerado.
Desidentificar tags recursivamente em um Sequence
aninhado
Os exemplos a seguir mostram como usar o objeto RecurseTag
para desidentificar recursivamente
tags DICOM aninhadas em um Sequence
.
O objeto RecurseTag
só oferece suporte ao RV SQ
, que é o RV de
um Sequence
.
Para informações sobre o VR SQ
, consulte 7.5 Anilhamento de conjuntos de dados.
A instância de exemplo DICOM
fornecida para esta página não contém tags DICOM com uma RV SQ
.
É possível criar e armazenar uma instância DICOM com dados falsos que contenha a RV SQ
seguindo as etapas abaixo, que são baseadas nas instruções em
Criar instâncias DICOM a partir de metadados JSON e arquivos JPEG.
A instância DICOM criada nas etapas a seguir usa dados falsos
e tem como objetivo ilustrar o comportamento deRecurseTag
.
Salve os seguintes metadados DICOM em um arquivo JSON chamado
instance.json
. Os metadados contêm uma tagPhysiciansReadingStudyIdentificationSequence
(00081062
). A tag tem uma RVSQ
e contém duas tagsPersonIdentificationCodeSequence
(00401101
) aninhadas. As tags aninhadas também têm um VRSQ
, e cada uma contém as seguintes tags aninhadas:CodeValue
(00080100
)CodingSchemeDesignator
(00080102
)
[{ "00020010": { "vr": "UI", "Value": [ "1.2.840.10008.1.2.4.50" ] }, "00080005": { "vr": "CS", "Value": [ "ISO_IR 192" ] }, "00080016": { "vr": "UI", "Value": [ "1111111" ] }, "00080018": { "vr": "UI", "Value": [ "2222222" ] }, "0020000D": { "vr": "UI", "Value": [ "3333333" ] }, "0020000E": { "vr": "UI", "Value": [ "4444444" ] }, "00280002": { "vr": "US", "Value": [ 3 ] }, "00280004": { "vr": "CS", "Value": [ "YBR_FULL_422" ] }, "00280006": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "00280008": { "vr": "IS", "Value": [ 1 ] }, "00280010": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280011": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280100": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280101": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280102": { "vr": "US", "Value": [ 7 ] }, "00280103": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "7FE00010": { "vr": "OB", "BulkDataURI": "jpeg-image" }, "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue2" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator2" ] } } ] } } ] } }]
Faça o download do arquivo
google.jpg
na sua máquina local. A API DICOMweb da API Cloud Healthcare aceita qualquer imagem JPEG associada a metadados JSON, desde que eles sejam válidos.Execute os comandos a seguir para criar uma imagem de abertura (para os metadados JSON), meio (para o JPEG) e fechamento na imagem:
echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file
Una a imagem
google.jpg
dentro dos limites intermediários e de fechamento. O arquivo de saída, que é enviado para a API Cloud Healthcare, é chamado demultipart-request.file
:cat opening.file instance.json middle.file google.jpg closing.file > multipart-request.file
Armazene o arquivo
multipart-request.file
:REST
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
--data-binary @multipart-request.file \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-InFile multipart-request.file `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
Siga as etapas abaixo para desidentificar a instância DICOM armazenada.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:
Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)3333333
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314
UID da série ( 0020000E
)4444444
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347
UID das instâncias ( 00080018
)2222222
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Em particular, observe que os valores das tags
CodeValue
eCodingSchemaDesignator
aninhadas são definidos comoPLACEHOLDER
:Original metadata
Metadados após a execução de RecurseTag
{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [
"CodeValue2"
] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": ["CodingSchemeDesignator2"
] } } ] } } ] } }{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } } ] } }
Desidentificar dados no nível do armazenamento DICOM
Nas amostras anteriores você viu como desidentificar dados DICOM no nível do conjunto de dados. Nesta seção, descrevemos como desidentificar dados no nível do armazenamento de DICOM.
Para alterar uma solicitação de desidentificação do conjunto de dados para uma solicitação de desidentificação do armazenamento DICOM, faça as seguintes alterações:
- Substitua o
destinationDataset
no corpo da solicitação pordestinationStore
. - Adicione
dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID
ao final do valor emdestinationStore
ao especificar o destino. - Adicione
dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID
ao especificar o local dos dados de origem.
Os exemplos a seguir mostram uma solicitação de desidentificação no nível do conjunto de dados e como modificar a solicitação para uma desidentificação no nível do armazenamento DICOM:
Desidentificação no nível do conjunto de dados:
"destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"
Desidentificação no nível de armazenamento DICOM:
"destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"
Os exemplos a seguir mostram como desidentificar uma instância DICOM em um armazenamento DICOM e gravar os dados desidentificados em um novo armazenamento DICOM. Antes de executar os exemplos, o ID do armazenamento DICOM de destino já precisa existir.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados. Precisa já existir antes da execução da operação de desidentificação.
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Precisa já existir antes da execução da operação de desidentificação.
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Você vai precisar desse valor na próxima etapa.Use o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Desidentificar um subconjunto de um armazenamento DICOM
É possível desidentificar um subconjunto de dados em um armazenamento DICOM especificando um filtro.
O filtro assume a forma de um arquivo de filtro especificado como um valor para o campo resourcePathsGcsUri
no objeto DicomFilterConfig
. O arquivo de filtro precisa existir em um bucket do Cloud Storage. não é possível especificar um arquivo de filtro existente na sua máquina local ou em qualquer outra fonte. O local do arquivo precisa estar no formato gs://BUCKET/PATH/TO/FILE
.
Criar um arquivo de filtro
Um arquivo de filtro define quais arquivos DICOM devem ser desidentificados. É possível filtrar arquivos nos seguintes níveis:
- No nível do estudo
- No nível da série
- No nível da instância
O arquivo de filtro é composto de uma linha por estudo, série ou instância que você quer desidentificar. Cada linha usa o formato /studies/STUDY_UID[/series/SERIES_UID[/instances/INSTANCE_UID]]
.
No final de cada linha há um caractere de nova linha: \n
ou \r\n
.
Se um estudo, série ou instância não for especificado no arquivo de filtro que você transmitiu ao chamar a operação de desidentificação, esse estudo, série ou instância não será desidentificado e não estará presente no armazenamento DICOM de destino.
Apenas a parte /studies/STUDY_UID
do caminho é obrigatória. Isso significa que é possível desidentificar um estudo especificando /studies/STUDY_UID
ou desidentificar uma série especificando /studies/STUDY_UID/series/SERIES_UID
.
Considere o arquivo de filtro a seguir. O arquivo de filtro faz com que um estudo, duas séries e três instâncias individuais sejam desidentificadas:
/studies/1.123.456.789
/studies/1.666.333.111/series/123.456\n
/studies/1.666.333.111/series/567.890\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/111\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/222\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/333\n
Criar um arquivo de filtro usando o BigQuery
Normalmente, você cria um arquivo de filtro exportando os metadados de um armazenamento DICOM para o BigQuery. Isso permite que você use o BigQuery para ver os UIDs de estudo, série e instância dos dados DICOM no seu armazenamento DICOM. Em seguida, veja o que você poderá fazer:
Consultar os UIDs de estudo, série e instância que você tem interesse. Por exemplo, depois de exportar os metadados para o BigQuery, execute a consulta a seguir para concatenar os UIDs de estudo, série e instância para um formato compatível com os requisitos do arquivo de filtro:
SELECT CONCAT ('/studies/', StudyInstanceUID, '/series/', SeriesInstanceUID, '/instances/', SOPInstanceUID) FROM [PROJECT_ID:BIGQUERY_DATASET.BIGQUERY_TABLE]
Se a consulta retornar um grande conjunto de resultados, é possível materializar uma nova tabela salvando os resultados da consulta em uma tabela de destino no BigQuery.
Depois de salvar os resultados da consulta na tabela de destino, salve o conteúdo da tabela de destino em um arquivo e exporte-o para o Cloud Storage. Para ver as etapas de como fazer isso, consulte Como exportar dados da tabela. O arquivo exportado é seu arquivo de filtro. Você usará o local do arquivo de filtro no Cloud Storage ao especificar o filtro na operação de exportação.
Criar um arquivo de filtro manualmente
É possível criar um arquivo de filtro com conteúdo personalizado e fazer o upload dele para um bucket do Cloud Storage.
Você usará o local do arquivo de filtro no Cloud Storage ao especificar o filtro na operação de desidentificação. Na amostra a seguir, você verá como fazer upload de um arquivo de filtro para um bucket do Cloud Storage usando o comando gcloud storage cp
:
gcloud storage cp PATH/TO/FILTER_FILE gs://BUCKET/DIRECTORY
Exemplo:
gcloud storage cp /home/user/Desktop/filters.txt gs://my-bucket/my-directory
Usar um filtro
Depois de configurar o arquivo de filtro, e possível transmiti-lo como um valor para o campo resourcePathsGcsUri
no objeto filterConfig
.
O exemplo a seguir se expande em Como desidentificar dados no nível de armazenamento DICOM, mas um arquivo de filtro no Cloud Storage é fornecido para determinar quais recursos DICOM são desidentificados.
REST
Desidentifique o conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- LOCATION: o local do conjunto de dados;
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM que contém os dados a serem desidentificados
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino
- BUCKET/PATH/TO/FILE: o local do arquivo de filtro em um bucket do Cloud Storage
Corpo JSON da solicitação:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } }
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } EOF
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Salve o corpo da solicitação em um arquivo chamado
request.json
. Execute o comando a seguir no terminal para criar ou substituir esse arquivo no diretório atual:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Depois execute o comando a seguir para enviar a solicitação REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentUse o método
projects.locations.datasets.operations.get
para conferir o status da operação de longa duração.Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- SOURCE_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados que contém os dados a serem desidentificados
- OPERATION_ID: o ID retornado da operação de longa duração.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
"done": true
, a operação de longa duração foi concluída.Depois que a desidentificação for bem-sucedida, você poderá recuperar os metadados da instância desidentificada para ver como ela foi alterada. A instância desidentificada tem um novo UID de estudos, de série e de instâncias. Portanto, primeiro você precisa procurar a instância desidentificada no novo conjunto de dados.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentVocê receberá uma resposta JSON semelhante a esta:
A tabela a seguir mostra como os UIDs de estudos, de série e de instâncias foram alterados:Metadados da instância original Metadados de instância desidentificados UID de estudos ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID da série ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID das instâncias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Usando os novos valores, extraia os metadados da instância.
Antes de usar os dados da solicitação abaixo, faça as substituições a seguir:
- PROJECT_ID: o ID do seu projeto do Google Cloud;
- DESTINATION_DATASET_ID: o ID do conjunto de dados de destino em que os dados desidentificados são gravados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: o local do conjunto de dados de origem
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: o ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de destino. Ele é igual ao ID do armazenamento DICOM no conjunto de dados de origem.
Para enviar a solicitação, escolha uma destas opções:
curl
execute o seguinte comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Execute o seguinte comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Abra a página de referência do método. O painel "APIs Explorer" é aberto no lado direito da página. Interaja com essa ferramenta para enviar solicitações. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.
Resolver problemas de operações de desidentificação para DICOM
Se ocorrerem erros durante uma operação de desidentificação DICOM, eles serão registrados no Cloud Logging. Para mais informações, consulte Como visualizar registros de erros no Cloud Logging.
Se toda a operação retornar um erro, consulte Solução de problemas de operações de longa duração.