En esta página, se explica cómo usar la configuración de DicomTagConfig
v1beta1 en la API de Cloud Healthcare para desidentificar datos sensibles en instancias de DICOM en los siguientes niveles:
- A nivel del conjunto de datos mediante
datasets.deidentify
- En el nivel del almacén DICOM con
dicomStores.deidentify
En esta página, también se explica cómo aplicar filtros cuando se desidentifican datos en el nivel del almacén DICOM.
Puedes configurar operaciones de desidentificación de DICOM con el objeto DicomConfig
de la versión heredada v1 o el objeto DicomTagConfig
de la versión v1beta1. Te recomendamos que uses DicomTagConfig
.
Si ya usas DicomConfig
para tus operaciones de anonimización, te recomendamos que realices la migración a DicomTagConfig
. Para obtener un resumen de las funciones nuevas, consulta Nuevas opciones de configuración en DicomTagConfig
.
Para obtener instrucciones sobre cómo migrar, consulta Cómo migrar solicitudes y respuestas para usar DicomTagConfig
.
Nuevas opciones de configuración en DicomTagConfig
Desidentifica texto con la desidentificación contextual
Puedes configurar el objeto DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
para habilitar la desidentificación contextual del texto de metadatos no estructurados.
Esta opción se basa en la opción de descriptores limpios.
Cuando especificas DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
, se usa un Infotipo adicional durante la inspección, lo que puede afectar los costos de facturación.
El uso de la opción DicomTagConfig.Options.CleanDescriptorsOption
transforma cualquier texto de metadatos no estructurado que coincida con las etiquetas quitadas y, de esta manera, mejora la calidad de la desidentificación. Por ejemplo, supongamos que desidentificas una radiografía y el paciente de la radiografía tiene un apellido que también es un sustantivo, como Wall
. Si algún metadato de la instancia, como el texto en StudyDescription
, contiene la palabra Wall
, el texto se transformará.
La opción CleanDescriptorsOption
oculta las frases contextuales que coinciden con cualquier etiqueta marcada para su eliminación en el perfil base de DICOM, siempre que las etiquetas coincidan con uno de los siguientes códigos de acción:
D
Z
X
U
Las frases contextuales que coinciden se reemplazan por el token [CTX]
.
Para configurar qué etiquetas se ocultan, especifica lo siguiente:
- Una enumeración en el objeto
ProfileType
. No es necesario especificar una enumeración. - El filtro
CleanTextTag
se aplica a etiquetas específicas.
Sin embargo, no se pueden cambiar las etiquetas que se usan en el perfil base de DICOM.
Oculta el texto quemado con la desidentificación contextual
Puedes especificar la enumeración TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
para habilitar la desidentificación contextual del texto grabado en una imagen.
Esta opción se basa en la opción de descriptores limpios.
Cuando especificas la enumeración TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, se usa un Infotipo adicional durante la inspección, lo que puede afectar los costos de facturación.
Puedes especificar la enumeración TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
de las siguientes maneras:
En un objeto
Options.ImageConfig
conDicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
. Cuando especificas esta opción, la etiquetaPixelData (7FE0,0010)
se agrega automáticamente a la lista de etiquetas que se ocultarán.En un objeto
Action.CleanImageTag
conDicomTagConfig.Action.CleanImageTag.TextRedactionMode
. Cuando especifiques esta opción, debes agregar la etiquetaPixelData
manualmente al arrayAction.queries[]
. La etiquetaPixelData
es la única etiqueta admitida cuando se usaAction.CleanImageTag
.
La opción TextRedactionMode.REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
oculta el texto quemado que coincide con cualquier etiqueta marcada para quitarse en el perfil básico de DICOM, siempre y cuando las etiquetas coincidan con uno de los siguientes códigos de acción:
D
Z
X
U
No hay ninguna configuración adicional para la desidentificación contextual del texto grabado, a excepción de habilitarlo o inhabilitarlo con una enumeración en el objeto ProfileType
. No es necesario especificar una enumeración.
Infotipos adicionales en la desidentificación de imágenes
Puedes usar tipos de información (infotipos) para especificar qué datos analizar cuando se realiza la desidentificación en las etiquetas. Un Infotipo es un tipo de datos sensibles, como el nombre de un paciente, dirección de correo electrónico, número de teléfono, número de identificación o número de tarjeta de crédito.
Puedes configurar los siguientes campos en el objeto DicomTagConfig.Options.ImageConfig
para determinar qué infotipos usar durante la desidentificación de imágenes DICOM:
Estos campos solo se aplican si DicomTagConfig.Options.ImageConfig.TextRedactionMode
se establece en uno de los siguientes valores:
Migra solicitudes y respuestas para usar DicomTagConfig
Puedes configurar la desidentificación de DICOM con DicomTagConfig
, que está disponible en la v1beta1 de la API de Cloud Healthcare y es una alternativa al uso de DicomConfig
heredado.
Cuando envíes una solicitud, no puedes incluir DicomConfig
y DicomTagConfig
.
En las siguientes secciones, se describen las configuraciones en DicomConfig
y cómo migarlas a DicomTagConfig
.
De TagFilterProfile
a ProfileType
Reemplaza el objeto DicomConfig
TagFilterProfile
por el objeto DicomTagConfig
ProfileType
. Los mismos cuatro perfiles de TagFilterProfileType
están disponibles en ProfileType
.
En el siguiente ejemplo, se muestra cómo migrar una solicitud de TagFilterProfile
a ProfileType
:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
keepList
y removeList
Los campos DicomConfig
keepList
y removeList
ya no están disponibles en DicomTagConfig
. Si usaste keepList
y removeList
para especificar etiquetas que se conservarán o quitarán en lugar de usar un perfil, debes migrar al nuevo objeto Action
en el que especificas el comportamiento de las etiquetas. El objeto Action
proporciona opciones adicionales para transformar etiquetas.
En el siguiente ejemplo, se muestra cómo migrar una solicitud de keepList
a Action.keepTag
. La solicitud especifica que el valor de la etiqueta PatientID
se mantiene durante la operación de desidentificación.
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
Combina listas de elementos que se conservarán, listas de elementos que se quitarán y perfiles
En el objeto DicomConfig
, puedes determinar si conservar o quitar datos
según las listas de elementos que se conservarán, las listas de elementos que se quitarán y los perfiles. Estas opciones son mutuamente excluyentes.
Cuando usas el objeto DicomTagConfig
, puedes combinar estas opciones especificando qué etiquetas se conservarán y quitarán en un objeto Action
y, al mismo tiempo, especificar un perfil en ProfileType
.
Las opciones configuradas en el objeto Action
anula las configuradas en el perfil ProfileType
. Las opciones del objeto Action
se aplican en el orden en que se proporcionan en la solicitud.
De skipIdRedaction
a Objects.primaryIds
Reemplaza el campo skipIdRedaction
en el objeto DicomConfig
por el campo primaryIds
en el objeto DicomTagConfig
. El campo primaryIds
, que se encuentra en el objeto Options
, contiene un objeto PrimaryIdsOption
en el que especificas una de las siguientes enums:
PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
: Es el comportamiento predeterminado cuando no se proporciona ningún valor aPrimaryIdsOption
. El valor predeterminado es la opción especificada enProfileType
.KEEP
: No cambies los IDs principales.REGEN
: Vuelve a generar los IDs principales.
En el siguiente ejemplo, se muestra cómo migrar una solicitud de skipIdRedaction
a Options.primaryIds
. La solicitud especifica que los valores de los IDs principales se conservan durante la operación de desidentificación:
DicomConfig | DicomTagConfig |
---|---|
|
|
De DeidentifyConfig.ImageConfig
a DicomTagConfig.Options.ImageConfig
Reemplaza el objeto DeidentifyConfig.ImageConfig
por el objeto DicomTagConfig.Options.ImageConfig
.
Las opciones del objeto ImageConfig
son las mismas en ambas versiones.
En el siguiente ejemplo, se muestra cómo migrar una solicitud de usar un ImageConfig
en DeidentifyConfig.image
a usar un ImageConfig
en DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage
.
La solicitud especifica que se debe ocultar todo el texto de una imagen durante la operación de desidentificación:
DeidentifyConfig.image | DeidentifyConfig.DicomTagConfig.Options.cleanImage |
---|---|
|
|
Descripción general de la desidentificación
Desidentificación a nivel de conjunto de datos
Para desidentificar datos de DICOM a nivel del conjunto de datos, llama al método datasets.deidentify
. El método datasets.deidentify
tiene los siguientes componentes:
- El conjunto de datos de origen: Un conjunto de datos que contiene almacenes de DICOM con una o más instancias que tienen datos sensibles. Cuando llamas al método
datasets.deidentify
, se desidentifican todas las instancias en todos los almacenes de DICOM del conjunto de datos. - El conjunto de datos de destino: La desidentificación no afecta el conjunto de datos original ni sus datos. En cambio, las copias desidentificadas de los datos originales se escriben en un conjunto de datos nuevo, denominado conjunto de datos de destino.
- Qué desidentificar: Parámetros de configuración que especifican cómo procesar los datos de DICOM en el conjunto de datos. Puedes configurar la desidentificación de DICOM para desidentificar los metadatos de la instancia de DICOM (mediante el uso de palabras clave de etiquetas) o el texto grabado en imágenes DICOM. Para ello, especifica estos parámetros en un objeto
DeidentifyConfig
.
En la mayoría de los ejemplos de esta guía, se muestra cómo desidentificar datos DICOM a nivel de conjunto de datos.
Desidentificación a nivel del almacén de DICOM
Desidentificar los datos de DICOM a nivel del almacén de DICOM te permite tener más control sobre qué datos se desidentifican. Por ejemplo, si tienes un conjunto de datos con varios almacenes de DICOM, puedes desidentificar cada almacén DICOM según el tipo de datos que exista en el almacén.
Para desidentificar los datos de DICOM en un almacén de DICOM, llama al método dicomStores.deidentify
. El método dicomStores.deidentify
tiene los siguientes componentes:
- Almacén de DICOM de origen: Un almacén DICOM que contiene una o más instancias que tienen datos sensibles. Cuando llamas a la operación
dicomStores.deidentify
, se desidentifican todas las instancias en el almacén de DICOM. - El almacén DICOM de destino: La desidentificación no afecta al almacén de DICOM original ni a sus datos. En cambio, las copias desidentificadas de los datos originales se escriben en el almacén DICOM de destino. El almacén de DICOM de destino ya debe existir.
- Qué desidentificar: Parámetros de configuración que especifican cómo procesar el almacén de DICOM. Puedes configurar la desidentificación de DICOM para desidentificar los metadatos de la instancia de DICOM (mediante el uso de palabras clave de etiquetas) o el texto grabado en imágenes de DICOM si especificas estos parámetros en un objeto
DeidentifyConfig
.
Para ver un ejemplo de cómo desidentificar datos de DICOM a nivel del almacén DICOM, consulta Desidentifica datos a nivel del almacén de DICOM.
Filtros
Cuando desidentificas datos de DICOM a nivel del almacén de DICOM, puedes desidentificar un subconjunto de los datos en el almacén de DICOM si configuras un archivo de filtro y especificas el archivo en la solicitud dicomStores.deidentify
. Para ver un ejemplo, consulta Desidentifica un subconjunto de un almacén de DICOM.
Descripción general de muestras
En las muestras de esta guía, se usa una sola instancia de DICOM llamada dicom_deid_instance_sample.dcm
, pero también puedes desidentificar varias instancias. Para usar la instancia de DICOM de muestra en los ejemplos de esta página, descarga el archivo en tu máquina local y sigue las instrucciones que se indican en Almacena datos de DICOM para almacenarlo en un almacén de DICOM.
En las siguientes secciones, se muestra cómo se ve la imagen en la instancia de DICOM y los metadatos de la instancia.
Imagen de muestra
Algunos ejemplos de esta página contienen un resultado de la imagen desidentificada. En cada muestra, se usa la siguiente imagen original como entrada. Puedes comparar la imagen de salida de cada operación de desidentificación con esta imagen original para ver los efectos de la operación:
Metadatos de muestra
La mayoría de las muestras de esta página contienen un resultado de los metadatos modificados en la instancia de DICOM. En cada muestra, se usan los siguientes metadatos originales como entrada. Puedes comparar los metadatos de salida de cada operación de desidentificación con estos metadatos originales para ver los efectos de la desidentificación:
[
{
"00020002": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00020003": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00020010": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.1.2.4.50"
]
},
"00020012": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.0.3.6.1"
]
},
"00020013": {
"vr": "SH",
"Value": [
"OFFIS_DCMTK_361"
]
},
"00080005": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_IR 100"
]
},
"00080016": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.840.10008.5.1.4.1.1.7"
]
},
"00080018": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695"
]
},
"00080020": {
"vr": "DA",
"Value": [
"20110909"
]
},
"00080030": {
"vr": "TM",
"Value": [
"110032"
]
},
"00080050": {
"vr": "SH"
},
"00080064": {
"vr": "CS",
"Value": [
"WSD"
]
},
"00080070": {
"vr": "LO",
"Value": [
"Manufacturer"
]
},
"00080090": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "John Doe"
}
]
},
"00081090": {
"vr": "LO",
"Value": [
"ABC1"
]
},
"00100010": {
"vr": "PN",
"Value": [
{
"Alphabetic": "Ann Johnson"
}
]
},
"00100020": {
"vr": "LO",
"Value": [
"S1214223-1"
]
},
"00100030": {
"vr": "DA",
"Value": [
"19880812"
]
},
"00100040": {
"vr": "CS",
"Value": [
"F"
]
},
"0020000D": {
"vr": "UI",
"Value": [
"2.25.70541616638819138568043293671559322355"
]
},
"0020000E": {
"vr": "UI",
"Value": [
"1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694"
]
},
"00200010": {
"vr": "SH"
},
"00200011": {
"vr": "IS"
},
"00200013": {
"vr": "IS"
},
"00200020": {
"vr": "CS"
},
"00280002": {
"vr": "US",
"Value": [
3
]
},
"00280004": {
"vr": "CS",
"Value": [
"YBR_FULL_422"
]
},
"00280006": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00280010": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280011": {
"vr": "US",
"Value": [
1024
]
},
"00280100": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280101": {
"vr": "US",
"Value": [
8
]
},
"00280102": {
"vr": "US",
"Value": [
7
]
},
"00280103": {
"vr": "US",
"Value": [
0
]
},
"00282110": {
"vr": "CS",
"Value": [
"01"
]
},
"00282114": {
"vr": "CS",
"Value": [
"ISO_10918_1"
]
}
}
]
Oculta el texto grabado de las imágenes
Puedes desidentificar el texto grabado en las imágenes de DICOM con el objeto ImageConfig
dentro de un objeto Action
. Dentro de ImageConfig
, puedes especificar qué infotipos incluir o excluir, y cómo ocultar texto con el objeto TextRedactionMode
.
Ocultar todo el texto
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo desidentificar una instancia de DICOM configurando TextRedactionMode
en REDACT_ALL_TEXT
.
Esta configuración oculta todo el texto grabado en la imagen.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Después de desidentificar la imagen con REDACT_ALL_TEXT
, esta se ve de la siguiente manera. Observa que se ocultó todo el texto grabado que aparece en la parte inferior de la imagen.
Cómo ocultar texto sensible con la opción de descriptores limpios
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo desidentificar una instancia de DICOM configurando TextRedactionMode
en REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
.
Para obtener más información sobre la opción CleanDescriptorsOption
, consulta Cómo desidentificar texto con la desidentificación contextual.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "cleanImage": { "textRedactionMode": "REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS" } } } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Después de desidentificar la imagen con REDACT_SENSITIVE_TEXT_CLEAN_DESCRIPTORS
, esta se ve de la siguiente manera. Observa que no se ocultó todo el texto grabado que aparece en la parte inferior de la imagen. El texto Female
aún se muestra, ya que PatientSex (0010,0040)
no es uno de los infotipos de DICOM predeterminados.
Desidentifica etiquetas de DICOM
Puedes desidentificar las instancias de DICOM según las palabras clave de etiqueta en los metadatos de DICOM.
Los siguientes métodos de filtrado de etiquetas están disponibles en el objeto DicomTagConfig
Action
:
Especificas cada opción Action
como una lista de IDs, nombres o Representación de valores (RV) de etiquetas de DICOM y, luego, la opción realiza una acción en las etiquetas de la lista. No puedes especificar más de una opción Action
en una lista de etiquetas.
Cada objeto Action
proporciona una lista queries[]
en la que especificas una lista de etiquetas. Se admiten los siguientes formatos de etiquetas:
- IDs de etiquetas, como
"00100010"
- Nombres de etiquetas, como
"PatientName"
- Representaciones de valor (VR), como
"PN"
No hay límite para la cantidad de etiquetas que se pueden proporcionar en la lista queries[]
.
Sin embargo, cada etiqueta solo puede tener una opción Action
.
Para especificar diferentes etiquetas que tengan diferentes opciones de Action
, debes especificar varios objetos Action
.
Mantener las etiquetas
Para evitar que se oculten los valores de las etiquetas, especifícalas en un objeto KeepTag
en el objeto DicomTagConfig
.
Para producir un objeto DICOM válido mientras usas un objeto KeepTag
, especifica los valores MINIMAL_KEEP_LIST_PROFILE
o DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS
en el objeto ProfileType
.
Cuando especificas cualquiera de estos perfiles, se conservan automáticamente las siguientes etiquetas, lo que garantiza que la instancia de DICOM desidentificada sea un DICOM válido:
StudyInstanceUID
SeriesInstanceUID
SOPInstanceUID
TransferSyntaxUID
MediaStorageSOPInstanceUID
MediaStorageSOPClassUID
PixelData
Rows
Columns
SamplesPerPixel
BitsAllocated
BitsStored
Highbit
PhotometricInterpretation
PixelRepresentation
NumberOfFrames
PlanarConfiguration
PixelAspectRatio
SmallestImagePixelValue
LargestImagePixelValue
RedPaletteColorLookupTableDescriptor
GreenPaletteColorLookupTableDescriptor
BluePaletteColorLookupTableDescriptor
RedPaletteColorLookupTableData
GreenPaletteColorLookupTableData
BluePaletteColorLookupTableData
ICCProfile
ColorSpace
WindowCenter
WindowWidth
VOILUTFunction
Los valores de algunas de las etiquetas anteriores se vuelven a generar, lo que significa que los valores se reemplazan por un valor diferente a través de una transformación determinista. Para obtener más información, consulta Retén la opción UID en el estándar de DICOM.
Los valores de StudyInstanceUID
, SeriesInstanceUID
, SOPInstanceUID
y MediaStorageSOPInstanceUID
se denominan "IDs principales". Para determinar cómo se transforman los IDs principales, especifica un valor en PrimaryIdsOption
.
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto KeepTag
para mantener los valores de etiquetas específicas sin cambios durante la desidentificación.
La etiqueta PatientName
se agrega a la lista queries[]
, por lo que el valor PatientName
no se oculta durante la desidentificación.
Como PrimaryIdsOption
no se especifica en la muestra, el campo primaryIds
se establece de forma predeterminada en PRIMARY_IDS_OPTION_UNSPECIFIED
, que se establece de forma predeterminada en el valor de ProfileType
. Como tampoco se especifica ProfileType
, el campo profileType
se establece de forma predeterminada en PROFILE_TYPE_UNSPECIFIED
, que quita las etiquetas en función del Perfil básico de confidencialidad de los atributos (Edición estándar de DICOM 2018e).
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Quitar las etiquetas
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto RemoveTag
para quitar los valores de etiquetas específicas durante la desidentificación. Una etiqueta quitada se reemplaza por un valor vacío.
En los siguientes ejemplos, se agrega la etiqueta PatientName
a la lista queries[]
, por lo que su valor se reemplaza por un valor vacío durante la desidentificación.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "removeTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Borrar etiquetas
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto DeleteTag
para borrar etiquetas específicas durante la desidentificación.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "deleteTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Restablece las etiquetas a un valor de marcador de posición
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto ResetTag
para establecer el valor de las etiquetas en la cadena PLACEHOLDER
durante la desidentificación.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "resetTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
En particular, observa que el valor de la etiqueta
PatientName
se establece enPLACEHOLDER
:Original metadata
Metadatos después de ejecutar ResetTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "PLACEHOLDER" } ] }
Inspecciona y transforma el texto sensible en etiquetas
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto CleanTextTag
para inspeccionar etiquetas y transformar los valores de las etiquetas según la configuración del objeto TextConfig
.
En estos ejemplos, se establecen las siguientes opciones en el objeto Actions
:
- Un objeto
CleanTextTag
. - Una lista
queries[]
que contiene la etiqueta de DICOMPatientName
Las siguientes opciones se establecen en el objeto TextConfig
:
- Un objeto
InfoTypeTransformation
que transforma el texto que coincide con un infotipo en particular. - Un objeto
ReplaceWithInfoTypeConfig
que reemplaza cualquier texto coincidente por el nombre del infotipo. - Una lista
infoTypes[]
que contiene el infotipoPERSON_NAME
.
Con estas configuraciones establecidas, la operación de desidentificación inspecciona la etiqueta PatientName
, la hace coincidir con el infotipo PERSON_NAME
y reemplaza el valor de la etiqueta por el infotipo PERSON_NAME
.
La etiqueta PatientName
tiene una representación de valor (VR) de PN
, que es una de las VR admitidas en el objeto CleanTextTag
.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "cleanTextTag": {} } ] }, "text": { "additionalTransformations": [ { "infoTypes": [ "PERSON_NAME" ], "replaceWithInfoTypeConfig": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
En particular, observa que el valor de la etiqueta
PatientName
se establece en[PERSON_NAME]
:Original metadata
Metadatos después de ejecutar CleanTextTag
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "Ann Johnson" } ] }
"00100010": { "vr": "PN", "Value": [ { "Alphabetic": "[PERSON_NAME]" } ] }
Reemplaza un UID por uno generado
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto RegenUidTag
para reemplazar un UID con uno generado recientemente. La única RV que admite el objeto RegenUidTag
es UI
.
De forma predeterminada, cada etiqueta de los metadatos de muestra con un VR de UI
tiene su UID generado durante la desidentificación. Para mostrar cómo generar un UID para una etiqueta específica, se establecen las siguientes opciones en el ejemplo:
ProfileType
se establece en la enumeraciónKEEP_ALL
, lo que evita que se desidentifiquen los metadatos de DICOM.PrimaryIdsOption
se establece en la enumeraciónKEEP
, lo que deja sin cambios los IDs principales (StudyInstanceUID
,SeriesInstanceUID
,SOPInstanceUID
yMediaStorageSOPInstanceUID
).
Cuando se configuran estas opciones, ninguno de los UIDs de ID principal en los datos de muestra se reemplaza con valores generados recientemente. Sin embargo, si agregas SOPInstanceUID
al array Action.queries[]
, puedes generar un UID nuevo específicamente para la etiqueta SOPInstanceUID
.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "options": { "primaryIds": "KEEP" }, "actions": [ { "queries": [ "00080018" ], "regenUidTag": {} } ], "profileType": "KEEP_ALL_PROFILE" } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de instancias nuevo porque especificaste la etiqueta
SOPInstanceUID
en el arrayAction.queries[]
, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambió el UID de las instancias:
Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con el valor nuevo, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/2.25.70541616638819138568043293671559322355/series/1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Observa que, de los IDs principales, solo
SOPInstanceUID
tiene un UID generado recientemente.
Desidentifica de forma recursiva las etiquetas en un Sequence
anidado
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo usar el objeto RecurseTag
para desidentificar de forma recursiva las etiquetas de DICOM anidadas en un Sequence
.
El objeto RecurseTag
solo admite la RV de SQ
, que es la RV de un Sequence
.
Para obtener información sobre la VR SQ
, consulta 7.5 Anidamiento de conjuntos de datos.
La instancia de muestra de DICOM proporcionada para esta página no contiene ninguna etiqueta de DICOM que tenga una VR SQ
.
Para crear y almacenar una instancia de DICOM con datos falsos que contengan la VR SQ
, completa los siguientes pasos, que se basan en las instrucciones de Crea instancias de DICOM a partir de imágenes JPEG y metadatos JSON.
La instancia de DICOM que creas en los siguientes pasos usa datos falsos y solo tiene como objetivo ilustrar el comportamiento deRecurseTag
.
Guarda los siguientes metadatos DICOM en un archivo JSON llamado
instance.json
. Los metadatos contienen una etiquetaPhysiciansReadingStudyIdentificationSequence
(00081062
). La etiqueta tiene una RVSQ
y contiene dos etiquetasPersonIdentificationCodeSequence
(00401101
) anidadas. Las etiquetas anidadas también tienen un VRSQ
y cada una contiene las siguientes etiquetas anidadas:CodeValue
(00080100
)CodingSchemeDesignator
(00080102
)
[{ "00020010": { "vr": "UI", "Value": [ "1.2.840.10008.1.2.4.50" ] }, "00080005": { "vr": "CS", "Value": [ "ISO_IR 192" ] }, "00080016": { "vr": "UI", "Value": [ "1111111" ] }, "00080018": { "vr": "UI", "Value": [ "2222222" ] }, "0020000D": { "vr": "UI", "Value": [ "3333333" ] }, "0020000E": { "vr": "UI", "Value": [ "4444444" ] }, "00280002": { "vr": "US", "Value": [ 3 ] }, "00280004": { "vr": "CS", "Value": [ "YBR_FULL_422" ] }, "00280006": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "00280008": { "vr": "IS", "Value": [ 1 ] }, "00280010": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280011": { "vr": "US", "Value": [ 1024 ] }, "00280100": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280101": { "vr": "US", "Value": [ 8 ] }, "00280102": { "vr": "US", "Value": [ 7 ] }, "00280103": { "vr": "US", "Value": [ 0 ] }, "7FE00010": { "vr": "OB", "BulkDataURI": "jpeg-image" }, "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue2" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator2" ] } } ] } } ] } }]
Descarga el archivo
google.jpg
en tu máquina local. La API de DICOMweb de la API de Cloud Healthcare acepta cualquier imagen JPEG vinculada con metadatos JSON, siempre que estos sean válidos.Ejecuta los siguientes comandos para crear una apertura (para los metadatos JSON), una imagen central (para el JPEG) y límites de cierre en la imagen:
echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file
Coloca la imagen
google.jpg
dentro de los límites central y de cierre. El archivo de salida, que envías a la API de Cloud Healthcare, se llamamultipart-request.file
:cat opening.file instance.json middle.file google.jpg closing.file > multipart-request.file
Almacena el archivo
multipart-request.file
:REST
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: El ID del almacén de DICOM dentro del conjunto de datos de origen
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
--data-binary @multipart-request.file \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-InFile multipart-request.file `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
Completa los siguientes pasos para desidentificar la instancia de DICOM que almacenaste.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PhysiciansReadingStudyIdentificationSequence" ], "recurseTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:
Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)3333333
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314
UID de serie ( 0020000E
)4444444
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347
UID de instancias ( 00080018
)2222222
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.222168347996079463826250565085126257314/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.25205702030237830896398173746777399347/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.286710307126045768765142714621897494633/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
En particular, observa que los valores de las etiquetas
CodeValue
yCodingSchemaDesignator
anidadas están configurados comoPLACEHOLDER
:Original metadata
Metadatos después de ejecutar RecurseTag
{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "CodeValue1" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "CodingSchemeDesignator1" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [
"CodeValue2"
] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": ["CodingSchemeDesignator2"
] } } ] } } ] } }{ "00081062": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } }, { "00401101": { "vr": "SQ", "Value": [ { "00080100": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] }, "00080102": { "vr": "SH", "Value": [ "PLACEHOLDER" ] } } ] } } ] } }
Desidentifica datos a nivel del almacén de DICOM
Las muestras anteriores muestran cómo desidentificar datos de DICOM a nivel de conjunto de datos. En esta sección, se describe cómo desidentificar datos a nivel del almacén de DICOM.
Para cambiar una solicitud de desidentificación de conjunto de datos a una solicitud de desidentificación de almacén de DICOM, realiza los siguientes cambios:
- Reemplaza
destinationDataset
en el cuerpo de la solicitud pordestinationStore
. - Agrega
dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID
al final del valor endestinationStore
cuando especifiques el destino. - Agrega
dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID
cuando especifiques la ubicación de los datos de origen.
En los siguientes ejemplos, se muestra una solicitud de desidentificación a nivel del conjunto de datos y cómo modificar la solicitud para una desidentificación a nivel del almacén de DICOM:
Desidentificación a nivel de conjunto de datos:
"destinationDataset": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID:deidentify"
Desidentificación a nivel del almacén DICOM:
"destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID" ... "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"
En los siguientes ejemplos, se muestra cómo desidentificar una instancia de DICOM en un almacén de DICOM y escribir los datos desidentificados en un almacén de DICOM nuevo. Antes de ejecutar las muestras, el ID del almacén de DICOM de destino ya debe existir.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos anonimizados. Ya debe existir antes de ejecutar la operación de desidentificación.
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Ya debe existir antes de ejecutar la operación de desidentificación.
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicomTagConfig": { "actions": [ { "queries": [ "PatientName" ], "keepTag": {} } ] } } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentOPERATION_ID
. Necesitarás este valor en el paso siguiente.Usa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Desidentifica un subconjunto de un almacén de DICOM
Puedes desidentificar un subconjunto de los datos en un almacén DICOM si especificas un filtro.
El filtro toma la forma de un archivo de filtro que especificas como un valor para el campo resourcePathsGcsUri
en el objeto DicomFilterConfig
. El archivo de filtro debe existir en un bucket de Cloud Storage. No puedes especificar un archivo de filtro que exista en tu máquina local o en cualquier otra fuente. La ubicación del archivo debe estar en formato gs://BUCKET/PATH/TO/FILE
.
Crea un archivo de filtro
Un archivo de filtro define qué archivos DICOM que desidentificar. Puede filtrar archivos en los siguientes niveles:
- A nivel del estudio
- En el nivel de la serie
- En el nivel de la instancia
El archivo de filtro está compuesto por una línea por estudio, serie o instancia que deseas desidentificar. Cada línea usa el formato /studies/STUDY_UID[/series/SERIES_UID[/instances/INSTANCE_UID]]
.
Al final de cada línea hay un carácter de salto de línea: \n
o \r\n
.
Si no se especifica un estudio, una serie o una instancia en el archivo de filtro que pasaste cuando se llamó a la operación de desidentificación, ese estudio, serie o instancia no se desidentificará y no estará presente en el almacén de DICOM de destino.
Solo se requiere la parte /studies/STUDY_UID
de la ruta de acceso. Esto significa que puedes desidentificar un estudio si especificas /studies/STUDY_UID
o puedes desidentificar una serie si especificas /studies/STUDY_UID/series/SERIES_UID
.
Considera el siguiente archivo de filtro. El archivo de filtro hace que se desidentifique un estudio, dos series y tres instancias individuales:
/studies/1.123.456.789
/studies/1.666.333.111/series/123.456\n
/studies/1.666.333.111/series/567.890\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/111\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/222\n
/studies/1.888.999.222/series/123.456/instances/333\n
Crea un archivo de filtro con BigQuery
Por lo general, para crear un archivo de filtro, primero debes exportar los metadatos de un almacén de DICOM a BigQuery. Esto te permite usar BigQuery para ver los UID del estudio, serie y de las instancias de los datos de DICOM en tu almacén de DICOM. A continuación, puedes hacer lo siguiente:
Realiza consultas para los UID del estudio, la serie y la instancia que te interesa. Por ejemplo, después de exportar los metadatos a BigQuery, puedes ejecutar la siguiente consulta para concatenar los UID del estudio, la serie y la instancia en un formato compatible con los requisitos del archivo de filtro:
SELECT CONCAT ('/studies/', StudyInstanceUID, '/series/', SeriesInstanceUID, '/instances/', SOPInstanceUID) FROM [PROJECT_ID:BIGQUERY_DATASET.BIGQUERY_TABLE]
Si la consulta muestra un conjunto de resultados grande, puedes materializar una tabla nueva si guardas los resultados de las consultas en una tabla de destino en BigQuery.
Después de guardar los resultados de las consultas en la tabla de destino, puedes guardar el contenido de la tabla de destino en un archivo y exportarlo a Cloud Storage. Si quieres obtener los pasos para hacerlo, consulta Exporta datos de tablas. El archivo exportado es tu archivo de filtro. Usarás la ubicación del archivo de filtro en Cloud Storage cuando especifiques el filtro en la operación de exportación.
Crea un archivo de filtro de forma manual
Puedes crear un archivo de filtro con contenido personalizado y subirlo a un depósito de Cloud Storage.
Usarás la ubicación del archivo de filtro en Cloud Storage cuando especifiques el filtro en la operación de desidentificación. En el siguiente ejemplo, se muestra cómo subir un archivo de filtro a un depósito de Cloud Storage con el comando gcloud storage cp
:
gcloud storage cp PATH/TO/FILTER_FILE gs://BUCKET/DIRECTORY
Por ejemplo:
gcloud storage cp /home/user/Desktop/filters.txt gs://my-bucket/my-directory
Usa un filtro
Después de configurar el archivo de filtro, puedes pasarlo como un valor al campo resourcePathsGcsUri
en el objeto filterConfig
.
En el siguiente ejemplo, se amplía Desidentifica datos a nivel del almacén de DICOM, pero se proporciona un archivo de filtro en Cloud Storage para determinar qué recursos DICOM se desidentifican.
REST
Desidentifica el conjunto de datos.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- LOCATION: La ubicación del conjunto de datos
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DICOM_STORE_ID: El ID del almacén de DICOM que contiene los datos que se desidentificarán
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: El ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino
- BUCKET/PATH/TO/FILE: La ubicación del archivo de filtro en un bucket de Cloud Storage
Cuerpo JSON de la solicitud:
{ "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } }
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:cat > request.json << 'EOF' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } EOF
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify"PowerShell
Guarda el cuerpo de la solicitud en un archivo llamado
request.json
. Ejecuta el comando siguiente en la terminal para crear o reemplazar este archivo en el directorio actual:@' { "destinationStore": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID", "config": { "dicom": { "filterProfile": "DEIDENTIFY_TAG_CONTENTS" }, "image": { "textRedactionMode": "REDACT_ALL_TEXT" } }, "filterConfig": { "resourcePathGcsUri": "gs://BUCKET/PATH/TO/FILE" } } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Luego, ejecuta el siguiente comando para enviar tu solicitud de REST:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/dicomStores/SOURCE_DICOM_STORE_ID:deidentify" | Select-Object -Expand ContentUsa el método
projects.locations.datasets.operations.get
para obtener el estado de la operación de larga duración.Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- SOURCE_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos que contiene los datos que se desidentificarán
- OPERATION_ID: Es el ID que muestra la operación de larga duración.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/SOURCE_DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
"done": true
, significa que la operación de larga duración finalizó.Una vez que la desidentificación se realiza de forma correcta, puedes recuperar los metadatos de la instancia desidentificada para ver cómo se cambió. La instancia desidentificada tiene un UID de estudios nuevo, un UID de serie y un UID de instancias, por lo que primero debes buscar la instancia desidentificada en el conjunto de datos nuevo.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand ContentDeberías recibir una respuesta JSON similar a la que se muestra a continuación:
En la siguiente tabla, se muestra cómo cambiaron el UID de los estudios, el UID de la serie y el UID de las instancias:Metadatos de la instancia original Metadatos de instancia desidentificados UID de estudios ( 0020000D
)2.25.70541616638819138568043293671559322355
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763
UID de serie ( 0020000E
)1.2.276.0.7230010.3.1.3.8323329.78.1531234558.523694
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710
UID de instancias ( 00080018
)1.2.276.0.7230010.3.1.4.8323329.78.1539083058.523695
1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029
Con los valores nuevos, recupera los metadatos de la instancia.
Antes de usar cualquiera de los datos de solicitud a continuación, realiza los siguientes reemplazos:
- PROJECT_IDEl ID de tu proyecto de Google Cloud.
- DESTINATION_DATASET_ID: El ID del conjunto de datos de destino en el que se escriben los datos desidentificados
- SOURCE_DATASET_LOCATION: La ubicación del conjunto de datos de origen
- DESTINATION_DICOM_STORE_ID: Es el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de destino. Es el mismo que el ID del almacén de DICOM en el conjunto de datos de origen.
Para enviar tu solicitud, elige una de estas opciones:
curl
Ejecuta el siguiente comando:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata"PowerShell
Ejecuta el siguiente comando:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/SOURCE_DATASET_LOCATION/datasets/DESTINATION_DATASET_ID/dicomStores/DESTINATION_DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.201854290391432893460946240745559593763/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.303327499491957026103380014864616068710/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.1.97415866390999888717168863957686758029/metadata" | Select-Object -Expand ContentExplorador de API
Abre la página de referencia del método. El panel del Explorador de API se abre en la parte derecha de la página. Puedes interactuar con esta herramienta para enviar solicitudes. Completa los campos obligatorios y haz clic en Ejecutar.
Soluciona problemas de operaciones de desidentificación de DICOM
Si se producen errores durante una operación de desidentificación de DICOM, estos se registran en Cloud Logging. Para obtener más información, consulta Visualiza los registros de errores en Cloud Logging.
Si toda la operación muestra un error, consulta Solución de problemas de operaciones de larga duración.