Tutorial ini menjelaskan skenario saat Anda dapat menggunakan streaming BigQuery untuk menyinkronkan penyimpanan FHIR dengan set data BigQuery secara hampir real-time.
Langkah 1: Mengonfigurasi izin BigQuery
Untuk melakukan streaming perubahan resource FHIR ke BigQuery, Anda harus memberikan izin tambahan ke akun layanan Cloud Healthcare Service Agent. Untuk mengetahui informasi selengkapnya, lihat Izin BigQuery FHIR store.
Langkah 2: Konfigurasi dan verifikasi streaming BigQuery
Untuk mengaktifkan streaming ke BigQuery, ikuti petunjuk berikut:
Buat penyimpanan FHIR dan tambahkan resource Pasien
Untuk membuat FHIR store dan menambahkan dua resource Pasien, ikuti langkah-langkah berikut:
Buat penyimpanan FHIR:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID Google Cloud project Anda
- LOCATION: lokasi set data
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID:
ID untuk penyimpanan FHIR. ID FHIR store harus memiliki:
- ID unik dalam set datanya
- String Unicode 1-256 karakter yang terdiri dari berikut ini:
- Numbers
- Surat
- Garis bawah
- Tanda Hubung
- Menstruasi
- FHIR_STORE_VERSION: versi FHIR dari FHIR store. Opsi yang tersedia adalah DSTU2, STU3, atau R4.
Meminta isi JSON:
{ "version": "FHIR_STORE_VERSION" }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "version": "FHIR_STORE_VERSION" } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "version": "FHIR_STORE_VERSION" } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Salin isi permintaan dan buka halaman referensi metode. Panel API Explorer terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Tempelkan isi permintaan di alat ini, lengkapi kolom lainnya yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Anda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Buat resource Patient pertama di penyimpanan FHIR:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: ID Google Cloud project Anda
- LOCATION: lokasi set data
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID: ID FHIR store
Meminta isi JSON:
{ "name": [ { "use": "official", "family": "Smith", "given": [ "Darcy" ] } ], "gender": "female", "birthDate": "1970-01-01", "resourceType": "Patient" }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "name": [ { "use": "official", "family": "Smith", "given": [ "Darcy" ] } ], "gender": "female", "birthDate": "1970-01-01", "resourceType": "Patient" } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/fhir+json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "name": [ { "use": "official", "family": "Smith", "given": [ "Darcy" ] } ], "gender": "female", "birthDate": "1970-01-01", "resourceType": "Patient" } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/fhir+json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient" | Select-Object -Expand ContentAnda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Buat resource Pasien kedua di penyimpanan FHIR:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID: ID FHIR store
Meminta isi JSON:
{ "name": [ { "use": "official", "family": "Zhang", "given": [ "Michael" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1980-01-01", "resourceType": "Patient" }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "name": [ { "use": "official", "family": "Zhang", "given": [ "Michael" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1980-01-01", "resourceType": "Patient" } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/fhir+json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "name": [ { "use": "official", "family": "Zhang", "given": [ "Michael" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1980-01-01", "resourceType": "Patient" } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/fhir+json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient" | Select-Object -Expand ContentAnda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Cari resource Pasien di penyimpanan FHIR dan verifikasi bahwa penyimpanan berisi dua resource Pasien:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID: ID FHIR store
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Jalankan perintah berikut:
curl -X GET \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient"PowerShell
Jalankan perintah berikut:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method GET `
-Headers $headers `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient" | Select-Object -Expand ContentAnda akan menerima respons JSON yang mirip dengan yang berikut ini:
Mengonfigurasi streaming BigQuery di penyimpanan FHIR
Perbarui penyimpanan FHIR untuk mengonfigurasi streaming BigQuery. Setelah mengonfigurasi streaming, Cloud Healthcare API akan melakukan streaming perubahan resource apa pun ke set data BigQuery.
Perbarui penyimpanan FHIR yang ada untuk menambahkan lokasi set data BigQuery:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID: ID penyimpanan FHIR Anda
- BIGQUERY_PROJECT_ID: project Google Cloud yang berisi set data BigQuery untuk streaming perubahan resource FHIR
- BIGQUERY_DATASET_ID: set data BigQuery tempat Anda melakukan streaming perubahan resource FHIR
Meminta isi JSON:
{ "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS_V2" } } } ] }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS_V2" } } } ] } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X PATCH \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=streamConfigs"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS_V2" } } } ] } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method PATCH `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=streamConfigs" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Salin isi permintaan dan buka halaman referensi metode. Panel API Explorer terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Tempelkan isi permintaan di alat ini, lengkapi kolom lainnya yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Anda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Memverifikasi konfigurasi streaming ke BigQuery
Pastikan streaming dikonfigurasi dengan benar dengan menyelesaikan langkah-langkah berikut:
Buat resource Patient ketiga di penyimpanan FHIR:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- FHIR_STORE_ID: ID FHIR store
Meminta isi JSON:
{ "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/fhir+json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/fhir+json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/Patient" | Select-Object -Expand ContentAnda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Buat kueri tabel
BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient
dengan menjalankanbq query
. BigQuery mengelola tabel menurut jenis resource FHIR. Resource Pasien ketiga yang Anda buat ada di tabelPatient
.bq query \ --project_id=BIGQUERY_PROJECT_ID \ --use_legacy_sql=false \ 'SELECT COUNT(*) FROM `BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient`'
Kueri menampilkan hasil berikut. Hasilnya menunjukkan bahwa ada satu catatan resource Pasien dalam tabel BigQuery, karena Anda menambahkan resource Pasien setelah mengonfigurasi streaming di penyimpanan FHIR.
+-----+ | f0_ | +-----+ | 1 | +-----+
Langkah 3: Mengekspor resource FHIR yang ada ke BigQuery
Jika Anda memiliki penyimpanan FHIR yang berisi data yang ingin disinkronkan dengan set data BigQuery, Anda harus menyelesaikan langkah-langkah berikut untuk memastikan data yang ada berada di BigQuery:
- Konfigurasi streaming ke BigQuery.
- Ekspor data yang ada ke set data BigQuery.
Untuk mengekspor dua resource Pasien yang ada di penyimpanan FHIR sebelum Anda mengonfigurasi streaming ke set data BigQuery, selesaikan langkah-langkah berikut:
Untuk mengekspor resource di penyimpanan FHIR ke BigQuery, jalankan perintah
gcloud healthcare fhir-stores export bq
. Perintah ini menggunakan flag--write-disposition=write-append
, yang menambahkan data ke tabel BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient
yang ada.gcloud healthcare fhir-stores export bq FHIR_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --bq-dataset=bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET \ --schema-type=analytics_v2 \ --write-disposition=write-append
Buat kueri tabel
BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient
untuk memverifikasi jumlah resource Pasien dalam set data BigQuery:bq query \ --project_id=BIGQUERY_PROJECT_ID \ --use_legacy_sql=false \ 'SELECT COUNT(*) FROM `BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient`'
Kueri menampilkan hasil berikut, yang menunjukkan bahwa ada 4 rekaman resource Pasien di tabel BigQuery:
+-----+ | f0_ | +-----+ | 4 | +-----+
Jumlah sebenarnya resource Pasien dalam tabel BigQuery adalah 3, tetapi kueri menampilkan 4. Ketidakkonsistenan dapat terjadi saat resource berisi duplikat dari operasi yang berbeda. Dalam hal ini, resource Pasien pertama ditambahkan ke tabel BigQuery dua kali ini:
- Saat pembuatan resource Pasien di-streaming
- Saat resource di penyimpanan FHIR diekspor ke BigQuery
Tabel BigQuery juga berisi histori mutasi resource Pasien pertama. Misalnya, jika Anda menghapus resource Pasien menggunakan
fhir.delete
, tabel BigQuery memiliki kolommeta.tag.code
dengan nilaiDELETE
.Untuk mendapatkan snapshot terbaru data di penyimpanan FHIR, buat kueri tampilan. Cloud Healthcare API membuat tampilan hanya dengan melihat versi terbaru setiap resource. Membuat kueri tampilan adalah cara paling akurat untuk menyinkronkan penyimpanan FHIR dan tabel BigQuery yang sesuai.
Untuk membuat kueri tampilan, jalankan perintah berikut:
bq query \ --project_id=BIGQUERY_PROJECT_ID \ --use_legacy_sql=false \ 'SELECT COUNT(*) FROM `BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.PatientView`'
Kueri menampilkan hasil berikut, yang dengan benar menunjukkan bahwa ada 3 resource Pasien dalam tabel BigQuery:
+-----+ | f0_ | +-----+ | 3 | +-----+
Langkah 4: Lakukan streaming resource dari beberapa penyimpanan FHIR ke set data BigQuery yang sama
Dalam beberapa kasus, Anda mungkin ingin melakukan streaming resource FHIR dari beberapa penyimpanan FHIR ke set data BigQuery yang sama untuk melakukan analisis pada resource FHIR gabungan dari penyimpanan FHIR.
Pada langkah-langkah berikut, Anda akan membuat penyimpanan FHIR kedua di set data Cloud Healthcare API yang sama dengan penyimpanan FHIR pertama, tetapi Anda dapat menggunakan penyimpanan FHIR dari set data yang berbeda saat menggabungkan resource FHIR.
Buat penyimpanan FHIR kedua dengan streaming BigQuery diaktifkan dan gunakan set data BigQuery yang sama dengan yang Anda gunakan di Mengonfigurasi streaming BigQuery di penyimpanan FHIR.
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- SECOND_FHIR_STORE_ID: ID untuk FHIR store kedua. ID penyimpanan FHIR harus unik dalam set data. ID penyimpanan FHIR dapat berupa string Unicode apa pun dari 1 hingga 256 karakter yang terdiri dari angka, huruf, garis bawah, tanda hubung, dan titik.
- FHIR_STORE_VERSION: versi penyimpanan FHIR: DSTU2, STU3, atau R4
- BIGQUERY_PROJECT_ID: project Google Cloud yang berisi set data BigQuery untuk streaming perubahan resource FHIR
- BIGQUERY_DATASET_ID: set data BigQuery tempat Anda melakukan streaming perubahan resource FHIR
Meminta isi JSON:
{ "version": "FHIR_STORE_VERSION" "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS" } } } ] }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "version": "FHIR_STORE_VERSION" "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS" } } } ] } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=SECOND_FHIR_STORE_ID"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "version": "FHIR_STORE_VERSION" "streamConfigs": [ { "bigqueryDestination": { "datasetUri": "bq://BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID", "schemaConfig": { "schemaType": "ANALYTICS" } } } ] } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=SECOND_FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand ContentAPIs Explorer
Salin isi permintaan dan buka halaman referensi metode. Panel API Explorer terbuka di sisi kanan halaman. Anda bisa berinteraksi dengan alat ini untuk mengirim permintaan. Tempelkan isi permintaan di alat ini, lengkapi kolom lainnya yang wajib diisi, lalu klik Jalankan.
Anda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Buat resource Patient di penyimpanan FHIR kedua:
REST
Sebelum menggunakan salah satu data permintaan, lakukan penggantian berikut:
- PROJECT_ID: Google Cloud project ID Anda
- LOCATION: lokasi set data induk
- DATASET_ID: set data induk FHIR store
- SECOND_FHIR_STORE_ID: ID FHIR store kedua
Meminta isi JSON:
{ "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" }
Untuk mengirim permintaan Anda, pilih salah satu opsi berikut:
curl
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:cat > request.json << 'EOF' { "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" } EOF
Kemudian, jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
curl -X POST \
-H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
-H "Content-Type: application/fhir+json" \
-d @request.json \
"https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/SECOND_FHIR_STORE_ID/fhir/Patient"PowerShell
Simpan isi permintaan dalam file bernama
request.json
. Jalankan perintah berikut di terminal untuk membuat atau menimpa file ini di direktori saat ini:@' { "name": [ { "use": "official", "family": "Lee", "given": [ "Alex" ] } ], "gender": "male", "birthDate": "1990-01-01", "resourceType": "Patient" } '@ | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8
Kemudian jalankan perintah berikut untuk mengirim permintaan REST Anda:
$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
Invoke-WebRequest `
-Method POST `
-Headers $headers `
-ContentType: "application/fhir+json" `
-InFile request.json `
-Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/SECOND_FHIR_STORE_ID/fhir/Patient" | Select-Object -Expand ContentAnda akan melihat respons JSON seperti berikut:
Buat kueri tabel
BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient
untuk memverifikasi jumlah resource Pasien dalam tabel BigQuery:bq query \ --project_id=BIGQUERY_PROJECT_ID \ --use_legacy_sql=false \ 'SELECT COUNT(*) FROM `BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.Patient`'
Saat melakukan streaming data tentang resource Pasien baru, BigQuery menggunakan tabel
Patient
yang ada di set data BigQuery. Kueri menampilkan hasil berikut, yang menunjukkan bahwa ada 5 rekaman resource Pasien di tabel BigQuery. Lihat Mengekspor resource FHIR yang ada ke BigQuery untuk mengetahui penjelasan mengapa tabel berisi 5 resource, bukan 4.+-----+ | f0_ | +-----+ | 5 | +-----+
Jalankan perintah berikut untuk membuat kueri tampilan:
bq query \ --project_id=BIGQUERY_PROJECT_ID \ --use_legacy_sql=false \ 'SELECT COUNT(*) FROM `BIGQUERY_PROJECT_ID.BIGQUERY_DATASET_ID.PatientView`'
Kueri menampilkan hasil berikut, yang menunjukkan bahwa ada 4 resource Pasien di gabungan penyimpanan FHIR pertama dan kedua serta di tabel BigQuery:
+-----+ | f0_ | +-----+ | 4 | +-----+