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Criação e gestão de FHIR stores

Esta página explica como criar, editar, ver, listar e eliminar arquivos Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR). Os FHIR stores contêm recursos FHIR, como recursos de reivindicação, recursos de pacientes, recursos de medicamentos e muito mais.

A API Cloud Healthcare suporta as seguintes versões da FHIR:

Criar uma loja FHIR

Antes de poder criar uma loja FHIR, tem de criar um conjunto de dados.

Os exemplos seguintes mostram como criar um arquivo FHIR através do método projects.locations.datasets.fhirStores.create.

Consola

Para criar uma FHIR store, conclua os seguintes passos:

Na Google Cloud consola, aceda à página Conjuntos de dados.
Aceda aos conjuntos de dados
Selecione o conjunto de dados onde quer criar um FHIR store.
Clique em Criar arquivo de dados.
Selecione FHIR como o tipo de armazenamento de dados.
Introduza um nome exclusivo no seu conjunto de dados. Se o nome não for exclusivo, a criação da loja FHIR falha.
Clicar em Seguinte.
Para configurar a sua loja FHIR, faça o seguinte:
1. Escolha a versão FHIR para a loja FHIR, uma das seguintes: DSTU2, STU3 ou R4.
2. Selecione as definições avançadas aplicáveis a partir do seguinte:
  - Permitir criação de atualizações: selecione esta opção para permitir a criação de um novo recurso através de uma operação de atualização com um ID especificado pelo utilizador.
  - Verificações de integridade referencial: selecione esta opção para ativar a integridade referencial nesta loja. Não é possível alterar esta definição após a criação da loja.
  - Controlo de versões de recursos: selecione esta opção para registar automaticamente as versões históricas dos recursos. Não é possível alterar esta definição após a criação da loja.
3. Selecione as definições de validação do perfil aplicáveis nos seguintes campos. Para mais informações, consulte ValidationConfig:
  - Ativar validação do perfil: selecione esta opção para ativar a validação do perfil. Para aplicar um guia de implementação que esteja ativado na sua loja FHIR, tem de ativar a validação de perfis.
  - Ativar validação de campos obrigatórios: selecione esta opção para ativar a validação de campos de recursos em relação às definições de estrutura no seu perfil FHIR.
  - Ativar validação do tipo de referência: selecione para ativar a validação do tipo de referência.
  - Ativar validação de FHIRPath: selecione esta opção para ativar a verificação de compatibilidade com FHIRPath.
4. Clicar em Seguinte.
Opcional: para ativar os guias de implementação na sua loja FHIR, faça o seguinte:
1. Clique em Ativar guias de implementação.
2. Clique e expanda a lista Guias de implementação.
3. Selecione os guias de implementação aplicáveis na lista.
  Cada guia de implementação suporta uma versão específica da FHIR. A lista mostra apenas os guias de implementação compatíveis com a versão da loja FHIR selecionada.
4. Clique em Importar IG personalizado do Cloud Storage para importar qualquer pacote de validação de perfil personalizado de uma localização do Cloud Storage.
5. No painel Selecionar objeto, selecione um recurso do pacote de validação de perfis de uma localização do Cloud Storage. Para mais informações, consulte o artigo Use Google Cloud a consola para ativar os guias de implementação.
6. Clique em Selecionar.
  - Os guias de implementação selecionados são apresentados numa tabela com a respetiva versão, URL e estado.
  - Se ativou os guias de implementação, mas não ativou a validação do perfil, o guia de implementação não entra em vigor.
  - Clicar em Seguinte.
Opcional: para exportar alterações de recursos para o BigQuery sempre que os recursos FHIR na sua loja forem criados, atualizados, corrigidos ou eliminados, faça o seguinte:
1. Clique em Transmitir alterações de recursos para o BigQuery.
2. Clique em Adicionar uma configuração de streaming. Para mais informações sobre o streaming do BigQuery, consulte o artigo Streaming de alterações de recursos FHIR para o BigQuery.
3. Selecione o nível de profundidade no controlo de deslize Profundidade da estrutura recursiva para definir a profundidade de todas as estruturas recursivas no esquema de saída. Por predefinição, o valor da profundidade recursiva é 2.
4. Clique em Concluído para guardar a configuração de streaming.
5. Clicar em Seguinte.
Opcional: para configurar um tópico do Pub/Sub para a loja FHIR, faça o seguinte:
1. Clique em Receber notificações do Cloud Pub/Sub.
2. Clique em Adicionar um tópico do Cloud Pub/Sub e selecione o nome do tópico.
  Quando especificar um tópico do Pub/Sub, introduza o URI qualificado para o tópico, conforme mostrado no exemplo seguinte:
```
projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC
```
3. Clicar em Seguinte.
Opcional: para adicionar etiquetas à loja, faça o seguinte:
1. Clique em Adicionar etiquetas para organizar as suas origens de dados.
2. Introduza a chave e o valor da etiqueta. Para mais informações sobre etiquetas de recursos, consulte o artigo Usar etiquetas de recursos.
3. Clique em Criar.

O novo FHIR store é apresentado na lista.

gcloud

Para criar um armazenamento FHIR no conjunto de dados, execute o comando gcloud healthcare fhir-stores create.

Antes de usar qualquer um dos dados de comandos abaixo, faça as seguintes substituições:

LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: um identificador para a loja FHIR. O ID da loja FHIR tem de ter o seguinte:
- Um ID exclusivo no respetivo conjunto de dados
- Uma string Unicode de 1 a 256 carateres que consiste no seguinte:
FHIR_STORE_VERSION: a versão FHIR da loja FHIR. As opções disponíveis são DSTU2, STU3 ou R4.

Execute o seguinte comando:

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION `
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores create FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION ^
  --version=FHIR_STORE_VERSION

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte:

Resposta

Created fhirStore [FHIR_STORE_ID].

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: um identificador para a loja FHIR. O ID da loja FHIR tem de ter o seguinte:
- Um ID exclusivo no respetivo conjunto de dados
- Uma string Unicode de 1 a 256 carateres que consiste no seguinte:
FHIR_STORE_VERSION: a versão FHIR da loja FHIR. As opções disponíveis são DSTU2, STU3 ou R4.

Corpo JSON do pedido:

{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

cat > request.json << 'EOF'
{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}
EOF

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

curl -X POST \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

@'
{
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method POST `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores?fhirStoreId=FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Copie o corpo do pedido e abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Cole o corpo do pedido nesta ferramenta, preencha todos os outros campos obrigatórios e clique em Executar.

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// createFHIRStore creates an FHIR store.
func createFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)
	version := "R4"

	resp, err := storesService.Create(parent, &healthcare.FhirStore{Version: version}).FhirStoreId(fhirStoreID).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Create: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Created FHIR store: %q\n", resp.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.Map;

public class FhirStoreCreate {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreCreate(String datasetName, String fhirStoreId) throws IOException {
    // String datasetName =
    //     String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");
    // String fhirStoreId = "your-fhir-id"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure the FhirStore to be created.
    Map<String, String> labels = new HashMap<>();
    labels.put("key1", "value1");
    labels.put("key2", "value2");
    String version = "STU3";
    FhirStore content = new FhirStore().setLabels(labels).setVersion(version);

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Create request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .fhirStores()
            .create(datasetName, content)
            .setFhirStoreId(fhirStoreId);

    // Execute the request and process the results.
    FhirStore response = request.execute();
    System.out.println("FHIR store created: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const createFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const version = 'STU3';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {
    parent,
    fhirStoreId,
    resource: {
      version,
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.create(request);
  console.log(`Created FHIR store: ${fhirStoreId}`);
};

createFhirStore();

Python

def create_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id, version):
    """Creates a new FHIR store within the parent dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    # version = 'R4'  # replace with the FHIR store version
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    body = {"version": version}

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .create(parent=fhir_store_parent, body=body, fhirStoreId=fhir_store_id)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Created FHIR store: {fhir_store_id}")

    return response

Editar uma loja FHIR

Os exemplos seguintes mostram como editar um arquivo FHIR. Pode editar um FHIR store para modificar propriedades como as seguintes:

O tópico do Pub/Sub para o qual a API Cloud Healthcare envia notificações de alterações da loja FHIR.
As etiquetas do FHIR store. As etiquetas são pares de chave-valor que ajudam a organizar os seus Google Cloud recursos.

Quando especificar um tópico do Pub/Sub, introduza o URI qualificado para o tópico, conforme mostrado no seguinte exemplo:

projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC

Para que as notificações funcionem, tem de conceder autorizações adicionais à conta de serviço do agente do serviço de saúde na nuvem. Para mais informações, consulte o artigo Autorizações do Pub/Sub para o armazenamento de DICOM, FHIR e HL7v2.

Consola

Para editar um FHIR store, conclua os seguintes passos:

Na Google Cloud consola, aceda à página Conjuntos de dados.
Aceder a conjuntos de dados
Selecione o conjunto de dados que contém o armazenamento FHIR que quer editar.
Na lista Armazenamentos de dados, selecione o armazenamento FHIR que quer editar.
Para editar a configuração da loja, clique em Configuração da loja FHIR.

Para mais informações sobre as opções de configuração da FHIR store, consulte o artigo Criar uma FHIR store.
Para editar os guias de implementação da loja, clique em Guias de implementação e selecione os guias de implementação aplicáveis ou importe um guia de implementação personalizado do armazenamento na nuvem. Para mais informações, consulte o artigo Use Google Cloud a consola para ativar os guias de implementação.

Para editar os guias de implementação ou aplicar os guias de implementação ativados, tem de ativar a validação de perfis na secção Configuração da loja FHIR.
Para exportar alterações de recursos para o BigQuery sempre que os recursos FHIR na sua loja forem criados, atualizados, corrigidos ou eliminados, clique em Adicionar nova configuração de streaming no campo Conjunto de dados.
Selecione um conjunto de dados do BigQuery onde as alterações aos recursos vão ser transmitidas. Para mais informações sobre o streaming do BigQuery, consulte o artigo Streaming de alterações de recursos FHIR para o BigQuery.
Para definir a profundidade de todas as estruturas recursivas no esquema de saída, clique na profundidade relevante no controlo de deslize Profundidade da estrutura recursiva. Por predefinição, a profundidade recursiva é 2.
Para exportar alterações de recursos apenas para tipos de recursos específicos, selecione os tipos de recursos na lista Selecionar tipos de recursos FHIR.
Para configurar um tópico do Pub/Sub para o arquivo de dados, selecione um nome do tópico na secção Notificações do Cloud Pub/Sub. Quando especificar um tópico do Pub/Sub, introduza o URI qualificado para o tópico, conforme mostrado no exemplo seguinte:
```
projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC
```
Para adicionar uma ou mais etiquetas à loja, clique em Etiquetas, clique em Adicionar etiqueta e introduza a etiqueta de chave/valor. Para mais informações sobre etiquetas de recursos, consulte o artigo Usar etiquetas de recursos.
Clique em Guardar.

gcloud

Para editar uma FHIR store, execute o comando gcloud healthcare fhir-stores update.

Antes de usar qualquer um dos dados de comandos abaixo, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR
PUBSUB_TOPIC_ID: um tópico do Pub/Sub para o qual as mensagens são publicadas quando ocorre um evento num repositório de dados

Execute o seguinte comando:

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION `
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores update FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION ^
  --pubsub-topic=projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte:

Resposta

Updated fhirStore [FHIR_STORE_ID].
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
notificationConfig:
 pubsubTopic: projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID
version: FHIR_STORE_VERSION

REST

Para editar uma loja FHIR, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.patch.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR
PUBSUB_TOPIC_ID: um tópico do Pub/Sub para o qual as mensagens são publicadas quando ocorre um evento num arquivo de dados. Para determinar os dados a incluir nas notificações do Pub/Sub, consulte o artigo Notificações do FHIR Pub/Sub.
KEY1: a primeira chave de etiqueta
VALUE1: o primeiro valor da etiqueta
KEY2: a segunda chave da etiqueta
VALUE2: o valor da segunda etiqueta

Corpo JSON do pedido:

{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

cat > request.json << 'EOF'
{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}
EOF

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

curl -X PATCH \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=notificationConfig,labels"

PowerShell

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

@'
{
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  }
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method PATCH `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=notificationConfig,labels" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID%",
  "notificationConfigs": [
    {
      "pubsubTopic": "projects/PROJECT_ID/topics/PUBSUB_TOPIC_ID"
    }
  ],
  "labels": {
    "KEY1": "VALUE1",
    "KEY2": "VALUE2"
  },
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// patchFHIRStore updates (patches) a FHIR store by updating its Pub/sub topic name.
func patchFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID, topicName string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	// topicName format is "projects/*/locations/*/topics/*"
	notificationConfig := &healthcare.FhirNotificationConfig{
		PubsubTopic: topicName,
	}

	fhirStore := &healthcare.FhirStore{
		NotificationConfigs: []*healthcare.FhirNotificationConfig{notificationConfig},
	}

	patchRequest := storesService.Patch(name, fhirStore).UpdateMask("notificationConfigs")

	if _, err := patchRequest.Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Patch: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Patched FHIR store %s with Pub/sub topic %s\n", datasetID, topicName)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirNotificationConfig;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStorePatch {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStorePatch(String fhirStoreName, String pubsubTopic) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    // String.format(
    // FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id",
    // "your-fhir-id");
    // String pubsubTopic = "projects/your-project-id/topics/your-pubsub-topic";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Fetch the initial state of the FHIR store.
    FhirStores.Get getRequest = client
        .projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .get(fhirStoreName);
    FhirStore store = getRequest.execute();

    // Update the FhirStore fields as needed as needed. For a full list of FhirStore
    // fields, see:
    // https://cloud.google.com/healthcare/docs/reference/rest/v1/projects.locations.datasets.fhirStores#FhirStore
    FhirNotificationConfig notificationConfig = new FhirNotificationConfig()
        .setPubsubTopic(pubsubTopic);
    store.setNotificationConfigs(Collections.singletonList(notificationConfig));

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Patch request = client
        .projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .patch(fhirStoreName, store)
        .setUpdateMask("notificationConfigs");

    // Execute the request and process the results.
    store = request.execute();
    System.out.println("FHIR store patched: \n" + store.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see
    // https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential = GoogleCredentials.getApplicationDefault()
        .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration
    // to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer = request -> {
      new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
      request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
      request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
    };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const patchFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  // const pubsubTopic = 'my-topic'
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {
    name,
    updateMask: 'notificationConfigs',
    resource: {
      notificationConfigs: [
        {
          pubsubTopic: `projects/${projectId}/topics/${pubsubTopic}`,
        },
      ],
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.patch(request);
  console.log(
    `Patched FHIR store ${fhirStoreId} with Cloud Pub/Sub topic ${pubsubTopic}`
  );
};

patchFhirStore();

Python

def patch_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id, pubsub_topic):
    """Updates the FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with your dataset ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    # pubsub_topic = 'projects/{project_id}/topics/{topic_id}'  # replace with your Pub/Sub topic
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    patch = {
        "notificationConfigs": [{"pubsubTopic": pubsub_topic}] if pubsub_topic else []
    }

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .patch(name=fhir_store_name, updateMask="notificationConfigs", body=patch)
    )

    response = request.execute()
    print(
        f"Patched FHIR store {fhir_store_id} with Cloud Pub/Sub topic: {pubsub_topic or 'None'}"
    )

    return response

Obter detalhes da loja FHIR

Os exemplos seguintes mostram como obter detalhes sobre um FHIR store.

Consola

Para ver os detalhes de uma loja FHIR:

Na Google Cloud consola, aceda à página Conjuntos de dados.
Aceda aos conjuntos de dados
Selecione o conjunto de dados que contém o FHIR store.
Clique no nome do FHIR store.

gcloud

Para obter detalhes sobre uma FHIR store, execute o comando gcloud healthcare fhir-stores describe.

Antes de usar qualquer um dos dados de comandos abaixo, faça as seguintes substituições:

LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR

Execute o seguinte comando:

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID \
 --dataset=DATASET_ID \
 --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID `
 --dataset=DATASET_ID `
 --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores describe FHIR_STORE_ID ^
 --dataset=DATASET_ID ^
 --location=LOCATION

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte.

Se configurou campos no recurso FhirStore, estes também aparecem na resposta.

Resposta

...
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
...
version: FHIR_STORE_VERSION

REST

Para obter detalhes sobre um FHIR store, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.get.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte.

Se configurou campos no recurso FhirStore, estes também aparecem na resposta.

Resposta

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  ...
  "version": "FHIR_STORE_VERSION"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// getFHIRStore gets an FHIR store.
func getFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	store, err := storesService.Get(name).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Get: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Got FHIR store: %q\n", store.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreGet {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreGet(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-fhir-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Get request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().get(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    FhirStore store = request.execute();
    System.out.println("FHIR store retrieved: \n" + store.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const getFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {name};

  const fhirStore =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.get(request);
  console.log(fhirStore.data);
};

getFhirStore();

Python

def get_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Gets the specified FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    # Imports Python's built-in "json" module
    import json

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    fhir_stores = client.projects().locations().datasets().fhirStores()
    fhir_store = fhir_stores.get(name=fhir_store_name).execute()

    print(json.dumps(fhir_store, indent=2))
    return fhir_store

Apresentar em lista os armazenamentos de FHIR num conjunto de dados

Os exemplos seguintes mostram como listar os armazenamentos de FHIR num conjunto de dados.

Consola

Para ver os arquivos de dados num conjunto de dados:

Na Google Cloud consola, aceda à página Conjuntos de dados.
Aceda aos conjuntos de dados
Selecione o conjunto de dados que contém o arquivo de dados que quer ver.

gcloud

Para ver detalhes sobre uma loja FHIR, execute o comando gcloud healthcare fhir-stores list.

Antes de usar qualquer um dos dados de comandos abaixo, faça as seguintes substituições:

DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
LOCATION: a localização do conjunto de dados

Execute o seguinte comando:

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores list --dataset=DATASET_ID --location=LOCATION

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte.

Se configurou campos no recurso FhirStore, estes também aparecem na resposta.

ID             LOCATION     REF_INT  RES_VER  UPDATE_CREATE  TOPIC
FHIR_STORE_ID  LOCATION                                       PUBSUB_TOPIC
...

REST

Para apresentar em lista os armazenamentos de FHIR num conjunto de dados, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.list.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
LOCATION: a localização do conjunto de dados

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores"

PowerShell

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte.

Se configurou campos no recurso FhirStore, estes também aparecem na resposta.

Resposta

{
  "fhirStores": [
    {
      "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
      "version": "FHIR_STORE_VERSION"
    },
    {
      ...
    }
  ]
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// listFHIRStores prints a list of FHIR stores to w.
func listFHIRStores(w io.Writer, projectID, location, datasetID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s", projectID, location, datasetID)

	resp, err := storesService.List(parent).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("List: %w", err)
	}

	fmt.Fprintln(w, "FHIR stores:")
	for _, s := range resp.FhirStores {
		fmt.Fprintln(w, s.Name)
	}
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.FhirStore;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.ListFhirStoresResponse;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Collections;
import java.util.List;

public class FhirStoreList {
  private static final String DATASET_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreList(String datasetName) throws IOException {
    // String datasetName =
    //    String.format(DATASET_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Results are paginated, so multiple queries may be required.
    String pageToken = null;
    List<FhirStore> stores = new ArrayList<>();
    do {
      // Create request and configure any parameters.
      FhirStores.List request =
          client
              .projects()
              .locations()
              .datasets()
              .fhirStores()
              .list(datasetName)
              .setPageSize(100) // Specify pageSize up to 1000
              .setPageToken(pageToken);

      // Execute response and collect results.
      ListFhirStoresResponse response = request.execute();
      stores.addAll(response.getFhirStores());

      // Update the page token for the next request.
      pageToken = response.getNextPageToken();
    } while (pageToken != null);

    // Print results.
    System.out.printf("Retrieved %s Fhir stores: \n", stores.size());
    for (FhirStore data : stores) {
      System.out.println("\t" + data.toPrettyString());
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const listFhirStores = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}`;
  const request = {parent};

  const fhirStores =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.list(request);
  console.log(JSON.stringify(fhirStores.data));
};

listFhirStores();

Python

def list_fhir_stores(project_id, location, dataset_id):
    """Lists the FHIR stores in the given dataset.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )

    fhir_stores = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .list(parent=fhir_store_parent)
        .execute()
        .get("fhirStores", [])
    )

    for fhir_store in fhir_stores:
        print(fhir_store)

    return fhir_stores

Obter as capacidades ou a declaração de conformidade de um FHIR store

Os exemplos seguintes mostram como obter a declaração de capacidades (STU3 ou R4 ou R5) ou de conformidade (DSTU2) para um arquivo FHIR.

As informações nas capacidades ou na declaração de conformidade refletem as definições na loja FHIR. Por exemplo, se FhirStore.enableUpdateCreate estiver definido como true, isto reflete-se no campo CapabilityStatement.rest.resource.updateCreate da declaração de capacidades.

A tabela seguinte mostra o método da Cloud Healthcare API para obter as capacidades ou a declaração de conformidade de um FHIR store e a respetiva interação de especificação FHIR equivalente:

Método da Cloud Healthcare API	Interação com a especificação FHIR
`projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.capabilities`	capacidades (STU3, R4 ou R5) ou `conformance` (DSTU2)

Consola

A consola Google Cloud e a CLI gcloud não suportam esta ação. Em alternativa, use curl, o PowerShell ou o seu idioma preferido.

gcloud

A consola Google Cloud e a CLI gcloud não suportam esta ação. Em alternativa, use curl, o PowerShell ou o seu idioma preferido.

REST

Para obter as capacidades ou a declaração de conformidade de um FHIR store, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.capabilities.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/metadata"

PowerShell

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID/fhir/metadata" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

{
  "acceptUnknown": "both",
  "date": "YYYY-MM-DD",
  "description": "FHIR capability statement for the FHIR store specified by the request.",
  "experimental": true,
  "fhirVersion": "FHIR_STORE_VERSION",
  "format": [
    "json"
  ],
  "id": "FHIR_STORE_ID",
  "kind": "instance",
  "patchFormat": [
    "application/json-patch+json"
  ],
  "publisher": "Google",
  "resourceType": "CapabilityStatement",
  ...
  "status": "draft",
  "url": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  "version": "YYYYMMDD"
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// getFHIRMetadata gets FHIR store metadata.
func getFHIRMetadata(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	fhirService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores.Fhir

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	resp, err := fhirService.Capabilities(name).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Capabilities: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := io.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("Capabilities: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores.Fhir.Capabilities;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.HttpBody;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreGetMetadata {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreGetMetadata(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "project-id", "region-id", "dataset-id", "store-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Capabilities request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().fhir().capabilities(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    HttpBody response = request.execute();
    System.out.println("FHIR store metadata retrieved: " + response.toPrettyString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const getFhirStoreCapabilities = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}/fhir/metadata`;
  const request = {name};

  const fhirStore =
    await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.get(request);
  console.log(JSON.stringify(fhirStore.data, null, 2));
};

getFhirStoreCapabilities();

Python

def get_fhir_store_metadata(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Gets the FHIR capability statement (STU3, R4), or the conformance statement
    in the DSTU2 case for the store, which contains a description of functionality
    supported by the server.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    # Imports Python's built-in "json" module
    import json

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Instantiates an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store' # replace with the FHIR store ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    fhir_stores = client.projects().locations().datasets().fhirStores()
    response = fhir_stores.fhir().capabilities(name=fhir_store_name).execute()

    print(json.dumps(response, indent=2))
    return response

Definir o nível de validação do recurso base

Por predefinição, todos os recursos na sua loja FHIR têm a validação de recursos base aplicada. Esta validação garante que as seguintes condições são verdadeiras quando o recurso é criado:

Todos os campos obrigatórios estão definidos.
Todos os tipos de recursos referidos são válidos.
O recurso cumpre todas as restrições do FHIRPath.

Pode tornar a validação de recursos base menos rigorosa desativando um ou mais destes tipos de validação de recursos base para a sua loja FHIR.

Consola

A consola Google Cloud e a CLI gcloud não suportam esta ação. Em alternativa, use curl, o PowerShell ou o seu idioma preferido.

gcloud

A consola Google Cloud e a CLI gcloud não suportam esta ação. Em alternativa, use curl, o PowerShell ou o seu idioma preferido.

REST

Para desativar a validação de recursos base numa loja FHIR existente, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.patch.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
LOCATION: a localização do conjunto de dados
BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE: o tipo de validação de recursos base que quer desativar. Para desativar a validação, defina qualquer um dos seguintes campos como true:
- disableRequiredFieldValidation
- disableReferenceTypeValidation
- disableFhirpathValidation

Corpo JSON do pedido:

{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

cat > request.json << 'EOF'
{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}
EOF

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

curl -X PATCH \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
     -d @request.json \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=validationConfig"

PowerShell

Guarde o corpo do pedido num ficheiro denominado request.json. Execute o seguinte comando no terminal para criar ou substituir este ficheiro no diretório atual:

@'
{
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}
'@  | Out-File -FilePath request.json -Encoding utf8

Em seguida, execute o seguinte comando para enviar o seu pedido REST:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method PATCH `
    -Headers $headers `
    -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
    -InFile request.json `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID?updateMask=validationConfig" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte.

Se configurou campos no recurso FhirStore, estes também aparecem na resposta.

Resposta

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID",
  ...
  "version": "FHIR_STORE_VERSION",
  "validationConfig": {
    "BASE_RESOURCE_VALIDATION_TYPE": true
  }
}

Eliminar uma FHIR store

Os exemplos seguintes mostram como eliminar um FHIR store.

Consola

Para eliminar um arquivo de dados:

Na Google Cloud consola, aceda à página Conjuntos de dados.
Aceda aos conjuntos de dados
Selecione o conjunto de dados que contém o arquivo de dados que quer eliminar.
Escolha Eliminar na lista pendente Ações para o arquivo de dados que quer eliminar.
Para confirmar, escreva o nome do arquivo de dados e, de seguida, clique em Eliminar.

gcloud

Para eliminar uma FHIR store, execute o comando gcloud healthcare fhir-stores delete.

Antes de usar qualquer um dos dados de comandos abaixo, faça as seguintes substituições:

LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR

Execute o seguinte comando:

Linux, macOS ou Cloud Shell

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION

Windows (PowerShell)

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID `
  --dataset=DATASET_ID `
  --location=LOCATION

Windows (cmd.exe)

gcloud healthcare fhir-stores delete FHIR_STORE_ID ^
  --dataset=DATASET_ID ^
  --location=LOCATION

Deve receber uma resposta semelhante à seguinte:

Deleted fhirStore [FHIR_STORE_ID].

REST

Para eliminar uma FHIR store, use o método projects.locations.datasets.fhirStores.delete.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
LOCATION: a localização do conjunto de dados
DATASET_ID: o conjunto de dados principal do FHIR store
FHIR_STORE_ID: o ID da loja FHIR

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Execute o seguinte comando:

curl -X DELETE \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID"

PowerShell

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method DELETE `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

{}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// deleteFHIRStore deletes an FHIR store.
func deleteFHIRStore(w io.Writer, projectID, location, datasetID, fhirStoreID string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.FhirStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s", projectID, location, datasetID, fhirStoreID)

	if _, err := storesService.Delete(name).Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Delete: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Deleted FHIR store: %q\n", fhirStoreID)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.FhirStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class FhirStoreDelete {
  private static final String FHIR_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/fhirStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void fhirStoreDelete(String fhirStoreName) throws IOException {
    // String fhirStoreName =
    //    String.format(
    //        FHIR_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-fhir-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    FhirStores.Delete request =
        client.projects().locations().datasets().fhirStores().delete(fhirStoreName);

    // Execute the request and process the results.
    request.execute();
    System.out.println("FHIR store deleted.");
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const deleteFhirStore = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const fhirStoreId = 'my-fhir-store';
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/fhirStores/${fhirStoreId}`;
  const request = {name};

  await healthcare.projects.locations.datasets.fhirStores.delete(request);
  console.log(`Deleted FHIR store: ${fhirStoreId}`);
};

deleteFhirStore();

Python

def delete_fhir_store(project_id, location, dataset_id, fhir_store_id):
    """Deletes the specified FHIR store.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/fhir
    before running the sample."""
    # Imports the Google API Discovery Service.
    from googleapiclient import discovery

    api_version = "v1"
    service_name = "healthcare"
    # Returns an authorized API client by discovering the Healthcare API
    # and using GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS environment variable.
    client = discovery.build(service_name, api_version)

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the FHIR store's parent dataset
    # fhir_store_id = 'my-fhir-store'  # replace with the FHIR store's ID
    fhir_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, location, dataset_id
    )
    fhir_store_name = f"{fhir_store_parent}/fhirStores/{fhir_store_id}"

    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .fhirStores()
        .delete(name=fhir_store_name)
    )

    response = request.execute()
    print(f"Deleted FHIR store: {fhir_store_id}")

    return response

O que se segue?

Saiba como criar e trabalhar com recursos FHIR.

Criação e gestão de FHIR stores Mantenha tudo organizado com as coleções Salve e categorize o conteúdo com base nas suas preferências.

Criar uma loja FHIR

Consola

gcloud

Linux, macOS ou Cloud Shell

Windows (PowerShell)

Windows (cmd.exe)

Resposta

REST

curl

PowerShell

Explorador de APIs

Resposta

Go

Java

Node.js

Python

Editar uma loja FHIR

Consola

gcloud

Linux, macOS ou Cloud Shell

Windows (PowerShell)

Windows (cmd.exe)

Resposta

REST

curl

PowerShell

Explorador de APIs

Resposta

Go

Java

Node.js

Python

Obter detalhes da loja FHIR

Consola

gcloud

Linux, macOS ou Cloud Shell

Windows (PowerShell)

Windows (cmd.exe)

Resposta

REST

curl

PowerShell

Explorador de APIs

Resposta

Go

Java

Node.js

Python

Apresentar em lista os armazenamentos de FHIR num conjunto de dados

Consola

gcloud

Linux, macOS ou Cloud Shell

Windows (PowerShell)

Windows (cmd.exe)

REST

curl

PowerShell

Explorador de APIs

Resposta

Go

Java

Node.js

Python

Obter as capacidades ou a declaração de conformidade de um FHIR store

Consola

gcloud

REST

curl

PowerShell

Explorador de APIs

Resposta

Go

Java

Node.js

Python

Definir o nível de validação do recurso base

Consola

gcloud

REST

Criação e gestão de FHIR stores