Usar a norma DICOMweb

Esta página explica como usar a implementação da Cloud Healthcare API do DICOMweb para armazenar e gerir dados de imagens DICOM.

Para mais informações sobre como a Cloud Healthcare API implementa vários serviços REST DICOMweb, consulte a declaração de conformidade com DICOM.

A implementação do DICOMweb na Cloud Healthcare API só suporta REST e não RPC.

Instale a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API

Vários dos exemplos nesta página usam a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API, uma ferramenta de código aberto que simplifica a forma de interagir com servidores DICOMweb. A ferramenta oferece funcionalidades para armazenar, obter, eliminar e pesquisar ficheiros DICOM. A página do GitHub para a ferramenta contém mais informações, como requisitos de instalação detalhados e formas de personalizar a ferramenta.

A ferramenta é executada através do Python. Para obter informações sobre como configurar o Python no Google Cloud, consulte Configurar um ambiente de desenvolvimento Python.

Depois de configurar o Python, pode instalar a ferramenta através do Pip:

pip install https://github.com/GoogleCloudPlatform/healthcare-api-dicomweb-cli/archive/v1.0.zip

Para usar a ferramenta, tem de se autenticar nos Google Cloud servidores. Pode fazê-lo através de um dos seguintes métodos:

• Definir a variável de ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS
• Autenticação através da CLI do Google Cloud com gcloud auth application-default login

Depois de configurar qualquer uma destas opções, a ferramenta deteta automaticamente as suas credenciais.

Armazene dados DICOM

Antes de poder armazenar dados DICOM, tem de criar um arquivo DICOM.

A Cloud Healthcare API implementa o serviço Web RESTful Store transaction quando armazena dados DICOM. Para mais informações, consulte a secção Transação da loja na declaração de conformidade com a norma DICOM da API Cloud Healthcare.

Nota: para fluxos de trabalho grandes com volumes de dados elevados, recomendamos que use a importação DICOM para um desempenho ideal.

Armazene dados DICOM através de um dos seguintes métodos. Inclua o cabeçalho application/dicom Accept no seu pedido.

• Armazene uma instância DICOM: normalmente, um ficheiro .dcm.

• Armazene vários itens através de uma mensagem de várias partes (multipart): crie um ficheiro multipart com várias partes de dados separadas por um limite. No seu pedido, defina Content-Type como multipart/related; type=application/dicom; boundary=BOUNDARY, onde BOUNDARY é um valor definido pelo utilizador que indica as diferentes partes da mensagem. Consulte a RFC 1341 para ver detalhes sobre a criação de mensagens multipartes.

  Use mensagens multipartes para armazenar os seguintes tipos de dados DICOM:

  • Estudos ou séries DICOM que contêm várias instâncias. Separe cada instância com um limite. Para obter instruções, consulte o artigo Armazene um estudo ou uma série DICOM através de uma mensagem multipartes.
  • Metadados JSON DICOM com ficheiros JPEG. Separe cada conjunto de dados com um limite. Para ver instruções, consulte o artigo Crie instâncias DICOM a partir de metadados JSON e imagens JPEG.

Os valores SOP_CLASS_UID, SOP_INSTANCE_UID, STUDY_INSTANCE_UID e SERIES_INSTANCE_UID são preenchidos a partir dos metadados fornecidos. Os UIDs têm de cumprir os seguintes requisitos:

• Contêm apenas valores numéricos separados por pontos.
• Não contenham informações de saúde protegidas (PHI).

Os exemplos seguintes mostram como armazenar uma instância num arquivo DICOM. Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

Armazene uma instância DICOM

Os exemplos seguintes mostram como armazenar uma instância DICOM. Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: o caminho para um ficheiro de instância DICOM no seu computador local que termina com o sufixo .dcm

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

curl -X POST \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: application/dicom" \
     --data-binary @DICOM_INSTANCE_FILE \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method POST `
    -Headers $headers `
    -InFile DICOM_INSTANCE_FILE `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand Content

O resultado é a seguinte resposta XML:

Resposta

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Go

import (
	"bytes"
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebStoreInstance stores the given dicomFile with the dicomWebPath.
func dicomWebStoreInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath, dicomFile string) error {
	ctx := context.Background()

	dicomData, err := os.ReadFile(dicomFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.ReadFile: %w", err)
	}

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.StoreInstances(parent, dicomWebPath, bytes.NewReader(dicomData))
	call.Header().Set("Content-Type", "application/dicom")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("StoreInstances: %w", err)
	}
	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := io.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("could not read response: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("StoreInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	fmt.Fprintf(w, "%s", respBytes)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.net.URISyntaxException;
import java.nio.file.Files;
import java.nio.file.Paths;
import java.util.Collections;
import org.apache.http.HttpEntity;
import org.apache.http.HttpResponse;
import org.apache.http.HttpStatus;
import org.apache.http.client.HttpClient;
import org.apache.http.client.methods.HttpUriRequest;
import org.apache.http.client.methods.RequestBuilder;
import org.apache.http.client.utils.URIBuilder;
import org.apache.http.entity.ByteArrayEntity;
import org.apache.http.impl.client.HttpClients;

public class DicomWebStoreInstance {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebStoreInstance(String dicomStoreName, String filePath)
      throws IOException, URISyntaxException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String filePath = "path/to/file.dcm";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    HttpClient httpClient = HttpClients.createDefault();
    String uri = String.format("%sv1/%s/dicomWeb/studies", client.getRootUrl(), dicomStoreName);
    URIBuilder uriBuilder = new URIBuilder(uri).setParameter("access_token", getAccessToken());
    // Load the data from file representing the study.
    File f = new File(filePath);
    byte[] dicomBytes = Files.readAllBytes(Paths.get(filePath));
    ByteArrayEntity requestEntity = new ByteArrayEntity(dicomBytes);

    HttpUriRequest request =
        RequestBuilder.post(uriBuilder.build())
            .setEntity(requestEntity)
            .addHeader("Content-Type", "application/dicom")
            .build();

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = httpClient.execute(request);
    HttpEntity responseEntity = response.getEntity();
    if (response.getStatusLine().getStatusCode() != HttpStatus.SC_OK) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception storing DICOM instance: %s\n", response.getStatusLine().toString()));
      responseEntity.writeTo(System.err);
      throw new RuntimeException();
    }
    System.out.println("DICOM instance stored: ");
    responseEntity.writeTo(System.out);
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }

  private static String getAccessToken() throws IOException {
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    return credential.refreshAccessToken().getTokenValue();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');

const dicomWebStoreInstance = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const dcmFile = 'file.dcm';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'studies';
  // Use a stream because other types of reads overwrite the client's HTTP
  // headers and cause storeInstances to fail.
  const binaryData = fs.createReadStream(dcmFile);
  const request = {
    parent,
    dicomWebPath,
    requestBody: binaryData,
  };

  const instance =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances(
      request,
      {
        headers: {
          'Content-Type': 'application/dicom',
          Accept: 'application/dicom+json',
        },
      }
    );
  console.log('Stored DICOM instance:\n', JSON.stringify(instance.data));
};

dicomWebStoreInstance();

Python

def dicomweb_store_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, dcm_file):
    """Handles the POST requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # dcm_file = 'dicom000_0001.dcm'  # replace with a DICOM file
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    with open(dcm_file, "rb") as dcm:
        dcm_content = dcm.read()

    # Sets required "application/dicom" header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom"}

    response = session.post(dicomweb_path, data=dcm_content, headers=headers)
    response.raise_for_status()
    print("Stored DICOM instance:")
    print(response.text)
    return response

Armazene um estudo ou uma série DICOM através de uma mensagem multipart

Os exemplos seguintes mostram como armazenar um estudo ou uma série DICOM, que consiste em várias instâncias, através de uma mensagem multipartes.

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• MULTIPART_FILE: o caminho para um ficheiro multipart no seu computador local. O ficheiro contém várias instâncias DICOM, com cada uma separada por um limite.
• BOUNDARY: o limite usado para separar as instâncias DICOM no ficheiro de várias partes

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

curl -X POST \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     -H "Content-Type: multipart/related; type=application/dicom; boundary=BOUNDARY" \
     --data-binary @MULTIPART_FILE \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method POST `
    -Headers $headers `
    -InFile MULTIPART_FILE `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand Content

O resultado é semelhante ao seguinte, com várias instâncias devolvidas:

Resposta

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Especifique uma classe de armazenamento para instâncias DICOM

Pré-visualização

Esta secção descreve as funcionalidades de pré-visualização que estão sujeitas a alterações e podem ter apoio técnico limitado. As alterações aos produtos e às funcionalidades de pré-DG podem não ser compatíveis com outras versões de pré-DG. Para mais informações, consulte os Termos da Oferta Pré-GA para a API Cloud Healthcare e as descrições da fase de lançamento.

Por predefinição, o método projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances armazena uma instância DICOM num arquivo DICOM com uma classe de armazenamento padrão. Pode definir a classe de armazenamento quando armazena objetos DICOM a partir do seu computador local. Para mais informações, consulte o artigo Altere a classe de armazenamento DICOM.

Os exemplos seguintes mostram como especificar a classe de armazenamento quando armazena objetos DICOM a partir do seu computador local.

curl

Use o método projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances. Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: o caminho para um ficheiro de instância DICOM no seu computador local que termina com o sufixo .dcm
• STORAGE_CLASS: a classe de armazenamento da instância DICOM no arquivo DICOM de STANDARD,NEARLINE, COLDLINE e ARCHIVE

curl -X POST \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Storage-Class: STORAGE_CLASS" \
    --data-binary @DICOM_INSTANCE_FILE \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies"

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve a resposta:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

PowerShell

Use o método projects.locations.datasets.dicomStores.storeInstances.

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• DICOM_INSTANCE_FILE: o caminho para um ficheiro de instância DICOM no seu computador local que termina com o sufixo .dcm
• STORAGE_CLASS: a classe de armazenamento da instância DICOM no arquivo DICOM de STANDARD,NEARLINE, COLDLINE e ARCHIVE

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred"; "Storage-Class" = "STORAGE_CLASS" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/dicom" `
  -InFile DCM_FILE.dcm `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies" | Select-Object -Expand Content

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve a resposta no formato JSON:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1beta1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Crie instâncias DICOM a partir de metadados JSON e imagens JPEG

A Cloud Healthcare API pode criar instâncias DICOM através de um ficheiro de metadados JSON e um ficheiro JPEG. Criar instâncias DICOM a partir de metadados JSON e um ficheiro JPEG se preferir não fazer a análise e a serialização DICOM, uma vez que a Cloud Healthcare API pode realizar estas tarefas por si.

O pedido HTTP que armazena estes dados tem de incluir o seguinte no Content-Type do pedido:

• O tipo de suporte multipart/related
• O tipo MIME application/dicom+json
• Um separador boundary

Os exemplos seguintes mostram como armazenar um ficheiro de metadados JSON com um ficheiro JPEG.

curl

O exemplo seguinte pressupõe que tem uma imagem JPEG existente.

O armazenamento de um ficheiro de metadados JSON com uma imagem JPEG compreende três passos:

1. Crie um ficheiro que contenha uma representação JSON de uma instância DICOM com uma imagem JPEG. Segue-se um ficheiro de modelo.

2. Crie três ficheiros de limites:

   • opening.file: contém o limite de abertura do ficheiro de metadados JSON
   • middle.file: contém o limite intermédio da imagem JPEG
   • closing.file: contém o limite de fecho de todas as partes da mensagem

3. Crie um ficheiro denominado multipart-request.file incluindo o ficheiro de metadados JSON e a imagem JPEG nos ficheiros de limite.

Tenha em atenção os seguintes valores que são fornecidos por predefinição no ficheiro de modelo de metadados JSON:

• O UID da sintaxe de transferência (1.2.840.10008.1.2.4.50) designa a sintaxe de transferência como JPEG Baseline. A maioria das imagens JPEG está no formato JPEG Baseline. O valor de interpretação fotométrica (YBR_FULL_422) significa que a imagem está a cores e não em tons de cinzento.
• BulkDataUri é um descritor arbitrário para a imagem e, no modelo, está definido como jpeg-image. Este valor é usado quando cria o limite da imagem.

Os valores de SOP_CLASS_UID, SOP_INSTANCE_UID, STUDY_INSTANCE_UID e SERIES_INSTANCE_UID podem ser qualquer valor numérico separado por pontos. O DICOM usa uma hierarquia de identificadores para instâncias, pacientes, estudos e séries. Por isso, escolha um conjunto lógico de identificadores para estas variáveis.

Substitua SOP Class UID por um valor da tabela de classes SOP padrão que designa o tipo de imagem que está a ser armazenada.

Nota: consoante a classe SOP que usar, pode ter de adicionar mais etiquetas ao ficheiro de metadados JSON. Por exemplo, se estiver a usar uma imagem de ressonância magnética (imagem RM), consulte a Tabela A.4-1. MR Image IOD Modules para determinar as etiquetas necessárias.

Substitua Rows pela altura vertical da imagem JPEG em píxeis. Substitua Columns pela largura horizontal da imagem JPEG em píxeis.

Conclua os seguintes passos:

1. Guarde o texto seguinte num ficheiro denominado instance.json, substituindo as variáveis onde especificado.

   [{
    "00020010":{"vr":"UI","Value":["1.2.840.10008.1.2.4.50"]},
    "00080005":{"vr":"CS","Value":["ISO_IR 192"]},
    "00080016":{"vr":"UI","Value":["SOP_CLASS_UID"]},
    "00080018":{"vr":"UI","Value":["SOP_INSTANCE_UID"]},
    "0020000D":{"vr":"UI","Value":["STUDY_INSTANCE_UID"]},
    "0020000E":{"vr":"UI","Value":["SERIES_INSTANCE_UID"]},
    "00280002":{"vr":"US","Value":[3]},
    "00280004":{"vr":"CS","Value":["YBR_FULL_422"]},
    "00280006":{"vr":"US","Value":[0]},
    "00280008":{"vr":"IS","Value":[1]},
    "00280010":{"vr":"US","Value":[Rows]},
    "00280011":{"vr":"US","Value":[Columns]},
    "00280100":{"vr":"US","Value":[8]},
    "00280101":{"vr":"US","Value":[8]},
    "00280102":{"vr":"US","Value":[7]},
    "00280103":{"vr":"US","Value":[0]},
    "7FE00010":{"vr":"OB","BulkDataURI":"jpeg-image"}
   }]

2. Para criar os limites de abertura (para os metadados JSON), intermédios (para a imagem JPEG) e de fecho, execute os seguintes comandos:

   echo -ne "--DICOMwebBoundary\r\nContent-Type: application/dicom+json\r\n\r\n" > opening.file
   echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary\r\nContent-Location: jpeg-image\r\nContent-Type: image/jpeg; transfer-syntax=1.2.840.10008.1.2.4.50\r\n\r\n" > middle.file
   echo -ne "\r\n--DICOMwebBoundary--" > closing.file

3. Envolva a imagem JPEG nos limites intermédios e finais. O ficheiro de saída, que envia para a Cloud Healthcare API, chama-se multipart-request.file:

   cat opening.file instance.json middle.file image.jpg closing.file > multipart-request.file

4. Faça um pedido POST e especifique as seguintes informações:

   • O nome do conjunto de dados principal
   • O nome do arquivo DICOM
   • O ficheiro multipart-request.file
   • Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra um pedido POST através de curl.

curl -X POST \
    -H "Content-Type: multipart/related; type=\"application/dicom+json\"; boundary=DICOMwebBoundary" \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies \
    --data-binary @multipart-request.file

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve a resposta no formato XML:

<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
    <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00081199" vr="SQ" keyword="ReferencedSOPSequence">
    <Item number="1">
      <DicomAttribute tag="00081150" vr="UI" keyword="ReferencedSOPClassUID">
        <Value number="1">SOP_CLASS_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081155" vr="UI" keyword="ReferencedSOPInstanceUID">
        <Value number="1">SOP_INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
      <DicomAttribute tag="00081190" vr="UR" keyword="RetrieveURL">
        <Value number="1">https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID</Value>
      </DicomAttribute>
    </Item>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Use a DICOMweb CLI

Os exemplos seguintes mostram como usar a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API para armazenar uma ou mais instâncias DICOM. Estão disponíveis mais amostras no repositório do GitHub da DICOMweb CLI.

Armazenamento de uma única instância DICOM:

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  store DCM_FILE

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve uma resposta semelhante ao exemplo seguinte:

TIMESTAMP -- DCM_FILE.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Armazenar vários ficheiros em paralelo com carateres universais:

O exemplo seguinte mostra como armazenar recursivamente vários ficheiros DICOM em paralelo a partir do diretório de trabalho atual. Para armazenar os ficheiros em paralelo, adicione a flag -m.

dcmweb -m \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  store "./**.dcm"

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve uma resposta semelhante ao exemplo seguinte:

TIMESTAMP -- DCM_FILE_1.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- DCM_FILE_2.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
TIMESTAMP -- DCM_FILE_3.dcm uploaded as https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID TIMESTAMP -- INSTANCE_UID
...
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Pesquise dados DICOM

Pode pesquisar estudos, séries, instâncias e frames. Os exemplos seguintes mostram uma implementação da transação de pesquisa para pesquisar instâncias numa loja DICOM. Para mais informações, consulte Transação de pesquisa na declaração de conformidade DICOM da API Cloud Healthcare.

Os exemplos seguintes mostram como pesquisar instâncias num arquivo DICOM. Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.searchForInstances.

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/instances" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

[
   {
      "00080005":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "00080016":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080018":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080020":{
         "vr":"DA",
         "Value":[
            "DATE_TIME"
         ]
      },
      "00080030":{
         "vr":"TM",
         "Value":[
            "TIME"
         ]
      },
      "00080060":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "0008103E":{
         "vr":"LO",
         "Value":[
            "LONG_STRING"
         ]
      },
      "00100010":{
         "vr":"PN",
         "Value":[
            {
               "Alphabetic":"Anonymized"
            }
         ]
      },
   },
...
]

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebSearchInstances searches instances.
func dicomWebSearchInstances(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	resp, err := storesService.SearchForInstances(parent, "instances").Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := io.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ioutil.ReadAll: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("SearchForInstances: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}

	respString := string(respBytes)
	fmt.Fprintf(w, "Found instances: %s\n", respString)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebSearchForInstances {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebSearchForInstances(String dicomStoreName) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.SearchForInstances request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .searchForInstances(dicomStoreName, "instances");

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();
    System.out.println("Dicom store instances found: \n" + response.toString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebSearchForInstances = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'instances';
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const instances =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.searchForInstances(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'application/dicom+json,multipart/related'},
      }
    );
  console.log(`Found ${instances.data.length} instances:`);
  console.log(JSON.stringify(instances.data));
};

dicomWebSearchForInstances();

Python

def dicomweb_search_instance(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Handles the GET requests specified in DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/instances".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    # Sets required application/dicom+json; charset=utf-8 header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom+json; charset=utf-8"}

    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    instances = response.json()

    print("Instances:")
    print(json.dumps(instances, indent=2))

    return instances

Pesquise através de etiquetas DICOM

Pode refinar as suas pesquisas anexando etiquetas DICOM aos seus pedidos sob a forma de parâmetros de consulta. Por exemplo, pode querer pesquisar estudos que contenham o nome de um paciente.

Tal como nos exemplos anteriores, os exemplos seguintes mostram uma implementação da transação de pesquisa para pesquisar estudos numa loja DICOM. No entanto, estes exemplos mostram como pesquisar estudos em que o nome do paciente é "Sally Zhang".

O exemplo seguinte mostra uma parte dos metadados de uma instância DICOM onde o nome do paciente está listado:

...
{
  "vr": "PN",
  "Value": [
    {
      "Alphabetic": "Sally Zhang"
    }
  ]
}
...

Para pesquisar estudos numa loja DICOM relacionados com o paciente, adicione um parâmetro de consulta ao seu pedido, onde pesquisa pela etiqueta DICOM PatientName. Para ver uma lista dos parâmetros de pesquisa suportados na Cloud Healthcare API, consulte a documentação da transação de pesquisa.

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: Certifique-se de que definiu a variável de ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS para o caminho do ficheiro de chave privada da sua conta de serviço.

Nota: pode adicionar a correspondência aproximada quando pesquisar por PatientName definindo o parâmetro de consulta abaixo como ?PatientName=Sally%20Zhang&fuzzymatching=true. A correspondência aproximada executa a tokenização e a normalização no valor de PatientName na consulta e no valor armazenado. Há correspondência se qualquer token de pesquisa for um prefixo de qualquer token armazenado. Por exemplo, se PatientName for Sally%20Zhang, então sa, Zh e Sally^Zhang correspondem. No entanto, ally não corresponde.

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies?PatientName=Sally%20Zhang"

PowerShell

Nota: Certifique-se de que definiu a variável de ambiente GOOGLE_APPLICATION_CREDENTIALS para o caminho do ficheiro de chave privada da sua conta de serviço.

Nota: pode adicionar a correspondência aproximada quando pesquisar por PatientName definindo o parâmetro de consulta abaixo como ?PatientName=Sally%20Zhang&fuzzymatching=true. A correspondência aproximada executa a tokenização e a normalização no valor de PatientName na consulta e no valor armazenado. Há correspondência se qualquer token de pesquisa for um prefixo de qualquer token armazenado. Por exemplo, se PatientName for Sally%20Zhang, então sa, Zh e Sally^Zhang correspondem. No entanto, ally não corresponde.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies?PatientName=Sally%20Zhang" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

[
  {
    "00080005": {
      "vr": "CS",
      "Value": [
        "CODE_STRING"
      ]
    },
    "00080020": {
      "vr": "DA",
      "Value": [
        "DATE_TIME"
      ]
    },
    "00080030": {
      "vr": "TM",
      "Value": [
        "TIME"
      ]
    },
    "00080050": {
      "vr": "SH"
    },
    "00080090": {
      "vr": "PN",
      "Value": [
        {
          "Alphabetic": "VALUE"
        }
      ]
    },
    "00100010": {
      "vr": "PN",
      "Value": [
        {
          "Alphabetic": "Sally Zhang"
        }
      ]
    },
    "00100020": {
      "vr": "LO",
      "Value": [
        "VALUE"
      ]
    },
    "00100030": {
      "vr": "DA"
    },
    "00100040": {
      "vr": "CS",
      "Value": [
        "F"
      ]
    },
    "0020000D": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "STUDY_INSTANCE_UID"
      ]
    },
    "00200010": {
      "vr": "SH"
    }
  }
]

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// queryParamOpt is a googleapi.Option (https://godoc.org/google.golang.org/api/googleapi#CallOption)
// that adds query parameters to an API call.
type queryParamOpt struct {
	key, value string
}

func (qp queryParamOpt) Get() (string, string) { return qp.key, qp.value }

// dicomWebSearchStudies refines a DICOMweb studies search by appending DICOM tags to the request.
func dicomWebSearchStudies(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.SearchForStudies(name, dicomWebPath)
	// Refine your search by appending DICOM tags to the
	// request in the form of query parameters. This sample
	// searches for studies containing a patient's name.
	patientName := queryParamOpt{key: "PatientName", value: "Sally Zhang"}
	resp, err := call.Do(patientName)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Get: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	respBytes, err := io.ReadAll(resp.Body)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("ioutil.ReadAll: %w", err)
	}

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("SearchForStudies: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, respBytes)
	}
	respString := string(respBytes)
	if len(respString) > 0 {
		fmt.Fprintf(w, "Found studies: %s\n", respString)
	} else {
		fmt.Println("No studies found.")
	}

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebSearchStudies {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebSearchStudies(String dicomStoreName) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    DicomStores.SearchForStudies request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .searchForStudies(dicomStoreName, "studies")
            // Refine your search by appending DICOM tags to the
            // request in the form of query parameters. This sample
            // searches for studies containing a patient's name.
            .set("PatientName", "Sally Zhang");

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();
    System.out.println("Studies found: \n" + response.toString());
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebSearchStudies = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = 'studies';
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const studies =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.searchForStudies(
      request,
      {
        // Refine your search by appending DICOM tags to the
        // request in the form of query parameters. This sample
        // searches for studies containing a patient's name.
        params: {PatientName: 'Sally Zhang'},
        headers: {Accept: 'application/dicom+json'},
      }
    );
  console.log(studies);

  console.log(`Found ${studies.data.length} studies:`);
  console.log(JSON.stringify(studies.data));
};

dicomWebSearchStudies();

Python

def dicomweb_search_studies(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    # Refine your search by appending DICOM tags to the
    # request in the form of query parameters. This sample
    # searches for studies containing a patient's name.
    params = {"PatientName": "Sally Zhang"}

    response = session.get(dicomweb_path, params=params)

    response.raise_for_status()

    print(f"Studies found: response is {response}")

    # Uncomment the following lines to process the response as JSON.
    # patients = response.json()
    # print('Patients found matching query:')
    # print(json.dumps(patients, indent=2))

    # return patients

Use a DICOMweb CLI

O exemplo seguinte mostra como usar a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API para pesquisar instâncias num arquivo DICOM. Estão disponíveis mais exemplos, incluindo como filtrar a sua pesquisa, no repositório do GitHub da DICOMweb CLI.

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  search instances

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve a resposta no formato JSON:

[
   {
      "00080005":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "00080016":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080018":{
         "vr":"UI",
         "Value":[
            "UNIQUE_IDENTIFIER"
         ]
      },
      "00080020":{
         "vr":"DA",
         "Value":[
            "DATE_TIME"
         ]
      },
      "00080030":{
         "vr":"TM",
         "Value":[
            "TIME"
         ]
      },
      "00080060":{
         "vr":"CS",
         "Value":[
            "CODE_STRING"
         ]
      },
      "0008103E":{
         "vr":"LO",
         "Value":[
            "LONG_STRING"
         ]
      },
      "00100010":{
         "vr":"PN",
         "Value":[
            {
               "Alphabetic":"Anonymized"
            }
         ]
      },
   },

...

]

Recupere dados DICOM

A Cloud Healthcare API implementa a transação de obtenção para obter estudos, séries, instâncias e frames num arquivo DICOM.

Para mais informações, consulte Recuperar transação na declaração de conformidade DICOM da API Cloud Healthcare.

Recupere um estudo

Os exemplos seguintes mostram como obter um estudo. Para mais informações, consulte DICOM study/series/instances na declaração de conformidade com DICOM da Cloud Healthcare API.

Quando especificar o ficheiro de saída, use uma extensão como .multipart. Em seguida, analise o ficheiro multipartes para obter as séries e as instâncias individuais no estudo.

Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.studies.retrieveStudy.

curl

Para obter um estudo, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• Um ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra um pedido GET através de curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" \
     --output FILENAME.multipart

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro DICOM é escrito no seu computador.

PowerShell

Para obter um estudo, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• Um ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra um pedido GET através do Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" | Select-Object -Expand Content
  -OutFile FILENAME.multipart `

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro DICOM é escrito no seu computador.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveStudy retrieves all instances in the given dicomWebPath
// study.
func dicomWebRetrieveStudy(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.111396399857604"
	// outputFile := "study.multipart"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	resp, err := storesService.RetrieveStudy(parent, dicomWebPath).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveStudy: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveStudy: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	// When specifying the output file, use an extension like ".multipart".
	// Then, parse the downloaded multipart file to get each individual DICOM
	// file.
	fmt.Fprintf(w, "Study retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveStudy {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveStudy(String dicomStoreName, String studyId)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String studyId = "your-study-id";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Studies.RetrieveStudy request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .retrieveStudy(dicomStoreName, "studies/" + studyId);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    // When specifying the output file, use an extension like ".multipart".
    // Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
    // DICOM file.
    String outputPath = "study.multipart";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM study written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format("Exception retrieving DICOM study: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    // The response's default transfer syntax is Little Endian Explicit.
    // As a result, if the file was uploaded using a compressed transfer syntax,
    // the returned object will be decompressed. This can negatively impact performance and lead
    // to errors for transfer syntaxes that the Cloud Healthcare API doesn't support.
    // To avoid these issues, and if the returned object's transfer syntax doesn't matter to
    // your application, use the
    // multipart/related; type="application/dicom"; transfer-syntax=* Accept Header.
    headers.setAccept("multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
// When specifying the output file, use an extension like ".multipart."
// Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
// DICOM file.
const fileName = 'study_file.multipart';

const dicomWebRetrieveStudy = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const study =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.retrieveStudy(
      request,
      {
        headers: {
          Accept:
            'multipart/related; type=application/dicom; transfer-syntax=*',
        },
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );

  const fileBytes = Buffer.from(study.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved study and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveStudy();

Python

def dicomweb_retrieve_study(
    project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.227'  # replace with the study UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
    )

    # When specifying the output file, use an extension like ".multipart."
    # Then, parse the downloaded multipart file to get each individual
    # DICOM file.
    file_name = "study.multipart"

    response = session.get(dicomweb_path)

    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(f"Retrieved study and saved to {file_name} in current directory")

    return response

Obtenha uma instância

Os exemplos seguintes mostram como obter uma instância. Para mais informações, consulte as instâncias DICOM na declaração de conformidade DICOM da Cloud Healthcare API.

Se estiver a obter uma instância, pode evitar ter de analisar limites de várias partes usando o cabeçalho HTTP Accept: application/dicom. A adição de transfer-syntax=* evita a transcodificação, devolvendo o ficheiro no formato em que foi originalmente armazenado.

Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveInstance.

curl

Para obter uma instância, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• O UID da série e o UID da instância
• Um nome de ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra um pedido GET através de curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: application/dicom; transfer-syntax=*" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID" \
     --output FILENAME.dcm

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro DICOM é escrito no seu computador.

PowerShell

Para obter uma instância, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• O UID da série
• O UID da instância
• Um nome de ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra um pedido GET através do Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "application/dicom; transfer-syntax=*" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID"
  -OutFile FILENAME.dcm `

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro DICOM é escrito no seu computador.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveInstance retrieves a specific instance.
func dicomWebRetrieveInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1113639985/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1953511724/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.9562821369"
	// outputFile := "instance.dcm"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.RetrieveInstance(parent, dicomWebPath)
	call.Header().Set("Accept", "application/dicom; transfer-syntax=*")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveInstance: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveInstance: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "DICOM instance retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveInstance {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final String DICOMWEB_PATH = "studies/%s/series/%s/instances/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveInstance(String dicomStoreName, String dicomWebPath)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String dicomWebPath = String.format(DICOMWEB_PATH, "your-study-id", "your-series-id",
    // "your-instance-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Instances.RetrieveInstance request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .series()
            .instances()
            .retrieveInstance(dicomStoreName, dicomWebPath);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    String outputPath = "instance.dcm";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM instance written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format("Exception retrieving DICOM instance: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    headers.set("X-GFE-SSL", "yes");
    // Avoid parsing multipart boundaries by setting 'application/dicom' HTTP header.
    // Add 'transfer-syntax=*' to avoid transcoding by returning the file in the format it
    // was originally stored in.
    headers.setAccept("application/dicom; transfer-syntax=*");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
const fileName = 'instance_file.dcm';

const dicomWebRetrieveInstance = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  // const seriesUid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633';
  // const instanceUid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}/series/${seriesUid}/instances/${instanceUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const instance =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveInstance(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'application/dicom; transfer-syntax=*'},
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );
  const fileBytes = Buffer.from(instance.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved DICOM instance and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveInstance();

Python

def dicomweb_retrieve_instance(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    dicom_store_id,
    study_uid,
    series_uid,
    instance_uid,
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    # series_uid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633'  # replace with the series UID
    # instance_uid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148'  # replace with the instance UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicom_store_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    dicomweb_path = "{}/dicomWeb/studies/{}/series/{}/instances/{}".format(
        dicom_store_path, study_uid, series_uid, instance_uid
    )

    file_name = "instance.dcm"

    # Set the required Accept header on the request
    headers = {"Accept": "application/dicom; transfer-syntax=*"}
    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(
            "Retrieved DICOM instance and saved to {} in current directory".format(
                file_name
            )
        )

    return response

Recupere formatos de imagem do consumidor

Os exemplos seguintes mostram como obter um formato de imagem de consumidor, como JPEG ou PNG, através da implementação da API Cloud Healthcare de recursos renderizados. Para mais informações, consulte os recursos renderizados na declaração de conformidade DICOM da Cloud Healthcare API.

Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveRendered.

Nota: se estiver a renderizar uma imagem com vários frames, use o método frames.retrieveFrames em vez do método frames.retrieveRendered porque frames.retrieveRendered não suporta imagens com vários frames.

curl

Para obter uma imagem, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• O UID da série
• O UID da instância
• Um nome de ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra como obter uma imagem PNG com um pedido GET através de curl.

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
     -H "Accept: image/png" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/rendered" \
     --output FILENAME.png

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro PNG é escrito no seu computador.

PowerShell

Para obter uma imagem, faça um pedido GET e especifique as seguintes informações:

• O nome do conjunto de dados principal
• O nome do arquivo DICOM
• O identificador único (UID) do estudo
• O UID da série
• O UID da instância
• Um nome de ficheiro de saída
• Uma chave de acesso

O exemplo seguinte mostra como obter uma imagem PNG com um pedido GET através do Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred"; Accept = "image/png" }

Invoke-RestMethod `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/rendered"
  -OutFile FILENAME.png `

Se o pedido for bem-sucedido, o ficheiro PNG é escrito no seu computador.

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"
	"os"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebRetrieveRendered retrieves a consumer imaging format like JPEG or PNG.
func dicomWebRetrieveRendered(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string, outputFile string) error {
	// projectID := "my-project"
	// location := "us-central1"
	// datasetID := "my-dataset"
	// dicomStoreID := "my-dicom-store"
	// dicomWebPath := "studies/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1113639985/series/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.1953511724/instances/1.3.6.1.4.1.11129.5.5.9562821369/rendered"
	// outputFile := "rendered_image.png"
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	call := storesService.RetrieveRendered(parent, dicomWebPath)
	call.Header().Set("Accept", "image/png")
	resp, err := call.Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("RetrieveRendered: %w", err)
	}

	defer resp.Body.Close()

	if resp.StatusCode > 299 {
		return fmt.Errorf("RetrieveRendered: status %d %s: %s", resp.StatusCode, resp.Status, resp.Body)
	}

	file, err := os.Create(outputFile)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("os.Create: %w", err)
	}
	defer file.Close()
	if _, err := io.Copy(file, resp.Body); err != nil {
		return fmt.Errorf("io.Copy: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Rendered PNG image retrieved and downloaded to file: %v\n", outputFile)

	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.HttpResponse;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies.Series.Instances;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.util.Collections;

public class DicomWebRetrieveRendered {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final String DICOMWEB_PATH = "studies/%s/series/%s/instances/%s/rendered";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebRetrieveRendered(String dicomStoreName, String dicomWebPath)
      throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String dicomWebPath = String.format(DICOMWEB_PATH, "your-study-id", "your-series-id",
    // "your-instance-id");

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Instances.RetrieveRendered request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .series()
            .instances()
            .retrieveRendered(dicomStoreName, dicomWebPath);

    // Execute the request and process the results.
    HttpResponse response = request.executeUnparsed();

    String outputPath = "image.png";
    OutputStream outputStream = new FileOutputStream(new File(outputPath));
    try {
      response.download(outputStream);
      System.out.println("DICOM rendered PNG image written to file " + outputPath);
    } finally {
      outputStream.close();
    }

    if (!response.isSuccessStatusCode()) {
      System.err.print(
          String.format(
              "Exception retrieving DICOM rendered image: %s\n", response.getStatusMessage()));
      throw new RuntimeException();
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    HttpHeaders headers = new HttpHeaders();
    headers.set("X-GFE-SSL", "yes");
    // Retrieve using the PNG consumer imaging format.
    headers.setAccept("image/png");
    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});
const fs = require('fs');
const util = require('util');
const writeFile = util.promisify(fs.writeFile);
const fileName = 'rendered_image.png';

const dicomWebRetrieveRendered = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  // const seriesUid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633';
  // const instanceUid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}/series/${seriesUid}/instances/${instanceUid}/rendered`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  const rendered =
    await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveRendered(
      request,
      {
        headers: {Accept: 'image/png'},
        responseType: 'arraybuffer',
      }
    );
  const fileBytes = Buffer.from(rendered.data);

  await writeFile(fileName, fileBytes);
  console.log(
    `Retrieved rendered image and saved to ${fileName} in current directory`
  );
};

dicomWebRetrieveRendered();

Python

def dicomweb_retrieve_rendered(
    project_id,
    location,
    dataset_id,
    dicom_store_id,
    study_uid,
    series_uid,
    instance_uid,
):
    """Handles the GET requests specified in the DICOMweb standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    # series_uid = '2.24.52329571877967561426579904912379710633'  # replace with the series UID
    # instance_uid = '1.3.6.2.4.2.14619.5.2.1.6280.6001.129311971280445372188125744148'  # replace with the instance UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicom_store_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id
    )

    dicomweb_path = "{}/dicomWeb/studies/{}/series/{}/instances/{}/rendered".format(
        dicom_store_path, study_uid, series_uid, instance_uid
    )

    file_name = "rendered_image.png"

    # Sets the required Accept header on the request for a PNG image
    headers = {"Accept": "image/png"}
    response = session.get(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    with open(file_name, "wb") as f:
        f.write(response.content)
        print(
            "Retrieved rendered image and saved to {} in current directory".format(
                file_name
            )
        )

    return response

Obtenha metadados

Pode obter os metadados de todas as instâncias num estudo ou numa série. O exemplo seguinte mostra como obter os metadados de uma instância. Para mais informações, consulte os recursos de metadados na declaração de conformidade com a DICOM da Cloud Healthcare API.

Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.retrieveMetadata.

Quando chama retrieveMetadata, o método devolve o mesmo conjunto de campos que são devolvidos quando pesquisa uma instância com o parâmetro de consulta includefield=all.

O equilíbrio entre retrieveMetadata e searchForInstances é a personalização. retrieveMetadata devolve uma resposta consistente com um âmbito de pesquisa restrito. Isto é ideal para cenários com carregamento elevado de instâncias DICOM. Entretanto, searchForInstances pode ser personalizado com vários parâmetros de consulta, como includefield. Isso é adequado para cenários que precisam de minimizar o tamanho da resposta, incluindo apenas campos selecionados.

Por predefinição, retrieveMetadata devolve uma resposta JSON. Para devolver uma resposta XML, transmita um cabeçalho HTTP Accept: multipart/related; type="application/dicom+xml" no seu pedido.

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• STUDY_INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância do estudo
• SERIES_INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância da série
• INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/metadata"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/metadata" | Select-Object -Expand Content

Explorador de APIs

Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

Resposta

[
  {
    "00020002": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020003": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020010": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020012": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    "00020013": {
      "vr": "SH",
      "Value": [
        "OFFIS_DCMTK_"
      ]
    },
    "00080016": {
      "vr": "UI",
      "Value": [
        "UNIQUE_IDENTIFIER"
      ]
    },
    ...
  }
]

Obtenha dados em massa

Uma instância DICOM consiste em vários elementos de dados. Embora a maioria dos elementos de dados contenha pequenos fragmentos de metadados (como o nome de um paciente ou a data de um estudo), alguns podem conter grandes quantidades de dados, também denominados "dados em massa". Para compreender que dados são "dados em massa" na Cloud Healthcare API, consulte a definição de dados em massa.

A Cloud Healthcare API processa estes elementos de "dados em massa" separadamente. Para obter os bytes de valor não processados, chame projects.locations.datasets.dicomStores.studies.series.instances.bulkdata.retrieveBulkdata usando uma das seguintes opções:

• Obtenção direta: se souber os identificadores do estudo, da série, da instância e da etiqueta específica que quer obter, pode construir o URL do pedido e chamar retrieveBulkdata diretamente. A obtenção direta é o método mais eficiente porque requer apenas uma única chamada API.

• Obtenção através dos metadados da instância DICOM: quando obtém os metadados de uma instância, a resposta contém um BulkDataURI para cada etiqueta de dados em massa suportada. Pode usar este URI para fazer um pedido retrieveBulkdata. Este método é útil para descobrir as etiquetas de dados em massa disponíveis para uma instância antes da obtenção.

Os exemplos seguintes mostram como obter dados em massa através da obtenção direta:

REST

Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

• PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
• LOCATION: a localização do conjunto de dados
• DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
• DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
• STUDY_INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância do estudo
• SERIES_INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância da série
• INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância
• BULK_DATA_PATH: a etiqueta de dados em massa, como 7FE00010 para PixelData. Para uma etiqueta (AAAA,AAAA) numa sequência (BBBB,BBBB) no índice do item i, o caminho seria BBBBBBBB/i/AAAAAAAA
• OUTPUT_FILE_PATH: um caminho no seu computador local onde os dados em massa estão armazenados num ficheiro DAT. Tem de especificar a extensão .dat.

Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

curl

Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

curl -X GET \
     -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
     --output OUTPUT_FILE_PATH \
     "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/bulkdata/BULK_DATA_PATH"

PowerShell

Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

Execute o seguinte comando:

$cred = gcloud auth print-access-token
$headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
    -Method GET `
    -Headers $headers `
    -OutFile OUTPUT_FILE_PATH `
    -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID/series/SERIES_INSTANCE_UID/instances/INSTANCE_UID/bulkdata/BULK_DATA_PATH"

Se for bem-sucedido, o ficheiro DAT é transferido para a sua máquina local.

Use a DICOMweb CLI

O exemplo seguinte mostra como usar a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API para obter todas as instâncias num arquivo DICOM e guardá-las no seu computador no diretório de trabalho atual. Estão disponíveis mais amostras no repositório do GitHub da DICOMweb CLI.

dcmweb \
  https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
  retrieve

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve uma resposta semelhante à seguinte e os ficheiros DICOM são escritos no seu computador:

TIMESTAMP -- Saving files into ./
TIMESTAMP -- Transferred SIZE in COUNT files

Elimine um estudo, uma série ou uma instância

A Cloud Healthcare API implementa um serviço Web proprietário para eliminar estudos, séries e instâncias DICOM. Este serviço não faz parte dos serviços padrão DICOMweb. Para mais informações, consulte a secção Eliminar na declaração de conformidade com DICOM da API Cloud Healthcare.

As solicitações de eliminação de estudos e séries devolvem uma operação de longa duração. Após a conclusão da operação, todas as instâncias no estudo ou na série são eliminadas.

Os pedidos de eliminação de instâncias não devolvem uma operação de longa duração. Em vez disso, devolvem um corpo de resposta vazio, como o seguinte:

{}

Os exemplos seguintes mostram como eliminar um estudo DICOM. Para mais informações, consulte projects.locations.datasets.dicomStores.studies.delete.

REST

1. Elimine o estudo.

   Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

   • PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
   • LOCATION: a localização do conjunto de dados
   • DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
   • DICOM_STORE_ID: o ID da loja DICOM
   • STUDY_INSTANCE_UID: o identificador exclusivo da instância do estudo

   Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

   curl

   Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

   Execute o seguinte comando:

   curl -X DELETE \
        -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
        "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID"

   PowerShell

   Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

   Execute o seguinte comando:

   $cred = gcloud auth print-access-token
   $headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
   
   Invoke-WebRequest `
       -Method DELETE `
       -Headers $headers `
       -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb/studies/STUDY_INSTANCE_UID" | Select-Object -Expand Content

   Explorador de APIs

   Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

   Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

   Resposta

   {
     "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
   }
   

2. Obtenha o estado da operação de execução longa.

   Antes de usar qualquer um dos dados do pedido, faça as seguintes substituições:

   • PROJECT_ID: o ID do seu Google Cloud projeto
   • LOCATION: a localização do conjunto de dados
   • DATASET_ID: o conjunto de dados principal do arquivo DICOM
   • OPERATION_ID: o ID devolvido pela operação de longa duração

   Para enviar o seu pedido, escolha uma destas opções:

   curl

   Nota: O comando seguinte pressupõe que tem sessão iniciada na CLI gcloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login, ou usando o Cloud Shell, que inicia automaticamente sessão na CLI gcloud. Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

   Execute o seguinte comando:

   curl -X GET \
        -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth print-access-token)" \
        "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"

   PowerShell

   Nota: O comando seguinte pressupõe que iniciou sessão na CLI do Google Cloud com a sua conta de utilizador executando gcloud init ou gcloud auth login .gcloud Pode verificar a conta atualmente ativa executando o comando gcloud auth list.

   Execute o seguinte comando:

   $cred = gcloud auth print-access-token
   $headers = @{ "Authorization" = "Bearer $cred" }
   
   Invoke-WebRequest `
       -Method GET `
       -Headers $headers `
       -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content

   Explorador de APIs

   Abra a página de referência do método. O painel APIs Explorer é aberto no lado direito da página. Pode interagir com esta ferramenta para enviar pedidos. Preencha todos os campos obrigatórios e clique em Executar.

   Deve receber uma resposta JSON semelhante à seguinte:

   Resposta

   {
     "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
     "metadata": {
       "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
       "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicomweb.DicomWebService.DeleteStudy",
       "createTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ",
       "endTime": "YYYY-MM-DDTHH:MM:SS+ZZ:ZZ",
       "logsUrl": "CLOUD_LOGGING_URL",
     },
     "done": true,
     "response": {
       "@type": "type.googleapis.com/google.protobuf.Empty",
     }
   }
   

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// dicomWebDeleteStudy deletes all instances in the given dicomWebPath study.
func dicomWebDeleteStudy(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, dicomWebPath string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %w", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies

	parent := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	if _, err := storesService.Delete(parent, dicomWebPath).Do(); err != nil {
		return fmt.Errorf("Delete: %w", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Deleted %q\n", dicomWebPath)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.gson.GsonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores.Studies;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.auth.http.HttpCredentialsAdapter;
import com.google.auth.oauth2.GoogleCredentials;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomWebDeleteStudy {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new GsonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomWebDeleteStudy(String dicomStoreName, String studyId) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String studyId = "your-study-id";

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Create request and configure any parameters.
    Studies.Delete request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .studies()
            .delete(dicomStoreName, "studies/" + studyId);

    // Execute the request and process the results.
    request.execute();
    System.out.println("DICOM study deleted.");
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredentials credential =
        GoogleCredentials.getApplicationDefault()
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          new HttpCredentialsAdapter(credential).initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const google = require('@googleapis/healthcare');
const healthcare = google.healthcare({
  version: 'v1',
  auth: new google.auth.GoogleAuth({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  }),
});

const dicomWebDeleteStudy = async () => {
  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const studyUid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0';
  const parent = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const dicomWebPath = `studies/${studyUid}`;
  const request = {parent, dicomWebPath};

  await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.studies.delete(
    request
  );
  console.log('Deleted DICOM study');
};

dicomWebDeleteStudy();

Python

def dicomweb_delete_study(project_id, location, dataset_id, dicom_store_id, study_uid):
    """Handles DELETE requests equivalent to the GET requests specified in
    the WADO-RS standard.

    See https://github.com/GoogleCloudPlatform/python-docs-samples/tree/main/healthcare/api-client/v1/dicom
    before running the sample."""

    # Imports the google.auth.transport.requests transport
    from google.auth.transport import requests

    # Imports a module to allow authentication using Application Default Credentials (ADC)
    import google.auth

    # Gets credentials from the environment. google.auth.default() returns credentials and the
    # associated project ID, but in this sample, the project ID is passed in manually.
    credentials, _ = google.auth.default()

    scoped_credentials = credentials.with_scopes(
        ["https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform"]
    )
    # Creates a requests Session object with the credentials.
    session = requests.AuthorizedSession(scoped_credentials)

    # URL to the Cloud Healthcare API endpoint and version
    base_url = "https://healthcare.googleapis.com/v1"

    # TODO(developer): Uncomment these lines and replace with your values.
    # project_id = 'my-project'  # replace with your GCP project ID
    # location = 'us-central1'  # replace with the parent dataset's location
    # dataset_id = 'my-dataset'  # replace with the parent dataset's ID
    # dicom_store_id = 'my-dicom-store' # replace with the DICOM store ID
    # study_uid = '1.3.6.1.4.1.5062.55.1.2270943358.716200484.1363785608958.61.0'  # replace with the study UID
    url = f"{base_url}/projects/{project_id}/locations/{location}"

    dicomweb_path = "{}/datasets/{}/dicomStores/{}/dicomWeb/studies/{}".format(
        url, dataset_id, dicom_store_id, study_uid
    )

    # Sets the required application/dicom+json; charset=utf-8 header on the request
    headers = {"Content-Type": "application/dicom+json; charset=utf-8"}

    response = session.delete(dicomweb_path, headers=headers)
    response.raise_for_status()

    print("Deleted study.")

    return response

Use a DICOMweb CLI

O exemplo seguinte mostra como usar a CLI DICOMweb da Cloud Healthcare API para eliminar um estudo:

dcmweb \
    https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID/dicomWeb \
   delete studies/STUDY_INSTANCE_UID

Se o pedido for bem-sucedido, o servidor devolve uma operação que a ferramenta de CLI consulta até que a operação de eliminação seja concluída.

Atualize ou corrija um estudo, uma série ou uma instância

Pré-visualização

Esta secção descreve as funcionalidades de pré-visualização que estão sujeitas a alterações e podem ter apoio técnico limitado. As alterações aos produtos e às funcionalidades de pré-DG podem não ser compatíveis com outras versões de pré-DG. Para mais informações, consulte os Termos da Oferta Pré-GA para a API Cloud Healthcare e as descrições da fase de lançamento.

A norma DICOMweb não especifica métodos para atualizar dados DICOM, mas a Cloud Healthcare API oferece vários métodos para atualizar estes dados após a carregamento. Consulte o artigo Atualize e aplique patches a estudos, séries e instâncias DICOM para ver métodos e guias disponíveis.