Die therapeutisch anwendbare Forschung Effektive Behandlungen (ZIEL) verfolgt das Programm einen umfassenden genomischen Ansatz, um molekulare die Auswirkungen auf Kinderkrebs haben.
Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) bietet Zugriff auf TARGET-Daten und -Metadaten in BigQuery-Tabellen zur einfachen Bearbeitung und Analysen. Diese Tabellen fassen die über Zehntausende von XML- und tabellarischen, frei zugänglichen TARGET-Daten verstreuten Informationen in einem abfragbaren Format nach Datentyp (z. B. klinisch, Bioproben, Genexpression, Mutation usw.) zusammen und erleichtern so den Zugang und die Analyse.
In ähnlicher Weise hat ISB-CGC BigQuery-Tabellen für andere Krebsprogramme erstellt. Siehe In der Dokumentation zu ISB-CGC-Programmen finden Sie eine vollständige Liste.
ISB-CGC bietet auch Notebook-Beispiele in R und Python, die von einfachen bis zu komplexen Abfrageerstellungen und -analysen mithilfe von ISB-CGC-BigQuery-Tabellen reichen:
Dataset-Zugriff
Cloud Storage-Ordner
ISB-CGC speichert Cloud-Speicherpfade zu TARGET-Daten, die vom National Cancer Institute's Genomic Data Commons gehostet werden, in dem BigQuery-Datensatz isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Weitere Informationen finden Sie in der Dokumentation zu ISB-CGC TARGET. um herauszufinden, wie Sie auf diese Dateispeicherorte zugreifen können.
BigQuery-Datasets
Zur Untersuchung und Abfrage von Daten können Sie in BigQuery auf folgende TARGET-Datasets zugreifen:
Verwenden Sie das ISB-CGC BigQuery-Suchtool, um andere ISB-CGC-Krebs-Datasets zu entdecken. Diese Daten finden Sie im Projekt isb-cgc-bq in Google BigQuery. Weitere Informationen zu ISB-CGC und dessen Daten finden Sie in der ISB-CGC-Dokumentation.
Über die Daten
Nutzung: Dieses Dataset ist öffentlich verfügbar und kann gemäß den von der Dataset-Quelle (https://cancergenome.nih.gov/) bereitgestellten Bedingungen genutzt werden. Das Dataset wird "IM IST-ZUSTAND" ohne ausdrückliche oder stillschweigende Garantie von Google bereitgestellt. Google lehnt jegliche Haftung für direkte oder indirekte Schäden ab, die aus der Nutzung des Datasets resultieren.