Tutorial

Analisi delle varianti

• Guida avanzata per analizzare le varianti con BigQuery

  Scopri come utilizzare BigQuery per analizzare le varianti ed eseguire query per conteggiare le chiamate delle varianti, gli esempi, le varianti per cromosoma e altro ancora.

Esecuzione delle pipeline

• Best practice per l'esecuzione di GATK

  Esegui la pipeline Best practice GATK dal Broad Institute del MIT e da Harvard su una o più pipeline.

• Esecuzione di Nextflow

  Utilizza Nextflow per eseguire una pipeline RNA-Seq di proof of concept.

• Esecuzione di Sentieon DNAseq

  Esegui Sentieon DNAseq come pipeline Google Cloud.

• D-sub in esecuzione

  Utilizza dsub per inviare ed eseguire job batch nel cloud.

Esecuzione di DeepVariant

• Esecuzione di DeepVariant

  Utilizza DeepVariant, un chiamante per le varianti genomiche che utilizza reti neurali profonde per chiamare varianti genetiche nei genomi germinali.

Deployment di un cluster Slurm su Compute Engine

• Deployment di un cluster Slurm su Compute Engine

  Scopri come eseguire il deployment di un cluster Slurm su Compute Engine per la gestione delle risorse nei centri di computing ad alte prestazioni.

Repository GitHub

• Strumenti di Cloud Life Sciences

  Esplora gli strumenti che puoi utilizzare con i dati relativi alla genomica su Google Cloud.