Tutoriels

Analyser des variants

• Guide avancé sur l'analyse des variantes à l'aide de BigQuery

  Apprenez à utiliser BigQuery pour analyser des variants et exécuter des requêtes permettant de compter les appels de variants, les échantillons, les variants par chromosome, etc.

Exécuter des pipelines

• Exécuter le pipeline de bonnes pratiques GATK

  Exécutez le pipeline des bonnes pratiques GATK du Broad  Institute du MIT et de Harvard sur un ou plusieurs pipelines.

• Exécuter Nextflow

  Exécutez un pipeline de démonstration de faisabilité pour RNA-Seq à l'aide de Nextflow.

• Exécuter Sentieon DNAseq

  Exécutez Sentieon DNAseq en tant que pipeline Google Cloud.

• Exécuter dsub

  Envoyez et exécutez des tâches par lot dans le cloud à l'aide de dsub.

Exécuter DeepVariant

• Exécuter DeepVariant

  Identifiez des variants génétiques dans les génomes germinaux à l'aide de DeepVariant, un détecteur de variants génomiques qui exploite les réseaux de neurones profonds.

Déployer un cluster Slurm sur Compute Engine

• Déployer un cluster Slurm sur Compute Engine

  Découvrez comment déployer un cluster Slurm sur Compute Engine pour gérer les ressources dans des centres de calcul hautes performances.

Dépôts GitHub

• Outils Cloud Life Sciences

  Explorez les outils à utiliser avec les données génomiques sur Google Cloud.