Anleitungen

Varianten analysieren

• Erweiterter Leitfaden zur Analyse von Varianten mit BigQuery

  Mit BigQuery Varianten analysieren und Abfragen ausführen, um Variantenaufrufe, Proben, Varianten pro Chromosom und mehr zu zählen

Pipelines ausführen

• GATK Best Practices ausführen

  GATK Best Practices-Pipeline vom Broad Institute von MIT und Harvard auf einer oder mehreren Pipelines ausführen

• Nextflow ausführen

  Mit Nextflow eine RNA-Seq-Pipeline als Proof of Concept ausführen

• Sentieon DNAseq ausführen

  Sentieon DNAseq als Google Cloud-Pipeline ausführen

• dsub ausführen

  Mit dsub Batchjobs in die Cloud senden und ausführen

DeepVariant ausführen

• DeepVariant ausführen

  DeepVariant verwenden, eine Aufruf-Funktion von Genomvarianten, die mit neuronalen Deep-Learning-Netzwerken genetische Varianten in Keimbahngenomen aufruft

Slurm-Cluster in Compute Engine bereitstellen

• Slurm-Cluster in Compute Engine bereitstellen

  So erstellen Sie in Compute Engine einen Slurm-Cluster zur Verwaltung von Ressourcen in Hochleistungs-Computing-Rechenzentren.

GitHub-Repositories

• Cloud Life Sciences-Tools

  Entdecken Sie Tools, die Sie in Google Cloud mit Genomdaten verwenden können.