Tutorial

Analisi delle varianti

• Guida avanzata per analizzare le varianti con BigQuery

  Scopri come utilizzare BigQuery per analizzare le varianti ed eseguire query per conteggiare le chiamate di varianti, i campioni, le varianti per cromosoma e altro ancora.

Esecuzione delle pipeline

• Esecuzione delle best practice GATK

  Esegui la pipeline GATK Best Practices del Broad Institute del MIT e di Harvard su una o più pipeline.

• Esecuzione di Nextflow

  Utilizza Nextflow per eseguire una pipeline RNA-Seq di prova del concetto.

• Esecuzione di Sentieon DNAseq

  Esegui Sentieon DNAseq come pipeline Google Cloud.

• Esecuzione di dsub

  Utilizza dsub per inviare ed eseguire job batch nel cloud.

Esecuzione di DeepVariant

• Esecuzione di DeepVariant

  Utilizza DeepVariant, un caller di varianti di genomica che utilizza reti neurali profonde, per chiamare le varianti genetiche nei genomi germinali.

Deployment di un cluster Slurm su Compute Engine

• Deployment di un cluster Slurm su Compute Engine

  Scopri come eseguire il deployment di un cluster Slurm su Compute Engine per gestire le risorse nei centri di calcolo ad alte prestazioni.

Repository GitHub

• Strumenti di Cloud Life Sciences

  Scopri gli strumenti che puoi utilizzare con i dati di genomica su Google Cloud.