La ricerca terapeutica applicabile da generare Trattamenti efficaci (TARGET) applica un approccio genomico completo per determinare la molecola cambiamenti che causano i tumori infantili.
In Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) consente di accedere ai dati e ai metadati di TARGET nelle tabelle BigQuery per accesso e analisi. Queste tabelle consolidano le informazioni sparse decine di migliaia di dati TARGET XML e tabulari ad accesso libero in un formato per tipo di dati (ad esempio clinico, biocampione, espressione genica, mutazione, e così via) per facilitare l'accesso e l'analisi.
Allo stesso modo, ISB-CGC ha creato tabelle BigQuery per altri programmi per il cancro; vedi La documentazione dei programmi IB-CGC per un elenco completo.
ISB-CGC fornisce anche esempi di blocchi note in R e Python che vanno da creazione e analisi di query da semplici a complesse utilizzando le tabelle BigQuery ISB-CGC:
Accesso a set di dati
Cartelle di Cloud Storage
ISB-CGC archivia i percorsi Cloud Storage dei dati di TARGET ospitati da il National Cancer Institute Genomic Data Commons in il set di dati BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Consulta la documentazione di ISB-CGC TARGET per scoprire come accedere alle posizioni dei file.
Set di dati di BigQuery
Puoi accedere ai seguenti set di dati TARGET in BigQuery per i dati dell'esplorazione e delle query:
Per esplorare altri set di dati sul cancro ISB-CGC, utilizza Strumento di ricerca BigQuery IB-CGC. Puoi trovare questi dati nella Progetto isb-cgc-bq in Google BigQuery. Per ulteriori informazioni su ISB-CGC e sui relativi dati, vedi Documentazione di ISB-CGC.
Informazioni sui dati
Utilizzo: questo set di dati è disponibile pubblicamente e può essere utilizzato da chiunque ai sensi del Termini forniti dall'origine del set di dati (https://cancergenome.nih.gov/) ed è fornito "così com'è" senza alcuna garanzia, espressa o implicita, da parte di Google. Google esclude qualsiasi responsabilità per eventuali danni, diretti o indiretti, derivanti dall'uso del set di dati.