Program Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments (TARGET) menerapkan pendekatan genomik komprehensif untuk menentukan perubahan molekul yang mendorong kanker pada anak-anak.
Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) menyediakan akses ke data dan metadata TARGET di tabel BigQuery untuk memudahkan akses dan analisis. Tabel ini menggabungkan informasi yang tersebar di lebih dari puluhan ribu data TARGET dengan akses terbuka dalam format XML dan tabel ke dalam format yang dapat dikueri menurut jenis data (seperti klinis, biospesimen, ekspresi gen, mutasi, dan sebagainya) untuk memudahkan akses dan analisis.
Demikian pula, ISB-CGC telah membuat tabel BigQuery untuk program kanker lainnya; lihat dokumentasi Program ISB-CGC untuk mengetahui daftar lengkapnya.
ISB-CGC juga menyediakan contoh notebook dalam R dan Python yang berkisar dari pembuatan dan analisis kueri sederhana hingga kompleks menggunakan tabel BigQuery ISB-CGC:
Akses set data
Folder Cloud Storage
ISB-CGC menyimpan jalur Cloud Storage ke data TARGET yang dihosting oleh Genomic Data Commons dari National Cancer Institute di set data BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Lihat dokumentasi TARGET ISB-CGC untuk mengetahui cara mengakses lokasi file ini.
Set data BigQuery
Anda dapat mengakses set data TARGET berikut di BigQuery untuk eksplorasi dan kueri data:
Untuk menjelajahi set data kanker ISB-CGC lainnya, gunakan Alat Penelusuran BigQuery ISB-CGC. Anda dapat menemukan data ini di project isb-cgc-bq di Google BigQuery. Untuk informasi selengkapnya tentang ISB-CGC dan datanya, lihat dokumentasi ISB-CGC.
Tentang data
Penggunaan: Set data ini tersedia secara publik untuk digunakan oleh siapa saja berdasarkan persyaratan yang diberikan oleh sumber set data (https://cancergenome.nih.gov/) dan disediakan "APA ADANYA" tanpa jaminan apa pun, baik dinyatakan secara tersurat maupun tersirat, dari Google. Google tidak bertanggung jawab atas kerusakan apa pun, baik secara langsung maupun tidak langsung, akibat dari penggunaan set data.