La Investigación Terapéutica Aplicable para Generar Tratamientos eficaces (TARGET) programa aplica un enfoque genómico integral para determinar la clasificación molecular cambios que provocan el cáncer infantil.
Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) proporciona acceso a datos y metadatos de TARGET en tablas de BigQuery para facilitar la el acceso y el análisis de los datos. Estas tablas consolidan la información dispersa en miles de datos XML y tabulares de acceso abierto TARGET en un formato de consulta por tipo de datos (como clínico, biospecífico, expresión genética, mutación, etc.) para facilitar el acceso y el análisis.
De manera similar, ISB-CGC creó tablas de BigQuery para otros programas contra el cáncer. ver la documentación de los programas del ISB-CGC para ver una lista completa.
ISB-CGC también proporciona ejemplos de {i>notebooks<i} en R y Python que abarcan desde Creación y análisis de consultas sencillas a complejas con tablas de BigQuery de ISB-CGC:
Acceso al conjunto de datos
Carpetas de Cloud Storage
ISB-CGC almacena las rutas de acceso de Cloud Storage a los datos de DESTINO alojados por del Instituto Nacional del Cáncer Genomic Data Commons en el conjunto de datos de BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Consulte la documentación del OBJETIVO DE ISB-CGC. para obtener información sobre cómo acceder a las ubicaciones de estos archivos.
Conjuntos de datos de BigQuery
Puedes acceder a los siguientes conjuntos de datos TARGET en BigQuery para explorar y consultar los datos:
Para explorar otros conjuntos de datos sobre cáncer de la ISB-CGC, use la Herramienta de búsqueda de BigQuery para ISB-CGC. Puedes encontrar estos datos en la Proyecto isb-cgc-bq en Google BigQuery. Para obtener más información sobre ISB-CGC y sus datos, consulte Documentación del ISB-CGC.
Acerca de los datos
Uso: Este conjunto de datos está disponible públicamente para que lo use cualquier persona de conformidad con las condiciones que provee la fuente del conjunto de datos (https://cancergenome.nih.gov/) y se proporciona "COMO ESTÁ", sin ninguna garantía por parte de Google, ni explícita ni implícita. Google rehúsa toda responsabilidad por cualquier daño, directo o indirecto, que resulte del uso del conjunto de datos.