Il programma Terrapeuticamente applicabile per la ricerca per generare trattamenti efficaci (TARGET) applica un approccio genomico completo per determinare i cambiamenti molecolari che causano i tumori infantili.
L'In Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) fornisce l'accesso ai dati e ai metadati di TARGET nelle tabelle BigQuery per facilitarne l'accesso e l'analisi. Queste tabelle consolidano le informazioni sparse in decine di migliaia di dati TARGET XML e ad accesso aperto tabulari in un formato interrogabile per tipo di dati (come clinico, biocampione, espressione genica, mutazione e così via) per facilitare l'accesso e l'analisi.
Allo stesso modo, ISB-CGC ha creato tabelle BigQuery per altri programmi antitumorali; consulta la documentazione relativa ai programmi ISB-CGC per un elenco completo.
ISB-CGC fornisce inoltre esempi di blocchi note in R e Python che spaziano dalla creazione e analisi di query semplici a complesse utilizzando le tabelle BigQuery ISB-CGC:
Accesso a set di dati
Cartelle di Cloud Storage
ISB-CGC archivia i percorsi Cloud Storage dei dati TARGET ospitati dalla Genomic Data Commons del National Cancer Institute nel set di dati BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Consulta la documentazione relativa a ISB-CGC TARGET per scoprire come accedere a queste posizioni dei file.
Set di dati di BigQuery
Puoi accedere ai seguenti set di dati TARGET in BigQuery per esplorare i dati ed eseguire query:
Per esplorare altri set di dati sul tumore ISB-CGC, utilizza lo strumento di ricerca BigQuery per ISB-CGC. Puoi trovare questi dati nel progetto isb-cgc-bq in Google BigQuery. Per ulteriori informazioni su ISB-CGC e i suoi dati, consulta la documentazione di ISB-CGC.
Informazioni sui dati
Utilizzo: questo set di dati è disponibile pubblicamente per l'utilizzo secondo i termini forniti dalla fonte del set di dati (https://cancergenome.nih.gov/) e viene fornito "così com'è", senza alcuna garanzia, espressa o implicita, da parte di Google. Google esclude qualsiasi responsabilità per eventuali danni, diretti o indiretti, derivanti dall'uso del set di dati.