Il programma Therapeutics Applica Research to Genera eccellenze di trattamento (TARGET) applica un approccio genomico completo per determinare i cambiamenti molecolari che causano i tumori infantili.
Il Gateway to the Cloud dell'Istituto per la Biologia del Cancro dei sistemi (ISB-CGC) fornisce l'accesso ai dati e ai metadati di TARGET nelle tabelle BigQuery per facilitarne l'accesso e l'analisi. Queste tabelle consolidano le informazioni sparse su decine di migliaia di dati tabulari e XML ad accesso libero di TARGET in un formato interrogabile per tipo di dati (ad esempio clinico, biospecimen, espressione genica, mutazione e così via) per facilitare l'accesso e l'analisi.
Allo stesso modo, ISB-CGC ha creato tabelle BigQuery per altri programmi per il cancro; consulta la documentazione dei programmi ISB-CGC per un elenco completo.
ISB-CGC fornisce anche esempi di blocchi note in R e Python, che vanno dalla creazione e dall'analisi di query semplici o complesse utilizzando le tabelle BigQuery ISB-CGC:
Accesso a set di dati
Cartelle di Cloud Storage
ISB-CGC archivia i percorsi Cloud Storage dei dati TARGET ospitati dal Genomic Data Commons del National Cancer Institute nel set di dati BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Consulta la documentazione di ISB-CGC TARGET per scoprire come accedere a queste posizioni dei file.
Set di dati di BigQuery
Puoi accedere ai seguenti set di dati TARGET in BigQuery per l'esplorazione e l'esecuzione di query sui dati:
Per esplorare altri set di dati tumorali ISB-CGC, utilizza lo strumento di ricerca BigQuery ISB-CGC. Puoi trovare questi dati nel progetto isb-cgc-bq in Google BigQuery. Per ulteriori informazioni su ISB-CGC e sui relativi dati, consulta la documentazione di ISB-CGC.
Informazioni sui dati
Utilizzo: questo set di dati è disponibile pubblicamente per l'utilizzo da parte di chiunque ai sensi dei termini forniti dalla fonte del set di dati (https://cancergenome.nih.gov/) e viene fornito "così com'è" senza alcuna garanzia, espressa o implicita, da parte di Google. Google esclude qualsiasi responsabilità per eventuali danni, diretti o indiretti, derivanti dall'uso del set di dati.