효과적인 치료를 위한 치료법 적용 연구(TARGET) 프로그램은 아동 암을 유발하는 분자 변화를 확인하기 위해 포괄적인 게놈 접근법을 적용합니다.
Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud(ISB-CGC)는 BigQuery 테이블의 TARGET 데이터 및 메타데이터에 대한 액세스를 제공하여 간편하게 액세스하고 분석할 수 있습니다. 이러한 테이블은 수만 개의 XML 및 테이블 형식 개방형 액세스 TARGET 데이터에 분산된 정보를 간편한 액세스 및 분석을 위해 데이터 유형별로 쿼리 가능한 형식(예: 임상, 바이오시료(biospecimen), 유전자 발현, 돌연변이)으로 통합합니다.
마찬가지로 ISB-CGC는 다른 암 프로그램을 위한 BigQuery 테이블을 만들었습니다. 전체 목록은 ISB-CGC 프로그램 문서를 참조하세요.
ISB-CGC는 또한 ISB-CGC BigQuery 테이블을 사용하는 간단한 쿼리 빌드 및 분석부터 복잡한 것까지 R 및 Python으로 노트북 예시를 제공합니다.
데이터세트 액세스
Cloud Storage 폴더
ISB-CGC는 국립 암 연구소의 Genomic Data Commons에서 호스팅되는 TARGET 데이터에 대한 Cloud Storage 경로를 BigQuery 데이터 세트 isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata에 저장합니다. 이러한 파일 위치에 액세스하는 방법은 ISB-CGC TARGET 문서를 참조하세요.
BigQuery 데이터세트
데이터 탐색 및 쿼리를 위해 BigQuery에서 다음 TARGET 데이터 세트에 액세스할 수 있습니다.
다른 ISB-CGC 암 데이터 세트를 탐색하려면 ISB-CGC BigQuery 검색 도구를 사용합니다. 이 데이터는 Google BigQuery의 isb-cgc-bq 프로젝트에서 찾을 수 있습니다. ISB-CGC 및 해당 데이터에 대한 자세한 내용은 ISB-CGC 문서를 참조하세요.
데이터 정보
사용: 이 데이터 세트는 데이터 세트 출처(https://cancergenome.nih.gov/)에서 제공하는 약관을 따르는 모든 사용자에게 공개되며 Google의 어떠한 명시적 또는 묵시적인 보증 없이 '있는 그대로' 제공됩니다. Google은 데이터세트 사용으로 인한 직간접적인 손해를 책임지지 않습니다.