Program Penelitian yang Berlaku Terapi untuk Menghasilkan Pengobatan yang Efektif (TARGET) menerapkan pendekatan genomik yang komprehensif untuk menentukan perubahan molekul yang mendorong kanker pada anak-anak.
Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) menyediakan akses ke data dan metadata TARGET dalam tabel BigQuery untuk kemudahan akses dan analisis. Tabel ini menggabungkan informasi yang tersebar di atas puluhan ribu data TARGET akses terbuka XML dan tabel ke dalam format yang dapat dikueri berdasarkan jenis data (seperti klinis, biospesimen, ekspresi gen, mutasi, dan sebagainya) untuk kemudahan akses dan analisis.
Demikian pula, ISB-CGC telah membuat tabel BigQuery untuk program kanker lainnya. Baca dokumentasi Program ISB-CGC untuk mengetahui daftar lengkapnya.
ISB-CGC juga memberikan contoh notebook di R dan Python yang berkisar dari pembuatan dan analisis kueri sederhana hingga kompleks menggunakan tabel BigQuery ISB-CGC:
Akses set data
Folder Cloud Storage
ISB-CGC menyimpan jalur Cloud Storage ke data TARGET yang dihosting oleh Genomic Data Commons National Cancer Institute dalam set data BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Lihat dokumentasi TARGET ISB-CGC untuk mengetahui cara mengakses lokasi file ini.
Set data BigQuery
Anda dapat mengakses set data TARGET berikut di BigQuery untuk eksplorasi dan kueri data:
Untuk mempelajari set data kanker ISB-CGC lainnya, gunakan Alat Penelusuran BigQuery ISB-CGC. Anda dapat menemukan data ini di project isb-cgc-bq di Google BigQuery. Untuk informasi selengkapnya tentang ISB-CGC dan datanya, lihat dokumentasi ISB-CGC.
Tentang data
Penggunaan: Set data ini tersedia secara publik untuk digunakan oleh siapa saja berdasarkan persyaratan yang disediakan oleh sumber set data (https://cancergenome.nih.gov/) dan disediakan "APA ADANYA" tanpa jaminan apa pun, baik tersurat maupun tersirat, dari Google. Google tidak bertanggung jawab atas kerusakan apa pun, baik secara langsung maupun tidak langsung, yang timbul dari penggunaan set data ini.