生成有效疗法的治疗性适用研究 (TARGET) 数据

生成有效疗法的治疗性适用研究 (TARGET) 计划采用一种全面的基因组方法来确定驱动儿童癌症的分子变化。

系统生物学癌症云网关研究所 (ISB-CGC) 提供对 BigQuery 表中的 TARGET 数据和元数据的访问权限,以便于访问和分析。这些表将分散在数万个 XML 和表格型开放访问的 TARGET 数据中的信息按数据类型(例如临床、生物标本、基因表达、突变等)整合为一个可查询的格式,以便于访问和分析。

同样,ISB-CGC 还为其他癌症计划创建了 BigQuery 表;如需查看完整列表,请参阅 ISB-CGC 计划文档

ISB-CGC 还提供了 R 和 Python 中的笔记本示例,这些示例范围包括使用 ISB-CGC BigQuery 表进行简单到复杂查询构建和分析:

数据集访问

Cloud Storage 文件夹

ISB-CGC 在 BigQuery 数据集 isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata 中存储由美国国家癌症研究所的基因组数据共享平台托管的 TARGET 数据的 Cloud Storage 路径。请参阅 ISB-CGC TARGET 文档,了解如何访问这些文件位置。

BigQuery 数据集

您可以访问 BigQuery 中的以下 TARGET 数据集以进行数据探索和查询:

如需浏览其他 ISB-CGC 癌症数据集,请使用 ISB-CGC BigQuery 搜索工具。 您可以在 Google BigQuery 中的 isb-cgc-bq 项目中找到此数据。如需详细了解 ISB-CGC 及其数据,请参阅 ISB-CGC 文档

关于数据

使用:此数据集公开提供给所有人使用,但使用者需遵循数据集来源 (https://cancergenome.nih.gov/) 规定的条款;Google“按原样”提供数据集,对此不作任何明示或暗示的保证。 对于因使用数据集而导致的任何直接或间接损害,Google 不承担任何责任。