O programa Pesquisa Aplicável à Terapia para Gerar Tratamentos Eficazes (TARGET, na sigla em inglês) aplica uma abordagem genômica completa para determinar as alterações moleculares que causam câncer infantil.
O Institute for Systems Biology Cancer Gateway to the Cloud (ISB-CGC) (em inglês) fornece acesso a dados e metadados do TARGET em tabelas do BigQuery para facilitar o acesso e a análise. Essas tabelas consolidam as informações espalhadas por dezenas de milhares de dados do TARGET nos formatos XML e tabular de acesso aberto em um formato consultável por tipo de dados (por exemplo, dados clínicos, bioespécime, expressão de gene, mutação etc.) para facilitar o acesso e a análise.
Da mesma forma, o ISB-CGC criou tabelas do BigQuery para outros programas sobre câncer. Consulte a documentação dos programas do ISB-CGC (em inglês) para ver a lista completa.
O ISB-CGC também fornece exemplos de notebook em R e Python que variam de criação de consulta simples à complexa e análise usando as tabelas do BigQuery do ISB-CGC:
Acesso ao conjunto de dados
Pastas do Cloud Storage
O ISB-CGC salva caminhos do Cloud Storage para os dados do TARGET hospedados pelo Genomic Data Commons do Instituto Nacional do Câncer no conjunto de dados do BigQuery isb-cgc-bq.GDC_case_file_metadata. Consulte a documentação do TARGET do ISB-CGC (em inglês) para saber como acessar os locais dos arquivos.
Conjuntos de dados do BigQuery
Para explorar e consultar os dados, acesse os seguintes conjuntos de dados do TARGET no BigQuery:
Para explorar outros conjuntos de dados de câncer do ISB-CGC, use a ferramenta de pesquisa do ISB-CGC no BigQuery. É possível encontrar esses dados no projeto isb-cgc-bq no Google BigQuery. Para mais informações sobre o ISB-CGC e os dados dele, consulte a documentação do ISB-CGC.
Sobre os dados
Uso: esse conjunto de dados está disponível ao público conforme os termos fornecidos pela fonte do conjunto de dados (https://cancergenome.nih.gov/) e é concedido "NO ESTADO EM QUE SE ENCONTRA", sem garantia expressa ou implícita do Google. O Google se isenta de qualquer responsabilidade por eventuais danos, diretos ou indiretos, decorrentes do uso do conjunto de dados.