Questa pagina spiega come esportare e importare le risorse FHIR da e verso Cloud Storage utilizzando i metodi projects.locations.datasets.fhirStores.import
e projects.locations.datasets.fhirStores.export
.
A seconda del formato dei tuoi dati FHIR, per caricare i dati in un datastore FHIR
puoi utilizzare il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.import
o projects.locations.datasets.fhirStores.fhir.executeBundle
. Per istruzioni nella scelta di un metodo, consulta
Importazione FHIR.
Impostazione delle autorizzazioni Cloud Storage
Prima di esportare e importare le risorse FHIR in e da Cloud Storage, devi concedere autorizzazioni aggiuntive all'account di servizio dell'agente di servizio Cloud Healthcare. Per ulteriori informazioni, consulta Autorizzazioni Cloud Storage degli archivi FHIR.
Generazione di dati dei pazienti simulati
SyntheaTM è un simulatore per la generazione di dati sulla popolazione di pazienti. Se non utilizzi SyntheaTM per generare dati sulla popolazione di pazienti, vai a Importazione di risorse FHIR o Esportazione di risorse FHIR.
Puoi importare solo i dati nella versione accettata dal datastore FHIR.
Per scaricare e installare SyntheaTM, completa i seguenti passaggi:
Clona il repository di strumenti SyntheaTM da GitHub:
git clone https://github.com/synthetichealth/synthea.git
Completa la procedura di installazione.
Vai a una delle seguenti sezioni per generare dati per una versione FHIR specifica:
Generazione di dati pazienti simulati per R4
Per impostazione predefinita, i dati SyntheaTM generati utilizzano la rappresentazione JSON FHIR R4 per le risorse. Per generare dati SyntheaTM FHIR R4 e importarli in un datastore FHIR dell'API Cloud Healthcare, completa i seguenti passaggi:
Segui le istruzioni per generare dati sintetici di pazienti. I dati generati vengono inviati a
synthea/output/fhir_r4
per FHIR R4.Copia i dati generati in un bucket Cloud Storage in modo da poterli importare in un datastore FHIR dell'API Cloud Healthcare. Ad esempio, per copiare i dati in una directory denominata
synthea-data
in un bucket Cloud Storage esistente, esegui il seguente comandogsutil cp
dalla directorysynthea
:gsutil -m cp output/fhir_r4/* gs://BUCKET/synthea-data
Segui le istruzioni per importare le risorse FHIR.
Generazione di dati di pazienti simulati per DSTU2 o STU3
Per generare dati SyntheaTM FHIR DSTU2 o STU3 e importarli in un datastore FHIR dell'API Cloud Healthcare, completa i seguenti passaggi:
Dalla directory
synthea
, utilizza un editor di testo per aprire il filesrc/main/resources/synthea.properties
, quindi apporta le seguenti modifiche, a seconda che tu stia generando dati DSTU2 o STU3.Per generare dati FHIR STU3:
- Imposta tutti i valori
*.fhir.export
e*.fhir_dstu2.export
sufalse
- Imposta tutti i valori
*.fhir_stu3.export
su true
Per generare dati FHIR DSTU2:
- Imposta tutti i valori
*.fhir.export
e*.fhir_stu3.export
sufalse
- Imposta tutti i valori
*.fhir_dstu2.export
su true
Ad esempio, per generare dati FHIR STU3:
exporter.fhir.export = false exporter.fhir_stu3.export = true exporter.fhir_dstu2.export = false exporter.hospital.fhir.export = false exporter.hospital.fhir_stu3.export = true exporter.hospital.fhir_dstu2.export = false exporter.practitioner.fhir.export = false exporter.practitioner.fhir_stu3.export = true exporter.practitioner.fhir_dstu2.export = false
- Imposta tutti i valori
Segui le istruzioni per generare dati sintetici di pazienti. I dati generati vengono inviati a
synthea/output/fhir_stu3
per la STU3 FHIR o alla directorysynthea/output/fhir_dstu2
per FHIR DSTU2.Copia i dati generati in un bucket Cloud Storage in modo da poterli importare in un datastore FHIR dell'API Cloud Healthcare. Ad esempio, per copiare i dati in una directory denominata
synthea-data
in un bucket Cloud Storage esistente, esegui il seguente comandogsutil cp
dalla directorysynthea
:gsutil -m cp output/fhir_stu3/* gs://BUCKET/synthea-data
Segui le istruzioni per importare le risorse FHIR.
Importazione delle risorse FHIR
Quando configuri il corpo della richiesta di importazione, imposta ContentStructure
su uno dei seguenti valori:
CONTENT_STRUCTURE_UNSPECIFIED
BUNDLE
: il file di origine contiene una o più righe di codice JSON delimitato da una nuova riga (ndjson). Ogni riga è un bundle contenente una o più risorse. Se non specifichiContentStructure
, il valore predefinito saràBUNDLE
.RESOURCE
: il file di origine contiene una o più righe di JSON (ndjson) delimitato da nuova riga. Ogni riga è una singola risorsa.BUNDLE_PRETTY
: l'intero file di origine è un unico bundle JSON. Il formato JSON può occupare più righe.RESOURCE_PRETTY
: l'intero file di origine è una risorsa JSON. Il formato JSON può occupare più righe.
Ad esempio, supponiamo che tu stia importando un file denominato resources.ndjson
con i seguenti contenuti:
{"class":{"code":"IMP","display":"inpatient encounter","system":"http://hl7.org/fhir/v3/ActCode"},"id":"6090e773-3e91-40a7-8fce-1e22f6774c29","reason":[{"text":"The patient had an abnormal heart rate. She was concerned about this."}],"resourceType":"Encounter","status":"finished","subject":{"reference":"Patient/2938bb9e-1f16-429e-8d44-9508ab0e4151"}}
{"class":{"code":"IMP","display":"inpatient encounter","system":"http://hl7.org/fhir/v3/ActCode"},"id":"7101f884-4f02-51b8-9gdf-2f33g7885d30","reason":[{"text":"The patient was experiencing recurrent fevers."}],"resourceType":"Encounter","status":"finished","subject":{"reference":"Patient/3049cc0f-2g27-530f-9e55-0619bc1f5262"}}
{"birthDate":"1970-01-01","gender":"female","id":"2938bb9e-1f16-429e-8d44-9508ab0e4151","name":[{"family":"Smith","given":["Darcy"],"use":"official"}],"resourceType":"Patient"}
Il file contiene due risorse Encounter e una risorsa Patient. Ogni risorsa si trova su una riga separata, quindi imposti ContentStructure
su RESOURCE
.
I dati potrebbero essere importati in modo errato o non importarli affatto se ContentStructure
non corrisponde al formato dei dati. Ad esempio, il file di esempio riportato sopra non verrà importato correttamente, a meno che ContentStructure
non sia impostato su RESOURCE
nella richiesta di importazione.
Gli esempi riportati di seguito mostrano come importare le risorse FHIR da un bucket Cloud Storage.
Console
Per importare le risorse FHIR da un bucket Cloud Storage, completa i seguenti passaggi:
- Nella console Google Cloud, vai alla pagina Set di dati.
Vai a Set di dati - Fai clic sul set di dati che contiene il datastore FHIR in cui stai importando le risorse FHIR.
- Nell'elenco dei datastore, scegli Importa dall'elenco
Azioni per il datastore FHIR.
Viene visualizzata la pagina Importa nel datastore FHIR. - Nell'elenco Progetto, seleziona un progetto Cloud Storage.
- Nell'elenco Località, seleziona un bucket Cloud Storage.
- Nelle impostazioni di importazione FHIR, seleziona la struttura dei contenuti pertinente.
- Fai clic su Importa per importare le risorse FHIR.
- Per monitorare lo stato dell'operazione, fai clic sulla scheda Operazioni. Al termine dell'operazione, vengono visualizzate le seguenti indicazioni:
- La sezione Stato operazione a lunga esecuzione ha un segno di spunta verde sotto l'intestazione OK.
- La sezione Panoramica contiene un segno di spunta verde e un indicatore OK nella stessa riga dell'ID operazione.
gcloud
Per importare le risorse FHIR in un datastore FHIR, utilizza il comando gcloud healthcare fhir-stores import gcs
. Specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- La posizione dell'oggetto in un bucket Cloud Storage. La posizione dei file all'interno del bucket è arbitraria e non deve rispettare esattamente il formato specificato nell'esempio seguente. Quando specifichi la posizione delle risorse FHIR in Cloud Storage, puoi utilizzare i caratteri jolly per importare più file da una o più directory.
Sono supportati i seguenti caratteri jolly:
- Utilizza
*
per trovare una corrispondenza con zero o più caratteri non separatori. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.ndjson
corrisponde a Example.ndjson ed Example22.ndjson in DIRECTORY. - Utilizza
**
per trovare corrispondenze di 0 o più caratteri (inclusi i separatori). Deve essere utilizzato alla fine di un percorso e senza altri caratteri jolly. Può essere utilizzato anche con un'estensione di nome file (come .ndjson), che importa tutti i file con questa estensione nella directory specificata e nelle relative sottodirectory. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/**.ndjson
importa tutti i file con l'estensione .ndjson del nome file in DIRECTORY e nelle relative sottodirectory. - Usa
?
per la corrispondenza di 1 carattere. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.ndjson
corrisponde a Example1.ndjson, ma non a Example.ndjson o a Example01.ndjson.
- Utilizza
Il seguente esempio mostra il comando gcloud healthcare fhir-stores import gcs
.
gcloud healthcare fhir-stores import gcs FHIR_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --gcs-uri=gs://BUCKET/DIRECTORY/FHIR_RESOURCE_NAME.ndjson
Per specificare la struttura dei file di origine FHIR, utilizza il flag --content-structure
.
La riga di comando visualizza l'ID operazione e, al termine dell'operazione,
done
:
Request issued for: [FHIR_STORE_ID] Waiting for operation [OPERATION_ID] to complete...done. name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
Per visualizzare ulteriori dettagli dell'operazione, esegui il comando gcloud healthcare operations describe
, fornendo il valore OPERATION_ID dalla risposta:
gcloud healthcare operations describe OPERATION_ID \ --dataset=DATASET_ID
La risposta include done: true
.
done: true metadata: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ImportResources createTime: 'CREATE_TIME' endTime: 'END_TIME' logsUrl: https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL, counter: success: 'SUCCESS_COUNT' name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID response: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ImportResourcesResponse fhirStore: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
API
Per importare le risorse FHIR in un datastore FHIR, utilizza il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.import
.
- La posizione dei file all'interno del bucket è arbitraria e non deve rispettare esattamente il formato specificato negli esempi che seguono.
- Quando specifichi la posizione delle risorse FHIR in Cloud Storage, puoi utilizzare i caratteri jolly per importare più file da una o più directory.
Sono supportati i seguenti caratteri jolly:
- Utilizza
*
per trovare una corrispondenza con zero o più caratteri non separatori. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.ndjson
corrisponde a Example.ndjson ed Example22.ndjson in DIRECTORY. - Utilizza
**
per trovare corrispondenze di 0 o più caratteri (inclusi i separatori). Deve essere utilizzato alla fine di un percorso e senza altri caratteri jolly. Può essere utilizzato anche con un'estensione di nome file (come .ndjson), che importa tutti i file con questa estensione nella directory specificata e nelle relative sottodirectory. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/**.ndjson
importa tutti i file con l'estensione .ndjson del nome file in DIRECTORY e nelle relative sottodirectory. - Usa
?
per la corrispondenza di 1 carattere. Ad esempio,gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.ndjson
corrisponde a Example1.ndjson, ma non a Example.ndjson o a Example01.ndjson.
- Utilizza
curl
Per importare le risorse FHIR in un datastore FHIR, effettua una richiesta POST
e specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- La posizione dell'oggetto in un bucket Cloud Storage
- Un token di accesso
Il seguente esempio mostra come importare un singolo file con una richiesta POST
mediante curl
.
curl -X POST \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \ --data "{ 'contentStructure': 'CONTENT_STRUCTURE', 'gcsSource': { 'uri': 'gs://BUCKET/DIRECTORY/FHIR_RESOURCE_FILE' } }" "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID:import"
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
La risposta contiene il nome di un'operazione. Per monitorare lo stato dell'operazione, puoi utilizzare il metodo dell'operazione get
:
curl -X GET \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta con lo stato dell'operazione in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ImportResources", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter": { "success": "SUCCESS_COUNT" } }, "done": true, "response": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ImportResourcesResponse", } }
PowerShell
Per importare le risorse FHIR in un datastore FHIR, effettua una richiesta POST
e specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- La posizione dell'oggetto in un bucket Cloud Storage
- Un token di accesso
Il seguente esempio mostra una richiesta POST
mediante Windows PowerShell.
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Post ` -Headers $headers ` -ContentType: "application/json; charset=utf-8" ` -Body "{ 'contentStructure': 'CONTENT_STRUCTURE', 'gcsSource': { 'uri': 'gs://BUCKET/DIRECTORY/FHIR_RESOURCE_FILE' } }" ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID:import" | Select-Object -Expand Content
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
La risposta contiene il nome di un'operazione. Per monitorare lo stato dell'operazione, puoi utilizzare il metodo dell'operazione get
:
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Get ` -Headers $headers ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta con lo stato dell'operazione in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ImportResources", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter": { "success": "SUCCESS_COUNT" } }, "done": true, "response": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ImportResourcesResponse", } }
Go
Java
Node.js
Python
Esportazione delle risorse FHIR
Gli esempi riportati di seguito mostrano come esportare le risorse FHIR in un bucket Cloud Storage. Quando esporti le risorse FHIR da un datastore FHIR, vengono esportate tutte le risorse nel datastore FHIR.
Durante l'esportazione, l'API Cloud Healthcare crea un file per ogni tipo di risorsa dall'archivio FHIR. Il nome file è composto dall'ID operazione e dal tipo
di risorsa separati da un trattino basso. Ogni file è costituito da un JSON delimitato da una nuova riga, dove ogni riga è una risorsa FHIR corrispondente al tipo di risorsa nel nome file. Ad esempio, se esporti più record Patient, il file di output verrà chiamato in modo simile a 1264567891234567_Patient
e conterrà una riga per ogni risorsa Patient dal datastore FHIR.
Console
Per esportare le risorse FHIR in Cloud Storage, completa questi passaggi:
- Nella console Google Cloud, vai alla pagina Set di dati.
Vai a Set di dati - Fai clic sul set di dati che contiene il datastore FHIR da cui stai esportando le risorse FHIR.
- Nell'elenco dei datastore, scegli Esporta dall'elenco Azioni per il datastore FHIR.
Viene visualizzata la pagina Esporta risorse FHIR. - Seleziona Bucket Google Cloud Storage.
- Nell'elenco Progetto, seleziona un progetto Cloud Storage.
- Nell'elenco Località, seleziona un bucket Cloud Storage.
- Fai clic su Esporta per esportare le risorse FHIR nella località definita in Cloud Storage.
- Per monitorare lo stato dell'operazione, fai clic sulla scheda Operazioni. Al termine dell'operazione, vengono visualizzate le seguenti indicazioni:
- La sezione Stato operazione a lunga esecuzione ha un segno di spunta verde sotto l'intestazione OK.
- La sezione Panoramica contiene un segno di spunta verde e un indicatore OK nella stessa riga dell'ID operazione.
gcloud
Per esportare le risorse FHIR in un bucket Cloud Storage, utilizza il comando gcloud healthcare fhir-stores export gcs
. Specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- Il nome del progetto principale
- La directory o il bucket Cloud Storage di destinazione. Scrivi in una directory o in un bucket Cloud Storage, anziché in un oggetto, poiché l'API Cloud Healthcare crea un oggetto per ogni tipo di risorsa. Ogni oggetto è costituito da un JSON delimitato da nuova riga, dove ogni riga è una risorsa FHIR. Se specifichi una directory che non esiste, viene creata.
- Un flag facoltativo,
--resource-type
, che esporta solo tipi di risorse specifici, definiti come elenco separato da virgole di uno o più tipi di risorse FHIR - Un flag facoltativo,
--since
, che esporta solo le risorse aggiornate dopo un intervallo di tempo specifico, definito comeYYYY-MM-DDThh:mm:ss.sss+zz:zz
Il seguente esempio mostra il comando gcloud healthcare fhir-stores export gcs
.
gcloud healthcare fhir-stores export gcs FHIR_STORE_ID \ --dataset=DATASET_ID \ --location=LOCATION \ --project=PROJECT_ID --gcs-uri=gs://BUCKET/DIRECTORY
La riga di comando visualizza l'ID operazione:
Waiting for operation [OPERATION_ID] to complete...done. name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID
Per visualizzare lo stato dell'operazione, esegui il comando gcloud healthcare operations describe
, fornendo il valore OPERATION_ID dalla risposta:
gcloud healthcare operations describe OPERATION_ID \ --dataset=DATASET_ID
Una volta completato il comando, la risposta include done
.
metadata: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ExportFhirData createTime: "CREATE_TIME" endTime: "END_TIME" name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID response: '@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ExportResourcesResponse fhirStore: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID resourceCount: 'RESOURCE_COUNT'
API
Per esportare le risorse FHIR, utilizza il metodo projects.locations.datasets.fhirStores.export
.
- Scrivi in un bucket o in una directory Cloud Storage, anziché in un oggetto, perché l'API Cloud Healthcare crea un file JSON delimitato da nuova riga per ogni tipo di risorsa. In ogni file JSON, ogni riga è una risorsa FHIR.
- Se il comando specifica una directory che non esiste, viene creata.
curl
Per esportare le risorse FHIR, effettua una richiesta POST
e specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- Il bucket Cloud Storage di destinazione
- Un token di accesso
- Un campo facoltativo,
_type
, che esporta solo tipi di risorse specifici, definiti come elenco separato da virgole di uno o più tipi di risorse FHIR - Un campo facoltativo,
_since
, che esporta solo le risorse aggiornate dopo un periodo di tempo specifico, definito comeYYYY-MM-DDThh:mm:ss.sss+zz:zz
Il seguente esempio mostra una richiesta POST
che utilizza curl
.
curl -X POST \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \ --data "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' }, }" "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID:export"
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
La risposta contiene il nome di un'operazione. Per monitorare lo stato dell'operazione, puoi utilizzare il metodo dell'operazione get
:
curl -X GET \ -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \ "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta con lo stato dell'operazione in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ExportResources", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter": { "success": "SUCCESS_COUNT" } }, "done": true, "response": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ExportResourcesResponse", } }
PowerShell
Per esportare le risorse FHIR, effettua una richiesta POST
e specifica le seguenti informazioni:
- Il nome del set di dati padre
- Il nome del datastore FHIR
- La directory o il bucket Cloud Storage di destinazione. Scrivi in una directory o in un bucket Cloud Storage, anziché in un oggetto, poiché l'API Cloud Healthcare crea un oggetto per ogni tipo di risorsa. Ogni oggetto è costituito da JSON delimitato da nuova riga, dove ogni riga è una risorsa FHIR.
- Un token di accesso
- Un campo facoltativo,
_type
, che esporta solo tipi di risorse specifici, definiti come elenco separato da virgole di uno o più tipi di risorse FHIR - Un campo facoltativo,
_since
, che esporta solo le risorse aggiornate dopo un periodo di tempo specifico, definito comeYYYY-MM-DDThh:mm:ss.sss+zz:zz
Il seguente esempio mostra una richiesta POST
mediante Windows PowerShell.
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Post ` -Headers $headers ` -ContentType: "application/json; charset=utf-8" ` -Body "{ 'gcsDestination': { 'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY' }, }" ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/fhirStores/FHIR_STORE_ID:export" | Select-Object -Expand Content
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce la risposta in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" }
La risposta contiene il nome di un'operazione. Per monitorare lo stato dell'operazione, puoi utilizzare il metodo dell'operazione get
:
$cred = gcloud auth application-default print-access-token $headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" } Invoke-WebRequest ` -Method Get ` -Headers $headers ` -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content
Se la richiesta ha esito positivo, il server restituisce una risposta con lo stato dell'operazione in formato JSON:
{ "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID", "metadata": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata", "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.fhir.FhirService.ExportResources", "createTime": "CREATE_TIME", "endTime": "END_TIME", "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/query/CLOUD_LOGGING_URL", "counter": { "success": "SUCCESS_COUNT" } }, "done": true, "response": { "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.fhir.rest.ExportResourcesResponse", } }
Go
Java
Node.js
Python
Risoluzione dei problemi relativi alle richieste di importazione ed esportazione di FHIR
Se si verificano errori durante una richiesta di importazione o esportazione di FHIR, gli errori vengono registrati in Cloud Logging. Per maggiori informazioni, consulta Visualizzazione dei log degli errori in Cloud Logging.
Se l'intera operazione restituisce un errore, consulta Risoluzione dei problemi relativi alle operazioni a lunga esecuzione.
Passaggi successivi
- Se hai importato correttamente i dati FHIR e vuoi analizzarli in BigQuery, continua a Esportare i dati FHIR in BigQuery.