Importa y exporta datos de DICOM con Cloud Storage

En esta página, se explica cómo exportar instancias de DICOM y cómo importar objetos de DICOM desde Cloud Storage. Una instancia de DICOM suele ser una imagen, pero puede ser otro tipo de datos persistentes, como un informe estructurado. Un objeto de Cloud Storage es una instancia de DICOM que reside en Cloud Storage.

Puedes importar y exportar un enorme cantidad de datos entre un depósito de Cloud Storage y una tienda de DICOM. Por ejemplo, es posible que tengas muchos archivos de instancia de DICOM que quieras importar a una tienda de DICOM. En lugar de almacenar los datos directamente de manera programática, puedes almacenar los datos en un depósito de Cloud Storage y, luego, importar los archivos a una tienda de DICOM mediante una sola operación de importación. Para obtener más información, consulta Cloud Storage.

Para almacenar una instancia de DICOM directamente, como tu máquina local, puedes almacenar los datos de DICOM mediante el servicio web RESTful de Transacciones en tienda como se lo implementa en la API de Cloud Healthcare. Para recuperar una sola instancia o estudio de una tienda de DICOM, puedes recuperar datos de DICOM mediante el servicio web RESTful de Recuperación de transacciones como se lo implementa en la API de Cloud Healthcare.

Configura permisos de Cloud Storage

Antes de importar y exportar datos de DICOM desde y hacia Cloud Storage, debes otorgar permisos adicionales a la cuenta de servicio del agente de servicios de Cloud Healthcare. Para obtener más información, consulta Permisos de Cloud Storage de la tienda de DICOM.

Importa objetos de DICOM

En las siguientes muestras, se demuestra cómo importar objetos de DICOM desde un depósito de Cloud Storage.

Console

Para importar objetos de DICOM desde un depósito de Cloud Storage, completa los siguientes pasos:

  1. En Cloud Console, ve a la página Conjuntos de datos.

    Ir a la página Conjuntos de datos

  2. Haz clic en el conjunto de datos para el que importas objetos de DICOM.

  3. En la lista de tiendas de DICOM, selecciona Importar en la lista Acciones.

    Aparecerá la página Importar a la tienda de DICOM.

  4. En la lista Proyecto, selecciona un proyecto de Cloud Storage.

  5. En la lista Ubicación, selecciona un depósito de Cloud Storage.

  6. Si deseas establecer una ubicación específica para la importación de archivos, haz lo siguiente:

    1. Expande Opciones avanzadas.
    2. Selecciona Anular ruta de Cloud Storage.
    3. Si deseas establecer una fuente específica para la importación de archivos, define la ruta de acceso mediante las siguientes variables en el cuadro de texto Ubicación:
      • *: hace coincidir caracteres sin separadores.
      • **: hace coincidir caracteres, incluidos los separadores. Se puede usar con una extensión de nombre de archivo para hacer coincidir todos los archivos del mismo tipo.
      • ?: hace coincidir 1 carácter.
  7. Haz clic en Importar para importar objetos de DICOM desde la fuente definida.

gcloud

El siguiente ejemplo funciona con la versión v1beta1 de la API de Cloud Healthcare.

Para importar objetos de DICOM desde un depósito de Cloud Storage, usa el comando gcloud beta healthcare dicom-stores import gcs. Especifica el nombre del conjunto de datos superior, el nombre de la tienda de DICOM y la ubicación del objeto en un depósito de Cloud Storage.

  • La ubicación de los archivos dentro del depósito es arbitraria y no necesita adherirse exactamente al formato especificado en el siguiente ejemplo.
  • Cuando especificas la ubicación de los objetos de DICOM en Cloud Storage, puedes usar comodines para importar varios archivos desde uno o más directorios. Se admiten los siguientes comodines:
    • Usa * para hacer coincidir 0 o más caracteres sin separadores. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.dcm hace coincidir Example.dcm y Example22.dcm en DIRECTORY.
    • Usa ** para hacer coincidir 0 o más caracteres (con separadores). Se debe usar al final de una ruta y no debe haber otros comodines en la ruta. También se puede usar con una extensión de nombre de archivo (como .dcm), que importa todos los archivos con la extensión de nombre de archivo en el directorio especificado y en sus subdirectorios. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/**.dcm importa todos los archivos con la extensión de nombre de archivo .dcm en DIRECTORY y en sus subdirectorios.
    • Usa ? para hacer coincidir 1 carácter. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.dcm hace coincidir Example1.dcm, pero no Example.dcm ni Example01.dcm.

En la siguiente muestra, se demuestra cómo importar objetos de DICOM desde un depósito de Cloud Storage.

gcloud beta healthcare dicom-stores import gcs DICOM_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --gcs-uri=gs://BUCKET/DIRECTORY/DICOM_INSTANCE.dcm

La línea de comandos muestra el ID de la operación:

name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID

Para ver el estado de la operación, ejecuta el comando gcloud beta healthcare operations describe y proporciona el OPERATION_ID de la respuesta:

gcloud beta healthcare operations describe OPERATION_ID \
  --location=LOCATION \
  --dataset=DATASET_ID 

Una vez que se completa el comando, se incluirá done: true en la respuesta.

done: true
metadata:
'@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1beta1.OperationMetadata
apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1beta1.dicom.DicomService.ImportDicomData
counter:
  success: SUCCESSFUL_INSTANCES
  failure: FAILED_INSTANCES
createTime: "CREATE_TIME"
endTime: "END_TIME"
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID
response:
'@type': "..."

API

Para importar objetos de DICOM desde un depósito de Cloud Storage, usa el método projects.locations.datasets.dicomStores.import.

  • La ubicación de los archivos dentro del depósito es arbitraria y no necesita adherirse exactamente al formato especificado en los siguientes ejemplos.
  • Cuando especificas la ubicación de los objetos de DICOM en Cloud Storage, puedes usar comodines para importar varios archivos desde uno o más directorios. Se admiten los siguientes comodines:
    • Usa * para hacer coincidir 0 o más caracteres sin separadores. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/Example*.dcm hace coincidir Example.dcm y Example22.dcm en DIRECTORY.
    • Usa ** para hacer coincidir 0 o más caracteres (con separadores). Se debe usar al final de una ruta y no debe haber otros comodines en la ruta. También se puede usar con una extensión de nombre de archivo (como .dcm), que importa todos los archivos con la extensión de nombre de archivo en el directorio especificado y en sus subdirectorios. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/**.dcm importa todos los archivos con la extensión de nombre de archivo .dcm en DIRECTORY y en sus subdirectorios.
    • Usa ? para hacer coincidir 1 carácter. Por ejemplo, gs://BUCKET/DIRECTORY/Example?.dcm hace coincidir Example1.dcm, pero no Example.dcm ni Example01.dcm.

Comando curl

Para importar objetos de DICOM, realiza una solicitud POST y proporciona el nombre del conjunto de datos superior, el nombre de la tienda de DICOM, la ubicación del objeto en un depósito de Cloud Storage y un token de acceso.

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante curl.

curl -X POST \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
    --data "{
      'gcsSource': {
        'uri': 'gs://BUCKET/*.dcm'
      }
    }" "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import"

Si la solicitud tiene éxito, se mostrará la respuesta en formato JSON en el servidor:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
}

La respuesta contiene un nombre de operación. Para realizar un seguimiento del estado de la operación, puedes usar el método get de la operación:

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará una respuesta con el estado de la operación en formato JSON:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
  "metadata": {
    "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
    "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ImportDicomData",
    "createTime": "CREATE_TIME",
    "endTime": "END_TIME",
    "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/viewer/CLOUD_LOGGING_URL",
    "counter": {
       "success": SUCCESSFUL_INSTANCES
       "failure": FAILED_INSTANCES
    },
  },
  "done": true,
  "response": {
    "@type": "..."
  }
}

PowerShell

Para importar objetos de DICOM, realiza una solicitud POST y proporciona el nombre del conjunto de datos superior, el nombre de la tienda de DICOM, la ubicación del objeto en un depósito de Cloud Storage y un token de acceso.

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
  -Body "{
    'gcsSource': {
      'uri': 'gs://BUCKET/*.dcm'
    }
  }" `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:import" | Select-Object -Expand Content

Si la solicitud tiene éxito, se mostrará la respuesta en formato JSON en el servidor:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
}

La respuesta contiene un nombre de operación. Para realizar un seguimiento del estado de la operación, puedes usar el método get de la operación:

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará una respuesta con el estado de la operación en formato JSON:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
  "metadata": {
    "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
    "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ImportDicomData",
    "createTime": "CREATE_TIME",
    "endTime": "END_TIME",
    "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/viewer/CLOUD_LOGGING_URL",
    "counter":{
       "success": SUCCESSFUL_INSTANCES
       "failure": FAILED_INSTANCES
    }
  },
  "done": true,
  "response": {
    "@type": "..."
  }
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// importDICOMInstance imports DICOM objects from GCS.
func importDICOMInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, contentURI string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %v", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	req := &healthcare.ImportDicomDataRequest{
		GcsSource: &healthcare.GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsSource{
			Uri: contentURI,
		},
	}
	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	lro, err := storesService.Import(name, req).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Import: %v", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Import to DICOM store started. Operation: %q\n", lro.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.googleapis.auth.oauth2.GoogleCredential;
import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.jackson2.JacksonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsSource;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.ImportDicomDataRequest;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Operation;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomStoreImport {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new JacksonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomStoreImport(String dicomStoreName, String gcsUri) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String gcsUri = "gs://your-bucket-id/path/to/destination/dir"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure where the store should be imported from.
    GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsSource gcsSource =
        new GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsSource().setUri(gcsUri);
    ImportDicomDataRequest importRequest = new ImportDicomDataRequest().setGcsSource(gcsSource);

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.CloudHealthcareImport request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .healthcareImport(dicomStoreName, importRequest);

    // Execute the request, wait for the operation to complete, and process the results.
    try {
      Operation operation = request.execute();
      while (operation.getDone() == null || !operation.getDone()) {
        // Update the status of the operation with another request.
        Thread.sleep(500); // Pause for 500ms between requests.
        operation =
            client
                .projects()
                .locations()
                .datasets()
                .operations()
                .get(operation.getName())
                .execute();
      }
      System.out.println("DICOM store import complete." + operation.getResponse());
    } catch (Exception ex) {
      System.out.printf("Error during request execution: %s", ex.toString());
      ex.printStackTrace(System.out);
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredential credential =
        GoogleCredential.getApplicationDefault(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY)
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          credential.initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const {google} = require('googleapis');
const healthcare = google.healthcare('v1');
const sleep = require('../sleep');

const importDicomInstance = async () => {
  const auth = await google.auth.getClient({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  });
  google.options({auth});

  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const gcsUri = 'my-bucket/my-directory/*.dcm'
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const request = {
    name,
    resource: {
      // The location of the DICOM instances in Cloud Storage
      gcsSource: {
        uri: `gs://${gcsUri}`,
      },
    },
  };

  const operation = await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.import(
    request
  );
  const operationName = operation.data.name;

  const operationRequest = {name: operationName};

  // Wait fifteen seconds for the LRO to finish.
  await sleep(15000);

  // Check the LRO's status
  const operationStatus = await healthcare.projects.locations.datasets.operations.get(
    operationRequest
  );

  const {data} = operationStatus;

  if (data.error === undefined) {
    console.log('Successfully imported DICOM instances');
  } else {
    console.log('Encountered errors. Sample error:');
    console.log(
      'Resource on which error occured:',
      data.error.details[0]['sampleErrors'][0]['resource']
    );
    console.log(
      'Error code:',
      data.error.details[0]['sampleErrors'][0]['error']['code']
    );
    console.log(
      'Error message:',
      data.error.details[0]['sampleErrors'][0]['error']['message']
    );
  }
};

importDicomInstance();

Python

def import_dicom_instance(
    project_id, cloud_region, dataset_id, dicom_store_id, content_uri
):
    """Import data into the DICOM store by copying it from the specified
    source.
    """
    client = get_client()
    dicom_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, cloud_region, dataset_id
    )
    dicom_store_name = "{}/dicomStores/{}".format(dicom_store_parent, dicom_store_id)

    body = {"gcsSource": {"uri": "gs://{}".format(content_uri)}}
    # Escape "import()" method keyword because "import"
    # is a reserved keyword in Python
    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .dicomStores()
        .import_(name=dicom_store_name, body=body)
    )

    response = request.execute()
    print("Imported DICOM instance: {}".format(content_uri))

    return response

Soluciona problemas de solicitudes de importación de DICOM

Si se producen errores durante una solicitud de importación de DICOM, estos se registrarán en Cloud Logging. Para obtener más información, consulta Visualiza los registros de errores en Cloud Logging.

Exporta instancias de DICOM

En las siguientes muestras, se demuestra cómo exportar instancias de DICOM a un depósito de Cloud Storage. Cuando exportas instancias de DICOM desde una tienda de DICOM, se exportarán todas las instancias de la tienda.

Console

Para exportar instancias de DICOM a Cloud Storage, completa los siguientes pasos:

  1. En Cloud Console, ve a la página Conjuntos de datos.

    Ir a la página Conjuntos de datos

  2. Haz clic en el conjunto de datos para el que exportas las instancias de DICOM.

  3. En la lista de tiendas de DICOM, selecciona Exportar en la lista Acciones.

    Aparecerá la página Exportar tienda de DICOM.

  4. Selecciona Depósito de Google Cloud Storage.

  5. En la lista Proyecto, selecciona un proyecto de Cloud Storage.

  6. En la lista Ubicación, selecciona un depósito de Cloud Storage.

  7. En Configuración de exportación de DICOM, selecciona el tipo de archivo que usas para exportar las instancias de DICOM. Estos son los tipos que se encuentran disponibles:

    • Archivo de DICOM (.dcm)
    • octet-stream
    • Imagen (.jpg, .png)
  8. Para definir la sintaxis de transferencia adicional, selecciona la sintaxis en la lista Sintaxis de transferencia.

  9. Haz clic en Exportar para exportar las instancias de DICOM a la ubicación definida en Cloud Storage.

gcloud

El siguiente ejemplo funciona con la versión v1beta1 de la API de Cloud Healthcare.

Para exportar instancias de DICOM a un depósito de Cloud Storage, usa el comando gcloud beta healthcare dicom-stores export gcs.

  • Proporciona el nombre del conjunto de datos superior, el nombre de la tienda de DICOM y el depósito de Cloud Storage de destino.
  • Escribe en un depósito o un directorio de Cloud Storage, en lugar de en un objeto, ya que la API de Cloud Healthcare crea un archivo .dcm para cada objeto.
  • Si el comando especifica un directorio que no existe, este se creará.

En el siguiente ejemplo, se muestra el comando gcloud beta healthcare dicom-stores export gcs.

gcloud beta healthcare dicom-stores export gcs DICOM_STORE_ID \
  --dataset=DATASET_ID \
  --location=LOCATION \
  --gcs-uri-prefix=gs://BUCKET/DIRECTORY 

La línea de comandos muestra el ID de la operación:

name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID

Para ver el estado de la operación, ejecuta el comando gcloud beta healthcare operations describe y proporciona el OPERATION_ID de la respuesta:

gcloud beta healthcare operations describe OPERATION_ID \
  --location=LOCATION \
  --dataset=DATASET_ID 

Una vez que se completa el comando, se incluirá done: true en la respuesta.

done: true
metadata:
'@type': type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1beta1.OperationMetadata
apiMethodName: google.cloud.healthcare.v1beta1.dicom.DicomService.ExportDicomData
counter:
  success: SUCCESSFUL_INSTANCES
  failure: FAILED_INSTANCES
createTime: "CREATE_TIME"
endTime: "END_TIME"
name: projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID
response:
'@type': "..."

API

Para exportar instancias de DICOM a un depósito de Cloud Storage, usa el método projects.locations.datasets.dicomStores.export.

  • Escribe en un depósito o un directorio de Cloud Storage, en lugar de en un objeto, ya que la API de Cloud Healthcare crea un archivo .dcm para cada objeto de DICOM.
  • Si el comando especifica un directorio que no existe, este se creará.

Comando curl

Para exportar instancias de DICOM, realiza una solicitud POST y proporciona el nombre del conjunto de datos superior, la tienda de DICOM, el depósito de Cloud Storage de destino y un token de acceso.

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante curl.

curl -X POST \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    -H "Content-Type: application/json; charset=utf-8" \
    --data "{
      'gcsDestination': {
        'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY'
      }
    }" "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export"

Si la solicitud tiene éxito, se mostrará la respuesta en formato JSON en el servidor:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
}

La respuesta contiene un nombre de operación. Para realizar un seguimiento del estado de la operación, puedes usar el método get de la operación:

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer $(gcloud auth application-default print-access-token)" \
    "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará una respuesta con el estado de la operación en formato JSON:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
  "metadata": {
    "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
    "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ExportDicomData",
    "createTime": "CREATE_TIME",
    "endTime": "END_TIME",
    "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/viewer/CLOUD_LOGGING_URL",
    "counter":{
       "success": SUCCESSFUL_INSTANCES
       "failure": FAILED_INSTANCES
    }
  },
  "done": true,
  "response": {
    "@type": "..."
  }
}

PowerShell

Para exportar instancias de DICOM, realiza una solicitud POST y proporciona el nombre del conjunto de datos superior, la tienda de DICOM, el depósito de Cloud Storage de destino y un token de acceso.

En el siguiente ejemplo, se muestra una solicitud POST mediante Windows PowerShell.

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Post `
  -Headers $headers `
  -ContentType: "application/json; charset=utf-8" `
  -Body "{
    'gcsDestination': {
      'uriPrefix': 'gs://BUCKET/DIRECTORY'
    }
  }" `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/dicomStores/DICOM_STORE_ID:export" | Select-Object -Expand Content

Si la solicitud tiene éxito, se mostrará la respuesta en formato JSON en el servidor:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID"
}

La respuesta contiene un nombre de operación. Para realizar un seguimiento del estado de la operación, puedes usar el método get de la operación:

$cred = gcloud auth application-default print-access-token
$headers = @{ Authorization = "Bearer $cred" }

Invoke-WebRequest `
  -Method Get `
  -Headers $headers `
  -Uri "https://healthcare.googleapis.com/v1/projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID" | Select-Object -Expand Content

Si la solicitud es exitosa, el servidor mostrará una respuesta con el estado de la operación en formato JSON:

{
  "name": "projects/PROJECT_ID/locations/LOCATION/datasets/DATASET_ID/operations/OPERATION_ID",
  "metadata": {
    "@type": "type.googleapis.com/google.cloud.healthcare.v1.OperationMetadata",
    "apiMethodName": "google.cloud.healthcare.v1.dicom.DicomService.ExportDicomData",
    "createTime": "CREATE_TIME",
    "endTime": "END_TIME",
    "logsUrl": "https://console.cloud.google.com/logs/viewer/CLOUD_LOGGING_URL",
    "counter":{
       "success": SUCCESSFUL_INSTANCES
       "failure": FAILED_INSTANCES
    },
  },
  "done": true,
  "response": {
    "@type": "..."
  }
}

Go

import (
	"context"
	"fmt"
	"io"

	healthcare "google.golang.org/api/healthcare/v1"
)

// exportDICOMInstance exports DICOM objects to GCS.
func exportDICOMInstance(w io.Writer, projectID, location, datasetID, dicomStoreID, destination string) error {
	ctx := context.Background()

	healthcareService, err := healthcare.NewService(ctx)
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("healthcare.NewService: %v", err)
	}

	storesService := healthcareService.Projects.Locations.Datasets.DicomStores

	req := &healthcare.ExportDicomDataRequest{
		GcsDestination: &healthcare.GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsDestination{
			UriPrefix: destination, // "gs://my-bucket/path/to/prefix/"
		},
	}
	name := fmt.Sprintf("projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s", projectID, location, datasetID, dicomStoreID)

	lro, err := storesService.Export(name, req).Do()
	if err != nil {
		return fmt.Errorf("Export: %v", err)
	}

	fmt.Fprintf(w, "Export to DICOM store started. Operation: %q\n", lro.Name)
	return nil
}

Java

import com.google.api.client.googleapis.auth.oauth2.GoogleCredential;
import com.google.api.client.http.HttpHeaders;
import com.google.api.client.http.HttpRequestInitializer;
import com.google.api.client.http.javanet.NetHttpTransport;
import com.google.api.client.json.JsonFactory;
import com.google.api.client.json.jackson2.JacksonFactory;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcare.Projects.Locations.Datasets.DicomStores;
import com.google.api.services.healthcare.v1.CloudHealthcareScopes;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.ExportDicomDataRequest;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsDestination;
import com.google.api.services.healthcare.v1.model.Operation;
import java.io.IOException;
import java.util.Collections;

public class DicomStoreExport {
  private static final String DICOM_NAME = "projects/%s/locations/%s/datasets/%s/dicomStores/%s";
  private static final JsonFactory JSON_FACTORY = new JacksonFactory();
  private static final NetHttpTransport HTTP_TRANSPORT = new NetHttpTransport();

  public static void dicomStoreExport(String dicomStoreName, String gcsUri) throws IOException {
    // String dicomStoreName =
    //    String.format(
    //        DICOM_NAME, "your-project-id", "your-region-id", "your-dataset-id", "your-dicom-id");
    // String gcsUri = "gs://your-bucket-id/path/to/destination/dir"

    // Initialize the client, which will be used to interact with the service.
    CloudHealthcare client = createClient();

    // Configure where the store will be exported too.
    GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsDestination gcsDestination =
        new GoogleCloudHealthcareV1DicomGcsDestination().setUriPrefix(gcsUri);
    ExportDicomDataRequest exportRequest =
        new ExportDicomDataRequest().setGcsDestination(gcsDestination);

    // Create request and configure any parameters.
    DicomStores.Export request =
        client
            .projects()
            .locations()
            .datasets()
            .dicomStores()
            .export(dicomStoreName, exportRequest);

    // Execute the request, wait for the operation to complete, and process the results.
    try {
      Operation operation = request.execute();
      while (operation.getDone() == null || !operation.getDone()) {
        // Update the status of the operation with another request.
        Thread.sleep(500); // Pause for 500ms between requests.
        operation =
            client
                .projects()
                .locations()
                .datasets()
                .operations()
                .get(operation.getName())
                .execute();
      }
      System.out.println("DICOM store export complete." + operation.getResponse());
    } catch (Exception ex) {
      System.out.printf("Error during request execution: %s", ex.toString());
      ex.printStackTrace(System.out);
    }
  }

  private static CloudHealthcare createClient() throws IOException {
    // Use Application Default Credentials (ADC) to authenticate the requests
    // For more information see https://cloud.google.com/docs/authentication/production
    GoogleCredential credential =
        GoogleCredential.getApplicationDefault(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY)
            .createScoped(Collections.singleton(CloudHealthcareScopes.CLOUD_PLATFORM));

    // Create a HttpRequestInitializer, which will provide a baseline configuration to all requests.
    HttpRequestInitializer requestInitializer =
        request -> {
          credential.initialize(request);
          request.setConnectTimeout(60000); // 1 minute connect timeout
          request.setReadTimeout(60000); // 1 minute read timeout
        };

    // Build the client for interacting with the service.
    return new CloudHealthcare.Builder(HTTP_TRANSPORT, JSON_FACTORY, requestInitializer)
        .setApplicationName("your-application-name")
        .build();
  }
}

Node.js

const {google} = require('googleapis');
const healthcare = google.healthcare('v1');

const exportDicomInstanceGcs = async () => {
  const auth = await google.auth.getClient({
    scopes: ['https://www.googleapis.com/auth/cloud-platform'],
  });
  google.options({auth});

  // TODO(developer): uncomment these lines before running the sample
  // const cloudRegion = 'us-central1';
  // const projectId = 'adjective-noun-123';
  // const datasetId = 'my-dataset';
  // const dicomStoreId = 'my-dicom-store';
  // const gcsUri = 'my-bucket/my-directory'
  const name = `projects/${projectId}/locations/${cloudRegion}/datasets/${datasetId}/dicomStores/${dicomStoreId}`;
  const request = {
    name,
    resource: {
      gcsDestination: {
        // The destination location of the DICOM instances in Cloud Storage
        uriPrefix: `gs://${gcsUri}`,
        // The format to use for the output files, per the MIME types supported in the DICOM spec
        mimeType: 'application/dicom',
      },
    },
  };

  await healthcare.projects.locations.datasets.dicomStores.export(request);
  console.log(`Exported DICOM instances to ${gcsUri}`);
};

exportDicomInstanceGcs();

Python

def export_dicom_instance(
    project_id, cloud_region, dataset_id, dicom_store_id, uri_prefix
):
    """Export data to a Google Cloud Storage bucket by copying
    it from the DICOM store."""
    client = get_client()
    dicom_store_parent = "projects/{}/locations/{}/datasets/{}".format(
        project_id, cloud_region, dataset_id
    )
    dicom_store_name = "{}/dicomStores/{}".format(dicom_store_parent, dicom_store_id)

    body = {"gcsDestination": {"uriPrefix": "gs://{}".format(uri_prefix)}}
    request = (
        client.projects()
        .locations()
        .datasets()
        .dicomStores()
        .export(name=dicom_store_name, body=body)
    )

    response = request.execute()
    print("Exported DICOM instances to bucket: gs://{}".format(uri_prefix))

    return response

Soluciona problemas de solicitudes de exportación de DICOM

Si se producen errores durante una solicitud de exportación de DICOM, estos se registrarán en Cloud Logging. Para obtener más información, consulta Visualiza los registros de errores en Cloud Logging.