Cancer Genome Atlas データ

GCP でホストされている Institute for Systems Biology Cancer Genomics Cloud(ISB-CGC)のデータセットにアクセスできます。これらのデータセットは The Cancer Genome Atlas(TCGA)プロジェクトのデータに基づいています。

ISB-CGC データセットには、33 種類の腫瘍からの以下のものが含まれています。

  • 体細胞突然変異コール
  • 臨床データ
  • mRNA および miRNA 発現
  • DNA メチル化
  • タンパク質発現

ISB-CGC は、R、Python、Cloud Datalab を使用したサンプルクエリと分析を試すために、以下の GitHub リポジトリも提供しています。

データセットへのアクセス

BigQuery データセット

データ探索とクエリ用に、BigQuery の次のデータセットにアクセスできます。

データについて

使用: このデータセットは、データセットのソース(https://cancergenome.nih.gov/)で規定されている条件の下で誰でも利用できるように公開されています。Google はこのデータセットを「現状のまま」提供し、明示または黙示を問わず、いかなる保証も行いません。Google は、このデータセットの使用で、直接または間接の損害が発生したとしても一切の責任を負いません。

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